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鞘翅目高级阶元分子系统学:研究现状及存在的问题
被引量:
4
1
作者
聂瑞娥
杨星科
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1055-1062,共8页
鞘翅目是世界上物种最丰富的类群,分为原鞘亚目(Archostemata Kolbe,1908)、藻食亚目(Myxophaga Crowson,1955)、肉食亚目(Adephaga Schellenberg,1806)和多食亚目(Polyphaga Emery,1886)。随着分子生物学的发展,分子系统学的技术被广...
鞘翅目是世界上物种最丰富的类群,分为原鞘亚目(Archostemata Kolbe,1908)、藻食亚目(Myxophaga Crowson,1955)、肉食亚目(Adephaga Schellenberg,1806)和多食亚目(Polyphaga Emery,1886)。随着分子生物学的发展,分子系统学的技术被广泛应用于鞘翅目系统学研究中。本文综述了鞘翅目高级阶元的分子系统学的研究进展及存在问题。基于分子生物学手段,分子分类学家提出了关于鞘翅目高级阶元分子系统学很多假说,分子分析结果支持鞘翅目的4个亚目各为单系,而亚目间的系统关系还不统一。基于分子手段对于亚目内的系统发育关系的研究也有了一定的进展,比如:分子系统学结果支持肉食亚目的水生类群和陆生类群分别为单系,水生类群为一次起源。目前,鞘翅目高级阶元分子系统学的研究还不够成熟和完善,主要表现为:材料选择有限且不均衡、基因数目和适合度不理想,以及一些关键节点研究的欠缺。
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关键词
鞘翅目
高级阶元
分子系统学
系统发育
分类系统
单系
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职称材料
天牛总科高级分类阶元系统发育关系的研究
被引量:
2
2
作者
王文凯
尹新明
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2002年第1期11-14,共4页
用支序分析法对天牛总科高级分类阶元进行了系统发育关系的研究 ,结果表明 :狭胸天牛亚科及锯天牛亚科为原始类群 ,瘦天牛与狭义的天牛科互为姐妹群 ,把瘦天牛亚科提升为瘦天牛科是正确的 。
关键词
天牛总科
系统发育
支序分析
高级
分类
阶
元
鞘翅目
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职称材料
基于核糖体DNA联合序列的天牛总科高阶元分子系统学研究
被引量:
2
3
作者
魏子涵
尹新明
+3 位作者
安世恒
苏丽娟
李京
张鸿飞
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期710-720,共11页
【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛...
【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛总科2科6亚科63种的分子进化系统。【结果】序列联合比对分析,最终得到1 404 bp的联合数据组,其中可变位点446个(32.0%),保守位点958(68.0%),转换/颠换的平均值(R值)为1.73。28S rDNA和18S rDNA以及联合序列的饱和度分析显示碱基突变未达到饱和,说明这些序列适合于分子进化树的构建。利用不同系统发育重建方法得到进化树具有相似拓扑结构,结果支持沟胫天牛亚科、花天牛亚科和天牛亚科为单系群,这与形态学分类结果相似;狭胸天牛独立成为亚科得到了支持。【结论】利用28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区联合序列成功构建出了天牛总科高阶元的系统发育树。研究表明联合序列分析是探讨天牛高阶元分类的有效的方法。
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关键词
天牛总科
高级阶元
核糖体DNA
18S
RDNA
分子系统发育
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职称材料
鞘翅目昆虫线粒体基因组研究进展
被引量:
20
4
作者
聂瑞娥
杨星科
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期860-868,共9页
鞘翅目(Coleoptera)是世界上最具多样性的类群,具有很高的生态和形态多样性,这些多样性吸引了很多进化生物学家和分类学家的关注。随着分子生物学的发展,分子生物学技术广泛应用于鞘翅目系统学的研究,但随着研究的深入,简单的分子片段...
鞘翅目(Coleoptera)是世界上最具多样性的类群,具有很高的生态和形态多样性,这些多样性吸引了很多进化生物学家和分类学家的关注。随着分子生物学的发展,分子生物学技术广泛应用于鞘翅目系统学的研究,但随着研究的深入,简单的分子片段已经不能满足研究的需求,需要发掘更新的分子标记。近年来,线粒体全基因组已经成为鞘翅目分子系统学研究中很重要的分子标记之一,并广泛地应用于鞘翅目昆虫各个阶元的研究中。本文就鞘翅目线粒体全基因组的概况、研究进展及存在问题进行了总结和讨论。目前,鞘翅目线粒体基因组的研究主要包括物种线粒体基因组组成与结构、分子系统学和分子进化等方面。线粒体基因组在解决系统发育和进化方面表现出了很多的优越性,然而也存在着一些缺点,如序列难获得、基因类型单一、各基因进化速率不同、应用较局限等。
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关键词
鞘翅目
分子系统学
线粒体全基因组
分子标记
分子进化
高级阶元
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职称材料
蚜虫与其初级内共生菌进化关系:假说及演化机理
被引量:
6
5
作者
黄晓磊
刘琳
乔格侠
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期582-588,共7页
蚜虫是半翅目(Hemiptera)中一类取食植物韧皮部汁液的昆虫,由于具有一些独特的生物学特征,是研究重要适应进化问题的理想模型。蚜虫体内存在一类专性的胞内共生菌Buchnera,对于蚜虫营养代谢和正常发育有重要贡献,被称为蚜虫的初级内共...
