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花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
王娟
石大川
+9 位作者
陈皓宁
吴丽青
闫彩霞
陈静
赵小波
孙全喜
苑翠玲
牟艺菲
单世华
李春娟
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期316-323,共8页
氮素利用效率(nitrogen utilization efficiency,NUE)是影响花生产量的重要因素之一。基于前期产量相关性状全基因组关联分析锚定到的一个候选基因,属于花生高亲和硝酸盐转运蛋白(nitrate transporter 2,NRT2)基因家族。本研究利用栽培...
氮素利用效率(nitrogen utilization efficiency,NUE)是影响花生产量的重要因素之一。基于前期产量相关性状全基因组关联分析锚定到的一个候选基因,属于花生高亲和硝酸盐转运蛋白(nitrate transporter 2,NRT2)基因家族。本研究利用栽培种花生全基因组和不同组织的转录组信息,对NRT2家族成员进行了全基因组鉴定与表达模式分析。共鉴定到10个NRT2基因家族成员,染色体定位分析结果显示这些基因不均匀地分布在20条染色体上。其中,3号(AhNRT2.5c)和13号(AhNRT2.5b)染色体,6号(AhNRT2.7b)和16号(AhNRT2.7a)染色体上的基因成员存在同源关系。AhNRT2.4,AhNRT2.5a,AhNRT2.5b和AhNRT2.5c四个基因在根组织中表达量较高,表明这些NRT2基因在根系中发挥重要作用。该结果为进一步研究花生NRT2基因家族及在氮转运过程中的作用机制提供了理论依据。
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关键词
栽培种花生
高亲和硝酸转运蛋白
基因功能鉴定
表达模式分析
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职称材料
植物吸收硝态氮的分子生物学进展
被引量：
23
2
作者
童依平
蔡超
+2 位作者
刘全友
李继云
李振声
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期433-440,共8页
植物吸收NO-3分为高亲和力(HATS,high affinitynitratetransportsystem)和低亲和力(LATS,low affinitynitratetransportsystem)转运系统。这两个系统的编码基因均已被克隆,其中HATS由NRT2基因家族和NAR2基因家族共同编码,LATS由NRT1基...
植物吸收NO-3分为高亲和力(HATS,high affinitynitratetransportsystem)和低亲和力(LATS,low affinitynitratetransportsystem)转运系统。这两个系统的编码基因均已被克隆,其中HATS由NRT2基因家族和NAR2基因家族共同编码,LATS由NRT1基因家族编码。本文比较详细地介绍了这些转运蛋白的结构和功能以及在这方面的最新进展,概要性地介绍了这些基因的表达调控;同时摘要点评了该研究领域中还没有解决的一些问题。
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关键词
高
等植物
硝酸
根
高
亲和
力
硝酸
根
转运
蛋白
低
亲和
力
硝酸
根
转运
蛋白
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职称材料
木薯MeNRT2.5基因的克隆及表达分析
被引量：
5
3
作者
任宁
陈秀珍
+3 位作者
夏幽泉
白雪杨
江行玉
周扬
《热带生物学报》
2019年第2期111-118,共8页
木薯具有高产、耐旱、耐贫瘠等特点,为了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以30 d龄的“华南8号”组培苗为实验材料,采用同源克隆技术获得1个高亲和性硝酸根转运蛋白基因NRT2。生物信息学分析结果表明,该基因...
木薯具有高产、耐旱、耐贫瘠等特点,为了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以30 d龄的“华南8号”组培苗为实验材料,采用同源克隆技术获得1个高亲和性硝酸根转运蛋白基因NRT2。生物信息学分析结果表明,该基因开放阅读框全长1 479 bp,编码492个氨基酸,命名为MeNRT2.5。MeNRT2.5蛋白有10个跨膜区域,与橡胶树、油桐树、可可树等物种的NRT2.5蛋白具有较高的同源性,其氨基酸序列相似性分别为94%,89.84%,87.40%。半质量RT-PCR结果表明,MeNRT2.5基因在根、茎、叶、花等各个器官均有表达,在成熟木薯植株的根中和组培苗的叶中表达量较高。实时荧光定量RT-PCR分析表明,MeNRT2.5在低浓度NO 3^-(0.3 mmol·L^-1)处理后,其在根中的表达量在6 h时达到峰值;高浓度NO 3^-(3 mmol·L^-1)处理后,其表达量在根茎叶中均没有明显变化,即该基因的表达被高浓度NO 3^-所抑制。该研究结果为进一步分析MeNRT2.5在木薯中的功能验证奠定理论基础。
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关键词
木薯
高
亲和
性
硝酸
根
转运
蛋白
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
王娟
石大川
陈皓宁
吴丽青
闫彩霞
陈静
赵小波
孙全喜
苑翠玲
牟艺菲
单世华
李春娟
机构
山东省花生研究所
山东省青岛市农业科学研究院
中国海洋大学食品科学与工程学院
山东省菏泽市农业科学研究院
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期316-323,共8页
基金
山东省自然科学基金面上项目(ZR2021MC124)
