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马氏和半马氏反应系统中的噪声效果分析
1
作者
曹文洁
滕嘉琪
+1 位作者
陈浩文
周天寿
《中山大学学报（自然科学版）（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期291-300,共10页
基因调控网、信号转导网、代谢控制网和蛋白质相互网等生物分子网络是计算系统生物学的主要研究对象.从随机过程的观点,这些网络可以划分为马氏反应网和非马氏反应网,依赖于分子机制的实验测定.另一方面,由于生化反应事件是随机发生的,...
基因调控网、信号转导网、代谢控制网和蛋白质相互网等生物分子网络是计算系统生物学的主要研究对象.从随机过程的观点,这些网络可以划分为马氏反应网和非马氏反应网,依赖于分子机制的实验测定.另一方面,由于生化反应事件是随机发生的,这必然会导致反应物种水平的涨落(即生化反应系统是固有噪声的).这种分子噪声可能在自然选择、细胞命运决定、细胞内部过程等起着重要作用.一个未完全解决的问题是分子噪声的生物学功能是什么.本文分别分析地导出一般的马氏生化网络和一般的半马氏生化网络中分子噪声对各个反应物种水平影响的计算公式,并对一般的朗之万方程,建立了小噪声影响系统平衡态和特征值的两个实用定理.此外,以广义生灭过程作为一个例子,分析地显示出分子记忆的效果等同于反馈的引入.本文的分析结果既有宽广的应用前景,也为基于实验数据的统计推断奠定了基础.
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关键词
马氏反应网络
半
马氏反应网络
分子噪声
化学主方程
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职称材料
题名
马氏和半马氏反应系统中的噪声效果分析
1
作者
曹文洁
滕嘉琪
陈浩文
周天寿
机构
中山大学数学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期291-300,共10页
基金
国家自然科学基金(11931019,62373384)
国家重点研发计划(2021YFA1302500)。
文摘
基因调控网、信号转导网、代谢控制网和蛋白质相互网等生物分子网络是计算系统生物学的主要研究对象.从随机过程的观点,这些网络可以划分为马氏反应网和非马氏反应网,依赖于分子机制的实验测定.另一方面,由于生化反应事件是随机发生的,这必然会导致反应物种水平的涨落(即生化反应系统是固有噪声的).这种分子噪声可能在自然选择、细胞命运决定、细胞内部过程等起着重要作用.一个未完全解决的问题是分子噪声的生物学功能是什么.本文分别分析地导出一般的马氏生化网络和一般的半马氏生化网络中分子噪声对各个反应物种水平影响的计算公式,并对一般的朗之万方程,建立了小噪声影响系统平衡态和特征值的两个实用定理.此外,以广义生灭过程作为一个例子,分析地显示出分子记忆的效果等同于反馈的引入.本文的分析结果既有宽广的应用前景,也为基于实验数据的统计推断奠定了基础.
关键词
马氏反应网络
半
马氏反应网络
分子噪声
化学主方程
Keywords
Markov reaction network
semi-Markov reaction
molecular noise
chemical master equation
分类号
O29 [理学—应用数学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马氏和半马氏反应系统中的噪声效果分析
曹文洁
滕嘉琪
陈浩文
周天寿
《中山大学学报（自然科学版）（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
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