蚜虫是半翅目(Hemiptera)中一类取食植物韧皮部汁液的昆虫,由于具有一些独特的生物学特征,是研究重要适应进化问题的理想模型。蚜虫体内存在一类专性的胞内共生菌Buchnera,对于蚜虫营养代谢和正常发育有重要贡献,被称为蚜虫的初级内共生菌。蚜虫-Buchnera是研究共生关系的理想模型,两者系统发育格局的研究有助于理解生物间专性共生关系的演化。本文系统综述了两者在不同分类水平(高级阶元、低级阶元)上的系统发育关系研究。现有证据暗示:两者在低级阶元水平上具有系统发育一致性,而在高级阶元水平上可能没有平行演化关系,这些对早期研究提出的平行演化假说提出了质疑。在现有研究的基础上,本文建议从增加取样类群、增加基因数目和数据量、系统发育一致性检验等几个方面开展更深入的系统发育研究,并开展Buchnera的转移实验,从而检验Buchnera的横向转移及其基因在不同蚜虫支系中的进化速率一致性,以便更客观地揭示蚜虫-Buchnera的进化关系。
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关键词
BUCHNERA
胞内共生
平行演化
系统发育关系
高级阶元
横向转移
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职称材料
题名
鞘翅目高级阶元分子系统学:研究现状及存在的问题
被引量:
4
1
作者
聂瑞娥
杨星科
机构
中国科学院动物研究所
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1055-1062,共8页
基金
国家基金委特殊学科点项目课题(J1210002)
国家自然科学基金项目(30970393)
文摘
鞘翅目是世界上物种最丰富的类群,分为原鞘亚目(Archostemata Kolbe,1908)、藻食亚目(Myxophaga Crowson,1955)、肉食亚目(Adephaga Schellenberg,1806)和多食亚目(Polyphaga Emery,1886)。随着分子生物学的发展,分子系统学的技术被广泛应用于鞘翅目系统学研究中。本文综述了鞘翅目高级阶元的分子系统学的研究进展及存在问题。基于分子生物学手段,分子分类学家提出了关于鞘翅目高级阶元分子系统学很多假说,分子分析结果支持鞘翅目的4个亚目各为单系,而亚目间的系统关系还不统一。基于分子手段对于亚目内的系统发育关系的研究也有了一定的进展,比如:分子系统学结果支持肉食亚目的水生类群和陆生类群分别为单系,水生类群为一次起源。目前,鞘翅目高级阶元分子系统学的研究还不够成熟和完善,主要表现为:材料选择有限且不均衡、基因数目和适合度不理想,以及一些关键节点研究的欠缺。
关键词
鞘翅目
高级阶元
分子系统学
系统发育
分类系统
单系
Keywords
Coleoptera
higher category
molecular phylogenetics
phylogeny
classificationsystem
monophyly
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
天牛总科高级分类阶元系统发育关系的研究
被引量:
2
2
作者
王文凯
尹新明
机构
湖北农学院农学系
河南农业大学植物保护学院
出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2002年第1期11-14,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (S3 92 70 113 )
文摘
用支序分析法对天牛总科高级分类阶元进行了系统发育关系的研究 ,结果表明 :狭胸天牛亚科及锯天牛亚科为原始类群 ,瘦天牛与狭义的天牛科互为姐妹群 ,把瘦天牛亚科提升为瘦天牛科是正确的 。
关键词
天牛总科
系统发育
支序分析
高级
分类
阶
元
鞘翅目
Keywords
Cerambycoidea
phylogeny
cladistic analysis
分类号
Q969.511.1 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
基于核糖体DNA联合序列的天牛总科高阶元分子系统学研究
被引量:
2
3
作者
魏子涵
尹新明
安世恒
苏丽娟
李京
张鸿飞
机构
河南农业大学植物保护学院
河南农业大学生命科学学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期710-720,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31071961)
文摘
【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛总科2科6亚科63种的分子进化系统。【结果】序列联合比对分析,最终得到1 404 bp的联合数据组,其中可变位点446个(32.0%),保守位点958(68.0%),转换/颠换的平均值(R值)为1.73。28S rDNA和18S rDNA以及联合序列的饱和度分析显示碱基突变未达到饱和,说明这些序列适合于分子进化树的构建。利用不同系统发育重建方法得到进化树具有相似拓扑结构,结果支持沟胫天牛亚科、花天牛亚科和天牛亚科为单系群,这与形态学分类结果相似;狭胸天牛独立成为亚科得到了支持。【结论】利用28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区联合序列成功构建出了天牛总科高阶元的系统发育树。研究表明联合序列分析是探讨天牛高阶元分类的有效的方法。
关键词
天牛总科
高级阶元
核糖体DNA
18S
RDNA
分子系统发育
Keywords
