山西地区鸽圆环病毒全基因组序列的测定与分析 被引量：1

1

作者 张娟 任鹏飞 +3 位作者 李兴 高振 王仲兵 梁立滨 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第1期96-101,共6页

为了解山西地区鸽圆环病毒(PiCV)的遗传演化特征,本研究从山西太原、晋中等地区鸽养殖场采集10份疑似感染PiCV的病料样品经常规处理后进行Cap基因的PCR检测。结果显示,从10份病料样品中检测到1份PiCV阳性样品,将鉴定的PiCV命名为SX01/Sh... 为了解山西地区鸽圆环病毒(PiCV)的遗传演化特征,本研究从山西太原、晋中等地区鸽养殖场采集10份疑似感染PiCV的病料样品经常规处理后进行Cap基因的PCR检测。结果显示,从10份病料样品中检测到1份PiCV阳性样品,将鉴定的PiCV命名为SX01/Shanxi/2023株。通过PCR分段扩增SX01/Shanxi/2023株的全基因组序列并测序,利用SeqMan软件将序列拼接。结果显示,分别获得759bp和1560bp的目的片段,经测序拼接后获得了PiCV全长2038bp的全基因组序列。利用MegAlign软件分析PiCV全基因组序列的同源性;采用IQ-tree软件构建PiCV全基因组的遗传进化树;利用ClusterW软件分析PiCV全基因组编码氨基酸序列的变异;利用Simplot和RDP4软件对SX01/Shanxi/2023株进行重组分析。结果显示:SX01/Shanxi/2023株与国内外PiCV全基因组序列的同源性在84.6%~96.3%,其中与德国PiCVCoCV株同源性最高达95.1%,与我国陕西TF1/SN/2016株的同源性最高达96.3%。进化树结果显示,SX01/Shanxi/2023株与国内陕西TF1/SN/2016株及DS1/GS/2018株处于同一进化分支,亲缘关系较近。氨基酸序列分析结果显示,SX01/Shanxi/2023株Cap蛋白及Rep蛋白氨基酸序列与PiCV参考株相比均发生了部分氨基酸位点的插入、缺失或突变,其中Cap蛋白氨基酸序列变异多于Rep蛋白。重组分析结果显示,该株病毒是由陕西TF1/SN/2016株为主要亲本,陕西WL1/SN/2018株为次要亲本形成的重组病毒,重组断点位于nt520。基于IQ-tree软件构建的重组断裂点位点前后(nt1~nt520、nt521~nt2038)的进化树进一步验证了上述结果。本研究首次在山西地区检测到PiCV,丰富了PiCV分子生物学特征和流行病学研究内容,也为山西地区PiCV感染的防控提供了重要参考依据。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 全基因组 遗传进化分析 重组分析

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鸽圆环病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量：1

2

作者 王星月 杨志远 +5 位作者 林健 张紫萱 周雨婷 程慧敏 刘月焕 胡格 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第1期335-342,共8页

为实现对鸽圆环病毒(pigeon circovirus, PiCV)的快速检测,建立了针对Cap基因的PiCV荧光定量PCR检测方法,并应用该方法进行PiCV分子流行病学调查。本研究针对PiCV核衣壳蛋白Cap基因的保守序列设计一对特异性引物,并通过优化反应条件,成... 为实现对鸽圆环病毒(pigeon circovirus, PiCV)的快速检测,建立了针对Cap基因的PiCV荧光定量PCR检测方法,并应用该方法进行PiCV分子流行病学调查。本研究针对PiCV核衣壳蛋白Cap基因的保守序列设计一对特异性引物,并通过优化反应条件,成功建立了荧光定量PCR检测方法。此外,还对该方法的灵敏度、特异性、重复性进行了全面评估。利用建立的荧光定量PCR方法对华北和西北部分地区147份临床样本进行检测,并对阳性代表样本的Cap全长序列进行遗传演化分析。结果表明,所建立的荧光定量PCR方法在1×10^(4)至1×10^(8)拷贝·μL^(-1)范围内显示出良好的线性关系,最低检测限达到1×10^(1)拷贝·μL^(-1),显著高于传统PCR方法。此方法具有良好的重复性,且不与其他常见鸽病病原产生交叉反应。采用本试验方法检测的147份华北和西北部分地区肉鸽和信鸽临床样本PiCV阳性率为85.0%,阳性样本的Cap全长序列分析及遗传演化分析结果显示,6株分离株相似性在89.8%~97.5%之间,与PiCV HeBeiTS2021株在同一个分支,亲缘关系较近。建立的PiCV荧光定量PCR方法具备灵敏、特异和稳定等优点,可用于PiCV的快速检测,同时流行病学调查结果表明,2022—2023年华北和西北部分地区PiCV感染率较高,为我国PiCV的防控研究提供数据支撑。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 Cap基因 荧光定量PCR 分子流行病学 遗传演化分析

