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盐角草高亲和钾离子转运蛋白SeHKT1基因的克隆及表达分析
被引量：
6
1
作者
马金彪
张大勇
+3 位作者
张梅茹
肖薪龙
张选
李丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期159-165,共7页
利用RACR技术从盐生植物盐角草中克隆Se HKT1基因,Gen Bank登录号为KP739261,用生物信息学方法对获得的基因序列进行分析,利用q RT-PCR方法研究Se HKT1基因在不同组织和不同盐胁迫下的表达特性。结果表明,该基因c DNA序列含有1个1 761 b...
利用RACR技术从盐生植物盐角草中克隆Se HKT1基因,Gen Bank登录号为KP739261,用生物信息学方法对获得的基因序列进行分析,利用q RT-PCR方法研究Se HKT1基因在不同组织和不同盐胁迫下的表达特性。结果表明,该基因c DNA序列含有1个1 761 bp的完整ORF,编码550个氨基酸,Blast分析表明该蛋白与毕氏海篷子Sb HKT1蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明Se HKT1基因在Na Cl处理下地上部和地下部均诱导上调表达,主要在盐角草根部表达,在地上部表达相对较低,200mmol/L Na Cl处理6 h后在根部表达量达到最高,随后逐渐降低;在钾饥饿条件下,该基因在根部和地上部的相对表达量均高于对照。说明Se HKT1不仅能响应N a Cl胁迫,还能在缺钾条件下提高表达,发挥高亲和钾离子载体功能。
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关键词
盐角草
高亲和钾离子转运体
RACE
基因表达
耐盐性
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职称材料
商陆PaHAK1与拟南芥HAK/KUP/KT家族基因的比较分析
被引量：
2
2
作者
谭鹏
邓雯韬
+2 位作者
田宇
苏益
蔺万煌
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期490-495,共6页
为探明商陆高亲和性K+转运体基因(Pa HAK1)的结构、功能及商陆耐低钾的原因,分析比较了商陆Pa HAK1和拟南芥HAK/KUP/KT家族基因中15个基因编码的高亲和性钾离子转运体氨基酸序列、蛋白质结构及其理化性质。结果表明:HAK基因家族编码蛋...
为探明商陆高亲和性K+转运体基因(Pa HAK1)的结构、功能及商陆耐低钾的原因,分析比较了商陆Pa HAK1和拟南芥HAK/KUP/KT家族基因中15个基因编码的高亲和性钾离子转运体氨基酸序列、蛋白质结构及其理化性质。结果表明:HAK基因家族编码蛋白均定位于细胞膜上,含有多个跨膜结构且跨膜结构域是蛋白质的保守结构域;Pa HAK1与At KUP3的跨膜结构十分相似,低钾胁迫下Pa HAK1和At KUP3的高表达与其高亲和钾转运吸收功能密切相关。系统进化树分析结果表明,Pa HAK1与拟南芥HAK基因家族中At KUP8亲缘关系最近,其氨基酸序列相似度为76.98%,推测Pa HAK1还可能通过维持细胞内高水平钾量在水分胁迫下发挥重要的调节作用。
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关键词
商陆
拟南芥
PaHAK1
HAK/KUP/KT
高
亲和
性
钾
离子
转运体
生物信息学分析
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职称材料
题名
盐角草高亲和钾离子转运蛋白SeHKT1基因的克隆及表达分析
被引量：
6
1
作者
马金彪
张大勇
张梅茹
肖薪龙
张选
李丽
机构
中国科学院新疆生态与地理研究所干旱区生物地理与生物资源重点实验室
上海市能源作物育种及应用重点实验室
江苏省农业科学院农业生物技术研究所省农业生物学重点实验室
中国科学院大学
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期159-165,共7页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2011211B47)
中国科学院“西部之光”人才培养计划“西部博士资助项目”(XBBS-201201)
上海市能源作物育种及应用重点实验室开放课题(201204)
文摘
利用RACR技术从盐生植物盐角草中克隆Se HKT1基因,Gen Bank登录号为KP739261,用生物信息学方法对获得的基因序列进行分析,利用q RT-PCR方法研究Se HKT1基因在不同组织和不同盐胁迫下的表达特性。结果表明,该基因c DNA序列含有1个1 761 bp的完整ORF,编码550个氨基酸,Blast分析表明该蛋白与毕氏海篷子Sb HKT1蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明Se HKT1基因在Na Cl处理下地上部和地下部均诱导上调表达,主要在盐角草根部表达,在地上部表达相对较低,200mmol/L Na Cl处理6 h后在根部表达量达到最高,随后逐渐降低;在钾饥饿条件下,该基因在根部和地上部的相对表达量均高于对照。说明Se HKT1不仅能响应N a Cl胁迫,还能在缺钾条件下提高表达,发挥高亲和钾离子载体功能。
关键词
盐角草
高亲和钾离子转运体
RACE
基因表达
耐盐性
Keywords
Salicornia europaea
high-affinity potassium transporter
RACE
gene expression
salt-tolerance
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
商陆PaHAK1与拟南芥HAK/KUP/KT家族基因的比较分析
被引量：
2
2
作者
谭鹏
邓雯韬
田宇
苏益
蔺万煌
机构
湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室
南方粮油作物协同创新中心
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期490-495,共6页
基金
湖南省教育厅高校创新平台开放基金资助项目(15K061)
文摘
为探明商陆高亲和性K+转运体基因(Pa HAK1)的结构、功能及商陆耐低钾的原因,分析比较了商陆Pa HAK1和拟南芥HAK/KUP/KT家族基因中15个基因编码的高亲和性钾离子转运体氨基酸序列、蛋白质结构及其理化性质。结果表明:HAK基因家族编码蛋白均定位于细胞膜上,含有多个跨膜结构且跨膜结构域是蛋白质的保守结构域;Pa HAK1与At KUP3的跨膜结构十分相似,低钾胁迫下Pa HAK1和At KUP3的高表达与其高亲和钾转运吸收功能密切相关。系统进化树分析结果表明,Pa HAK1与拟南芥HAK基因家族中At KUP8亲缘关系最近,其氨基酸序列相似度为76.98%,推测Pa HAK1还可能通过维持细胞内高水平钾量在水分胁迫下发挥重要的调节作用。
关键词
商陆
拟南芥
PaHAK1
HAK/KUP/KT
高
亲和
性
钾
离子
转运体
生物信息学分析
Keywords
Phytolacca acinosa Roxb
Arabidopsis thaliana
PaHAK1
HAK/KUP/KT
high-affinity K＋ transporter
bioinformatics analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐角草高亲和钾离子转运蛋白SeHKT1基因的克隆及表达分析
马金彪
张大勇
张梅茹
肖薪龙
张选
李丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
商陆PaHAK1与拟南芥HAK/KUP/KT家族基因的比较分析
谭鹏
邓雯韬
田宇
苏益
蔺万煌
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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