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猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究 被引量:31
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作者 刘光清 薛强 +3 位作者 仇华吉 蔡雪晖 童光志 郭宝清 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期81-87,共7页
对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因 (ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序 ,并对其基因特征作了分析。结果表明 ,CH_1a株ORF1全长 11882nt,其中ORF1a长 75 12nt、ORF1b长 4374nt。它们与VR2 332株的核苷酸同源性分别为 89%、92 % ;... 对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因 (ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序 ,并对其基因特征作了分析。结果表明 ,CH_1a株ORF1全长 11882nt,其中ORF1a长 75 12nt、ORF1b长 4374nt。它们与VR2 332株的核苷酸同源性分别为 89%、92 % ;与LV株的核苷酸同源性分别为 5 4%、6 3.3%。ORF1编码两个聚合蛋白 ,其中ORF1a编码的聚合蛋白经裂解后产生 6个成熟的非结构蛋白 (Nsp1α、Nsp1β、Nsp2_5 ) ,以Nsp2的变异性最为显著 ,它与LV株的氨基酸同源性为 41%。ORF1b编码的聚合蛋白经裂解后 ,产生 4个成熟的非结构蛋白 (RdRpCP2_4) ,其中RdRp为病毒的复制酶 ,CP4表现出较大的变异性 ,与LV株的氨基酸同源性为 48%。在ORF1a_ORF1b的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构 ,它们是核糖体移码翻译所必需的结构。在基因组末端存在非编码区 ,其中 5’NCR长 190nt,比LV株 5’NCR短 31nt,其核苷酸同源性为 6 1%。 3’NCR长 15 1nt,比LV株 3’NCR长 37nt,保守性稍高 ,其与VR2 332株和LV株的核苷酸同源性分别为 95 .4%和 78.2 %。在 3’NCR末端有一个poly(A)尾巴 ,长 2 0nt。在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列 ,是复制酶识别并结合的区域。 展开更多
关键词 繁殖 呼吸综合征病毒 CH-1A株 非结构基因 分子克隆 基因特征 序列分析 结构蛋白编码区
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猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)CH-1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究
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作者 刘光清 仇华吉 +4 位作者 蔡雪晖 钱平 薛强 童光志 郭宝清 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第S1期78-,共1页
本研究对猪生殖-呼吸道综合征病毒(PRRSV)的非结构基因,包括ORF1基因、5’端非编码区基因(Non-CodingRigon,NCR)和3’端非编码区基因(NCR)分别进行了分子克隆和测序,并对其基因特征作了研究... 本研究对猪生殖-呼吸道综合征病毒(PRRSV)的非结构基因,包括ORF1基因、5’端非编码区基因(Non-CodingRigon,NCR)和3’端非编码区基因(NCR)分别进行了分子克隆和测序,并对其基因特征作了研究分析。结果表明,PRRSV-CH-1a株ORF1a起始密码子上游是由保守序列5’UUAACC3’连接的5’NCR,在该区附近的约43个碱基有较高的保守性,其余核苷酸的变异较大。ORF1a编码的多聚蛋白又可切割生成六个非结构蛋白(Nsp1a、Nsp1β、Nsp2-5),其中Nsp2可能具有型特异性,在不同基因型的PRRSV分离株之间表现出较大的变异,和VR2332株的NsP2的编码基因相比有86%的同源性,同LV株只有45%的同源性;ORF1b所编码的聚合蛋白经切割后形成四个非结构蛋白(RdRp、CP2-4),同 ORF1a所编码的蛋白相比较为保守,但是,在CP4的C端仍有较大的变异,其编码区和VR2332株相比有88.7%的同源性,而和LV株只有53.4%的同源性。CH-1a株的ORF1a-ORF1b的衔接区为核糖体移码区,在所有的PRRSV分离株中高度保守。 展开更多
关键词 PRRSV CH-1A株 ORF1基因 非结构基因 5’NCR 3’NCR
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HCV非结构基因NS5分子生物学研究进展
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作者 罗雯 《科学技术与工程》 2003年第4期390-392,共3页
丙型肝炎病毒(HCV)非结构基因5(NS5)区是RNA依赖的RNA聚合酶(RDRP)及一种磷蛋白的编码区,与HCV的复制、致病及抗药性关系密切。就HCV NS5区有关的分子生物学研究进展进行了综述。
关键词 丙型肝炎病毒 HCV 非结构基因 NS5基因 分子生物学 研究进展 RNA聚合酶 编码蛋白
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口蹄疫病毒非结构蛋白基因3ABC在大肠杆菌中的高效表达 被引量:10