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鸽圆环病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用

3

作者 刘存 刘砚涵 +6 位作者 祝夕超 李法凯 张栋 邵新宇 田野 孙圣福 陈静 《动物医学进展》 北大核心 2025年第1期68-73,共6页

为了建立鸽圆环病毒(PiCV)的快速检测方法,依据PiCV Rep基因的保守序列区域设计了荧光定量PCR的引物和探针,并建立了快速检测PiCV的荧光定量PCR方法。结果显示,构建的PiCV荧光定量PCR方法在1.44×10,1~1.44×10^(7)/μL拷贝标... 为了建立鸽圆环病毒(PiCV)的快速检测方法,依据PiCV Rep基因的保守序列区域设计了荧光定量PCR的引物和探针,并建立了快速检测PiCV的荧光定量PCR方法。结果显示,构建的PiCV荧光定量PCR方法在1.44×10,1~1.44×10^(7)/μL拷贝标准品间具有良好的线性关系,线性相关系数达0.9866;该方法具有良好的敏感性,其检测病毒系列含量下限为14.4拷贝/μL;该方法特异性良好,与鸽新城疫病毒、鸽疱疹病毒、鸽腺病毒等病毒及鸽组织DNA不存在交叉反应;该方法重复性较好,批内重复试验变异系数均介于0.454%~0.473%,批间重复试验变异系数均介于0.367%~0.869%。与传统普通PCR方法相比,所建立的PiCV荧光定量PCR方法敏感性更高,临床样品PiCV检出率更高,两者检测符合率为93.75%。结果表明,所建立的PiCV荧光定量PCR方法为临床检测鸽圆环病毒提供了一种快速、灵敏的检测方法,为PiCV的流行病学调查和主动监测提供了技术支撑。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 荧光定量PCR Rep基因 检测

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鸽圆环病毒全基因组测序及遗传进化分析

4

作者 王仲浩 田野 +5 位作者 袁小远 李桂明 陈书民 刘明超 王传文 孟凯 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第11期5414-5421,共8页

【目的】了解华东部分地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)基因组特征及遗传变异规律。【方法】无菌采集58只病死鸽的肺脏、脾脏、肝脏组织,利用PCR扩增进行病原检测。对PiCV阳性样本通过PCR扩增病毒基因组全长并进行TA克隆... 【目的】了解华东部分地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)基因组特征及遗传变异规律。【方法】无菌采集58只病死鸽的肺脏、脾脏、肝脏组织,利用PCR扩增进行病原检测。对PiCV阳性样本通过PCR扩增病毒基因组全长并进行TA克隆。阳性质粒测序结果通过DNAStar和Mega 11.0软件进行全基因组序列拼接以及核苷酸、氨基酸序列比对,并构建系统进化树。利用RDP 5.42和Simplot 3.5.2软件对分离株进行重组分析并鉴定。【结果】PCR检测结果显示,58只病死鸽中检出30只PiCV阳性,且其他病毒未检出。测序结果显示,成功获得5株PiCV全基因组序列,分别命名为SD02、SD040、JS091、AH056和AH529,序列长度分别为2037、2034、2039、2039和2041 bp。相似性比对结果显示,5株PiCV分离株与国内外参考株核苷酸序列相似性为83.2%~100%,与国内的分离株亲缘关系更近。遗传进化分析结果显示,5株PiCV分离株属于不同亚型,分离株SD040、SD02、JZ091、AH056、AH529分别属于B、A、C、G和H亚型。氨基酸序列分析表明,5株PiCV分离株与标准株jz1相比,Cap蛋白氨基酸出现不同程度的突变、替换和缺失,Rep蛋白存在3个氨基酸位点缺失和1个氨基酸位点突变。重组分析表明,5株PiCV分离株有2个重组事件被鉴定,其中分离株AH056是由GX6株和JS2株重组产生,重组断点位于161 bp处。【结论】本研究分离获得5株不同亚型PiCV全基因组序列。病毒重组及关键蛋白突变为其多样性和复杂性的重要成因。本研究丰富了对PiCV基因组特征及遗传演化规律的认识,为华东地区PiCV的防控提供了重要参考依据。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 全基因组测序 遗传进化分析

