基于形态学和高通量测序技术的巴里坤湖浮游生物多样性比较研究

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作者 刘昌财 韩家难 +3 位作者 王智超 王晨悦 史楠楠 穆罕默德·萨利姆·常 《塔里木大学学报》 2025年第5期9-18,共10页

高通量测序技术已广泛应用于淡水、海水等常见水体的生物多样性调查,但其在盐湖浮游生物多样性监测中的应用研究相对缺乏。本研究以新疆巴里坤湖为对象,联合应用高通量测序技术与形态学鉴定技术,对浮游生物多样性进行了比较分析。结果显... 高通量测序技术已广泛应用于淡水、海水等常见水体的生物多样性调查,但其在盐湖浮游生物多样性监测中的应用研究相对缺乏。本研究以新疆巴里坤湖为对象,联合应用高通量测序技术与形态学鉴定技术,对浮游生物多样性进行了比较分析。结果显示:两种方法总计鉴定出10门110属的浮游生物,其中共有鉴定7门14属。在蓝藻门(原核浮游生物)中,通过形态学特征鉴定的物种中66.67%可被16S rDNA测序可检出;而经16S rDNA测序所获得的物种中有89.66%无法依据形态学鉴定方法识别。对于真核浮游生物而言,仅有14.04%的形态学鉴定物种可被18S rDNA测序检出,而18S rDNA测序所获物种中无法通过形态学方法鉴定的占63.64%;但是两种方法在优势物种的鉴定上存在一致性。其中,在浮游生物分类组成和相对丰度鉴定中高通量测序技术具有明显的优势,鉴定效率高、成本低等优点,但也存在部分类群无法鉴定的情况;而形态学鉴定耗时且容易遗漏小型物种。因此,建议采用高通量测序技术与形态学鉴定相结合的方法全面准确地揭示盐湖浮游生物多样性。 展开更多

关键词 形态学鉴定 高通量测序技术 浮游生物 16S rDNA 18S rDNA

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基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用 被引量：1

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作者 张振超 陶美奇 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 王传友 安林海 戴忠良 《核农学报》 北大核心 2025年第3期513-521,I0003-I0005,共12页

为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表... 为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明,70组KASP标记中,未分型成功有3个,未分型材料>5份有13个,多态性差的有6个,分型成功48个(成功率68.6%)。48个标记中,多态性信息含量(PIC)值≥0.30的标记有37个(占比77.08%),其中PIC值为0.37的标记数量最多,为11个,0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据,获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现,Br05与其他材料的遗传关系较远;Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99,表明两两间为同一株系的可能性大,这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定,发现纯度值区间为83.3%~96.7%,说明Br19株系间存在差异;采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型,结果有5个标记(SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19)在三者间的分型结果不同,可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。 展开更多

关键词 高通量测序 竞争性等位基因特异性PCR 指纹图谱 纯度鉴定 分子标记

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高通量测序技术在低频突变检测中的应用 被引量：2

3

作者 栾洋 尤馨悦 杨劲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期126-139,共14页

体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的... 体细胞突变的累积与衰老、肿瘤及多种疾病的发生密切相关。在正常组织细胞中,基因组中自发突变和诱发突变的变异等位基因频率极低,对这类低频突变的检测一直面临挑战。第二代和第三代高通量测序(next-generation sequencing,NGS)技术的出现,可以实现任意物种全基因组上变异的直接检测,克服传统突变检测技术的诸多局限性。但是常规NGS由于测序错误率较高从而限制了其在低频突变检测上的应用,基于分子一致性测序策略进行错误矫正的高准确性NGS测序技术作为有效的低频突变检测工具,有望在环境诱变剂的评价与研究、细胞与基因治疗药物风险评估、人群健康风险监测和生命科学基础研究领域发挥重要作用。本文对比经典突变检测方法,对基于NGS的低频突变检测技术研究进展进行综述,并对应用前景进行展望,以期为该技术的进一步开发、研究和在相关领域的应用提供参考。 展开更多

关键词 高通量测序技术 低频突变 分子一致性测序 致突变 风险评估

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基于高通量测序技术挖掘分子遗传标记及其在蛋鸡生产中的精准应用 被引量：2

