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基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系 被引量:6
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作者 张源真 王伟 +1 位作者 姜志强 张钊 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期89-95,共7页
通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统... 通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树。结果显示:在鳚亚目鱼类的16S rRNA片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有207 bp变异位点,转换/颠换值为0.8,碱基平均差异为3.36;支持绵鳚(Enchelyopus elongates)归于鳚亚目绵鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)归于鳚亚目线鳚科(Stichaeidae);方氏云鳚(Enedriasfangi)和云鳚(Enedrias nebulosus)种间遗传距离只有0.01,亲缘关系最近。 展开更多
关键词 亚目(blennioidei) 线粒体DNA 16S RRNA基因序列 系统发育
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中国鱼类名录 Ⅻ——鳚亚目、(鱼+衔)亚目、喉盘鱼亚目、鰕虎鱼亚目、微体鱼亚目、刺尾鱼亚目、带鱼亚目、鲭亚目、鲳亚目、金枪鱼亚目、攀鲈亚目、刺鳅亚目 被引量:4
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作者 李明德 罗阳 郭斌 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期64-70,共7页
鳚亚目 4 科 33 属 95 种,鰕虎鱼亚目 5 科 98 属 259 种,刺尾鱼亚目 5 科 11 属 65 种,鲈形目 19亚目 104 科 535 属 1799 种。
关键词 鱼类名录 分布 亚目 鰕虎鱼亚目 刺尾鱼亚目 中国
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中国鱼类名录XI——隆头鱼亚目、尤鰧鱼亚目、绵鳚亚目、玉筋鱼亚目 被引量:1
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作者 李明德 田新生 孙凯艳 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期70-76,共7页
隆头鱼亚目 5 科 63 属 316 种,鰧鱼亚目 8 科 19 属 53 种,绵鳚亚目 3 科 7 属 8 种,玉筋鱼亚目 1 科 3 属 3 种。
关键词 鱼类名录 分布 隆头鱼亚目 鰧鱼亚目 亚目 中国
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基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究 被引量:6
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作者 张源真 王伟 姜志强 《现代农业科技》 2012年第8期318-320,共3页
通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统... 通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树。结果表明:在鳚亚目鱼类的ITS-1片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有49 bp变异位点,转换/颠换值为1.0;3种鱼ITS-1长度为375~562 bp,其中方氏云鳚的最长,为532~562 bp,六线鳚的最短,为375 bp;锦鳚科的方氏云鳚和云鳚聚为一支;方氏云鳚和云鳚种间遗传距离只有0.02,亲缘关系最近。 展开更多
关键词 亚目 线粒体DNA ITS-1基因序列 系统发育
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