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山羊SKIP基因的分离、鉴定及与生长性状的关联分析
被引量：
1
1
作者
熊琪
张年
+5 位作者
李小姗
李晓锋
索效军
杨前平
陶虎
陈明新
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期83-88,共6页
为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast...
为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast比较和系统发育树的构建,发现山羊SKIP与绵羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息学分析SKIP蛋白的理化性质,预测SKIP蛋白分子质量为52ku,等电点为5.18,包含典型的疏水区域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶结构域,定位在细胞质(60.9%)和细胞核(26.1%)中。间接免疫荧光试验验证了SKIP的细胞定位,并发现位于细胞核中的SKIP在成肌细胞分化过程中转移到细胞质。通过波尔山羊和麻城黑山羊的DNA混池测序,发现SKIP内含子2有一处G/A突变,利用PCRRFLP方法对波尔×麻城黑山羊F2代杂交后代进行基因分型,性状关联分析发现该单核苷酸多态性位点(SNP)与出生体质量、胸围、管围、身高等性状显著相关,等位基因G与生长呈正相关。
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关键词
单核苷酸多态性位点
山羊
骨骼肌和肾脏富集的肌醇磷酸酶
生长性状
成肌分化
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职称材料
题名
山羊SKIP基因的分离、鉴定及与生长性状的关联分析
被引量：
1
1
作者
熊琪
张年
李小姗
李晓锋
索效军
杨前平
陶虎
陈明新
机构
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室
华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/农业部猪遗传育种重点开放实验室/生猪健康养殖协同创新中心
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期83-88,共6页
基金
国家自然科学基金青年项目(31402051)
文摘
为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast比较和系统发育树的构建,发现山羊SKIP与绵羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息学分析SKIP蛋白的理化性质,预测SKIP蛋白分子质量为52ku,等电点为5.18,包含典型的疏水区域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶结构域,定位在细胞质(60.9%)和细胞核(26.1%)中。间接免疫荧光试验验证了SKIP的细胞定位,并发现位于细胞核中的SKIP在成肌细胞分化过程中转移到细胞质。通过波尔山羊和麻城黑山羊的DNA混池测序,发现SKIP内含子2有一处G/A突变,利用PCRRFLP方法对波尔×麻城黑山羊F2代杂交后代进行基因分型,性状关联分析发现该单核苷酸多态性位点(SNP)与出生体质量、胸围、管围、身高等性状显著相关,等位基因G与生长呈正相关。
关键词
单核苷酸多态性位点
山羊
骨骼肌和肾脏富集的肌醇磷酸酶
生长性状
成肌分化
Keywords
single nucleotide polymorphism
goat
SKIP
growth trait
myoblast differentiation
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山羊SKIP基因的分离、鉴定及与生长性状的关联分析
熊琪
张年
李小姗
李晓锋
索效军
杨前平
陶虎
陈明新
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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