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高质量毕赤酵母基因组DNA提取方法比较
被引量：
14
1
作者
唐天乐
高炳淼
+1 位作者
长孙东亭
罗素兰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期196-199,共4页
旨在比较5种毕赤酵母基因组DNA的提取法,以便获得简便高效的提取高质量酵母基因组DNA的优化方法。分别使用蜗牛酶破壁法,超声波破碎法,液氮研磨法,Lyticase破壁法,试剂盒法提取毕赤酵母基因组DNA,然后进行DNA电泳检测以及紫外分光光度...
旨在比较5种毕赤酵母基因组DNA的提取法,以便获得简便高效的提取高质量酵母基因组DNA的优化方法。分别使用蜗牛酶破壁法,超声波破碎法,液氮研磨法,Lyticase破壁法,试剂盒法提取毕赤酵母基因组DNA,然后进行DNA电泳检测以及紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。结果显示,5种方法均能提取出酵母基因组DNA,而酶法所提取的酵母基因组DNA质量最好。由此证实,蜗牛酶法成本低、效果好,是理想的提取高质量酵母基因组DNA的方法,完全满足后续试验要求。
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关键词
毕赤酵母
高质量基因组
DNA
提取方法优化
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职称材料
基于33个遗传多样性水稻材料的泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异
被引量：
26
2
作者
钦鹏
陈薇兰
+1 位作者
王淏
李仕贵
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2021年第3期275-278,共4页
【目的】基因组结构变异(SV)和基因拷贝数变异(g CNV)是动植物中主要的遗传变异来源,全面准确地鉴定和分析SV和g CNV对挖掘优异等位基因、保障水稻粮食安全具有重要意义。【方法】利用长片段测序数据和基因组装方法(HERA),对31个具有遗...
【目的】基因组结构变异(SV)和基因拷贝数变异(g CNV)是动植物中主要的遗传变异来源,全面准确地鉴定和分析SV和g CNV对挖掘优异等位基因、保障水稻粮食安全具有重要意义。【方法】利用长片段测序数据和基因组装方法(HERA),对31个具有遗传多样性的水稻栽培稻进行了高质量基因组组装,结合日本晴和蜀恢498高质量基因组,进行了系统的基因组比较分析。【结果】共鉴定到171072个非冗余SVs和25549个g CNVs,其中82.8%的PAV未在先前基于短序列测序数据获得的PAV中鉴定到。利用非洲栽培稻CG14作为外群,对发生在亚洲栽培稻群体的SV(d SV)进行了推断,发现大多数d SV位于基因非编码区,以及泛基因组中50%(32668)基因上下游2 kbp区域在32个亚洲栽培稻种至少有一个d SV。进一步结合转录组数据分析发现SVs和g CNVs对调控基因表达量对具有重要作用。对SV形成机制分析发现,SV主要由TEI(转座子插入)和NHEJ(非同源末端连接)两种机制形成,但不同类型SV的主要形成机制有所不同。该研究还构建了水稻中首个图形基因组,结合674份材料的二代测序和叶片早衰数据,发现17.5%的SV与其附近SNP的连锁度非常低,GWAS分析发现一个与叶片早衰显著相关的位点只能被SV检测到。相关研究成果以"Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals hidden genomic variations"为题于2021年5月发表在国际期刊Cell。【结论】提供了一个高质量泛基因组水平的基因组变异资源,将促进水稻的功能基因组和进化生物学研究、优异基因资源发掘和水稻育种。
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关键词
水稻
泛
基因组
高质量基因组
结构性变异
基因
拷贝数变异
图形
基因组
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职称材料
我国苹果免套袋栽培技术研究进展
3
作者
牛军强
焦学艺
+2 位作者
杨泽华
尹晓宁
马明
《寒旱农业科学》
2025年第4期295-300,共6页
随着农村劳动力短缺的加剧,套袋苹果栽培成本日益攀升,而苹果价格低迷让套袋优势难以维持以及苹果套袋生产中存在诸多弊端,从而导致传统的苹果套袋技术已无法满足生产中的实际需求,因此苹果免套袋生产的“风口”正在形成,其将成为苹果...
