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轮状病毒VP4、VP7基因的克隆与核苷酸序列分析 被引量：9
1
作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期99-103,共5页
用反转录聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增 816bp、916bp的VP4、VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM_T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒... 用反转录聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增 816bp、916bp的VP4、VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM_T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT_V4、PT_V7中含有轮状病毒的VP4、VP7基因片段。经核苷酸序列分析 ,表明克隆了轮状病毒主要保护性抗原VP4。 展开更多
关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 基因克隆 VP4 VP7
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福建省肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)全基因组核苷酸序列分析 被引量：6
2
作者 陈炜 周朝晖 +7 位作者 沈晓娜 张拥军 谢剑锋 吴冰珊 王金章 翁育伟 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期14-18,共5页
目的了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异。方法对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进... 目的了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异。方法对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进化分析。结果 2010FJLY008株全长7 403bp,核苷酸及编码氨基酸序列同源性比较,均与08年阜阳流行株Fuyang17.08-2同源性最高,整个基因组核苷酸同源性为98.2%,氨基酸同源性为99.5%;全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析,与Fuyang17.08-2株进化关系较为接近,同属于C4a基因亚型。结论 2010年福建省EV71型病毒流行株(2010FJLY008)在病毒基因组结构、基因组核苷酸同源性比较、编码氨基酸同源性比较、全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析等方面,均与2008年阜阳流行株(Fuyang17.08-2)关系密切,未产生明显的抗原漂移及变异。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 全基因组 核苷酸序列分析
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鼻咽癌恶性转化基因Tx核苷酸序列分析 被引量：4
3
作者 任维 黎明 +3 位作者 夏林庆 翁新宪 廖伟 曹亚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期541-547,共7页
从人类鼻咽癌细胞系CNE2基因组DNA文库中克隆一个恶性转化基因Tx转染小鼠JB6 + 细胞 ,使细胞恶性转化 ,宿主细胞具有停泊非依赖生长的特性 .已经报道的Tx中一个 3 0kb片段(Tx3 0 )的序列分析结果表明 ,Tx包含人类免疫球蛋白κ轻链完整的... 从人类鼻咽癌细胞系CNE2基因组DNA文库中克隆一个恶性转化基因Tx转染小鼠JB6 + 细胞 ,使细胞恶性转化 ,宿主细胞具有停泊非依赖生长的特性 .已经报道的Tx中一个 3 0kb片段(Tx3 0 )的序列分析结果表明 ,Tx包含人类免疫球蛋白κ轻链完整的J区 .进一步对Tx全长进行亚克隆和测序 ,并采用生物信息学方法进行分析表明 ,Tx包含人类Igκ完整的J区、C区基因片段、还有 5个重组信号序列 ,1个核基质结合序列和 1个N segment的插入 .Tx与正常人IgκJ、C区比较只是在某些位点存在碱基的缺失、插入或置换 ,二者同源性高达 98% ,其电子定位于 2p11 2 ,这与人Igκ的染色体定位是一致的 .可以认为 。 展开更多
关键词 鼻咽癌 恶性转化基因 核苷酸序列分析 Igκ基因
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易变山羊草抗禾谷孢囊线虫基因中核苷酸结合位点区(NBS)的克隆及序列分析 被引量：7
4
作者 邓洪新 杨晓娟 +1 位作者 邓光兵 余懋群 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期751-755,共5页
大部分已克隆的植物抗病基因都包含有核苷酸结合位点区 (NBS)和富含亮氨酸的重复序列区 (LRR) .利用来自节节麦的抗禾谷孢囊线虫基因Cre3位点NBS区保守序列设计特异引物 ,从含有来自易变山羊草的抗禾谷孢囊线虫基因的小麦品系E 10的基... 大部分已克隆的植物抗病基因都包含有核苷酸结合位点区 (NBS)和富含亮氨酸的重复序列区 (LRR) .利用来自节节麦的抗禾谷孢囊线虫基因Cre3位点NBS区保守序列设计特异引物 ,从含有来自易变山羊草的抗禾谷孢囊线虫基因的小麦品系E 10的基因组中PCR扩增得到一条约 5 30bp的单一条带 .将扩增条带克隆和序列分析发现 ,该克隆 (Rccn4 )的编码区长 5 2 8bp ,含一个不完整的开放读码框 ,没有起始密码子、终止密码子和内含子结构 ,它编码一个 176个氨基酸残基的蛋白质 ,分子量为 2 0 4kD .Rccn4含有NBS LRR类抗病基因NBS区共有的保守模体I(V)LDD、T(T S)R、G(L S)PLA(A I L)、RCF(A L)Y ,并且与Cre3基因的NBS编码区核苷酸和氨基酸同源性分别为99 4 %和 98% . 展开更多
关键词 小麦品系E-10 抗禾谷孢囊线虫基因 核苷酸结合区 克隆 序列分析 易变山羊草 抗虫性
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口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析 被引量：2
