期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证
被引量：
1
1
作者
刘浩然
张晨禹
+5 位作者
龚洋
叶圆圆
陈杰丹
陈亮
刘丁丁
马春雷
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期27-39,共13页
为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测。结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具...
为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测。结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具有亲缘关系或地理位置接近的资源聚在一起的趋势;对重测序数据进行功能注释后发现,在18份白化茶树资源中存在17 056个共有非同义突变基因,其中14个叶绿素合成相关基因中存在98个错义突变位点。随后,基于前期获得的基因组变异信息开发了一套包含59个mSNP、222个SNP位点的液相芯片,利用该液相芯片检测13份茶树资源的基因型信息。结果表明,同一品种两两之间的遗传相似度在92%~98%,不同品种间的遗传相似度则在84%以下,表明该芯片可对18份白化茶树资源进行准确鉴别,研究结果可为mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定、分子标记辅助育种等方面的应用奠定基础。
展开更多
关键词
茶树
mSNP分子标记
靶向测序基因型检测
遗传多样性
全
基因
组重
测
序
在线阅读
下载PDF
职称材料
基于农艺性状和SNP分子标记的湖南78份茶树种质资源遗传多样性研究
被引量：
1
2
作者
郭佳璐
璩馥榕
+5 位作者
蔡天晨
赵洋
杨培迪
刘勇
周跃斌
刘振
《茶叶科学》
北大核心
2025年第2期219-233,共15页
为明确湖南省茶树种质资源的遗传多样性,探明种质资源的遗传结构,并对其进行精准鉴定评价,本研究利用靶向测序基因型检测技术(GBTS)对湖南省内的78份茶树种质资源的76252个SNP位点进行了基因型检测和遗传多样性分析,并对这批资源的30项...
为明确湖南省茶树种质资源的遗传多样性,探明种质资源的遗传结构,并对其进行精准鉴定评价,本研究利用靶向测序基因型检测技术(GBTS)对湖南省内的78份茶树种质资源的76252个SNP位点进行了基因型检测和遗传多样性分析,并对这批资源的30项农艺性状和15项生化成分进行了精准鉴定。结果表明,78份湖南省茶树种质资源间存在比较丰富的遗传变异,表型性状的遗传多样性指数为0.07~2.08,变异系数为2.26%~47.50%,最小的是萼片数,最大的是叶齿深度;生化成分的遗传多样性指数为1.36~2.09,变异系数为5.90%~118.49%,最小的是水浸出物,最大的是没食子酸;欧氏距离为20时可将78份茶树种质资源分为5个类群,在第Ⅰ、Ⅲ类群中,叶长、叶片大小、叶基、酚氨比、没食子酸(GA)、茶碱(THEO)、没食子儿茶素(GC)、表没食子儿茶素(EGC)、表儿茶素(EC)、表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、没食子儿茶素没食子酸酯(GCG)、表儿茶素没食子酸酯(ECG)均存在显著差异。基于78份资源的基因型检测结果构建系统进化树,可将78份资源分为3个类群。同时,本研究挖掘出表型性状特异、高氨基酸、高可可碱、高咖啡碱等功能成分特异茶树资源23份。相关研究结果可为湖南省茶树种质资源的保护和利用提供依据。
展开更多
关键词
茶树
种质资源
精准鉴定
靶向测序基因型检测
遗传多样性
在线阅读
下载PDF
职称材料
家驴40K液相芯片开发及其初步应用
被引量：
1
3
作者
李聪
刘书琴
+5 位作者
高峰
苏江天
王朝飞
拓少华
孙玉江
党瑞华
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5538-5548,共11页
为加快我国家驴的分子选育进展,本研究收集国内外27个驴品种,共251头成年驴的全基因组重测序数据,结合国内外家驴重要性状遗传变异研究结果,设计了一款基于靶向测序基因型检测技术的家驴40K液相芯片。结果表明,家驴40K液相芯片中的变异...
为加快我国家驴的分子选育进展,本研究收集国内外27个驴品种,共251头成年驴的全基因组重测序数据,结合国内外家驴重要性状遗传变异研究结果,设计了一款基于靶向测序基因型检测技术的家驴40K液相芯片。结果表明,家驴40K液相芯片中的变异位点(45893个SNPs和1个InDel)在家驴基因组范围内的平均间距为61.8 kb。利用该芯片对210头成年德州驴母驴进行基因分型测试,所有测试样本的位点检出率为98.4%~99.2%,位点平均测序深度为133×,共有42575个位点的次等位基因频率大于0.35。使用芯片对20张驴皮样本进行了品种鉴定,初步验证了芯片的可用性。综上,本研究开发的家驴40K液相芯片作为首款大规模家驴基因型检测工具,具有位点密度高、多态性好、检出率高、应用性强等优势,可用于家驴早期的分子标记辅助选择、品种鉴定等方面,进一步提高家驴的育种效率。
展开更多
关键词
家驴
靶向测序基因型检测
液相芯片
育种
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证
被引量：
1
1
作者
刘浩然
张晨禹
龚洋
叶圆圆
陈杰丹
陈亮
刘丁丁
马春雷
机构
中国农业科学院茶叶研究所/农业农村部特种经济动植物生物学与遗传育种重点实验室
中国农业科学院研究生院
出处
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期27-39,共13页
基金
国家重点研发计划课题(2021YFD1200203)
浙江省农业(茶树)新品种选育重大科技专项子课题(2021C02067-6-1)
+1 种基金
中国农业科学院茶叶研究所基本科研业务费(1610212022009)
浙江省自然科学基金(LQ20C160010)。
文摘
