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鸡TRIM32的序列分析及功能初步研究
1
作者
黄心钰
张俊生
+5 位作者
卢军
张淼湘
林宏文
黄小武
焦培荣
郭剑英
《中国动物传染病学报》
北大核心
2025年第5期122-129,共8页
本研究克隆鸡TRIM32(ChTRIM32)基因序列,分析其基因序列及其与不同物种TRIM32基因的同源性和遗传演化关系,预测其结构域及蛋白质二级结构,表达鸡TRIM32蛋白,并探究鸡TRIM32在天然免疫信号通路中的作用。试验结果表明:鸡TRIM32基因开放...
本研究克隆鸡TRIM32(ChTRIM32)基因序列,分析其基因序列及其与不同物种TRIM32基因的同源性和遗传演化关系,预测其结构域及蛋白质二级结构,表达鸡TRIM32蛋白,并探究鸡TRIM32在天然免疫信号通路中的作用。试验结果表明:鸡TRIM32基因开放阅读框为1944 bp,编码647个氨基酸,其蛋白质分子质量约为71.84 kDa;鸡TRIM32蛋白包含1个N端RING-HC结构域、1个B-box1结构域和6个重复的C端NHL结构;鸡TRIM32与火鸡、美洲雕、天鹅、枭鹦、鸿雁、绿头鸭、野猪、人、家鼠、狗、水牛、斑马鱼TRIM32的氨基酸序列同源性分别为97.2%、92.6%、91.9%、91.7%、91.6%、88.8%、75.0%、74.8%、74.7%、74.2%、74.0%、63.9%;鸡TRIM32与其他鸟类TRIM32的亲缘关系最近,与哺乳动物TRIM32的亲缘关系较远,与鱼类TRIM32的亲缘关系最远;鸡TRIM32蛋白质二级结构包含无规则卷曲(38.64%)、α-螺旋(29.37%)、延伸链(22.87%)、β-转角(9.12%);构建pCAGGS-ChTRIM32真核表达质粒;H5N1亚型禽流感病毒(DK212株)感染DF1细胞后,鸡TRIM32基因及其他抗病毒基因(IFN-β、IL-6、OAS、Mx)表达水平上调;过表达鸡TRIM32能增强鸡STING对IFN-β启动子的激活作用。本文成功鉴定并克隆了鸡TRIM32基因,预测了鸡TRIM32蛋白的结构域与二级结构,并研究了鸡TRIM32在天然免疫信号通路中的功能,为进一步探究鸡TRIM32在鸡抗病毒天然免疫信号通路中的作用奠定了基础。
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关键词
鸡trim32基因
序列分析
天然免疫信号通路
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题名
鸡TRIM32的序列分析及功能初步研究
1
作者
黄心钰
张俊生
卢军
张淼湘
林宏文
黄小武
焦培荣
郭剑英
机构
华南农业大学兽医学院
柳州市动物疫病预防控制中心
通辽市扎鲁特旗动物疫病预防控制中心
出处
《中国动物传染病学报》
北大核心
2025年第5期122-129,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1800202)
国家自然科学基金项目(32072844、31872497)。
文摘
本研究克隆鸡TRIM32(ChTRIM32)基因序列,分析其基因序列及其与不同物种TRIM32基因的同源性和遗传演化关系,预测其结构域及蛋白质二级结构,表达鸡TRIM32蛋白,并探究鸡TRIM32在天然免疫信号通路中的作用。试验结果表明:鸡TRIM32基因开放阅读框为1944 bp,编码647个氨基酸,其蛋白质分子质量约为71.84 kDa;鸡TRIM32蛋白包含1个N端RING-HC结构域、1个B-box1结构域和6个重复的C端NHL结构;鸡TRIM32与火鸡、美洲雕、天鹅、枭鹦、鸿雁、绿头鸭、野猪、人、家鼠、狗、水牛、斑马鱼TRIM32的氨基酸序列同源性分别为97.2%、92.6%、91.9%、91.7%、91.6%、88.8%、75.0%、74.8%、74.7%、74.2%、74.0%、63.9%;鸡TRIM32与其他鸟类TRIM32的亲缘关系最近,与哺乳动物TRIM32的亲缘关系较远,与鱼类TRIM32的亲缘关系最远;鸡TRIM32蛋白质二级结构包含无规则卷曲(38.64%)、α-螺旋(29.37%)、延伸链(22.87%)、β-转角(9.12%);构建pCAGGS-ChTRIM32真核表达质粒;H5N1亚型禽流感病毒(DK212株)感染DF1细胞后,鸡TRIM32基因及其他抗病毒基因(IFN-β、IL-6、OAS、Mx)表达水平上调;过表达鸡TRIM32能增强鸡STING对IFN-β启动子的激活作用。本文成功鉴定并克隆了鸡TRIM32基因,预测了鸡TRIM32蛋白的结构域与二级结构,并研究了鸡TRIM32在天然免疫信号通路中的功能,为进一步探究鸡TRIM32在鸡抗病毒天然免疫信号通路中的作用奠定了基础。
关键词
鸡trim32基因
序列分析
天然免疫信号通路
Keywords
Chicken
trim
32
gene
sequence analysis
innate immune signaling pathway
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
鸡TRIM32的序列分析及功能初步研究
黄心钰
张俊生
卢军
张淼湘
林宏文
黄小武
焦培荣
郭剑英
《中国动物传染病学报》
北大核心
2025
0
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