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作者 赵金波 谭磊 +7 位作者 潘洪彬 黄畅 刘永 王光正 豆腾飞 王坤 李子健 葛长荣 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第10期3866-3878,共13页

高通量测序技术是研究物种复杂生物性状遗传机制的基础,随着高通量测序技术的不断优化提升,一些与生物表型性状密切相关的基因组变异被精准地挖掘出来,其中包括单核苷酸多态位点(SNP)、小片段的插入或缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)以及... 高通量测序技术是研究物种复杂生物性状遗传机制的基础,随着高通量测序技术的不断优化提升,一些与生物表型性状密切相关的基因组变异被精准地挖掘出来,其中包括单核苷酸多态位点(SNP)、小片段的插入或缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)以及结构变异(SV)为代表的分子标记。与传统遗传标记相比较,分子遗传标记具有多态性高、遍布整个基因组、检测手段简单快捷以及成本低廉的特点。通过检测覆盖全基因组范围内的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体或群体遗传资源进行评估,能够缩短世代间隔、提高选种的准确性,进而在短期内取得较大的遗传进展。作者从高通量测序技术挖掘分子遗传标记角度入手,综述了三代测序技术发展历程和应用领域以及三代分子遗传标记检测技术在蛋鸡种业创新中的应用,并详细阐述了高通量测序技术与分子遗传标记相结合在蛋鸡群体遗传多样性及进化分类、群体遗传图谱的构建和功能基因定位、数量性状形成的遗传机制解析和质量性状形成的遗传机制解析等4个方面的精准应用,以期为蛋鸡基因组选择进入实质应用阶段提供科学依据和指导。 展开更多

关键词 高通量测序技术 分子遗传标记 蛋鸡生产 精准应用

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高通量技术在微生物培养中的应用进展及分子测序对比分析 被引量：7

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作者 刘莹 韩锰 +2 位作者 王文磊 马成玉 张沛 《安徽农业科学》 CAS 2020年第15期16-19,共4页

高通量技术是以微型生物反应器为操作平台,实现对生物细胞的分离培养和分子测序。通过着重分析几种实用型高通量技术在微生物分离培养及分子测序中的应用进展,发现微包埋技术在高通量试验中的研究及应用较为深入;而对不同环境菌样的分... 高通量技术是以微型生物反应器为操作平台,实现对生物细胞的分离培养和分子测序。通过着重分析几种实用型高通量技术在微生物分离培养及分子测序中的应用进展,发现微包埋技术在高通量试验中的研究及应用较为深入;而对不同环境菌样的分离培养中,海洋微生物方面的应用最为突出。另外,通过对比高通量分子测序技术可以发现,Illumina测序法的平均测序速度最快;单分子测序法所得数据的精确度最高,测序读长最长,周期相对最短。最后,对高通量技术在微生物学应用中的一些不足进行总结,并提出假设性解决方法。 展开更多

关键词 微生物 高通量技术 分离培养 分子测序

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基于单分子纳米孔测序技术揭示大白菜抽薹期全长转录组差异的复杂性

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作者 王树彬 张志刚 +5 位作者 王荣花 李巧云 王立华 胡新新 赵智中 刘栓桃 《山东农业科学》 北大核心 2024年第11期1-12,共12页

为了解春白菜抽薹相关转录组的结构和表达差异,采用单分子纳米孔测序技术对早抽薹材料He102与晚抽薹材料06-247带叶片的花序轴进行了全长转录组分析。与大白菜参考基因组V3.0比对后,He102与06-247分别得到了6051557条和4844987条有效读... 为了解春白菜抽薹相关转录组的结构和表达差异,采用单分子纳米孔测序技术对早抽薹材料He102与晚抽薹材料06-247带叶片的花序轴进行了全长转录组分析。与大白菜参考基因组V3.0比对后,He102与06-247分别得到了6051557条和4844987条有效读段以及37309条和30415条非冗余全长转录本。两材料中共鉴定到46485个非冗余基因,其中包括1688个新基因。从He102与06-247中分别鉴定出2421个和993个独有的可变剪切事件,内含子保留是最常见的可变剪切类型;分别鉴定到3286个和2646个独有的可变多聚酰胺酸位点。共筛选出453个lncRNA,80%以上的lncRNA属于基因间区非编码RNA,分别鉴定到81个和55个He102和06-247独有的lncRNA。在两材料中筛选到5197个差异表达基因,其中He102中上调的有2453个,下调的有2744个,结合功能富集分析获得了41个与抽薹有关的候选基因。本研究结果揭示了不同抽薹期大白菜材料转录组在结构和表达上存在复杂的差异,这为阐释大白菜抽薹分子机理提供了新的线索。 展开更多

