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SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究
被引量：
2
1
作者
陈彦涛
罗钟琳
丁建东
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003年第8期1406-1409,共4页
以粗粒化的多肽链模型进行了 SARS病毒包膜中 E蛋白的计算机模拟 ,描述了该蛋白质空间构象的概貌 .首先扩展了多肽链的 HP模型 ,使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 ,并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 .相关...
以粗粒化的多肽链模型进行了 SARS病毒包膜中 E蛋白的计算机模拟 ,描述了该蛋白质空间构象的概貌 .首先扩展了多肽链的 HP模型 ,使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 ,并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 .相关格子链的 Monte Carlo模拟显示了很高的计算效率 .模拟再现了蛋白质的 coil-globule转变 ,验证了蛋白质序列分布的重要性 .结果表明 ,在水环境中 ,E蛋白质空间结构由紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 ;在脂环境中 ,中部疏水片段会成为向外延伸的环 ,而当两侧紧致的亲水片段分开时 ,则形成桥 .
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关键词
SARS病毒
E蛋白
计算机模拟
蛋白质折叠
高分子构象统计
生物信息学
非典型肺炎
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职称材料
题名
SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究
被引量：
2
1
作者
陈彦涛
罗钟琳
丁建东
机构
复旦大学高分子科学系
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003年第8期1406-1409,共4页
基金
国家自然科学基金 (批准号 :2 982 5 10 9
2 0 1740 0 6 )
+3 种基金
高等学校青年教师教学和科研奖励基金
国家"九七三"项目 (批准号 :G19990 5 430 6 -0 3)
"八六三"项目 (批准号 :2 0 0 1AA2 15 45 1)
上海市科技发展基金 (批准号 :0 2 DZ110 10 )资助
文摘
以粗粒化的多肽链模型进行了 SARS病毒包膜中 E蛋白的计算机模拟 ,描述了该蛋白质空间构象的概貌 .首先扩展了多肽链的 HP模型 ,使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 ,并且考虑了全部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 .相关格子链的 Monte Carlo模拟显示了很高的计算效率 .模拟再现了蛋白质的 coil-globule转变 ,验证了蛋白质序列分布的重要性 .结果表明 ,在水环境中 ,E蛋白质空间结构由紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 ;在脂环境中 ,中部疏水片段会成为向外延伸的环 ,而当两侧紧致的亲水片段分开时 ,则形成桥 .
关键词
SARS病毒
E蛋白
计算机模拟
蛋白质折叠
高分子构象统计
生物信息学
非典型肺炎
Keywords
Protein folding
Computer simulation
Macromolecular conformation statistics
SARS coronavirus
Bioinformatics
分类号
R563.1 [医药卫生—呼吸系统]
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SARS病毒E蛋白的计算机模拟的初步研究
陈彦涛
罗钟琳
丁建东
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
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