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用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质
被引量：
2
1
作者
宋江宁
李炜疆
《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》
CSCD
北大核心
2003年第3期7-11,共5页
以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分...
以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分类和预测.训练集和测试集相同时和不相同时的预测准确率分别可达66%和64%.
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关键词
氨基酸
顺式
肽键
蛋白质序列
分类
统计预测分析方法
顺式构象势函数
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职称材料
题名
用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质
被引量：
2
1
作者
宋江宁
李炜疆
机构
江南大学工业生物技术教育部重点实验室
出处
《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》
CSCD
北大核心
2003年第3期7-11,共5页
基金
工业生物技术教育部重点实验室访问学者基金项目资助课题.
文摘
以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分类和预测.训练集和测试集相同时和不相同时的预测准确率分别可达66%和64%.
关键词
氨基酸
顺式
肽键
蛋白质序列
分类
统计预测分析方法
顺式构象势函数
Keywords
cis peptide bond
amino acid composition
protein secondary structure
statistical correlation
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质
宋江宁
李炜疆
《无锡轻工大学学报（食品与生物技术）》
CSCD
北大核心
2003
2
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