5
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期496-500,共5页
以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸... 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 China/99P2区 核苷酸序列 比较分析
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马传染性贫血病病毒驴白细胞弱毒疫苗株前病毒全基因组核苷酸序列分析 被引量：2
6
作者 杨志彪 王柳 +2 位作者 童光志 孔宪刚 仇华吉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期161-166,共6页
马传染性贫血病病毒 (EIAV)是马传染性贫血病 (简称马传贫 ,EIA)的病原。我国的EIAV弱毒疫苗是迄今为止世界上唯一投入应用的慢病毒疫苗 ,成功地控制了我国EIA的流行。本研究从EIAV弱毒疫苗株 (DLA)感染的驴白细胞中提取前病毒DNA ,以... 马传染性贫血病病毒 (EIAV)是马传染性贫血病 (简称马传贫 ,EIA)的病原。我国的EIAV弱毒疫苗是迄今为止世界上唯一投入应用的慢病毒疫苗 ,成功地控制了我国EIA的流行。本研究从EIAV弱毒疫苗株 (DLA)感染的驴白细胞中提取前病毒DNA ,以提取的前病毒DNA为模板 ,利用PCR技术分 3个片段扩增EIAV前病毒 ,这 3个片段覆盖全部前病毒DNA。将这 3个片段分别克隆到载体质粒pBluescrtiptsK中 ,得到 3个重组质粒P2 .8,P2 .4,P4.1,经酶切鉴定后 ,测序。对测序结果分析、拼接 ,得到EIAV驴白细胞弱毒疫苗株前病毒基因组全序列。EIAVDLA株前病毒基因组全长 82 6 6bp。基因组两端是长为334bp的LTR ,其中U3为 2 14bp ,R为 81bp ,U5为 39bp。前病毒基因组有 3个较大的开放阅读框架 (ORF) ,分别编码gag、pol和env基因。gag基因位于 732～ 1931位碱基之间 ,全长 12 0 0bp ;pol基因位于 172 7～ 5 12 8位碱基之间 ,全长 34 0 2bp ;env基因位于5 32 4～ 7912之间 ,长为 2 5 89bp。此外前病毒还有 3个小的ORF ,S1位于 5 132～ 5 2 84位碱基之间 ,长为 15 3bp ;S2位于 5 2 98～ 5 5 0 1位碱基之间 ,长为 2 0 4bp ;S3位于 72 5 8～ 76 5 9位碱基之间 ,长为 40 2bp。本研究结果为进一步确定EIAV的基因功能、揭示马传贫疫苗毒的致弱? 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 驴白细胞弱母疫苗株 前病毒 核苷酸序列分析 基因组
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人源性噬菌体抗体库的构建及抗肺癌抗体基因的筛选、表达和核苷酸序列分析 被引量：1
7
作者 胡建林 郭先健 +3 位作者 胡义德 黄桂君 李淑平 陈维中 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期55-55,59,共2页
人源性噬菌体抗体库的构建及抗肺癌抗体基因的筛选、表达和核苷酸序列分析Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎｏｆｈｕｍａｎｐｈａｇｅａｎｔｉｂｏｄｙｌｉｂｒａｒｙａｎｄｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＤＮＡｓｅｇｕｅｎｃｉ... 人源性噬菌体抗体库的构建及抗肺癌抗体基因的筛选、表达和核苷酸序列分析Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎｏｆｈｕｍａｎｐｈａｇｅａｎｔｉｂｏｄｙｌｉｂｒａｒｙａｎｄｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＤＮＡｓｅｇｕｅｎｃｉｎｇｏｆａｎｔｉｂｏｄｉｅｓａｇａ... 展开更多
关键词 噬菌体抗体 人源性抗体 肺肿瘤 重组 核苷酸 序列分析
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猪水泡病病毒结构蛋白VP1基因的核苷酸序列分析 被引量：1
8
作者 龚振华 田相军 +2 位作者 刘俊辉 王玉东 蒋正军 《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第2期23-26,共4页
提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸... 提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸在89%和98 %之间。 展开更多
关键词 猪水泡病病毒 结构蛋白 VP1基因 核苷酸序列分析 猪 水泡病
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轮状病毒VP7基因的克隆及核苷酸序列分析 被引量：1
9
作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 2002年第2期87-90,共4页
用反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 916bp的VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT V7中含... 用反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 916bp的VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT V7中含有轮状病毒的VP7基因片段。经核苷酸序列分析 。 展开更多
关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 保护性抗原 VP7基因 基因克隆 PCR扩增 重组质粒 腹泻
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关于核苷酸序列频谱分析方法的探讨 被引量：1
10
作者 王宏漫 欧宗瑛 《信号处理》 CSCD 2002年第4期349-352,共4页