关键词 第三代高通量测序技术 单分子纳米孔测序技术 大白菜 抽薹期 全长转录本

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高通量测序技术在产前遗传学诊断中的应用 被引量：4

7

作者 王亚平 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期806-808,共3页

受人类基因组计划的推动，2005年有多篇论文报道了一种有别于Sanger方法的高效测序新思路，后归纳为高通量测序（high-throughput sequencing，HTS），或称新一代测序（next-generation sequencing，NGS）技术。HTS的基本特征是大规模... 受人类基因组计划的推动，2005年有多篇论文报道了一种有别于Sanger方法的高效测序新思路，后归纳为高通量测序（high-throughput sequencing，HTS），或称新一代测序（next-generation sequencing，NGS）技术。HTS的基本特征是大规模并行测序，通过一次并行测定几十万甚至几亿条DNA分子序列，短时问内获悉巨量的遗传信息。十多年来，HTS技术平台不断出新、测序成本急速降低、应用范围迅疾扩大。高速发展的HTS技术不但给生命科学、医学理论和应用研究带来了重大机遇，也使出生缺陷的产前遗传学诊断迎来了一个新的技术时代。 展开更多

关键词 测序技术 遗传学诊断 高通量 应用 产前 人类基因组计划 HTS 分子序列

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基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析贵州水豆豉中细菌多样性 被引量：9

8

作者 邓高文 刘洋 +5 位作者 李跑 廖卢艳 尹含靓 蒋立文 覃业优 肖何 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第24期61-66,共6页

以不同生产阶段的贵州水豆豉为研究对象,利用Illumina MiSeq高通量测序技术,对贵州水豆豉自然发酵前后、调味后发酵3个阶段的细菌菌群结构及多样性进行研究,并对其优势菌进行分离鉴定。结果表明,3个样品共得到296063条有效数据,1124个... 以不同生产阶段的贵州水豆豉为研究对象,利用Illumina MiSeq高通量测序技术,对贵州水豆豉自然发酵前后、调味后发酵3个阶段的细菌菌群结构及多样性进行研究,并对其优势菌进行分离鉴定。结果表明,3个样品共得到296063条有效数据,1124个操作分类单元。在3个样品中共注释了6个门类,21个属类。在门水平上,随着发酵时间的延长,厚壁菌门(Firmicutes)丰度不断增加,变形菌门(Proteobacteria)不断减少。在属水平上,随着发酵时间的延长,芽孢杆菌属(Bacillus)丰度不断增加。后发酵24 h后(DCFW3),由于食盐、香辛料等抑菌成分的加入,细菌种类下降。此外,通过对贵州水豆豉中优势菌的分离纯化,利用VITEK MS全自动微生物质谱从贵州水豆豉中获得4株产蛋白酶较高的菌株,分别为枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌和蜡样芽孢杆菌。该研究为贵州水豆豉标准化和安全控制提供一定的参考依据。 展开更多

关键词 水豆豉 高通量测序技术 多样性 发酵阶段 菌种分离鉴定

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高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的应用 被引量：1

9

作者 康巧林 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期114-117,共4页

MicroRNA是一类广泛存在于动植物中长约21 nt的非编码小分子RNA,主要通过内切核苷酸或者翻译抑制调节基因转录后表达。植物MicroRNA在植物的生长发育、开花时序、新陈代谢及环境胁迫等方面起重要作用。简述了植物MicroRNA的生物发生、... MicroRNA是一类广泛存在于动植物中长约21 nt的非编码小分子RNA,主要通过内切核苷酸或者翻译抑制调节基因转录后表达。植物MicroRNA在植物的生长发育、开花时序、新陈代谢及环境胁迫等方面起重要作用。简述了植物MicroRNA的生物发生、作用机制及调控功能,并在此基础上综述了高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的最新应用进展。 展开更多