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鸽圆环病毒病诊治

5

作者 任瑞 张艳 《四川畜牧兽医》 2025年第4期53-55,共3页

鸽圆环病毒(PiCV)在1992年首次报道。国内于2007年从病鸽体内检测到PiCV的存在,研究人员开始关注这种易引起鸽食欲下降、精神萎靡、羽毛凌乱、呕吐、腹泻、多尿,嗉囊充满液体等临床症状的病原。PiCV可感染肉鸽和赛鸽,是影响鸽健康的重... 鸽圆环病毒(PiCV)在1992年首次报道。国内于2007年从病鸽体内检测到PiCV的存在,研究人员开始关注这种易引起鸽食欲下降、精神萎靡、羽毛凌乱、呕吐、腹泻、多尿,嗉囊充满液体等临床症状的病原。PiCV可感染肉鸽和赛鸽,是影响鸽健康的重要传染性疾病之一。 展开更多

关键词 羽毛凌乱 食欲下降 PiCV 精神萎靡 鸽圆环病毒

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广西鸽圆环病毒全基因组的克隆和序列分析

6

作者 黄运福 银慧慧 +9 位作者 何深宏 颜国庆 兰天艳 曾雪颜 姜源明 赵武 唐作顺 俸祥仁 彭婷 刘伟 《动物医学进展》 北大核心 2025年第11期74-80,共7页

为了解广西鸽圆环病毒(PiCV)的流行情况、基因组特征和遗传进化情况,通过PCR技术对病死鸽样品进行PiCV检测,进一步从阳性样品中克隆病毒全基因组序列并进行序列分析。结果显示,57份样品的阳性检出率为56.14%(32/57)。克隆到8株PiCV全基... 为了解广西鸽圆环病毒(PiCV)的流行情况、基因组特征和遗传进化情况,通过PCR技术对病死鸽样品进行PiCV检测,进一步从阳性样品中克隆病毒全基因组序列并进行序列分析。结果显示,57份样品的阳性检出率为56.14%(32/57)。克隆到8株PiCV全基因组序列,分别命名为GX1~GX8,大小为2030 bp~2040 bp,存在2个主要开放阅读框(ORF),分别为编码Rep蛋白的ORF-V1和编码Cap蛋白的ORF-C1;PiCV广西株与GenBank上登录的其他参考毒株全基因组序列同源性为85.3%~98.6%,主要与国内分离毒株亲缘关系最近;PiCV广西株与其他参考毒株Cap基因核苷酸(氨基酸)同源性为75.9%~97.3%(72.9%~98.9%),Rep基因核苷酸(氨基酸)同源性为85.3%~99.4%(91.8%~99.4%),Cap和Rep基因主要与国内毒株亲缘关系最近。结果表明广西鸽群中存在较为严重的PiCV感染,流行的毒株主要为国内不同地区毒株的进化分支。研究结果为进一步防控广西鸽群中PiCV的流行提供依据。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 全基因组 克隆 序列分析

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赛鸽圆环病毒天津株全基因组的扩增和序列分析 被引量：1

7

作者 王志悦 李欣蕊 +6 位作者 孙嘉咛 王许刚 王瑞 李春红 徐明举 张瑞华 徐彤 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期173-177,共5页

