期刊文献+
共找到2篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
大白菜生长素受体基因家族生物信息学鉴定与表达分析 被引量:2
1
作者 代真林 张荣琴 +4 位作者 杨俊 张晋豪 魏兰芳 刘棋 姬广海 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第6期938-949,共12页
【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜生长素受体基因家族的进化关系、编码蛋白、保守结构域和顺式... 【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜生长素受体基因家族的进化关系、编码蛋白、保守结构域和顺式作用元件。基于NCBI转录组测序(RNA-sep)数据,分析BrTIR1/AFBs基因家族在大白菜不同组织中的表达模式以及在根肿病入侵条件下的表达情况。【结果】从大白菜基因组数据库中鉴定得到10个BrTIR1/AFBs基因。拟南芥、茎瘤芥和大豆生长素受体基因家族多序列比对以及系统进化树分析结果显示:BrTIR1/AFBs基因分为6个亚家族(TIR1、AFB1、AFB2、AFB3、AFB4和AFB5),处于同一亚族的基因具有相似的结构。染色体定位结果显示:BrTIR1/AFBs基因家族成员分布在除Chr5、Chr6和Chr10号染色体之外的7条染色体上,呈现出不均匀分布。顺式作用元件分析结果显示:所有的BrTIR1/AFBs基因家族成员都含有响应生长素、防御和逆境胁迫的作用元件,预示着这些基因可能参与相应的生物学过程。组织表达模式分析发现:10个BrTIR1/AFBs基因的转录本在6个组织中被检测到,且不同组织中的表达量存在明显差异。大白菜BrTIR1/AFBs基因家族成员在根肿病病原菌入侵时表达量发生显著变化。【结论】大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族成员具有保守的基因结构和功能结构域,在大白菜不同组织中发挥着特异的功能,且在抵御病害和干旱等逆境中发挥重要作用。 展开更多
关键词 大白菜 生长素受体基因家族 全基因组鉴定 顺势作用元件 表达谱
在线阅读 下载PDF
小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析 被引量:2
2
作者 王谢琴 李瑞雪 +3 位作者 张红 陈娇 于小蓉 刘汉梅 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期938-947,共10页
籽粒淀粉的含量和结构影响小麦的产量和品质,而淀粉合酶在淀粉合成中起着关键作用。植物淀粉合酶基因经多次复制和功能分化,形成了具有不同功能特性的多成员大家族。为揭示淀粉合酶基因家族成员间的序列特性和表达差异,本研究参考已知... 籽粒淀粉的含量和结构影响小麦的产量和品质,而淀粉合酶在淀粉合成中起着关键作用。植物淀粉合酶基因经多次复制和功能分化,形成了具有不同功能特性的多成员大家族。为揭示淀粉合酶基因家族成员间的序列特性和表达差异,本研究参考已知的水稻淀粉合酶蛋白序列,对小麦全基因组中的淀粉合酶基因进行鉴定,并对其进行差异表达分析。结果共鉴定到27个小麦淀粉合酶基因,这些基因分布在1A/1B/1D、2A/2B/2D、6A/6B/6D、7A/7B/7D染色体上,可分为Group A和Group B两大类,Group A包含TaGBSS、TaSSⅠ、TaSSⅡ三个亚家族,所编码的蛋白均具有motif1~motif10,且motif排列顺序一致;Group B包含TaSSⅢ、TaSSⅣ两个亚家族,所编码的蛋白都缺少motif9和motif10,另外TaSSⅢ亚家族还缺少motif8。与玉米、水稻、高粱、拟南芥不同,小麦淀粉合酶基因没有TaSSⅤ亚家族。同一亚家族内不同基因具有明显的表达差异,其中,TaGBSSⅠ、TaSSⅡa和TaSSⅢa在胚乳中特异表达;小麦相同部分同源群内的淀粉合酶基因间在不同组织和不同发育时期也存在表达差异,TaSSⅡa-B和TaSSⅡa-D在授粉后20 d和30 d的胚乳中表达量比TaSSⅡa-A高。差异表达的淀粉合酶基因启动子中的胚乳特异表达元件(RY-element、AACA-motif和ACGTOSGLUB1)存在类型和数量差异。 展开更多
关键词 小麦 淀粉合酶 基因家族 表达差异 顺势作用元件
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部