为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测。结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具有亲缘关系或地理位置接近的资源聚在一起的趋势;对重测序数据进行功能注释后发现,在18份白化茶树资源中存在17 056个共有非同义突变基因,其中14个叶绿素合成相关基因中存在98个错义突变位点。随后,基于前期获得的基因组变异信息开发了一套包含59个mSNP、222个SNP位点的液相芯片,利用该液相芯片检测13份茶树资源的基因型信息。结果表明,同一品种两两之间的遗传相似度在92%~98%,不同品种间的遗传相似度则在84%以下,表明该芯片可对18份白化茶树资源进行准确鉴别,研究结果可为mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定、分子标记辅助育种等方面的应用奠定基础。
关键词
茶树
mSNP分子标记
靶向测序基因型检测
遗传多样性
全
基因
组重
测
序
Keywords
tea plant
mSNP
GBTS
genetic diversity
whole genome resequencing
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
S326 [农业科学—作物遗传育种]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于农艺性状和SNP分子标记的湖南78份茶树种质资源遗传多样性研究
被引量：
1
2
作者
郭佳璐
璩馥榕
蔡天晨
赵洋
杨培迪
刘勇
周跃斌
刘振
机构
湖南农业大学
湖南省农业科学院茶叶研究所
湖南农业大学黄埔创新研究院
出处
《茶叶科学》
北大核心
2025年第2期219-233,共15页
基金
国家现代农业产业技术体系项目(CARS-19)。
文摘
为明确湖南省茶树种质资源的遗传多样性,探明种质资源的遗传结构,并对其进行精准鉴定评价,本研究利用靶向测序基因型检测技术(GBTS)对湖南省内的78份茶树种质资源的76252个SNP位点进行了基因型检测和遗传多样性分析,并对这批资源的30项农艺性状和15项生化成分进行了精准鉴定。结果表明,78份湖南省茶树种质资源间存在比较丰富的遗传变异,表型性状的遗传多样性指数为0.07~2.08,变异系数为2.26%~47.50%,最小的是萼片数,最大的是叶齿深度;生化成分的遗传多样性指数为1.36~2.09,变异系数为5.90%~118.49%,最小的是水浸出物,最大的是没食子酸;欧氏距离为20时可将78份茶树种质资源分为5个类群,在第Ⅰ、Ⅲ类群中,叶长、叶片大小、叶基、酚氨比、没食子酸(GA)、茶碱(THEO)、没食子儿茶素(GC)、表没食子儿茶素(EGC)、表儿茶素(EC)、表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、没食子儿茶素没食子酸酯(GCG)、表儿茶素没食子酸酯(ECG)均存在显著差异。基于78份资源的基因型检测结果构建系统进化树,可将78份资源分为3个类群。同时,本研究挖掘出表型性状特异、高氨基酸、高可可碱、高咖啡碱等功能成分特异茶树资源23份。相关研究结果可为湖南省茶树种质资源的保护和利用提供依据。
关键词
茶树
种质资源
精准鉴定
靶向测序基因型检测
遗传多样性
Keywords
tea plant
germplasm resources
accurate identification
genotyping by target sequencing(GBTS)
genetic diversity
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
S435.711 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
家驴40K液相芯片开发及其初步应用
被引量：
1
3
作者
李聪
刘书琴
高峰
苏江天
王朝飞
拓少华
孙玉江
党瑞华
机构
西北农林科技大学动物科技学院
青岛农业大学动物科技学院
延安市安塞区科学技术局
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5538-5548,共11页
基金
山东省农业重大应用技术创新项目(SD2019XM008)
山东省现代农业产业技术体系驴创新团队建设专项基金(SDAIT-27)
+2 种基金
中央引导地方项目(K3030922098)
陕西省创新能力支持计划项目(2018XY-021)
陕西省科技厅“科学家+工程师”项目(2020)。
文摘
为加快我国家驴的分子选育进展,本研究收集国内外27个驴品种,共251头成年驴的全基因组重测序数据,结合国内外家驴重要性状遗传变异研究结果,设计了一款基于靶向测序基因型检测技术的家驴40K液相芯片。结果表明,家驴40K液相芯片中的变异位点(45893个SNPs和1个InDel)在家驴基因组范围内的平均间距为61.8 kb。利用该芯片对210头成年德州驴母驴进行基因分型测试,所有测试样本的位点检出率为98.4%~99.2%,位点平均测序深度为133×,共有42575个位点的次等位基因频率大于0.35。使用芯片对20张驴皮样本进行了品种鉴定,初步验证了芯片的可用性。综上,本研究开发的家驴40K液相芯片作为首款大规模家驴基因型检测工具,具有位点密度高、多态性好、检出率高、应用性强等优势,可用于家驴早期的分子标记辅助选择、品种鉴定等方面,进一步提高家驴的育种效率。
关键词
家驴
靶向测序基因型检测
液相芯片
育种
Keywords
domestic donkey
genotyping detection by target sequencing
liquid chip
breeding
分类号
S822.2 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证
刘浩然
张晨禹
龚洋
叶圆圆
陈杰丹
陈亮
刘丁丁
马春雷
《茶叶科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于农艺性状和SNP分子标记的湖南78份茶树种质资源遗传多样性研究
郭佳璐
璩馥榕
蔡天晨
赵洋
杨培迪
刘勇
周跃斌
刘振
《茶叶科学》
北大核心
2025
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
家驴40K液相芯片开发及其初步应用
李聪
刘书琴
高峰
苏江天
王朝飞
拓少华
孙玉江
党瑞华
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
