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基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯建模方法
1
作者
李婵
曲璐渲
+1 位作者
信俊昌
王之琼
《东北大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期323-330,共8页
为了解决目前用于构建基因调控网络的方法中所存在的网络构建准确率低、网络构建时间过长等问题,以及减小网络构建的复杂度,提高网络构建效率,提出了一种基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯网络建模方法(high-order dynamic Bayesian...
为了解决目前用于构建基因调控网络的方法中所存在的网络构建准确率低、网络构建时间过长等问题,以及减小网络构建的复杂度,提高网络构建效率,提出了一种基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯网络建模方法(high-order dynamic Bayesian network modeling method based on potential regulatory factor screening,PRS-HO-DBN).该方法将关联模型与高阶动态贝叶斯网络模型相结合,首先利用潜在调控因子筛选的方法在不同的时间延迟下删除与目标基因关联程度较低的基因,保留与目标基因关联程度较高的基因并作为目标基因的潜在调控因子集,以减小搜索空间;然后利用高阶动态贝叶斯模型进行结构学习,以提高网络构建的精确率.与其他的网络构建模型方法相比,该方法可以极大地缩短网络构建的时间,提升效率和精确度.
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关键词
基因调控
网络
潜在调控因子
高阶动态贝叶斯网络
关联模型
结构学习
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题名
基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯建模方法
1
作者
李婵
曲璐渲
信俊昌
王之琼
机构
东北大学医学与生物信息工程学院
东北大学计算机科学与工程学院
辽宁省大数据管理与分析重点实验室
出处
《东北大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期323-330,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(62072089)
中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(N2116016,N2104001,N2019007,N2224001-10).
文摘
为了解决目前用于构建基因调控网络的方法中所存在的网络构建准确率低、网络构建时间过长等问题,以及减小网络构建的复杂度,提高网络构建效率,提出了一种基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯网络建模方法(high-order dynamic Bayesian network modeling method based on potential regulatory factor screening,PRS-HO-DBN).该方法将关联模型与高阶动态贝叶斯网络模型相结合,首先利用潜在调控因子筛选的方法在不同的时间延迟下删除与目标基因关联程度较低的基因,保留与目标基因关联程度较高的基因并作为目标基因的潜在调控因子集,以减小搜索空间;然后利用高阶动态贝叶斯模型进行结构学习,以提高网络构建的精确率.与其他的网络构建模型方法相比,该方法可以极大地缩短网络构建的时间,提升效率和精确度.
关键词
基因调控
网络
潜在调控因子
高阶动态贝叶斯网络
关联模型
结构学习
Keywords
gene regulatory networks
potential regulatory factors
high-order dynamic Bayesian network
correlation model
structure learning
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于潜在调控因子筛选的高阶动态贝叶斯建模方法
李婵
曲璐渲
信俊昌
王之琼
《东北大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
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