本研究利用PCR从有腹泻症状的鸽中检测到圆环病毒,进一步进行了全基因组扩增。基因组序列分析表明该基因组长度为2032 bp,编码5个开放阅读框(ORFs),5'端和3'端各存在一个基因间隔区。该基因组序列与已登录的中国、澳大利亚、日... 本研究利用PCR从有腹泻症状的鸽中检测到圆环病毒,进一步进行了全基因组扩增。基因组序列分析表明该基因组长度为2032 bp,编码5个开放阅读框(ORFs),5'端和3'端各存在一个基因间隔区。该基因组序列与已登录的中国、澳大利亚、日本、波兰、比利时和巴西的PiCV基因序列同源性为81.5%~97.7%。全基因组系统发育分析显示,54个序列(53个参考PiCV基因组序列和1个本研究PiCV基因组序列)可分为6个分支(A、B、C、D、E和F),本研究分离毒株位于B支,与来自比利时(DQ915957和DQ915958)、中国(KX108826、KX108805、KX108825、KJ704802和KJ704806)的分离株亲缘关系密切。Simplot重组分析结果显示Rep ORFs包含多个重组热点,表明我国鸽圆环病毒存在遗传多样性。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 序列分析 重组分析

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鸽圆环病毒Cap基因SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法的建立及应用 被引量：1

8

作者 韩晓语 杨俊杰 +4 位作者 赵洪哲 郭昊 王亚新 温永俊 王凤雪 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期95-101,共7页

为建立一种针对鸽圆环病毒(PiCV)的快速诊断方法,试验根据PiCV的Cap保守基因序列,设计合成一对特异性引物,建立了PiCV荧光定量PCR检测方法,对其敏感性、特异性、重复性进行评价并利用该方法对临床样本进行检测。结果表明:在最佳反应条件... 为建立一种针对鸽圆环病毒(PiCV)的快速诊断方法,试验根据PiCV的Cap保守基因序列,设计合成一对特异性引物,建立了PiCV荧光定量PCR检测方法,对其敏感性、特异性、重复性进行评价并利用该方法对临床样本进行检测。结果表明:在最佳反应条件下,所建立的PiCV荧光定量PCR方法在1×10^(2)~1×10^(7) copies/μL标准品范围内具有良好的线性相关性,线性相关系数为0.9846;敏感性试验结果显示,该方法最低可检测到1×10^(2) copies/μL标准品,是常规PCR检测方法的100倍;特异性试验结果显示,该方法与其他常见的鸽病病原不发生交叉反应;重复性评价结果显示,批内与批间的变异系数均小于2%;所建立PiCV荧光定量PCR方法对临床病死鸽肝脏样品检测结果显示,PiCV阳性率达75.7%,高于常规PCR方法的检测阳性率(54.1%),说明该方法具有良好的适用性。可应用于对PiCV的快速检测,为PiCV的及时防控提供有力技术支持。 展开更多

关键词 Cap基因 鸽圆环病毒 实时定量PCR

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广西地区鸽圆环病毒Cap和Rep基因的克隆及遗传进化分析 被引量：1

9

作者 黄运福 颜国庆 +5 位作者 唐林生 韦建兴 银慧慧 赵武 姜源明 刘伟 《现代畜牧兽医》 2024年第4期1-5,共5页

研究旨在了解广西某肉鸽场鸽圆环病毒(PiCV) Cap和Rep基因的遗传变异情况,通过PCR技术对感染PiCV的鸽组织样品克隆Cap和Rep基因并进行测序及序列分析。结果显示,克隆的Cap和Rep基因大小分别为816 bp和954 bp。核苷酸序列同源性比对分析... 研究旨在了解广西某肉鸽场鸽圆环病毒(PiCV) Cap和Rep基因的遗传变异情况,通过PCR技术对感染PiCV的鸽组织样品克隆Cap和Rep基因并进行测序及序列分析。结果显示,克隆的Cap和Rep基因大小分别为816 bp和954 bp。核苷酸序列同源性比对分析结果显示,克隆的Cap和Rep基因与XJ1毒株核苷酸同源性最高,分别为95.5%和97.6%。遗传进化分析结果显示,Cap和Rep基因与XJ1毒株亲缘关系较近。研究表明,广西鸽群中存在PiCV流行,其Cap和Rep基因与XJ1毒株核苷酸同源性最高,亲缘关系较近,这为广西地区PiCV的诊断及防控提供了重要参考。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 Cap基因 Rep基因 遗传进化分析

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鸽圆环病毒福建株全基因组序列分析 被引量：13

10

作者 万春和 黄瑜 +3 位作者 程龙飞 傅光华 施少华 陈红梅 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第5期27-32,共6页

