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食源性人兽共患病病原活菌检测技术研究进展
被引量：
5
1
作者
凌南
范漻钰
+3 位作者
任建鸾
曾德新
薛峰
戴建君
《中国动物检疫》
CAS
2018年第10期68-73,共6页
食源性人兽共患病已成为威胁人类健康、食品安全和畜牧业发展的重要因素,因此发展快速、准确、高效的人兽共患病病原活菌检测技术非常必要。目前已有多种针对活菌的检测方法。本文比较分析了目前正在使用或开发的人兽共患病病原活菌检...
食源性人兽共患病已成为威胁人类健康、食品安全和畜牧业发展的重要因素,因此发展快速、准确、高效的人兽共患病病原活菌检测技术非常必要。目前已有多种针对活菌的检测方法。本文比较分析了目前正在使用或开发的人兽共患病病原活菌检测技术。同时,利用PMA-q PCR检测技术,进行了副溶血性弧菌检测效果验证,认为该检测技术兼具检测速度快、灵敏度高、特异性强、成本低等优点,作为一种新型的活菌快速检测技术,具有广阔的应用前景。另外,一种新型的铂化合物检测技术也被证明可用于活菌检测。
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关键词
食源性人兽共患病
病原
活菌
检测技术
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职称材料
警惕人兽共患病经动物源性食品传染人
2
作者
赵欣花
洪于准
谢斌
《福建畜牧兽医》
2000年第5期51-51,共1页
关键词
食源性
疾病
食源性人兽共患病
食品卫生
控制
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职称材料
一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7的全基因组测序及毒力和耐药基因分析
3
作者
周艳
万启旸
+3 位作者
朱树娇
张辉
包红朵
王冉
《广东农业科学》
2025年第2期58-70,共13页
[目的]分析一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软...
[目的]分析一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软件预测基因组序列信息,并通过UniProt、KEGG、KEGG Pathway、GO、Pfam、COG、TIGERfams、RefSeq和NR数据库进行基因预测和注释,再利用碳水化合物酶(CAZy)、病原与宿主互作(PHI)、毒力因子(VFDB)和耐药基因(CARD)数据库进行基因功能分析。[结果]肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1基因组大小为5404747 bp,GC含量为50.49%,该菌株含有3个质粒;共预测到5674个蛋白质编码基因,包含22个rRNA(7个23S rRNA、7个16S rRNA、8个5S rRNA)、1个tmRNA、102个tRNA基因和282个小RNA分子;预测出9个CRISPR序列、273个重复序列;KEGG、KEGG Pathway、NR、UniProt、GO、COG、Pfam、RefSeq和TIGERfams数据库分别注释到1712、1693、5265、5264、4029、4294、4688、5252和2741个基因;CAZy数据库注释筛选出100个基因,PHI数据库注释筛选出2354个基因,VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括菌毛、鞭毛、Ⅱ型分泌系统、Ⅲ型分泌系统、Ⅵ型分泌系统、紧密黏附素、铁转运系统、脂多糖、荚膜、侵袭素和外毒素;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与多重耐药外排泵、大环内酯类抗生素、四环素、多粘菌素、杆菌肽、氨基糖苷类抗生素、肽类抗生素及甲硝唑相关。[结论]获得一株肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1全基因组序列,序列分析表明该菌株携带大量毒力基因与耐药基因。
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关键词
肠出血性大肠杆菌O157∶H7
食源性人兽共患病
全基因组测序
基因
功能注释
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职称材料
题名
食源性人兽共患病病原活菌检测技术研究进展
被引量：
5
1
作者
凌南
范漻钰
任建鸾
曾德新
薛峰
戴建君
机构
南京农业大学动物医学院
出处
《中国动物检疫》
CAS
2018年第10期68-73,共6页
基金
江苏省大学生创新训练计划项目(201810307061X)
江苏省农业自主创新资金资助项目(CX[18]2011)
文摘
