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林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析
1
作者
谌颖莲
竭航
+4 位作者
赵贵军
封孝兰
张承露
吴佳勇
曾德军
《野生动物学报》
北大核心
2022年第2期370-378,共9页
为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级...
为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级结构、三级结构、互作蛋白、磷酸化分析及miRNAs结合预测,筛选与麝鼠(Ondatra zibethicus)FASN相同且与牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)不同的氨基酸位点作为麝香生物合成有关的关键位点。获取了林麝FASN基因的mRNA序列(GenBank ID:MW570770),其具有一定的物种保守性,筛选出16个关键位点,其中第307、602、657和1334位氨基酸能够改变蛋白羟基活性,预测出10个蛋白磷酸化位点,miR-1307-5p和miR-669与3′-UTR亲和能力较强。林麝FASN基因序列与其他物种之间的差异信息可为解析麝香生物合成机制提供参考。
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关键词
林麝
FASN
蛋白序列分析
麝香生物合成
MIRNAS
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题名
林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析
1
作者
谌颖莲
竭航
赵贵军
封孝兰
张承露
吴佳勇
曾德军
机构
重庆市药物种植研究所
出处
《野生动物学报》
北大核心
2022年第2期370-378,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81973428)
重庆市技术创新与应用发展专项项目(cstc2019jscx-dxwtBX0021)
重庆市自然科学基金项目(cstc2019jcyj-msxmX0024)。
文摘
为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级结构、三级结构、互作蛋白、磷酸化分析及miRNAs结合预测,筛选与麝鼠(Ondatra zibethicus)FASN相同且与牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)不同的氨基酸位点作为麝香生物合成有关的关键位点。获取了林麝FASN基因的mRNA序列(GenBank ID:MW570770),其具有一定的物种保守性,筛选出16个关键位点,其中第307、602、657和1334位氨基酸能够改变蛋白羟基活性,预测出10个蛋白磷酸化位点,miR-1307-5p和miR-669与3′-UTR亲和能力较强。林麝FASN基因序列与其他物种之间的差异信息可为解析麝香生物合成机制提供参考。
关键词
林麝
FASN
蛋白序列分析
麝香生物合成
MIRNAS
Keywords
Moschus berezovskii
FASN
Protein sequence analysis
Musk biosynthesis
miRNAs
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析
谌颖莲
竭航
赵贵军
封孝兰
张承露
吴佳勇
曾德军
《野生动物学报》
北大核心
2022
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