运用PCR技术从福建省某地发病信鸽组织中获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PICV)福建株(简称fj1株)全基因组序列,并对鸽圆环病毒福建株基因组核苷酸组成、结构及其遗传进行分析。结果表明,所获fj1株全基因大小2037 nt,包含有2个主要的... 运用PCR技术从福建省某地发病信鸽组织中获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PICV)福建株(简称fj1株)全基因组序列,并对鸽圆环病毒福建株基因组核苷酸组成、结构及其遗传进行分析。结果表明,所获fj1株全基因大小2037 nt,包含有2个主要的开放阅读框(open reading frame,ORF):ORF-V1(41～994nt)编码复制相关结构蛋白(the replicated-associated protein,Rep),ORF-C1(1987～1166nt)编码核衣壳蛋白(the putative capsid protein,Cap);在V1和C1的5'端之间存在一个与圆环病毒滚环复制有关的高度保守的环状发夹结构。fj1株与GenBank登录所有鸽圆环病毒核苷酸同源性在84.5%～93.8%之间,与中国浙江鸽圆环病毒分离株zj1和zj2核苷酸同源性分别为88.7%和88.9%。从遗传进化上看,中国3株鸽圆环病毒均处在Cap蛋白起始密码子"ATG"分支,但分居不同亚群。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 全基因 序列分析

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肉鸽圆环病毒、腺病毒及疱疹病毒Ⅰ型混合感染的多重PCR检测 被引量：9

11

作者 陈俊红 何宇 +6 位作者 祁宇晨 刘裕鹏 邢光东 王莹 徐善金 方光远 戴鼎震 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第22期167-171,共5页

运用多重PCR同时检测肉鸽病原(圆环病毒、腺病毒及疱疹病毒Ⅰ型)的方法,分别设计与合成3种病毒基因扩增引物,并提取疑似病鸽的肝脏样品DNA、进行单一PCR扩增及基因序列测定,结果分别获得了大小为239、418、618 bp的DNA产物。通过摸索多... 运用多重PCR同时检测肉鸽病原(圆环病毒、腺病毒及疱疹病毒Ⅰ型)的方法,分别设计与合成3种病毒基因扩增引物,并提取疑似病鸽的肝脏样品DNA、进行单一PCR扩增及基因序列测定,结果分别获得了大小为239、418、618 bp的DNA产物。通过摸索多重PCR反应条件,应用多重PCR同时检测3种病毒基因片段,同时获得了鸽疱疹病毒Ⅰ型、鸽圆环病毒及鸽源腺病毒的基因片段。再对疑似混合感染这3种病毒的肝脏样品进行检测,发现50%(6/12)样品存在3种病毒的混合感染、25%(3/12)样品存在鸽圆环病毒和鸽源腺病毒的混合感染、8.3%(1/12)样品存在鸽源腺病毒和Ⅰ型鸽疱疹病毒的混合感染、8.3%(1/12)样品存在鸽圆环病毒和Ⅰ型鸽疱疹病毒的混合感染、8.3%(1/12)样品未发生任何感染。结果表明,多重PCR可快速检测鸽疱疹病毒Ⅰ型、鸽圆环病毒及鸽源腺病毒的混合感染,表明运用三重PCR检测3种病毒混合感染有很好的应用价值。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 鸽源腺病毒 鸽疱疹病毒Ⅰ型 多重PCR 基因测序

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鸽圆环病毒研究进展 被引量：8

12

作者 栗文文 袁海霞 +2 位作者 徐雅萍 林蕾 余旭平 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第8期236-238,共3页

鸽圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)是20世纪90年代初发现的一种新的主要影响青年鸽的传染性病原,可引起免疫抑制,导致鸽子生病或死亡,从而给鸽的饲养带来巨大损失。因此,了解该病毒的特性、基因组结构、致病机理、诊断方法至关重要。... 鸽圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)是20世纪90年代初发现的一种新的主要影响青年鸽的传染性病原,可引起免疫抑制,导致鸽子生病或死亡,从而给鸽的饲养带来巨大损失。因此,了解该病毒的特性、基因组结构、致病机理、诊断方法至关重要。文章针对这几个方面对鸽圆环病毒作了概述,以便更好地了解该病毒,减轻其对养鸽业造成的危害。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 病毒特征 致病机理 基因组结构 检测方法