随着农村劳动力短缺的加剧,套袋苹果栽培成本日益攀升,而苹果价格低迷让套袋优势难以维持以及苹果套袋生产中存在诸多弊端,从而导致传统的苹果套袋技术已无法满足生产中的实际需求,因此苹果免套袋生产的“风口”正在形成,其将成为苹果栽培发展的必然趋势。本文通过实地调研和对相关文献综合梳理,从苹果免套袋技术的重要性、栽培技术现状及存在的问题较为详尽地阐述我国苹果免套袋栽培技术研究进展,并对我国苹果免套袋栽培技术的未来发展进行了展望,对我国苹果免套袋栽培技术的研究和推广意义重大。
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关键词
苹果
免套袋
栽培技术
高质量基因组
保护膜剂
发展趋势
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职称材料
题名
高质量毕赤酵母基因组DNA提取方法比较
被引量：
14
1
作者
唐天乐
高炳淼
长孙东亭
罗素兰
机构
海南大学海洋学院热带生物资源教育部重点实验室海南大学生物技术实验中心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期196-199,共4页
基金
国家"863"计划(2007AA02Z114)
国家自然科学基金项目(30860368)
+2 种基金
重大新药创制国家科技重大专项课题项目(2009ZX09103-644)
海南大学创新团队项目(hd09xm02)
重点科研项目(hd09xm15)
文摘
旨在比较5种毕赤酵母基因组DNA的提取法,以便获得简便高效的提取高质量酵母基因组DNA的优化方法。分别使用蜗牛酶破壁法,超声波破碎法,液氮研磨法,Lyticase破壁法,试剂盒法提取毕赤酵母基因组DNA,然后进行DNA电泳检测以及紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。结果显示,5种方法均能提取出酵母基因组DNA,而酶法所提取的酵母基因组DNA质量最好。由此证实,蜗牛酶法成本低、效果好,是理想的提取高质量酵母基因组DNA的方法,完全满足后续试验要求。
关键词
毕赤酵母
高质量基因组
DNA
提取方法优化
Keywords
Pichia pastoris High quality genomic DNA Extraction method optimization
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于33个遗传多样性水稻材料的泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异
被引量：
26
2
作者
钦鹏
陈薇兰
王淏
李仕贵
机构
四川农业大学水稻研究所
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2021年第3期275-278,共4页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0100400)
国家自然科学基金重大研究计划集成项目(92035301)。
文摘
【目的】基因组结构变异(SV)和基因拷贝数变异(g CNV)是动植物中主要的遗传变异来源,全面准确地鉴定和分析SV和g CNV对挖掘优异等位基因、保障水稻粮食安全具有重要意义。【方法】利用长片段测序数据和基因组装方法(HERA),对31个具有遗传多样性的水稻栽培稻进行了高质量基因组组装,结合日本晴和蜀恢498高质量基因组,进行了系统的基因组比较分析。【结果】共鉴定到171072个非冗余SVs和25549个g CNVs,其中82.8%的PAV未在先前基于短序列测序数据获得的PAV中鉴定到。利用非洲栽培稻CG14作为外群,对发生在亚洲栽培稻群体的SV(d SV)进行了推断,发现大多数d SV位于基因非编码区,以及泛基因组中50%(32668)基因上下游2 kbp区域在32个亚洲栽培稻种至少有一个d SV。进一步结合转录组数据分析发现SVs和g CNVs对调控基因表达量对具有重要作用。对SV形成机制分析发现,SV主要由TEI(转座子插入)和NHEJ(非同源末端连接)两种机制形成,但不同类型SV的主要形成机制有所不同。该研究还构建了水稻中首个图形基因组,结合674份材料的二代测序和叶片早衰数据,发现17.5%的SV与其附近SNP的连锁度非常低,GWAS分析发现一个与叶片早衰显著相关的位点只能被SV检测到。相关研究成果以"Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals hidden genomic variations"为题于2021年5月发表在国际期刊Cell。【结论】提供了一个高质量泛基因组水平的基因组变异资源,将促进水稻的功能基因组和进化生物学研究、优异基因资源发掘和水稻育种。
关键词
水稻
泛
基因组
高质量基因组
结构性变异
基因
拷贝数变异
图形
基因组
Keywords
rice
pan-genome
high-quality genome
structural variation
gene copy number variation
graph-based genome
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
我国苹果免套袋栽培技术研究进展
3
作者
牛军强
焦学艺
杨泽华
尹晓宁
马明
机构
甘肃省农业科学院林果花卉研究所
兰州树木园
出处
《寒旱农业科学》
2025年第4期295-300,共6页
基金
甘肃省科技重大专项-农业类(23ZDNA001)
甘肃省重点研发项目(25YFNA002)。
文摘
随着农村劳动力短缺的加剧,套袋苹果栽培成本日益攀升,而苹果价格低迷让套袋优势难以维持以及苹果套袋生产中存在诸多弊端,从而导致传统的苹果套袋技术已无法满足生产中的实际需求,因此苹果免套袋生产的“风口”正在形成,其将成为苹果栽培发展的必然趋势。本文通过实地调研和对相关文献综合梳理,从苹果免套袋技术的重要性、栽培技术现状及存在的问题较为详尽地阐述我国苹果免套袋栽培技术研究进展,并对我国苹果免套袋栽培技术的未来发展进行了展望,对我国苹果免套袋栽培技术的研究和推广意义重大。
关键词
苹果
免套袋
栽培技术
高质量基因组
保护膜剂
发展趋势
Keywords
Apple
Bag-free
Cultivation technique
High-quality genomic
Protective film agent
Development trend
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高质量毕赤酵母基因组DNA提取方法比较
唐天乐
高炳淼
长孙东亭
罗素兰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于33个遗传多样性水稻材料的泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异
钦鹏
陈薇兰
王淏
李仕贵
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2021
26
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
我国苹果免套袋栽培技术研究进展
牛军强
焦学艺
杨泽华
尹晓宁
马明
《寒旱农业科学》
2025
0
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职称材料
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引证文献
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