关键词 高通量测序技术 solexa 454-FLX 小分子RNA MIRNA

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高通量测序技术在法医学硅藻检验中的应用进展 被引量：2

10

作者 蔡杰 王博 +1 位作者 陈建华 邓建强 《法医学杂志》 CAS CSCD 2022年第1期20-30,共11页

硅藻检验是法医学水中尸体检验中鉴别生前溺水与死后抛尸、推断落水地点的重要手段,以硅藻DNA为主要研究对象的分子生物学技术成为硅藻检验的重要技术途径之一。近年来,高通量测序技术获得了较快发展,已被广泛应用于硅藻分类调查。本文... 硅藻检验是法医学水中尸体检验中鉴别生前溺水与死后抛尸、推断落水地点的重要手段,以硅藻DNA为主要研究对象的分子生物学技术成为硅藻检验的重要技术途径之一。近年来,高通量测序技术获得了较快发展,已被广泛应用于硅藻分类调查。本文对高通量测序技术及其在法医学硅藻检验中的研究和应用现状及前景进行综述。 展开更多

关键词 法医病理学 高通量测序 硅藻 溺死 分子种属鉴定 综述

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迎接高通量测序技术诊断儿童遗传性疾病的新时代

11

作者 夏凡 周文浩 王慧君 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2015年第1期1-3,共3页

周文浩教授非常荣幸能邀请到美国贝勒医学院夏凡教授来复旦大学附属儿科医院讲学,并就分子遗传诊断中心的工作给予非常具体的指导.复旦大学附属儿科医院分子诊断实验室已经开展100余项基因检测项目,应用Sanger测序、aCGH和MLPA等技术,... 周文浩教授非常荣幸能邀请到美国贝勒医学院夏凡教授来复旦大学附属儿科医院讲学,并就分子遗传诊断中心的工作给予非常具体的指导.复旦大学附属儿科医院分子诊断实验室已经开展100余项基因检测项目,应用Sanger测序、aCGH和MLPA等技术,建立了常见单基因遗传病的筛查和诊断平台,二代测序检测项目也初步展开. 展开更多

关键词 技术诊断 遗传性疾病 复旦大学附属儿科医院 测序 高通量 儿童 分子遗传诊断 单基因遗传病

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高通量测序技术及EST-SSR标记在蔬菜研究上的应用

12

作者 陈兴奎 《上海蔬菜》 2016年第1期79-81,共3页

高通量测序技术又称下一代测序技术（Next-generation sequencingtechnology ） ,1次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，与以往的测序技术相比，其特点是通量高、测序成本显著降低、测序时间显著缩短。

关键词 测序技术 高通量 SSR标记 应用 蔬菜 DNA分子 序列测定

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DNA测序技术的发展历史与最新进展 被引量：48

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作者 解增言 林俊华 +1 位作者 谭军 舒坤贤 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期64-70,共7页

DNA测序技术是现代分子生物学研究中最常用的技术。从1977年第一代测序技术的出现,经过30多年的发展,DNA测序技术取得重大进展,以高通量为特点的第二代测序技术逐步成熟并商业化,以单分子测序为特点的第三代测序技术也已经出现。介绍每... DNA测序技术是现代分子生物学研究中最常用的技术。从1977年第一代测序技术的出现,经过30多年的发展,DNA测序技术取得重大进展,以高通量为特点的第二代测序技术逐步成熟并商业化,以单分子测序为特点的第三代测序技术也已经出现。介绍每一代测序技术的特点,并重点介绍了第二代测序技术及其应用。展望新的测序技术对于未来生物学研究及人们自身健康与人类疾病等方面研究的影响。 展开更多

关键词 第一代DNA测序技术 第二代DNA测序技术 第三代DNA测序技术 高通量 单分子测序

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16S rDNA测序快速鉴定废水生物处理系统目标细菌 被引量：23

14

作者 李永峰 任南琪 +3 位作者 杨传平 陈瑛 郑国香 胡立杰 《哈尔滨工程大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期806-810,共5页

