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基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究
被引量：
6
1
作者
张源真
王伟
姜志强
《现代农业科技》
2012年第8期318-320,共3页
通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法（MP）和邻接法（NJ）构建系统...
通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法（MP）和邻接法（NJ）构建系统发育树。结果表明：在鳚亚目鱼类的ITS-1片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有49 bp变异位点,转换/颠换值为1.0;3种鱼ITS-1长度为375~562 bp,其中方氏云鳚的最长,为532~562 bp,六线鳚的最短,为375 bp;锦鳚科的方氏云鳚和云鳚聚为一支;方氏云鳚和云鳚种间遗传距离只有0.02,亲缘关系最近。
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关键词
鳚亚目
线粒体DNA
ITS-1基因序列
系统发育
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题名
基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究
被引量：
6
1
作者
张源真
王伟
姜志强
机构
大连海洋大学
出处
《现代农业科技》
2012年第8期318-320,共3页
基金
辽宁省重大科技攻关项目(2008203002)
辽宁省教育厅计划(2009A175)
文摘
通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法（MP）和邻接法（NJ）构建系统发育树。结果表明：在鳚亚目鱼类的ITS-1片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有49 bp变异位点,转换/颠换值为1.0;3种鱼ITS-1长度为375~562 bp,其中方氏云鳚的最长,为532~562 bp,六线鳚的最短,为375 bp;锦鳚科的方氏云鳚和云鳚聚为一支;方氏云鳚和云鳚种间遗传距离只有0.02,亲缘关系最近。
关键词
鳚亚目
线粒体DNA
ITS-1基因序列
系统发育
Keywords
Blennioidei
mitochondrial DNA（mtDNA）
internal transcribed spacer 1（ITS-1）
molecular phylogeny
分类号
Q959.483 [生物学—动物学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究
张源真
王伟
姜志强
《现代农业科技》
2012
6
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