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基于网络药理学与分子对接探究黄芪-葛根-丹参治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
被引量:
5
1
作者
李思远
司赵宏
+3 位作者
张智敏
代颖燃
萨仁
武忠
《特产研究》
2023年第2期11-19,共9页
本文运用网络药理学研究方法探究黄芪-葛根-丹参中有效成分治疗糖尿病视网膜病(DR)的潜在机制。采用TCMSP平台筛选黄芪-葛根-丹参的活性成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET和DrugBank数据库筛选DR相关靶点,以及在UniProt数...
本文运用网络药理学研究方法探究黄芪-葛根-丹参中有效成分治疗糖尿病视网膜病(DR)的潜在机制。采用TCMSP平台筛选黄芪-葛根-丹参的活性成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET和DrugBank数据库筛选DR相关靶点,以及在UniProt数据库查询成分和疾病靶点对应的基因名。利用STRING数据库结合Cytoscape软件进行拓扑分析,筛选出核心靶标并绘制网络互作图,再利用Metascape平台对药物-疾病共同靶点进行GO和KEGG通路富集分析并建立成分-靶点-通路网络模型,最后使用Discovery Studio和AutoDock Vina软件对其重要化合物与DR关键靶点进行分子对接验证。通过上述方法共筛选得到中药有效成分89个及靶点基因247个,DR相关基因共4231个,其中药物-疾病共同靶点145个,涉及有效成分76个;GO富集分析涉及生物过程1864条(P<0.05);KEGG富集分析通路共205条(P<0.05),主要有AGE-RAGE、P13K-Akt、TNF和HIF-1信号通路等;关键成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、异鼠李素、刺芒柄花素和丹参酮IIA等能与相应靶点蛋白AKT1、TNF、VEGFA、TP53和IL-6形成有效的分子结合。黄芪-葛根-丹参治疗DR的机制可能与抑制炎症因子分泌、降低氧化应激、抑制新生血管形成和抑制细胞凋亡等作用有关,可为后期临床应用和试验提供理论依据。
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关键词
糖尿病视网膜病
黄芪-葛根-丹参
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探究黄芪-葛根-丹参治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
被引量:
5
1
作者
李思远
司赵宏
张智敏
代颖燃
萨仁
武忠
机构
内蒙古医科大学中医学院
内蒙古包头市蒙医中医医院皮肤科
内蒙古自治区人民医院中医科
出处
《特产研究》
2023年第2期11-19,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1700501)
内蒙古自治区卫生健康科技计划项目(202201025)。
文摘
本文运用网络药理学研究方法探究黄芪-葛根-丹参中有效成分治疗糖尿病视网膜病(DR)的潜在机制。采用TCMSP平台筛选黄芪-葛根-丹参的活性成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET和DrugBank数据库筛选DR相关靶点,以及在UniProt数据库查询成分和疾病靶点对应的基因名。利用STRING数据库结合Cytoscape软件进行拓扑分析,筛选出核心靶标并绘制网络互作图,再利用Metascape平台对药物-疾病共同靶点进行GO和KEGG通路富集分析并建立成分-靶点-通路网络模型,最后使用Discovery Studio和AutoDock Vina软件对其重要化合物与DR关键靶点进行分子对接验证。通过上述方法共筛选得到中药有效成分89个及靶点基因247个,DR相关基因共4231个,其中药物-疾病共同靶点145个,涉及有效成分76个;GO富集分析涉及生物过程1864条(P<0.05);KEGG富集分析通路共205条(P<0.05),主要有AGE-RAGE、P13K-Akt、TNF和HIF-1信号通路等;关键成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、异鼠李素、刺芒柄花素和丹参酮IIA等能与相应靶点蛋白AKT1、TNF、VEGFA、TP53和IL-6形成有效的分子结合。黄芪-葛根-丹参治疗DR的机制可能与抑制炎症因子分泌、降低氧化应激、抑制新生血管形成和抑制细胞凋亡等作用有关,可为后期临床应用和试验提供理论依据。
关键词
糖尿病视网膜病
黄芪-葛根-丹参
网络药理学
分子对接
Keywords
diabetic retinopathy
Radix astragali
-
Pueraria lobata
-
Salvia miltiorrhiza
network pharmacology
molecular docking
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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1
基于网络药理学与分子对接探究黄芪-葛根-丹参治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
李思远
司赵宏
张智敏
代颖燃
萨仁
武忠
《特产研究》
2023
5
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