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高通量测序分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响
被引量：
5
1
作者
张丽芳
李艳琼
+5 位作者
蔡建
高秀
徐晴芳
刘威良
杨卫星
胡海林
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期936-941,共6页
【目的】分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响。【方法】通过高通量测序技术、土壤性质测定及生物信息学技术分析感染根结线虫马铃薯和健康马铃薯根际土壤真菌群落多样性差异。【结果】从6个土壤样品中共获得3界12门34纲7...
【目的】分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响。【方法】通过高通量测序技术、土壤性质测定及生物信息学技术分析感染根结线虫马铃薯和健康马铃薯根际土壤真菌群落多样性差异。【结果】从6个土壤样品中共获得3界12门34纲77目171科332属526种的土壤真菌。对物种多样性指数分析后,发现感染根结线虫马铃薯病株与健康马铃薯植株的根际土壤真菌群落多样性和土壤性质均存在显著性差异。对6个样品进行物种组成分析后,在门水平中,感病植株根际土壤真菌Basidiomycota丰度较健康植株根际土壤真菌丰度高,Ascomycota丰度低于健康植株根际土壤;在科水平中,病株根际土壤丰度较高的菌群有Nectriaceae和Trimorphomycetaceae;在属水平中,健康植株根际土壤丰度较高的菌群为镰刀菌属Fusarium、被孢霉属Mortierella和未知分类毛壳菌科属unclassified_f_Chaetomiaceae。【结论】感染根结线虫的马铃薯与健康马铃薯根际土壤真菌群落丰度在门、科和属水平上均存在差异,为进一步研究马铃薯根结线虫的发生和防治提供了新的思路。
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关键词
根
结线虫
马铃薯根际土壤
土壤
性质
高通量测序
真菌多样性
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职称材料
发生马铃薯立枯病土壤中立枯丝核菌的荧光定量PCR快速检测
被引量：
29
2
作者
李瑞琴
刘星
+5 位作者
邱慧珍
张文明
张春红
王蒂
张俊莲
沈其荣
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期136-144,共9页
连作马铃薯根际土壤中立枯丝核菌的大量累积可能是导致马铃薯连作障碍发生的主要原因之一。为了解根际土壤中土传病害病原菌的积累与连作障碍之间的关系,进一步寻求缓解和克服马铃薯连作障碍土传病害的有效途径,本研究建立优化了荧光定...
连作马铃薯根际土壤中立枯丝核菌的大量累积可能是导致马铃薯连作障碍发生的主要原因之一。为了解根际土壤中土传病害病原菌的积累与连作障碍之间的关系,进一步寻求缓解和克服马铃薯连作障碍土传病害的有效途径,本研究建立优化了荧光定量PCR（real-time PCR）方法,对引起马铃薯立枯病的病原菌立枯丝核菌进行了快速监测和绝对定量,对马铃薯连作1~5年根际土壤立枯丝核菌的动态变化趋势进行了检测分析。结果显示,研究建立优化的荧光定量PCR检测方法,可直接应用土壤DNA进行病原菌的定量检测,能检测到土壤中浓度为1×102个拷贝/g土的马铃薯立枯丝核菌,扩增效率为1.04,具有检出限低、扩增效率高的特点,实现了不通过病土分离培养方法,就可掌握病原菌在根际土壤中的累积状况;在马铃薯立枯病发病严重的连作根际土壤中,立枯丝核菌的累积数量随连作年限的递增呈上升趋势;病原菌的累积随生育进程的推进呈下降趋势;病原菌累积量最大的是连作5年的播前土壤,每g土壤达3.75×107个拷贝数,由此可见,连作导致了土壤微生物种群结构发生改变,土壤致病真菌数量增加,相应地也增加了马铃薯立枯病的初侵染机率。
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关键词
连作
马铃薯根际土壤
立枯丝核菌
实时荧光定量PCR
动态变化趋势
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职称材料
题名
高通量测序分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响
被引量：
5
1
作者
张丽芳
李艳琼
蔡建
高秀
徐晴芳
刘威良
杨卫星
胡海林
机构
曲靖师范学院云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心
昆明学院农学与生命科学学院
曲靖师范学院数学与统计学院
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期936-941,共6页
