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香叶基香叶基焦磷酸合成酶在肺鳞状细胞癌中的表达及临床意义: 1; 作者王鑫王晓霞 +5 位作者李彦庆郑永鑫乌杰任猛贾向东许天祥《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-324,共13页; 目的·利用生物信息学和免疫组织化学法探究在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)组织中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase 1,GGPS1)的表达及其临床意义。方法·首先从UCSC Xena平... 展开更多; 关键词香叶基香叶基焦磷酸合成酶肺鳞状细胞癌生物信息学免疫组织化学临床意义; 在线阅读下载PDF 职称材料

红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析被引量：7: 2; 作者兰小中孙敏《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2006年第4期537-543,共7页; 20碳单位的香叶基香叶基焦磷酸是紫杉醇生物合成的直接前体,它由香叶基香叶基焦磷酸合成酶催化生成。采用RT-PCR技术从高原植物西藏红豆杉中克隆了编码香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因,命名为TwGGPPS(Gen- Bank登录号:DQ 364604)。该基因... 展开更多; 关键词西藏红豆杉紫杉醇香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆生物信息学分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

急性呼吸窘迫综合征患者香叶基香叶基焦磷酸合成酶的表达及其临床意义被引量：2: 3; 作者王晓霞许天祥 +3 位作者吕镗烽胥武剑刘建波宋勇《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期639-645,共7页; 目的·通过检测急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)患者外周血单个核细胞中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase,GGPPS)的表达情况,研究GGPPS在ARDS诊治中的临床意义。方法&#... 展开更多; 关键词急性呼吸窘迫综合征香叶基香叶基焦磷酸合成酶预后生物标志物; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于关键节点代谢流重排提高酿酒酵母的香叶基香叶醇产量被引量：2: 4; 作者吴伟鹏于洪巍 +3 位作者叶丽丹周萍萍姚震边旗《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期877-884,共8页; 香叶基香叶醇(geranylgeraniol,GGOH)是生产香料、药物、维生素A和E的重要中间体,其生物活性构型为(E,E,E)-GGOH。为了提高酿酒酵母的(E,E,E)-GGOH产量,在表达了香叶基香叶基焦磷酸合酶-法尼基焦磷酸合酶融合酶(BTS1-DPP1)和香叶基香叶... 展开更多; 关键词香叶基香叶醇代谢调控顺序表达葡萄糖响应香叶基香叶基焦磷酸合酶; 在线阅读下载PDF 职称材料

丹参SmGGPPS3基因的克隆及表达分析被引量：19: 5; 作者化文平宋双红 +1 位作者智媛王喆之《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期50-57,共8页; 香叶基香叶基焦磷酸合酶(Geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)是植物细胞二萜类物质合成的重要调节靶点。本研究从药用植物丹参中克隆了一条新的GGPPS基因(SmGGPPS3),基因全长2908 bp,包含一个931 bp的内含子和一个960 bp的... 展开更多; 关键词丹参香叶基香叶基焦磷酸合酶(GGPPS) 基因克隆基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名香叶基香叶基焦磷酸合成酶在肺鳞状细胞癌中的表达及临床意义: 1; 作者王鑫王晓霞李彦庆郑永鑫乌杰任猛贾向东许天祥; 机构内蒙古科技大学包头医学院研究生院内蒙古自治区人民医院腹部肿瘤外科内蒙古自治区人民医院重症医学科内蒙古医科大学研究生院; 出处《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期312-324,共13页; 基金内蒙古自治区自然科学基金(2023LHMS08052,2023MS08019,2019MS08085,2018LH08002) 内蒙古自治区人民医院博士科研启动基金(2020BS06) +3 种基金内蒙古医学科学院公立医院科研联合基金科技项目(2023GLLH0012,2023GLLH0038)。; 文摘目的·利用生物信息学和免疫组织化学法探究在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)组织中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase 1,GGPS1)的表达及其临床意义。方法·首先从UCSC Xena平台下载LUSC组织与配对正常组织的转录组数据,使用R语言进行数据标准化和差异表达分析,并利用UALCAN数据库进行验证;采用UALCAN和LinkedOmics数据库分析LUSC患者中GGPS1表达与临床病理特征关系;利用Kaplan-Meier Plotter数据库探究LUSC患者GGPS1表达对预后的影响。应用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析筛选基因相关系数及风险评分。通过列线图和校正曲线评价GGPS1对LUSC的诊断价值。