山东省产业体系(SDAIT-04-02)
+1 种基金
泰山学者特聘专家(ts201712080)
国家自然科学基金(31800164)。
文摘
氮素利用效率(nitrogen utilization efficiency,NUE)是影响花生产量的重要因素之一。基于前期产量相关性状全基因组关联分析锚定到的一个候选基因,属于花生高亲和硝酸盐转运蛋白(nitrate transporter 2,NRT2)基因家族。本研究利用栽培种花生全基因组和不同组织的转录组信息,对NRT2家族成员进行了全基因组鉴定与表达模式分析。共鉴定到10个NRT2基因家族成员,染色体定位分析结果显示这些基因不均匀地分布在20条染色体上。其中,3号(AhNRT2.5c)和13号(AhNRT2.5b)染色体,6号(AhNRT2.7b)和16号(AhNRT2.7a)染色体上的基因成员存在同源关系。AhNRT2.4,AhNRT2.5a,AhNRT2.5b和AhNRT2.5c四个基因在根组织中表达量较高,表明这些NRT2基因在根系中发挥重要作用。该结果为进一步研究花生NRT2基因家族及在氮转运过程中的作用机制提供了理论依据。
关键词
栽培种花生
高亲和硝酸转运蛋白
基因功能鉴定
表达模式分析
Keywords
peanut
high-affinity nitrate transporter
gene functional characterization
expression pattern
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
植物吸收硝态氮的分子生物学进展
被引量：
23
2
作者
童依平
蔡超
刘全友
李继云
李振声
机构
中国科学院生态环境研究中心
中国科学院遗传与发育生物学研究所
出处
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期433-440,共8页
基金
国家重点基础研究发展规划项目(1998010205)
国家自然科学基金重大项目(30390080)资助。
文摘
植物吸收NO-3分为高亲和力(HATS,high affinitynitratetransportsystem)和低亲和力(LATS,low affinitynitratetransportsystem)转运系统。这两个系统的编码基因均已被克隆,其中HATS由NRT2基因家族和NAR2基因家族共同编码,LATS由NRT1基因家族编码。本文比较详细地介绍了这些转运蛋白的结构和功能以及在这方面的最新进展,概要性地介绍了这些基因的表达调控;同时摘要点评了该研究领域中还没有解决的一些问题。
关键词
高
等植物
硝酸
根
高
亲和
力
硝酸
根
转运
蛋白
低
亲和
力
硝酸
根
转运
蛋白
Keywords
higher plants
nitrate
high-affinity nitrate transporter
low-affinity nitrate transporter
分类号
Q945 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
木薯MeNRT2.5基因的克隆及表达分析
被引量：
5
3
作者
任宁
陈秀珍
夏幽泉
白雪杨
江行玉
周扬
机构
海南大学热带农林学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室
出处
《热带生物学报》
2019年第2期111-118,共8页
基金
国家自然科学基金(31660253)
海南大学科研团队项目(hdkytg201706)
+1 种基金
海南大学科研启动项目(KYQD(ZR)1845)
海南省重大科技计划项目(HNGDhs201502)
文摘
木薯具有高产、耐旱、耐贫瘠等特点,为了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以30 d龄的“华南8号”组培苗为实验材料,采用同源克隆技术获得1个高亲和性硝酸根转运蛋白基因NRT2。生物信息学分析结果表明,该基因开放阅读框全长1 479 bp,编码492个氨基酸,命名为MeNRT2.5。MeNRT2.5蛋白有10个跨膜区域,与橡胶树、油桐树、可可树等物种的NRT2.5蛋白具有较高的同源性,其氨基酸序列相似性分别为94%,89.84%,87.40%。半质量RT-PCR结果表明,MeNRT2.5基因在根、茎、叶、花等各个器官均有表达,在成熟木薯植株的根中和组培苗的叶中表达量较高。实时荧光定量RT-PCR分析表明,MeNRT2.5在低浓度NO 3^-(0.3 mmol·L^-1)处理后,其在根中的表达量在6 h时达到峰值;高浓度NO 3^-(3 mmol·L^-1)处理后,其表达量在根茎叶中均没有明显变化,即该基因的表达被高浓度NO 3^-所抑制。该研究结果为进一步分析MeNRT2.5在木薯中的功能验证奠定理论基础。
关键词
木薯
高
亲和
性
硝酸
根
转运
蛋白
基因克隆
表达分析
Keywords
Cassava
high affinity nitrate transporter
gene cloning
expression analysis
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析
王娟
石大川
陈皓宁
吴丽青
闫彩霞
陈静
赵小波
孙全喜
苑翠玲
牟艺菲
单世华
李春娟
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
植物吸收硝态氮的分子生物学进展
童依平
蔡超
刘全友
李继云
李振声
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
23
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
木薯MeNRT2.5基因的克隆及表达分析
任宁
陈秀珍
夏幽泉
白雪杨
江行玉
周扬
《热带生物学报》
2019
5
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职称材料
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