由A、T、C、G四种字符组成的核苷酸序列本质上是生物分子的一种符号表示。在计算生物学中,常采用离散傅立叶变换进行频谱分析。根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,本文提出采用调频Z变换的分析方法,定... 由A、T、C、G四种字符组成的核苷酸序列本质上是生物分子的一种符号表示。在计算生物学中,常采用离散傅立叶变换进行频谱分析。根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,本文提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。 展开更多
关键词 核苷酸序列 频谱分析 离散傅立叶变换 基因识别 信号处理 生物学
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轮状病毒VP4基因的克隆与核苷酸序列分析 被引量：7
11
作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《动物科学与动物医学》 2002年第5期25-28,共4页
用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质... 用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒 p T- V4中含有轮状病毒的 VP4基因片段。经核苷酸序列分析 ,表明克隆了轮状病毒主要保护性抗原 展开更多
关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 保护性抗原 VP4基因 基因克隆 RT-PCR 非细菌性腹泻 基因工程疫苗
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多浪羊IFN-γ基因克隆及核苷酸序列分析 被引量：1
12
作者 左文斌 潘辉 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第2期19-23,共5页
为了分析新疆多浪羊的IFN-γ基因,根据GenBank中NM_001009803的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IFN-γ基因序列。测序结果表明I,FN-γ基因序列包含了一个582 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Bla... 为了分析新疆多浪羊的IFN-γ基因,根据GenBank中NM_001009803的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IFN-γ基因序列。测序结果表明I,FN-γ基因序列包含了一个582 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,多浪羊的IFN-γ基因与普通绵羊的同源性高达99.82%,为多浪羊IFN-γ的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。 展开更多
关键词 多浪羊 IFN-Γ 基因克隆 核苷酸序列分析
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新疆卡拉库尔羊Fas基因的克隆及核苷酸序列分析 被引量：1
13
作者 潘辉 贺艳艳 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第2期14-18,共5页
为了分析新疆卡拉库尔羊的Fas基因,根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊Fas基因的cDNA序列。结果表明,Fas基因cDNA序列包含了一个750 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库... 为了分析新疆卡拉库尔羊的Fas基因,根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊Fas基因的cDNA序列。结果表明,Fas基因cDNA序列包含了一个750 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的Fas基因与普通绵羊的同源性高达99.69%。这为将来制备卡拉库尔羊Fas基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。 展开更多
关键词 卡拉库尔羊 FAS基因 核苷酸序列分析
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新疆甜菜坏死黄脉病毒RNA5的检测及核苷酸序列分析
14
作者 向本春 刘升学 +2 位作者 黄家风 席德慧 吴彩兰 《西北农业学报》 CAS CSCD 2003年第3期76-80,共5页
利用RT-PCR方法,对12个新疆不同地区的甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)分离物和美国的BN-TX及黑龙江的He分离物进行检测,结果表明,只有库尔勒地区的所有分离物和来自黑龙江的He分离物含有RNA5,其他地区的分离物未检测到RNA5。选K2和He分离物进... 利用RT-PCR方法,对12个新疆不同地区的甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)分离物和美国的BN-TX及黑龙江的He分离物进行检测,结果表明,只有库尔勒地区的所有分离物和来自黑龙江的He分离物含有RNA5,其他地区的分离物未检测到RNA5。选K2和He分离物进行序列分析,测得K2分离物长为1323 nt,He分离物长为1300 nt;与国内外报道的中国包头B分离物、呼和浩特H、日本的D5分离物和法国的F72分离物的RNA5序列相比,序列同源性K2为95.0％～96.8％,He为96.0％～99.3％,均含有一个开放阅读框(ORF),由此推导出的各分离物的氨基酸同源性,K2为93.0％～96.5％,He为96.5％～99.6％。其变异主要集中在富含A的区域。 展开更多
关键词 新疆 甜菜坏死黄脉病毒 RNA5 检测 核苷酸 序列分析
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一株新型散发型戊型肝炎病毒部分核苷酸序列测定与分析
15
作者 刘子玲 迟宝荣 +4 位作者 姚程 杨波 张静 韩西瑶 王秀丽 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期647-650,共4页