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鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析 被引量：6

13

作者 米晓云 吴建勇 +5 位作者 马文戈 日孜瓦古·努尔东 王琦 盛肖刚 黄炯 魏玉荣 《塔里木大学学报》 2021年第1期1-8,共8页

采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)... 采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)、ORF C1(1166~1981 nt)、ORF C2(410~790 nt)、ORF C3(2~292 nt)和ORF C4(739~984 nt)5个阅读框,5’端和3’端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt。XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2%~94.9%,其中与GF17和GH1834的同源性最高(均为94.9%),基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子"ATG"分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近。鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 全基因 序列分析

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鸽圆环病毒SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法的建立及应用 被引量：8

14

作者 亓玉卓 梁琳 +4 位作者 朱亚丽 梁瑞英 贾亚雄 单虎 崔尚金 《中国家禽》 北大核心 2021年第3期22-27,共6页

为建立一种针对鸽圆环病毒(PiCV)的快速诊断方法,试验根据PiCV的Rep保守基因序列,设计合成一对特异性引物,建立了PiCV荧光定量PCR检测方法,对其敏感性、特异性、重复性进行评价并利用该方法对临床样本进行检测。结果表明:在最佳反应条件... 为建立一种针对鸽圆环病毒(PiCV)的快速诊断方法,试验根据PiCV的Rep保守基因序列,设计合成一对特异性引物,建立了PiCV荧光定量PCR检测方法,对其敏感性、特异性、重复性进行评价并利用该方法对临床样本进行检测。结果表明:在最佳反应条件下,所建立的PiCV荧光定量PCR方法在1.43×10^(2)~1.43×10^(8)copies/μL标准品范围内具有良好的线性相关性,线性相关系数为0.998;敏感性试验结果显示,该方法最低可检测到1.43×10^(2)copies/μL标准品,是常规PCR检测方法的1000倍;特异性试验结果显示,该方法与其他常见的鸽病病原不发生交叉反应;重复性评价结果显示,批内与批间的变异系数均小于0.8%;所建立PiCV荧光定量PCR方法对临床鸽血清样品检测结果显示,PiCV阳性率达38.7%,高于常规PCR方法的检测阳性率(28.7%),说明该方法具有良好的适用性。研究结果PiCV的流行病学调查、病原学监测及定量研究奠定了基础。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 实时定量PCR Rep基因 检测

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2021—2022年我国部分地区鸽圆环病毒感染状况调查 被引量：6

15

作者 邢安琪 于晓慧 +8 位作者 彭真奇 蒋文明 克军宏 李阳 李金平 袁丽萍 许立华 王静静 刘华雷 《中国动物检疫》 CAS 2023年第7期1-7,共7页

为了解目前我国鸽群中鸽圆环病毒(pigeon circovrius,PiCV)的流行现状及遗传变异情况,2021—2022年对山东等11个省(自治区)PiCV感染状况进行了调查,共采集鸽相关样品658份,采用PCR方法进行PiCV病原学检测,并对3份PiCV病原学阳性样品进... 为了解目前我国鸽群中鸽圆环病毒(pigeon circovrius,PiCV)的流行现状及遗传变异情况,2021—2022年对山东等11个省(自治区)PiCV感染状况进行了调查,共采集鸽相关样品658份,采用PCR方法进行PiCV病原学检测,并对3份PiCV病原学阳性样品进行基因组序列测定及遗传进化分析。结果显示:在主动监测的9个省(自治区)49个采样点中,检出464份PiCV病原学阳性样品,个体阳性率为75.20%(464/617),场点阳性率为91.84%(45/49),其中河南省个体阳性率最高(100%);在被动监测的3个省41份病死鸽组织样品中,共检出28份PiCV病原学阳性样品;3份病原学阳性代表样品(QingDao 957、JiLin2、FuJian 1179)与已报道的24条PiCV全基因组序列同源性为87.30%~95.90%;QingDao 957和JiLin 2与国内报道的JS15-1序列亲缘关系较近,而FuJian 1179与国外报道的PL53参考序列属于同一分支,推测QingDao 957和JiLin2毒株在国内流行的PiCV中占主导地位,而FuJian 1179可能是通过国际贸易等传入的新病原。结果表明,PiCV在我国部分地区鸽群中污染面较广,感染较严重,且来源复杂。因此,应加强鸽场的饲养管理,提高鸽群抵抗力,同时在外部引种时要做好病毒检测,以有效控制PiCV流行。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 流行病学调查 遗传进化分析

