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水稻细菌性谷枯病菌的分子鉴定及16S rDNA序列分析
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作者 周求根 兰波 +2 位作者 徐沛东 李湘民 杨迎青 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期760-765,共6页
为准确鉴定水稻细菌性谷枯病病原菌,并明确其分类地位,本研究利用16S rDNA通用引物对该病菌进行了PCR扩增,克隆了其16S rDNA片段,并基于该序列对该病菌进行了分子鉴定,进而通过序列比对与系统发育分析,研究了其16S rDNA片段与近缘菌的... 为准确鉴定水稻细菌性谷枯病病原菌,并明确其分类地位,本研究利用16S rDNA通用引物对该病菌进行了PCR扩增,克隆了其16S rDNA片段,并基于该序列对该病菌进行了分子鉴定,进而通过序列比对与系统发育分析,研究了其16S rDNA片段与近缘菌的序列差异及系统发育关系。结果表明：水稻细菌性谷枯病菌各菌株均能扩增得到1 600 bp左右的条带;BLAST比对结果显示,其序列与颖壳伯克氏菌（Burkholderia glumae）同源率为100%,将其鉴定为颖壳伯克氏菌（B.glumae）;B.glumae与B.metallica、B.stabilis、B.cepacia、B.vietnamiensis、B.plantarii、B.gladioli及B.cocovenenans的16S rDNA序列存在明显的差异性区域,主要集中在180-210bp、440-470 bp、580-590 bp、640-650 bp、1000-1040 bp、1130-1150 bp和1240-1250 bp。B.glumae与B.plantarii、B.cocovenenans及B.gladioli的亲缘关系较近,聚为一个组群,其它菌株则聚为另一个组群。 展开更多
关键词 水稻细菌性谷枯病 颖壳伯克氏菌 16S RDNA 克隆 序列分析 系统进化
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