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不同DNA序列映射对频谱3-周期性的影响
1
作者
邵建峰
邵伟
+1 位作者
严晓华
赵剑
《南京工业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2012年第5期128-132,共5页
DNA符号序列经过数值映射后其数字序列所具有的频谱3-周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。将常见映射分为4类,讨论了各类映射之间的关系;使用Parzen窗口密度估计法确定不同映射下的3-周期信噪比阈值,并利用在该阈...
DNA符号序列经过数值映射后其数字序列所具有的频谱3-周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。将常见映射分为4类,讨论了各类映射之间的关系;使用Parzen窗口密度估计法确定不同映射下的3-周期信噪比阈值,并利用在该阈值下的分类正确率指标对不同映射进行了评价;依据移动序列信噪比曲线给出敏感性、非震荡性2种指标,比较了不同映射在利用3-周期性进行基因编码区域识别上的优劣性。
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关键词
3-周期性
序列映射
基因识别
信噪比阈值
分类正确率
敏感性
非震荡性
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职称材料
题名
不同DNA序列映射对频谱3-周期性的影响
1
作者
邵建峰
邵伟
严晓华
赵剑
机构
南京工业大学理学院
南京工业大学电子与信息工程学院
出处
《南京工业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2012年第5期128-132,共5页
文摘
DNA符号序列经过数值映射后其数字序列所具有的频谱3-周期性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征。将常见映射分为4类,讨论了各类映射之间的关系;使用Parzen窗口密度估计法确定不同映射下的3-周期信噪比阈值,并利用在该阈值下的分类正确率指标对不同映射进行了评价;依据移动序列信噪比曲线给出敏感性、非震荡性2种指标,比较了不同映射在利用3-周期性进行基因编码区域识别上的优劣性。
关键词
3-周期性
序列映射
基因识别
信噪比阈值
分类正确率
敏感性
非震荡性
Keywords
3-base periodicity
DNA mapping
gene recognition
SNR threshold
classification accuracy
sensitivity
non-oscillation
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
不同DNA序列映射对频谱3-周期性的影响
邵建峰
邵伟
严晓华
赵剑
《南京工业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2012
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