Cerambycoidea
higher taxa
ribosomal DNA
18 S rDNA
28 S rDNA
molecular phylogeny
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
鞘翅目昆虫线粒体基因组研究进展
被引量:
20
4
作者
聂瑞娥
杨星科
机构
中国科学院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期860-868,共9页
基金
国家自然科学基金项目(3130190)
国家基金委特殊学科点项目(J1210002)
文摘
鞘翅目(Coleoptera)是世界上最具多样性的类群,具有很高的生态和形态多样性,这些多样性吸引了很多进化生物学家和分类学家的关注。随着分子生物学的发展,分子生物学技术广泛应用于鞘翅目系统学的研究,但随着研究的深入,简单的分子片段已经不能满足研究的需求,需要发掘更新的分子标记。近年来,线粒体全基因组已经成为鞘翅目分子系统学研究中很重要的分子标记之一,并广泛地应用于鞘翅目昆虫各个阶元的研究中。本文就鞘翅目线粒体全基因组的概况、研究进展及存在问题进行了总结和讨论。目前,鞘翅目线粒体基因组的研究主要包括物种线粒体基因组组成与结构、分子系统学和分子进化等方面。线粒体基因组在解决系统发育和进化方面表现出了很多的优越性,然而也存在着一些缺点,如序列难获得、基因类型单一、各基因进化速率不同、应用较局限等。
关键词
鞘翅目
分子系统学
线粒体全基因组
分子标记
分子进化
高级阶元
Keywords
Coleoptera
molecular phylogenetics
mitochondrial genome
molecular marker
molecular evolution
higher categories
分类号
Q964 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
蚜虫与其初级内共生菌进化关系:假说及演化机理
被引量:
6
5
作者
黄晓磊
刘琳
乔格侠
机构
中国科学院动物研究所
中国科学院研究生院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期582-588,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30830017,30900133)
国家杰出青年科学基金(31025024)
+1 种基金
国家基础科学人才培养基金(NSFC-J0930004)
中国科学院动物进化与系统学重点实验室开放课题(O529YX5105)
文摘
蚜虫是半翅目(Hemiptera)中一类取食植物韧皮部汁液的昆虫,由于具有一些独特的生物学特征,是研究重要适应进化问题的理想模型。蚜虫体内存在一类专性的胞内共生菌Buchnera,对于蚜虫营养代谢和正常发育有重要贡献,被称为蚜虫的初级内共生菌。蚜虫-Buchnera是研究共生关系的理想模型,两者系统发育格局的研究有助于理解生物间专性共生关系的演化。本文系统综述了两者在不同分类水平(高级阶元、低级阶元)上的系统发育关系研究。现有证据暗示:两者在低级阶元水平上具有系统发育一致性,而在高级阶元水平上可能没有平行演化关系,这些对早期研究提出的平行演化假说提出了质疑。在现有研究的基础上,本文建议从增加取样类群、增加基因数目和数据量、系统发育一致性检验等几个方面开展更深入的系统发育研究,并开展Buchnera的转移实验,从而检验Buchnera的横向转移及其基因在不同蚜虫支系中的进化速率一致性,以便更客观地揭示蚜虫-Buchnera的进化关系。
关键词
BUCHNERA
胞内共生
平行演化
系统发育关系
高级阶元
横向转移
Keywords
Buchnera
endosymbiosis
parallel evolution
phylogenetic relationship
higher taxonomic level
horizontal transfer
分类号
Q968 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鞘翅目高级阶元分子系统学:研究现状及存在的问题
聂瑞娥
杨星科
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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职称材料
2
天牛总科高级分类阶元系统发育关系的研究
王文凯
尹新明
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2002
2
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职称材料
3
基于核糖体DNA联合序列的天牛总科高阶元分子系统学研究
魏子涵
尹新明
安世恒
苏丽娟
李京
张鸿飞
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
鞘翅目昆虫线粒体基因组研究进展
聂瑞娥
杨星科
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
20
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
蚜虫与其初级内共生菌进化关系:假说及演化机理
黄晓磊
刘琳
乔格侠
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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