基金
云南省科技计划计划青年项目(2018FD080)
曲靖师范学院青年项目(2019QN002)。
文摘
【目的】分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响。【方法】通过高通量测序技术、土壤性质测定及生物信息学技术分析感染根结线虫马铃薯和健康马铃薯根际土壤真菌群落多样性差异。【结果】从6个土壤样品中共获得3界12门34纲77目171科332属526种的土壤真菌。对物种多样性指数分析后,发现感染根结线虫马铃薯病株与健康马铃薯植株的根际土壤真菌群落多样性和土壤性质均存在显著性差异。对6个样品进行物种组成分析后,在门水平中,感病植株根际土壤真菌Basidiomycota丰度较健康植株根际土壤真菌丰度高,Ascomycota丰度低于健康植株根际土壤;在科水平中,病株根际土壤丰度较高的菌群有Nectriaceae和Trimorphomycetaceae;在属水平中,健康植株根际土壤丰度较高的菌群为镰刀菌属Fusarium、被孢霉属Mortierella和未知分类毛壳菌科属unclassified_f_Chaetomiaceae。【结论】感染根结线虫的马铃薯与健康马铃薯根际土壤真菌群落丰度在门、科和属水平上均存在差异,为进一步研究马铃薯根结线虫的发生和防治提供了新的思路。
关键词
根
结线虫
马铃薯根际土壤
土壤
性质
高通量测序
真菌多样性
Keywords
Root-knot nematodes
potato rhizosphere soils
soil properties
high throughout sequencing technology
fungi diversity
分类号
S154 [农业科学—土壤学]
S532 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
发生马铃薯立枯病土壤中立枯丝核菌的荧光定量PCR快速检测
被引量：
29
2
作者
李瑞琴
刘星
邱慧珍
张文明
张春红
王蒂
张俊莲
沈其荣
机构
甘肃农业大学资源与环境学院
甘肃省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所
甘肃省干旱生境作物学重点实验室
甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室
甘肃农业大学农学院
南京农业大学资源与环境学院
出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期136-144,共9页
基金
农业部公益性行业(农业)科研专项(201103004)
甘肃省科技重大专项(1102NKDM025)
国家科技支撑计划(2012BAD06B03)资助
文摘
连作马铃薯根际土壤中立枯丝核菌的大量累积可能是导致马铃薯连作障碍发生的主要原因之一。为了解根际土壤中土传病害病原菌的积累与连作障碍之间的关系,进一步寻求缓解和克服马铃薯连作障碍土传病害的有效途径,本研究建立优化了荧光定量PCR（real-time PCR）方法,对引起马铃薯立枯病的病原菌立枯丝核菌进行了快速监测和绝对定量,对马铃薯连作1~5年根际土壤立枯丝核菌的动态变化趋势进行了检测分析。结果显示,研究建立优化的荧光定量PCR检测方法,可直接应用土壤DNA进行病原菌的定量检测,能检测到土壤中浓度为1×102个拷贝/g土的马铃薯立枯丝核菌,扩增效率为1.04,具有检出限低、扩增效率高的特点,实现了不通过病土分离培养方法,就可掌握病原菌在根际土壤中的累积状况;在马铃薯立枯病发病严重的连作根际土壤中,立枯丝核菌的累积数量随连作年限的递增呈上升趋势;病原菌的累积随生育进程的推进呈下降趋势;病原菌累积量最大的是连作5年的播前土壤,每g土壤达3.75×107个拷贝数,由此可见,连作导致了土壤微生物种群结构发生改变,土壤致病真菌数量增加,相应地也增加了马铃薯立枯病的初侵染机率。
关键词
连作
马铃薯根际土壤
立枯丝核菌
实时荧光定量PCR
动态变化趋势
Keywords
rhizosphere soil of continuously cropped potato
Rhizoctonia solani
Real-time PCR
dynamicchanging trend
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量测序分析根结线虫对马铃薯根际土壤真菌群落多样性的影响
张丽芳
李艳琼
蔡建
高秀
徐晴芳
刘威良
杨卫星
胡海林
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
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职称材料
2
发生马铃薯立枯病土壤中立枯丝核菌的荧光定量PCR快速检测
李瑞琴
刘星
邱慧珍
张文明
张春红
王蒂
张俊莲
沈其荣
《草业学报》
CSCD
北大核心
2013
29
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