白凤菜含有丰富的矿质元素、氨基酸和锌,在许多地区颇受欢迎,是公认的保健蔬菜,具有一定的药用和食用价值。本研究利用Illumina HiSeq X Ten技术平台对白凤菜进行了转录组测序,并与生化提取、q RT-PCR结果进行交叉验证。结果发现白凤菜...白凤菜含有丰富的矿质元素、氨基酸和锌,在许多地区颇受欢迎,是公认的保健蔬菜,具有一定的药用和食用价值。本研究利用Illumina HiSeq X Ten技术平台对白凤菜进行了转录组测序,并与生化提取、q RT-PCR结果进行交叉验证。结果发现白凤菜一年生长期叶片中的总黄酮含量显著高于半年生长期叶片中的总黄酮含量;转录组结果则显示在一年生长期叶片中,与黄酮生物合成相关的基因中共有10个基因显著上调表达;利用qRT-PCR深入挖掘在总黄酮上调表达路径中的关键基因,发现一年生长期叶片中无色花青素双加氧酶/花青素合成酶(LDOX/ANS)与类黄酮-3’-羟化酶(F3'H)呈显著上调表达。综上,生化提取与转录组数据均显示,一年生长期叶片中总黄酮含量高于半年期叶片,且LDOX/ANS与F3'H在其中起关键调控作用。本研究结果为白凤菜分子生物学研究奠定基础,为白凤菜药用活性成分的生物合成调控、品质改良、品种选育等提供参考依据。展开更多
黑桫椤(Gymnosphaera podophylla Dalla Torre&Sarnth.)为著名的孑遗蕨类,具有很强的环境适应能力,然而其适应性机制尚不清楚。本研究采用PacBio和Illumina技术对黑桫椤的根、羽轴和羽片进行转录组测序,分别生成12879、14185和1608...黑桫椤(Gymnosphaera podophylla Dalla Torre&Sarnth.)为著名的孑遗蕨类,具有很强的环境适应能力,然而其适应性机制尚不清楚。本研究采用PacBio和Illumina技术对黑桫椤的根、羽轴和羽片进行转录组测序,分别生成12879、14185和16084个全长unigenes。基因表达分析结果表明,与黑桫椤抗干旱、缺水胁迫和生物胁迫相关的基因表达水平较高。根、羽轴和羽片特异性上调基因均显著富集到KEGG代谢通路中的“苯丙烷生物合成途径”,根和羽轴的器官特异性上调基因还显著富集到“类黄酮生物合成途径”。共有192个全长unigenes被注释为类黄酮生物合成途径所涉及的13个酶结构基因,其中包括112个差异表达基因(DEGs),表明黑桫椤类黄酮生物合成途径较为保守,且存在器官特异性差异表达基因。本文对黑桫椤多器官全长转录组和类黄酮生物合成途径结构基因进行了综合分析,为进一步研究其对环境的适应性提供了丰富的遗传资源。展开更多
文摘白凤菜含有丰富的矿质元素、氨基酸和锌,在许多地区颇受欢迎,是公认的保健蔬菜,具有一定的药用和食用价值。本研究利用Illumina HiSeq X Ten技术平台对白凤菜进行了转录组测序,并与生化提取、q RT-PCR结果进行交叉验证。结果发现白凤菜一年生长期叶片中的总黄酮含量显著高于半年生长期叶片中的总黄酮含量;转录组结果则显示在一年生长期叶片中,与黄酮生物合成相关的基因中共有10个基因显著上调表达;利用qRT-PCR深入挖掘在总黄酮上调表达路径中的关键基因,发现一年生长期叶片中无色花青素双加氧酶/花青素合成酶(LDOX/ANS)与类黄酮-3’-羟化酶(F3'H)呈显著上调表达。综上,生化提取与转录组数据均显示,一年生长期叶片中总黄酮含量高于半年期叶片,且LDOX/ANS与F3'H在其中起关键调控作用。本研究结果为白凤菜分子生物学研究奠定基础,为白凤菜药用活性成分的生物合成调控、品质改良、品种选育等提供参考依据。
文摘黑桫椤(Gymnosphaera podophylla Dalla Torre&Sarnth.)为著名的孑遗蕨类,具有很强的环境适应能力,然而其适应性机制尚不清楚。本研究采用PacBio和Illumina技术对黑桫椤的根、羽轴和羽片进行转录组测序,分别生成12879、14185和16084个全长unigenes。基因表达分析结果表明,与黑桫椤抗干旱、缺水胁迫和生物胁迫相关的基因表达水平较高。根、羽轴和羽片特异性上调基因均显著富集到KEGG代谢通路中的“苯丙烷生物合成途径”,根和羽轴的器官特异性上调基因还显著富集到“类黄酮生物合成途径”。共有192个全长unigenes被注释为类黄酮生物合成途径所涉及的13个酶结构基因,其中包括112个差异表达基因(DEGs),表明黑桫椤类黄酮生物合成途径较为保守,且存在器官特异性差异表达基因。本文对黑桫椤多器官全长转录组和类黄酮生物合成途径结构基因进行了综合分析,为进一步研究其对环境的适应性提供了丰富的遗传资源。
