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一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术
1
作者
林旻
杨绍华
+5 位作者
林艳
王月
胡太蛟
宋亚娜
潘雷博
陈在杰
《福建农业科技》
CAS
2023年第10期40-47,共8页
建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结...
建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA的质量。结果表明:96孔板结合磁珠法提取水稻种子切片的DNA质量和纯度优于TPS法提取水稻叶片的DNA质量;STARP标记检测验证结果显示96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA可适用于GS3、Wx的STARP标记基因分型,其鉴定结果与测序结果一致。研究显示96孔板结合磁珠法可以从微量水稻种子切片中提出高回收率、高纯度、高完整度、无PCR抑制物的DNA用于高通量STATP法基因单倍型分析,可获得一种96孔板结合磁珠法提取DNA的高通量基因分型操作流程。
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关键词
水稻种子切片
96孔板结合磁珠法
高通量基因分型
STARP技术
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职称材料
KASP标记技术在主要农作物中的应用及展望
被引量：
36
2
作者
杨青青
唐家琪
+2 位作者
张昌泉
高继平
刘巧泉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期58-71,共14页
随着基因测序技术的发展,植物基因组数据越来越丰富,其中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据由于具有高密度、高通量和易于自动化分析等特点而被广泛用于分子标记的开发和应用。竞争性等位基因特异性PCR(kompeti...
随着基因测序技术的发展,植物基因组数据越来越丰富,其中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据由于具有高密度、高通量和易于自动化分析等特点而被广泛用于分子标记的开发和应用。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术是近些年来发展起来的一种主要基于SNP的高通量基因分型技术。该技术由于其高通量、低成本和可操作性强等优点而在农作物性状改良等领域具有很大的应用潜力。本文介绍了KASP技术的发展、原理和方法步骤,综述了该技术在主要农作物的种质资源鉴定、分子标记辅助育种、基因定位和种子纯度鉴定等遗传育种中的应用,并讨论了该技术的优缺点,以期为今后农作物育种研究提供参考依据。
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关键词
KASP
高通量基因分型
遗传鉴定
分子育种
农艺性状改良
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职称材料
液相芯片技术在动物遗传育种中的应用与发展
3
作者
丁文家
魏大为
+4 位作者
杨尚
陈宁博
马云
雷初朝
黄永震
《中国畜禽种业》
2025年第8期33-41,共9页
液相芯片是一种用于高通量基因分型的技术,与基因组重测序和固相芯片相比,具有检测位点选择更加灵活、芯片开发和检测成本更低等优势,该技术基于多重PCR和探针杂交捕获2种不同的技术体系,可满足低、中、高不同SNP密度的基因型分型需求,...
液相芯片是一种用于高通量基因分型的技术,与基因组重测序和固相芯片相比,具有检测位点选择更加灵活、芯片开发和检测成本更低等优势,该技术基于多重PCR和探针杂交捕获2种不同的技术体系,可满足低、中、高不同SNP密度的基因型分型需求,已被广泛应用于家养动物(牛、羊、猪、鸡和家蚕等)种质资源鉴定、重要性状挖掘和品种选育改良等。该文综述和分析了液相芯片技术的原理、在家养动物中的研究进展,以及在应用实践中存在的问题与挑战,旨在为该技术的产业化应用和家养动物遗传育种研究提供有效的技术支撑。
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关键词
液相芯片
高通量基因分型
动物遗传育种
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职称材料
题名
一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术
1
作者
林旻
杨绍华
林艳
王月
胡太蛟
宋亚娜
潘雷博
陈在杰
机构
福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室
福建农林大学生命科学学院
出处
《福建农业科技》
CAS
2023年第10期40-47,共8页
基金
福建省科技计划公益类项目(2020R1027009)
福建省人民政府、中国农业科学院“5511”协同创新工程(XTCXGC2021002)。
文摘