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北京地区1株鸽圆环病毒全基因组测定及遗传进化分析 被引量：7

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作者 亓玉卓 梁琳 +3 位作者 韩坤 梁瑞英 贾亚雄 崔尚金 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第1期32-42,共11页

【目的】了解北京地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病鸽的肝脏和脾脏组织为模板,采用PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织DNA为模板,应用PCR技术分段扩增PiCV的全基因序列。应... 【目的】了解北京地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病鸽的肝脏和脾脏组织为模板,采用PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织DNA为模板,应用PCR技术分段扩增PiCV的全基因序列。应用DNAStar和Mega 7.0软件对扩增得到的全序列进行拼接和核苷酸序列比对,并构建系统进化树,对病毒基因组的2个开放阅读框分别进行核苷酸和氨基酸序列比对,并构建系统进化树。【结果】经PCR检测,3只病鸽中有1只病鸽的组织中检测到PiCV阳性,并未检出其他病毒。采用PCR分段扩增成功获得了1株PiCV的全基因组序列,命名为PiCV BJ,该病毒基因组大小为2034 bp,包含有2个主要的开放阅读框(ORFs),ORF-V1编码Rep蛋白,ORF-C1编码Cap蛋白。相似性比对结果显示,PiCV BJ株基因组序列与GenBank上登录的其他参考序列的核苷酸相似性在86.0%~97.0%之间,与2011年分离自波兰的PL53相似性为97.0%。遗传进化结果显示,PiCV BJ株与2014年分离自波兰的PL124在同一分支,亲缘关系较近;与其他禽源圆环病毒不在同一分支,亲缘关系较远。PiCV BJ株Cap基因的起始密码子为ATG,与2011年分离自比利时的11-08304株核苷酸、氨基酸序列相似性高达95.8%和85.2%;Rep基因与2011年分离自波兰的PL53相似性最高,核苷酸和氨基酸相似性分别高达94.6%和96.2%;Cap和Rep基因的进化树分析结果也显示,PiCV BJ株均与PL53和11-08304株在同一分支,亲缘关系较近,这与相似性分析的结果一致。【结论】PiCV BJ株来自国外,可能由赛鸽引种传入中国,提示在外部引种时要做好病毒监测。本研究丰富了PiCV的遗传学研究资料,为进一步探究PiCV的遗传变异及传播机制提供了参考依据,也为PiCV的防控提供了重要的理论基础。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒(PiCV) 全基因组 遗传进化分析

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鸽圆环病毒Cap及Rep基因的克隆与进化分析 被引量：5

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作者 日孜瓦古·努尔东 米晓云 +7 位作者 魏玉荣 吴建勇 苗书魁 马文戈 韩涛 葛丽娟 魏婕 黄炯 《塔里木大学学报》 2020年第1期1-6,共6页

为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)... 为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)。测序毒株被命名为PiCV-XJ2018,其Cap基因与GF82/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为94.98%,Rep基因与GF71/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为97.17%。遗传进化分析结果显示,PiCV-XJ2018毒株与国内2014年检测的广东株及上海株亲缘关系较近。本研究将为本地区鸽圆环病毒的诊断与防控提供参考数据。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 Rep基因 Cap基因 进化分析

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鸽圆环病毒和鸽疱疹病毒双重PCR检测方法的建立及初步应用 被引量：8

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作者 兰世捷 苗艳 +13 位作者 陈亮 李洪彬 朱庆贺 冯万宇 李丹 沈思思 张蕾 钟鹏 史同瑞 江波涛 罗天瑶 王志强 金振华 吴宪 《中国家禽》 北大核心 2022年第4期113-116,共4页