目的 :了解长春地区戊型肝炎病毒 ( HEV)株的变异程度。方法 :用逆转录 -套式 -聚合酶链反应方法从患者血清中获取病毒 ,用双脱氧终止法进行核苷酸序列分析。结果 :China Changchun-2 2 0 MC与日本株、猪的 HEV分离株 ( AF0 82 843)、... 目的 :了解长春地区戊型肝炎病毒 ( HEV)株的变异程度。方法 :用逆转录 -套式 -聚合酶链反应方法从患者血清中获取病毒 ,用双脱氧终止法进行核苷酸序列分析。结果 :China Changchun-2 2 0 MC与日本株、猪的 HEV分离株 ( AF0 82 843)、美国株 - 1 ( AF0 60 669)、墨西哥株 ( M745 0 6)、第四基因型 ( AJ2 72 1 0 8)、缅甸株 ( M732 1 8)、中国株 ( M941 77、D1 1 0 93、D1 1 0 92 )、尼泊尔株 ( AF0 5 1 830 )、巴基斯坦株 ( M80 5 81、AF1 85 82 2 )核苷酸同源性为 72 %～ 88% ,氨基酸同源性为 93%～ 97%。结论 :China Changchun- 2 2 0 MC株与其它 HEV株相比有较高的基因异质性 ,可能是一新型的 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 碱基序列 逆转录聚合酶链反应 双脱氧终止法 核苷酸序列分析
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2株O型口蹄疫病毒结构蛋白基因VP1的核苷酸序列分析 被引量：1
16
作者 宋敏 王淼 +2 位作者 王天仕 张丽 李黎 《上海畜牧兽医通讯》 2007年第1期32-33,共2页
关键词 O型口蹄疫病毒 核苷酸序列分析 结构蛋白基因 VP1 动物传染病 小核糖核酸 交叉免疫 血清型
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小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析
17
作者 葛艳 尤永进 +2 位作者 徐泉兴 陈谊 饶忠 《上海农业学报》 CSCD 2005年第2期11-15,共5页
通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主... 通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切。在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征。同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(MuscovyDuckParvovirus,MDPV)FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%。 展开更多
关键词 小鹅瘟病毒 开放性阅读框架 核苷酸序列分析 GPV-YG株 小鹅瘟
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保定地区HFRS流行高峰年中1株家鼠型病毒株的分离鉴定及其核苷酸序列分析
18
作者 陈宇萍 耿志洲 +2 位作者 武涌泉 王华 马晓红 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第4期71-73,共3页
目的　探讨保定地区 HFRS流行高峰的原因。方法　对 HFRS病人急性期血清用 RT- PCR方法进行病毒基因分型 ,从 1例家鼠型 (SEO型 )汉坦病毒感染的病人血清中分离病毒 ,并进行核苷酸序列测定。结果　 31例病人中 ,2例为姬鼠型(HTN型 ) ,2 ... 目的　探讨保定地区 HFRS流行高峰的原因。方法　对 HFRS病人急性期血清用 RT- PCR方法进行病毒基因分型 ,从 1例家鼠型 (SEO型 )汉坦病毒感染的病人血清中分离病毒 ,并进行核苷酸序列测定。结果　 31例病人中 ,2例为姬鼠型(HTN型 ) ,2 4例为家鼠型 (SEO型 ) ,1例 SEO型病毒经分离鉴定测序后与 SEOU L、R2 2 株进行比较 ,M基因核苷酸同源性分别为 :95 .15 %、93.94% ;氨基酸同源性均为 97.2 7%。结论　所分离 SEO型汉坦病毒为 1996年流行高峰年的主要流行株 ,未发现病毒基因片段的重排 ,流行不是由病毒基因重排引起。不同地区 SEO型病毒分子结构差异较小 。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 汉坦病毒 核苷酸 序列分析
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新疆卡拉库尔羊TNF-α基因的克隆及核苷酸序列分析
19
作者 贺艳艳 潘辉 +2 位作者 刘书东 左文斌 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第3期54-58,共5页
根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊肿瘤坏死因子-α基因的cDNA序列。结果表明,TNF-αcDNA序列包含了一个705 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的TNF-α基因与普通... 根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊肿瘤坏死因子-α基因的cDNA序列。结果表明,TNF-αcDNA序列包含了一个705 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的TNF-α基因与普通绵羊的同源性高达99.86%。这为将来制备卡拉库尔羊TNF-α基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。 展开更多
关键词 卡拉库尔羊 肿瘤坏死因子-Α 核苷酸序列分析
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DNA核苷酸碱基序列分析软件的编写和应用 被引量：3
20
作者 关敏 辜华良 +1 位作者 常雅萍 于永利 《白求恩医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期467-469,共3页
目的 :初步分析 DNA测序结果。方法 :采用 Visual Basic6 .0编程语言编写了 DNA碱基序列分析软件。结果 :此软件具备计数碱基、自动查找开放阅读框架 (open reading frame,ORF)、翻译氨基酸序列、查找酶切位点等主要功能。结论 :该软件... 目的 :初步分析 DNA测序结果。方法 :采用 Visual Basic6 .0编程语言编写了 DNA碱基序列分析软件。结果 :此软件具备计数碱基、自动查找开放阅读框架 (open reading frame,ORF)、翻译氨基酸序列、查找酶切位点等主要功能。结论 :该软件适用于初步分析 展开更多
关键词 DNA 碱基序列分析软件 开放阅读框架 核苷酸
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