在废水生物处理系统中建立分子生物学技术快速鉴定有关微生物,具有十分重要的意义.以发酵法生物制氢系统的活性污泥分离培养的厌氧发酵细菌为研究对象,采用16S rDNA碱基测序分子生物学技术,通过生物信息学数据库NCBI将DNA序列输入、比对... 在废水生物处理系统中建立分子生物学技术快速鉴定有关微生物,具有十分重要的意义.以发酵法生物制氢系统的活性污泥分离培养的厌氧发酵细菌为研究对象,采用16S rDNA碱基测序分子生物学技术,通过生物信息学数据库NCBI将DNA序列输入、比对,可以直接鉴定从废水生物处理系统中分离培养的细菌进行种属科的系统发育学地位的判定,从而简化了细菌鉴定程序.通过16S rDNA测序技术,进行了分离产氢细菌的分子生物学鉴定,发现生物制氢厌氧活性污泥中所分离的细菌可能存在的菌属有:Lactobacillus,Clostridium,Klebsiella,Propionibacter-ium和可能新发现的1个新属Biohydrogenbacterium等5个菌属的菌种,其中新属Biohydrogenbacterium的菌种都以利用碳水化合物生产氢气为其主要特征.16S rDNA测序技术为废水生物处理系统的细菌学研究提供了方便、准确和经济的技术基础. 展开更多

关键词 废水生物处理 16S rDNA测序 目标细菌 生物信息学技术 分子鉴定

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测序技术的研究进展及三代测序的应用 被引量：14

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作者 乌日拉嘎 徐海燕 +3 位作者 冯淑贞 孙志宏 孟和毕力格 张和平 《中国乳品工业》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期33-37,共5页

简述了一代和高通量测序技术的基础上重点介绍以单分子实时测序为代表的第三代测序技术及其他的应用,并对单分子测序技术和未来发展方向进行展望。

关键词 Sanger测序技术 高通量测序技术 单分子测序技术 应用

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基于分子生物学原理技术检测肉制品中动物源性成分研究进展 被引量：9

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作者 易艳 刘明东 +5 位作者 蒋子敬 姜展樾 马丽侠 叶德萍 韩国全 周李华 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期288-294,共7页

肉制品掺假严重侵害消费者对食品质量安全的信任,影响食品行业的健康发展,已成为全球关注的焦点之一。该文综述当前应用较为广泛的基于分子生物学原理的检测技术的优缺点和应用场景,包括普通PCR定性检测、实时荧光PCR相对定量、数字PCR... 肉制品掺假严重侵害消费者对食品质量安全的信任,影响食品行业的健康发展,已成为全球关注的焦点之一。该文综述当前应用较为广泛的基于分子生物学原理的检测技术的优缺点和应用场景,包括普通PCR定性检测、实时荧光PCR相对定量、数字PCR绝对定量、环介导等温扩增快速检测、DNA条形码、高通量测序等新型分子检测技术,以期为政府监管部门及第三方检测机构的研究者提供参考。 展开更多

关键词 肉制品掺假 动物源性成分 分子生物学技术 高通量测序 PCR

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微生物资源分子鉴定技术的研究进展 被引量：8

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作者 张羽 马爱进 +3 位作者 高利芬 彭海 贾英民 孙宝国 《中国工程科学》 CSCD 北大核心 2021年第5期86-93,共8页

微生物作为全世界分布最广且拥有量最多的生物资源,应用领域广泛,具有突出的经济价值和社会价值。以往虽已有众多微生物研究,但限于技术方法无法深入展开,随着微生物检测技术的不断发展,为微生物研究提供了新途径和新方法。本文总结了... 微生物作为全世界分布最广且拥有量最多的生物资源,应用领域广泛,具有突出的经济价值和社会价值。以往虽已有众多微生物研究,但限于技术方法无法深入展开,随着微生物检测技术的不断发展,为微生物研究提供了新途径和新方法。本文总结了国内外微生物资源分子鉴定技术的发展及其应用情况,主要有脱氧核糖核酸(DNA)含量测定、核酸杂交技术、DNA指纹图谱技术、核酸扩增技术、基因芯片技术和高通量测序技术等;梳理了现有微生物资源分子鉴定技术的优缺点;分析了微生物资源分子鉴定技术存在的问题,如依赖于实验室环境,实验结果的重现性、准确性不足,缺乏相应的微生物数据库。为促进我国微生物资源的保护和利用,研究建议,要继续加强对各鉴定技术的研究,建立具有自主知识产权的微生物资源鉴定平台,完善微生物资源数据库等。 展开更多