采用STRING、GeneMANIA数据库构建GGPS1蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。运用R语言挑选与GGPS1相关差异基因,并进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。采用免疫组织化学法检测LUSC患者GGPS1表达情况,并分析其与临床病理特征和预后的相关性。结果·通过TIMER2.0数据库检索到GGPS1在多数肿瘤中表达均升高,且在LUSC中呈高表达。UCSC Xena、UALCAN数据库中GGPS1在LUSC的表达高于癌旁组织(均P<0.05)。UALCAN和LinkedOmics数据库发现GGPS1在指标分期较晚患者中的表达水平更高,且Kaplan-Meier Plotter数据库显示LUSC患者GGPS1高表达总生存期(overall survival,OS)较短(P<0.05)。基于LASSO回归评估LUSC患者有较好的风险预测效能。构建LUSC患者的个体化预测模型具有最佳预测准确度。GO、KEGG结果显示,GGPS1相关基因主要与蛋白质代谢、调节脂质和胆固醇代谢过程、尼古丁成瘾、磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferatoractivated receptors,PPAR)信号通路等有关。GGPS1的代谢功能可能促进肿瘤发生。免疫组化结果提示GGPS1主要定位于细胞质中,且LUSC组织中表达高于癌旁组织(P<0.05),GGPS1高表达与LUSC患者肿瘤大小、淋巴结转移和TNM分期有关(均P<0.05),且GGPS1表达高的患者OS明显短于低表达者(P=0.000)。多因素Cox回归分析提示GGPS1可作为LUSC的独立预后因素。结论·相较于正常肺组织,GGPS1在LUSC中表达显著升高,尤其在肿瘤体积较大、淋巴结转移阳性及晚期的患者中表达升高更明显;且GGPS1过表达是LUSC患者预后差的独立预测因子。GGPS1有望成为新的LUSC诊治和预防的分子靶点。; 关键词香叶基香叶基焦磷酸合成酶肺鳞状细胞癌生物信息学免疫组织化学临床意义; Keywords geranylgeranyl diphosphate synthase 1(GGPS1) lung squamous cell carcinoma(LUSC) bioinformatics immunohistochemistry clinical significance; 分类号 R734.2 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析被引量：7: 2; 作者兰小中孙敏; 机构西藏大学农牧学院动物科技系生物技术教研室西南大学生命科学学院; 出处《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2006年第4期537-543,共7页; 基金教育部重点资助项目(204189) 西藏自治区重点科研资助项目(2005-65); 文摘 20碳单位的香叶基香叶基焦磷酸是紫杉醇生物合成的直接前体,它由香叶基香叶基焦磷酸合成酶催化生成。采用RT-PCR技术从高原植物西藏红豆杉中克隆了编码香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因,命名为TwGGPPS(Gen- Bank登录号:DQ 364604)。该基因编码区长为1 182 bp,编码393个氨基酸的多肽;生物信息学分析表明TwGGPPS定位于质体,在其氨基端具有长为18个氨基酸的质体转运肽;TwGGPPS属于异戊烯基转运酶家族,具有该酶家族特有的2个天冬氨酸富集基序;分子系统进化分析表明植物的GGPPS分为被子植物和裸子植物2种类型,TwGGPPS属于裸子植物类型的GGPPS;对TwGGPPS的蛋白质结构模拟分析结果表明,TwGGPPS由大量的α-螺旋通过随机卷曲连接而成,这些α-螺旋环绕形成一个袋状空腔,其空腔口部为底物结合与碳链延伸的活性部位。对TwGGPPS基因组结构的分析表明该基因没有内含子。该基因的克隆和分析为实现紫杉醇的基因工程提供了一个重要的基因和作用靶点。; 关键词西藏红豆杉紫杉醇香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆生物信息学分析; Keywords Taxus wallichiana Taxol geranylgeranyl diphosohate synthase cloning bioinformatics; 分类号 S791.49 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名急性呼吸窘迫综合征患者香叶基香叶基焦磷酸合成酶的表达及其临床意义被引量：2: 3; 作者王晓霞许天祥吕镗烽胥武剑刘建波宋勇; 机构内蒙古自治区人民医院重症医学科内蒙古自治区人民医院腹部肿瘤外科东部战区总医院呼吸与危重症医学科; 出处《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期639-645,共7页; 基金内蒙古自治区人民医院院内基金(2016082) 内蒙古自治区自然科学基金(2018LH08002,2019MS08085) 内蒙古自治区卫生计生科研计划项目(201703011)。; 文摘目的·通过检测急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)患者外周血单个核细胞中香叶基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase,GGPPS)的表达情况,研究GGPPS在ARDS诊治中的临床意义。方法·通过定量反转录聚合酶链反应检测ARDS患者(ARDS组)和正常人群(对照组)外周血单个核细胞中GGPPS mRNA水平,采用蛋白质印迹法(Western blotting)检测ARDS组和对照组外周血单个核细胞中GGPPS蛋白表达水平。同时比较ARDS存活组和死亡组GGPPS的表达差异,并采用Spearman相关分析明确GGPPS表达与ARDS患者临床指标的相关性。结果·ARDS组外周血单个核细胞中GGPPS mRNA水平明显高于对照组(P=0.000),并且随ARDS病情加重逐渐升高(P<0.05)。