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作者 曹轶梅 刘在新 +3 位作者 卢曾军 郭建宏 常惠芸 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期115-118,共4页
将牛源O型口蹄疫病毒(Foot and mouthdiseasevirus,FMDV)China/99株非结构蛋白基因3ABC从pGEM T 3ABC重组质粒中亚克隆到原核表达载体pTriEx 4Neo上,成功构建重组表达质粒pTriEx 3ABC。将其转化大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞中表达,... 将牛源O型口蹄疫病毒(Foot and mouthdiseasevirus,FMDV)China/99株非结构蛋白基因3ABC从pGEM T 3ABC重组质粒中亚克隆到原核表达载体pTriEx 4Neo上,成功构建重组表达质粒pTriEx 3ABC。将其转化大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞中表达,表达产物经SDS PAGE可检测到分子量约为59 1ku的目的蛋白带,经薄层扫描分析,目的蛋白占菌体总蛋白的31 4%。Westernblotting分析证明表达产物能被FMDV阳性血清所识别。表达产物纯化后作抗原进行ELISA检测,结果表明,表达的蛋白显示特异的免疫学活性,并能区分自然感染动物和注苗动物。研究为以FMDV非结构蛋白为抗原,建立自然感染动物和注苗动物的鉴别诊断方法提供了材料。 展开更多
关键词 口蹄疫 病毒 结构蛋白基因 3ABC 大肠杆菌 基因表达
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丙型肝炎病毒非结构蛋白3全长基因的克隆和表达 被引量:3
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作者 安润 楚雍烈 +4 位作者 杨娥 寻萌 孙菊 卢阳 郑建武 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期449-451,473,共4页
目的克隆和表达丙型肝炎病毒(HCV)非结构基因NS3,为进一步研究其基因功能奠定基础。方法设计特异性引物,以HCV全长cDNA质粒为模板进行PCR扩增,获得全长NS3基因。将其插入克隆载体pMD18-Tvector中,经酶切、PCR及测序鉴定后,与表达载体pET... 目的克隆和表达丙型肝炎病毒(HCV)非结构基因NS3,为进一步研究其基因功能奠定基础。方法设计特异性引物,以HCV全长cDNA质粒为模板进行PCR扩增,获得全长NS3基因。将其插入克隆载体pMD18-Tvector中,经酶切、PCR及测序鉴定后,与表达载体pET32a重组,后转入BL21菌株并诱导表达。采用SDS-PAGE电泳及Western-blot检测NS3基因的蛋白表达水平。结果含有NS3的重组体构建成功并在大肠杆菌中表达。结论运用原核细胞基因工程技术成功构建和表达了HCV非结构基因NS3蛋白,为尽一步研究HCVNS3基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白3基因 基因表达 克隆
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禽流感病毒新疆分离株1/96(H14N5)非结构蛋白基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 邓国华 于康震 +4 位作者 王秀荣 姜永萍 田国斌 乔传玲 陈化兰 《动物医学进展》 CSCD 2004年第1期103-106,共4页
研究应用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒分离株 A/ Chicken/ Xinjiang/ 1 / 96(H1 4 N5) ,提取病毒基因组及病毒感染鸡胚绒毛尿囊膜细胞信使 RNA,运用 RT-PCR技术扩增病毒分离株的 NS1和 NS2基因 c DNA,克隆后进行序列测定。序... 研究应用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒分离株 A/ Chicken/ Xinjiang/ 1 / 96(H1 4 N5) ,提取病毒基因组及病毒感染鸡胚绒毛尿囊膜细胞信使 RNA,运用 RT-PCR技术扩增病毒分离株的 NS1和 NS2基因 c DNA,克隆后进行序列测定。序列测定后分析结果表明 。 展开更多
关键词 禽流感病毒 新疆分离株 1/96 H14N5 结构蛋白基因 克隆 序列分析
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猪流感病毒H1N1亚型天津分离株核蛋白、基质蛋白、非结构蛋白基因克隆与序列分析
7
作者 孙英峰 鄢明华 +5 位作者 路超 李秀丽 张莉 韩伟 任卫科 田向学 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第4期61-66,共6页