食源性人兽共患病已成为威胁人类健康、食品安全和畜牧业发展的重要因素,因此发展快速、准确、高效的人兽共患病病原活菌检测技术非常必要。目前已有多种针对活菌的检测方法。本文比较分析了目前正在使用或开发的人兽共患病病原活菌检测技术。同时,利用PMA-q PCR检测技术,进行了副溶血性弧菌检测效果验证,认为该检测技术兼具检测速度快、灵敏度高、特异性强、成本低等优点,作为一种新型的活菌快速检测技术,具有广阔的应用前景。另外,一种新型的铂化合物检测技术也被证明可用于活菌检测。
关键词
食源性人兽共患病
病原
活菌
检测技术
Keywords
food-borne zoonoses
pathogen
live bacteria
detection technology
分类号
S855.1 [农业科学—临床兽医学]
R155.5 [医药卫生—营养与食品卫生学]
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职称材料
题名
警惕人兽共患病经动物源性食品传染人
2
作者
赵欣花
洪于准
谢斌
机构
厦门出入境检验检疫局
出处
《福建畜牧兽医》
2000年第5期51-51,共1页
关键词
食源性
疾病
食源性人兽共患病
食品卫生
控制
分类号
S855 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7的全基因组测序及毒力和耐药基因分析
3
作者
周艳
万启旸
朱树娇
张辉
包红朵
王冉
机构
江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所/江苏省食品质量安全重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地
出处
《广东农业科学》
2025年第2期58-70,共13页
基金
国家自然科学基金(31972764)。
文摘
[目的]分析一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软件预测基因组序列信息,并通过UniProt、KEGG、KEGG Pathway、GO、Pfam、COG、TIGERfams、RefSeq和NR数据库进行基因预测和注释,再利用碳水化合物酶(CAZy)、病原与宿主互作(PHI)、毒力因子(VFDB)和耐药基因(CARD)数据库进行基因功能分析。[结果]肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1基因组大小为5404747 bp,GC含量为50.49%,该菌株含有3个质粒;共预测到5674个蛋白质编码基因,包含22个rRNA(7个23S rRNA、7个16S rRNA、8个5S rRNA)、1个tmRNA、102个tRNA基因和282个小RNA分子;预测出9个CRISPR序列、273个重复序列;KEGG、KEGG Pathway、NR、UniProt、GO、COG、Pfam、RefSeq和TIGERfams数据库分别注释到1712、1693、5265、5264、4029、4294、4688、5252和2741个基因;CAZy数据库注释筛选出100个基因,PHI数据库注释筛选出2354个基因,VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括菌毛、鞭毛、Ⅱ型分泌系统、Ⅲ型分泌系统、Ⅵ型分泌系统、紧密黏附素、铁转运系统、脂多糖、荚膜、侵袭素和外毒素;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与多重耐药外排泵、大环内酯类抗生素、四环素、多粘菌素、杆菌肽、氨基糖苷类抗生素、肽类抗生素及甲硝唑相关。[结论]获得一株肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EO157-1全基因组序列,序列分析表明该菌株携带大量毒力基因与耐药基因。
关键词
肠出血性大肠杆菌O157∶H7
食源性人兽共患病
全基因组测序
基因
功能注释
Keywords
enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7
foodborne zoonoses
whole genome sequencing
genes
functional annotation
分类号
S852 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
食源性人兽共患病病原活菌检测技术研究进展
凌南
范漻钰
任建鸾
曾德新
薛峰
戴建君
《中国动物检疫》
CAS
2018
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
警惕人兽共患病经动物源性食品传染人
赵欣花
洪于准
谢斌
《福建畜牧兽医》
2000
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
一株猪源肠出血性大肠杆菌O157:H7的全基因组测序及毒力和耐药基因分析
周艳
万启旸
朱树娇
张辉
包红朵
王冉
《广东农业科学》
2025
0
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职称材料
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