ARDS组外周血单个核细胞中GGPPS蛋白表达明显高于对照组(P<0.05),并且随病情加重逐渐升高(P<0.05)。ARDS死亡组外周血单个核细胞中GGPPS mRNA水平及蛋白表达水平高于ARDS存活组(P<0.05)。ARDS患者外周血单个核细胞中GGPPS mRNA高表达与高的急性生理与慢性健康评分Ⅱ(APACHE Ⅱ)(r=0.862,P=0.000)、高序贯器官功能衰竭估计(SOFA)评分(r=0.719,P=0.023)、低氧合指数(r=-0.821,P=0.000)、高C反应蛋白(r=0.758,P=0.024)及高白细胞计数(r=0.761,P=0.015)相关。结论·ARDS患者外周血单个核细胞中GGPPS表达水平升高,且其表达水平与ARDS病情严重程度及预后相关,GGPPS有望成为ARDS病情严重程度评估的生物标志物。; 关键词急性呼吸窘迫综合征香叶基香叶基焦磷酸合成酶预后生物标志物; Keywords acute respiratory distress syndrome(ARDS) geranylgeranyl diphosphate synthase(GGPPS) prognosis biomarker; 分类号 R563.9 [医药卫生—呼吸系统]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于关键节点代谢流重排提高酿酒酵母的香叶基香叶醇产量被引量：2: 4; 作者吴伟鹏于洪巍叶丽丹周萍萍姚震边旗; 机构浙江大学化学工程与生物工程学院; 出处《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期877-884,共8页; 基金国家自然科学基金(21576234 21776244); 文摘香叶基香叶醇(geranylgeraniol,GGOH)是生产香料、药物、维生素A和E的重要中间体,其生物活性构型为(E,E,E)-GGOH。为了提高酿酒酵母的(E,E,E)-GGOH产量,在表达了香叶基香叶基焦磷酸合酶-法尼基焦磷酸合酶融合酶(BTS1-DPP1)和香叶基香叶基焦磷酸合酶-二酰基甘油二磷酸磷酸酶融合酶(BTS1-ERG20)的初始菌株(产34.85mg?L^(-1)GGOH)的基础上,本实验进一步利用代谢工程的手段对法尼基焦磷酸(FPP)代谢节点处进行代谢流重排。一方面,过表达了来源于红法夫酵母的香叶基香叶基焦磷酸(GGPP)合酶突变体(Crt E03M),增加了前体物质GGPP的供应,从而将GGOH产量提高了1.6倍,达到56.04mg?L^(-1);另一方面,利用葡萄糖诱导性弱启动子PHXT1对竞争支路关键酶角鲨烯合酶(ERG9)进行下调,从而使GGOH产量提高4.5倍,达到156mg?L^(-1)。同时,通过敲除GAL80基因构建了葡萄糖调控的GAL体系,用以控制GGOH的合成,与PHXT1控制的角鲨烯合成支路一起,构成了顺序表达体系,最终,以十二烷为有机相,在摇瓶中进行两相发酵,培养72 h后获得GGOH产量183.07mg?L^(-1),与初始菌株相比提高了5倍。本工作对其他FPP下游途径的代谢调控具有借鉴意义。; 关键词香叶基香叶醇代谢调控顺序表达葡萄糖响应香叶基香叶基焦磷酸合酶; Keywords Geranylgeraniol metabolic regulation sequential expression glucose responsive GGPPsynthase; 分类号 Q789 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名丹参SmGGPPS3基因的克隆及表达分析被引量：19: 5; 作者化文平宋双红智媛王喆之; 机构药用资源与天然药物化学教育部重点实验室陕西学前师范学院生物科学与技术系; 出处《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期50-57,共8页; 基金陕西省教育厅项目(12JK0833) 陕西省博士后科研项目陕西学前师范学院基金(11KJ007); 文摘香叶基香叶基焦磷酸合酶(Geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)是植物细胞二萜类物质合成的重要调节靶点。本研究从药用植物丹参中克隆了一条新的GGPPS基因(SmGGPPS3),基因全长2908 bp,包含一个931 bp的内含子和一个960 bp的编码序列。推测的氨基酸序列与蓖麻、橡胶、拟南芥等植物GGPPS一致性达到67%以上。实时定量PCR结果显示,SmGGPPS3基因在丹参不同发育时期不同器官中表达差异显著,同时受茉莉酸甲酯和病原菌的诱导。遗传互补实验也表明,SmGGPPS3编码蛋白具有GGPP合酶的活性。; 关键词丹参香叶基香叶基焦磷酸合酶(GGPPS) 基因克隆基因表达; Keywords Salvia miltiorrhiza GGPPS Gene clone Gene expression; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	香叶基香叶基焦磷酸合成酶在肺鳞状细胞癌中的表达及临床意义	王鑫王晓霞李彦庆郑永鑫乌杰任猛贾向东许天祥	《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析	兰小中孙敏	《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心	2006	7	在线阅读下载PDF 职称材料
3	急性呼吸窘迫综合征患者香叶基香叶基焦磷酸合成酶的表达及其临床意义	王晓霞许天祥吕镗烽胥武剑刘建波宋勇	《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2020	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于关键节点代谢流重排提高酿酒酵母的香叶基香叶醇产量	吴伟鹏于洪巍叶丽丹周萍萍姚震边旗	《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	丹参SmGGPPS3基因的克隆及表达分析	化文平宋双红智媛王喆之	《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2014	19	在线阅读下载PDF 职称材料