为建立同时检测鸽圆环病毒(PiCV)和鸽疱疹病毒(PiHV)的双重PCR,试验参照GenBank中两种病毒的基因序列设计2对特异性引物,通过优化反应条件,建立了同时检测2种病毒的双重PCR技术。结果显示:该PCR可同时扩增出269 bp(PiCV)和505 bp(PiHV)... 为建立同时检测鸽圆环病毒(PiCV)和鸽疱疹病毒(PiHV)的双重PCR,试验参照GenBank中两种病毒的基因序列设计2对特异性引物,通过优化反应条件,建立了同时检测2种病毒的双重PCR技术。结果显示:该PCR可同时扩增出269 bp(PiCV)和505 bp(PiHV)目的条带,对鸽Ⅰ型副黏病毒、鸽痘病毒和禽腺病毒检测结果为阴性;对PiCV和PiHV的最低检出量分别为1.45×10;copies/μL和1.45×10;copies/μL,敏感性较高;利用该方法对黑龙江省部分鸽场88份疑似样品检测显示,PiCV和PiHV感染的比例分别81.8%和36.4%,双重PCR与单一PCR的符合率为100%。结果表明:建立的方法使用便捷,对于PiHV和PiCV的临床快速检测与流行病学调查具有重要的应用价值。 展开更多

关键词 鸽圆环病毒 鸽疱疹病毒 双重PCR

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鸽Ⅰ型副黏病毒、圆环病毒和疱疹病毒混合感染的诊断 被引量：4

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作者 黄运福 颜国庆 +5 位作者 梁海皇 银慧慧 赵武 曾雪颜 兰天艳 刘伟 《现代畜牧兽医》 2024年第3期59-63,共5页

研究旨在确诊广西某肉鸽场中出现神经症状的病鸽并为该场提供相应的防治方案,通过临床诊断、病理解剖、分子生物学检测、细菌分离、病毒分离等方法对广西某肉鸽场病鸽进行诊断。结果显示,剖检可见病鸽肝脾肿大、坏死,花斑肾;分子生物学... 研究旨在确诊广西某肉鸽场中出现神经症状的病鸽并为该场提供相应的防治方案,通过临床诊断、病理解剖、分子生物学检测、细菌分离、病毒分离等方法对广西某肉鸽场病鸽进行诊断。结果显示,剖检可见病鸽肝脾肿大、坏死,花斑肾;分子生物学检测结果显示,鸽Ⅰ型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type 1,PPMV-1)、圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)和疱疹病毒(pigeon herpesvirus,PiHV)为阳性;对病样进行细菌培养,结果未分离到细菌;将病样接种SPF鸡胚进行病毒分离,结果显示,尿囊液血凝效价稳定在8 log2,其血凝性可被新城疫病毒(NDV)阳性血清抑制,但不能被禽流感病毒(AIV)阳性血清抑制。研究表明,最终诊断结果为PPMV-1、PiCV和PiHV混合感染。 展开更多

关键词 鸽Ⅰ型副黏病毒 鸽圆环病毒 鸽疱疹病毒

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高通量测序技术检测鸽群中病毒感染状况 被引量：4

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作者 王楷宬 庄青叶 +3 位作者 邱源 刘朔 王素春 彭程 《中国动物检疫》 CAS 2018年第5期81-84,共4页

为了解我国鸽子病毒感染状况,采用高通量测序方法,对华东地区肉鸽携带的病原进行了检测,共检测到5种主要感染病原,包括禽轮状病毒、鸽圆环病毒、鸽星状病毒、鸽冠状病毒和鸽微RNA病毒B。除鸽圆环病毒外,其余4种病毒均在我国鸽群中首次... 为了解我国鸽子病毒感染状况,采用高通量测序方法,对华东地区肉鸽携带的病原进行了检测,共检测到5种主要感染病原,包括禽轮状病毒、鸽圆环病毒、鸽星状病毒、鸽冠状病毒和鸽微RNA病毒B。除鸽圆环病毒外,其余4种病毒均在我国鸽群中首次被发现。该检测结果对我国的鸽群疫病监测和防控具有重要意义,同时证实高通量技术能够检测出动物群体中的主要感染病原,是动物疫病检测的新思路,有利于全面掌握动物病原感染状况,及时预警、处置和防控动物疫病的发生。 展开更多

关键词 高通量测序 鸽群 病毒检测 禽轮状病毒 鸽圆环病毒 鸽星状病毒 鸽冠状病毒 鸽微RNA病毒B

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