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密度泛函理论的氨基酸近红外非谐振动光谱解析
1
作者
唐妍
吴佳
+5 位作者
徐建洁
郭腾霄
胡建波
张航
刘永刚
杨云帆
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3149-3156,共8页
氨基酸作为组成蛋白质的基本结构单元在生物体中起着重要作用。不同的基团组成和手性结构所代表的功能均有差异,因此甄别其基本化学结构和分子振动信息将为构建基础生物分子光谱与结构相关性模型提供重要的理论依据。近红外光谱主要展...
氨基酸作为组成蛋白质的基本结构单元在生物体中起着重要作用。不同的基团组成和手性结构所代表的功能均有差异,因此甄别其基本化学结构和分子振动信息将为构建基础生物分子光谱与结构相关性模型提供重要的理论依据。近红外光谱主要展示各类含氢基团(如O—H、N—H和C—H等)的倍频和合频振动信息;振动信息比较复杂,加上常规红外光谱仪器分辨率限制等原因,导致实验测得的谱带变宽,无法准确对其振动模式进行指认,分析较为困难。理论计算可以对每个振动模式进行独立计算,能够提供更清晰的光谱信息,进而对实验得到的宽谱带进行解析,使其更易甄别和分析不同分子体系的各类基团的结构振动信息。采用非谐振DFT方法对氨基酸(谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸)及由此三种氨基酸组成的多肽(谷胱甘肽)进行结构优化和非谐振振动分析,计算得到四种分子7500~4500 cm-1波段内的高精度NIR光谱,并对它们的谱图进行了详细的振动峰位指认。以振动强度作为标准,将整个近红外波段分为三个光谱区探究分子结构和组成基团对光谱特征的影响,对计算光谱进行了详细的分析并且建立了光谱与结构间的对应关系。该研究为更深的理解氨基酸及多肽的结构性质提供了思路。
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关键词
近红外
光谱
非谐振动光谱
密度泛函理论
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职称材料
题名
密度泛函理论的氨基酸近红外非谐振动光谱解析
1
作者
唐妍
吴佳
徐建洁
郭腾霄
胡建波
张航
刘永刚
杨云帆
机构
西南科技大学环境友好能源材料国家重点实验室
国民核生化灾害防护国家重点实验室
重庆青山工业有限责任公司
中国工程物理研究院流体物理研究所
西南科技大学分析测试中心
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3149-3156,共8页
基金
国家自然科学基金项目(11872058)资助。
文摘
氨基酸作为组成蛋白质的基本结构单元在生物体中起着重要作用。不同的基团组成和手性结构所代表的功能均有差异,因此甄别其基本化学结构和分子振动信息将为构建基础生物分子光谱与结构相关性模型提供重要的理论依据。近红外光谱主要展示各类含氢基团(如O—H、N—H和C—H等)的倍频和合频振动信息;振动信息比较复杂,加上常规红外光谱仪器分辨率限制等原因,导致实验测得的谱带变宽,无法准确对其振动模式进行指认,分析较为困难。理论计算可以对每个振动模式进行独立计算,能够提供更清晰的光谱信息,进而对实验得到的宽谱带进行解析,使其更易甄别和分析不同分子体系的各类基团的结构振动信息。采用非谐振DFT方法对氨基酸(谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸)及由此三种氨基酸组成的多肽(谷胱甘肽)进行结构优化和非谐振振动分析,计算得到四种分子7500~4500 cm-1波段内的高精度NIR光谱,并对它们的谱图进行了详细的振动峰位指认。以振动强度作为标准,将整个近红外波段分为三个光谱区探究分子结构和组成基团对光谱特征的影响,对计算光谱进行了详细的分析并且建立了光谱与结构间的对应关系。该研究为更深的理解氨基酸及多肽的结构性质提供了思路。
关键词
近红外
光谱
非谐振动光谱
密度泛函理论
Keywords
Near-infrared spectroscopy
Anharmonic spectra
DFT
分类号
O644 [理学—物理化学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
密度泛函理论的氨基酸近红外非谐振动光谱解析
唐妍
吴佳
徐建洁
郭腾霄
胡建波
张航
刘永刚
杨云帆
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024
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