关键词 微生物资源 分子鉴定 核酸扩增技术 基因芯片技术 高通量测序技术 微生物数据库

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全基因组测序在结核分枝杆菌研究中的应用 被引量：22

18

作者 张洁 任怡宣 +1 位作者 潘丽萍 张宗德 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第7期737-740,共4页

全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中,包括结核分枝杆菌谱系或亚种鉴定、区分患者的发病模式,以及识别传染源、超级传播者和确定传播方向,以及用于结核分枝杆菌的耐药性预测和微进化研究等,在临床和公共卫生领域发挥了... 全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中,包括结核分枝杆菌谱系或亚种鉴定、区分患者的发病模式,以及识别传染源、超级传播者和确定传播方向,以及用于结核分枝杆菌的耐药性预测和微进化研究等,在临床和公共卫生领域发挥了很重要的作用。即便如此,目前还存在很多问题需要解决。作者对全基因组测序技术在结核分枝杆菌研究中的相关内容、应用成果及进展进行综述。 展开更多

关键词 分枝杆菌 结核 全基因组关联研究 高通量核苷酸测序 分子诊断技术 综述

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RNA测序的研究进展 被引量：3

19

作者 王康宇 王义 +2 位作者 孙春玉 蒋世翠 张美萍 《江苏农业科学》 北大核心 2014年第10期12-16,共5页

RNA测序研究是基因功能及结构研究的基础,能够从整体水平研究基因功能及其结构。随着高通量测序和定量检测技术的不断发展,能够通过RNA测序对转录组进行更深度更完整的研究。该研究进展包括改善转录起始位点的预测、链特异性测序、融合... RNA测序研究是基因功能及结构研究的基础,能够从整体水平研究基因功能及其结构。随着高通量测序和定量检测技术的不断发展,能够通过RNA测序对转录组进行更深度更完整的研究。该研究进展包括改善转录起始位点的预测、链特异性测序、融合基因的检测、microRNA定量的分析以及RNA可变剪切的识别。目前利用单分子测序技术可以实现RNA的直接测序,通过二代测序技术与单分子测序技术相结合的方式,能更深层次、更全面地获得转录组信息。 展开更多

关键词 转录组信息 测序 高通量测序技术 单分子测序技术

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分子生物技术在厌氧氨氧化工艺研究中的应用 被引量：8

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作者 户海燕 瞿思宜 +2 位作者 张正哲 施曼玲 金仁村 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期20-26,43,共8页

厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation,anammox)工艺是一种高效低耗的新型废水生物脱氮工艺,具有广阔的应用前景。但迄今为止该工艺的主要承载者厌氧氨氧化菌未获得纯培物,因此传统的微生物学方法不足以研究其生物学特性。分子生物... 厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation,anammox)工艺是一种高效低耗的新型废水生物脱氮工艺,具有广阔的应用前景。但迄今为止该工艺的主要承载者厌氧氨氧化菌未获得纯培物,因此传统的微生物学方法不足以研究其生物学特性。分子生物技术的发展改变了传统的微生物学研究方法,其中,变性梯度凝胶电泳(DGGE)、荧光原位杂交(FISH)、实时荧光定量PCR(q PCR)、高通量测序和基因芯片技术脱颖而出。文章重点介绍了这些技术在氧氨氧化工艺研究中的应用,以及其主要的优点和缺点。将分子生物技术应用到厌氧氨氧化工艺研究中,对于全面认识厌氧氨氧化菌的性质、解析厌氧氨氧化工艺的微生物学机理、确保工艺的长期高效稳定运行具有重要意义。 展开更多

关键词 厌氧氨氧化工艺 分子生物技术 荧光原位杂交 实时荧光定量PCR 高通量测序 基因芯片

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