建立一种高质量、低成本的水稻种子切片DNA制备方法,用于育种群体的高通量基因分型。通过对比TPS法提取水稻叶片DNA及96孔板结合磁珠法提取切片种子DNA的纯度和浓度,进一步采用STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)标记检测验证96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA的质量。结果表明:96孔板结合磁珠法提取水稻种子切片的DNA质量和纯度优于TPS法提取水稻叶片的DNA质量;STARP标记检测验证结果显示96孔板结合磁珠法提取水稻切片种子DNA可适用于GS3、Wx的STARP标记基因分型,其鉴定结果与测序结果一致。研究显示96孔板结合磁珠法可以从微量水稻种子切片中提出高回收率、高纯度、高完整度、无PCR抑制物的DNA用于高通量STATP法基因单倍型分析,可获得一种96孔板结合磁珠法提取DNA的高通量基因分型操作流程。
关键词
水稻种子切片
96孔板结合磁珠法
高通量基因分型
STARP技术
Keywords
Slices of rice seeds
Method of 96-well plates combined with magnetic beads
High-throughput genotyping
STARP(Semi-thermal asymmetric PCR)technology
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
KASP标记技术在主要农作物中的应用及展望
被引量：
36
2
作者
杨青青
唐家琪
张昌泉
高继平
刘巧泉
机构
植物功能基因组学教育部重点实验室江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心扬州大学农学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期58-71,共14页
基金
国家自然科学基金项目(31825019,31872860)
江苏省科技计划(JBGS(2021)001,CX(20)3004)。
文摘
随着基因测序技术的发展,植物基因组数据越来越丰富,其中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据由于具有高密度、高通量和易于自动化分析等特点而被广泛用于分子标记的开发和应用。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术是近些年来发展起来的一种主要基于SNP的高通量基因分型技术。该技术由于其高通量、低成本和可操作性强等优点而在农作物性状改良等领域具有很大的应用潜力。本文介绍了KASP技术的发展、原理和方法步骤,综述了该技术在主要农作物的种质资源鉴定、分子标记辅助育种、基因定位和种子纯度鉴定等遗传育种中的应用,并讨论了该技术的优缺点,以期为今后农作物育种研究提供参考依据。
关键词
KASP
高通量基因分型
遗传鉴定
分子育种
农艺性状改良
Keywords
KASP
high-throughput genotyping
genetic identification
molecular breeding
improvement of agronomic characters
分类号
S336 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
液相芯片技术在动物遗传育种中的应用与发展
3
作者
丁文家
魏大为
杨尚
陈宁博
马云
雷初朝
黄永震
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《中国畜禽种业》
2025年第8期33-41,共9页
基金
科技创新2030—重大项目(2023ZD040480206)
宁夏回族自治区重点研发计划(2024BBF01007)
+1 种基金
河南省农业科学院自主创新项目(2024ZC128)
国家现代农业产业技术体系(CARS-37)。
文摘
液相芯片是一种用于高通量基因分型的技术,与基因组重测序和固相芯片相比,具有检测位点选择更加灵活、芯片开发和检测成本更低等优势,该技术基于多重PCR和探针杂交捕获2种不同的技术体系,可满足低、中、高不同SNP密度的基因型分型需求,已被广泛应用于家养动物(牛、羊、猪、鸡和家蚕等)种质资源鉴定、重要性状挖掘和品种选育改良等。该文综述和分析了液相芯片技术的原理、在家养动物中的研究进展,以及在应用实践中存在的问题与挑战,旨在为该技术的产业化应用和家养动物遗传育种研究提供有效的技术支撑。
关键词
液相芯片
高通量基因分型
动物遗传育种
Keywords
Liquid phase chip
High-throughput genotyping
Animal genetics and breeding
分类号
S813.3 [农业科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种适用于高通量基因分型的水稻种子切片DNA制备技术
林旻
杨绍华
林艳
王月
胡太蛟
宋亚娜
潘雷博
陈在杰
《福建农业科技》
CAS
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
KASP标记技术在主要农作物中的应用及展望
杨青青
唐家琪
张昌泉
高继平
刘巧泉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
36
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
液相芯片技术在动物遗传育种中的应用与发展
丁文家
魏大为
杨尚
陈宁博
马云
雷初朝
黄永震
《中国畜禽种业》
2025
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职称材料
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