从天津地区不同猪场分离到6株H1N1亚型猪源流感病毒(SIV)。根据GenBank发表的H1N1亚型SIV的核蛋白(NP)、基质蛋白(M)及非结构蛋白(NS)基因序列,分别设计3对引物,将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行测序分析。遗传进化分析结果表明:A/sw... 从天津地区不同猪场分离到6株H1N1亚型猪源流感病毒(SIV)。根据GenBank发表的H1N1亚型SIV的核蛋白(NP)、基质蛋白(M)及非结构蛋白(NS)基因序列,分别设计3对引物,将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行测序分析。遗传进化分析结果表明:A/swine/Tianjin/TJ2/2005(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ4/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Guangdong/33/2006(H1N1)位于同一分支上,属于古典型H1N1猪谱系;A/swine/Tianjin/TJ3/2006(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ8/2006(H1N1)的NP、M及NS基因核苷酸在遗传进化树中均与A/Dunedin/2/2000(H1N1)组成一个大分支,可能起源于人谱系;A/swine/Tianjin/TJ6/2009(H1N1)与A/swine/Tianjin/TJ7/2009(H1N1)NP、M及NS基因核苷酸序列在遗传进化树中均与A/swine/Jiangsu/s15/2011(H1N1)位于同一分支上,属于类禽H1N1猪谱系。本试验对6株H1N1亚型SIV的NP、M及NS全基因序列进行分析,在一定程度上揭示了天津地区H1N1亚型SIV的基因进化与流行情况。 展开更多
关键词 猪流感 HINl亚型 核蛋白基因 基质蛋白基因 结构蛋白基因 序列分析
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GPV YZ株非结构蛋白1基因的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 吕春伟 朱峰伟 +1 位作者 杨丽金 朱新产 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期27-37,共11页
对鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因进行克隆、测序、比对及蛋白质结构和功能等生物信息学分析,探究了非结构蛋白1的基因分子特征和理化特性及病理学相关致病机理。通过PCR、质粒克隆及核苷酸序列测定方法获得病毒YZ株非结构蛋白1基因序... 对鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因进行克隆、测序、比对及蛋白质结构和功能等生物信息学分析,探究了非结构蛋白1的基因分子特征和理化特性及病理学相关致病机理。通过PCR、质粒克隆及核苷酸序列测定方法获得病毒YZ株非结构蛋白1基因序列,采用DNAsis、Mega 5.10、Blast等多种生物学软件完成核苷酸序列及氨基酸序列和系统进化分析。结果显示,鹅细小病毒YZ株非结构蛋白1的基因全长1 881个核苷酸,编码627个氨基酸。与GPV-GB标准株、MDPV、ChPV、AAV的NS1基因序列存在很高的同源相似性,与MDPV的亲缘关系最近,提示番鸭和鹅细小病毒来自共同的祖先,其宿主的不同而演化为不同的分支。对应GPVNS1-YZ的同源区段序列(293-524)含231个氨基酸,分子量为26.446 kDa、PI=6.04,带负电的氨基酸30个,带正电的氨基酸28个,体外表达半衰期为5.5 h时,不稳定系数为40.23,脂肪系数为78.01,平均疏水值为-0.43,表明这一蛋白质为亲水性蛋白;该蛋白还存在9个抗原肽的位置:55-69,185-195,94-129,156-167,19-30,76-83,6-12,205-210,40-45,出现16个可能的B细胞抗原表位,表明它具有较高的免疫原性;但不存在跨膜片段,也不含信号肽和二硫键,可能不会分泌到宿主细胞的细胞膜外发生作用;其二级结构包含α-螺旋占30.74%,β-折叠占17.32%,无规则卷曲占51.95%,三级结构近似球状,包含一个SF3解旋酶超家族的DNA病毒解旋酶功能域(AA17-AA173),提示鹅细小病毒的非结构蛋白1可能在感染发生后参与病毒DNA自我复制中的DNA解旋过程。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 结构蛋白基因 结构蛋白1 序列分析
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猪传染性胃肠炎病毒基因组结构及主要基因功能研究进展 被引量:7
9
作者 王佳 成伟伟 +4 位作者 容维中 杨明 陈伯祥 赵子惠 李元新 《现代畜牧兽医》 2023年第8期79-84,共6页
猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)是一种单股正链RNA病毒,为冠状病毒α亚群成员,全基因组7个分区,编码4种结构蛋白和18种非结构蛋白。开展基因组的研究利于完善临床诊断技术、探索病毒作用机制、开发新型疫苗和抗病毒药物,对病毒防控和治疗具... 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)是一种单股正链RNA病毒,为冠状病毒α亚群成员,全基因组7个分区,编码4种结构蛋白和18种非结构蛋白。开展基因组的研究利于完善临床诊断技术、探索病毒作用机制、开发新型疫苗和抗病毒药物,对病毒防控和治疗具有重要作用。文章从TGEV病原学、基因组结构、主要基因及其编码蛋白的功能等方面进行了综述,以期为后续TGEV的分子生物学基础研究提供参考。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 基因 结构基因 非结构基因
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H3N2流感病毒非结构蛋白-1真核表达载体的构建与表达及其对293T细胞增殖的影响
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作者 迟莹 卞倩 +3 位作者 李燕 张文帅 温恬 焦永军 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期40-44,共5页
目的:构建甲型H3N2流感病毒非结构蛋白-1(nonstructal-1,NS1)真核表达载体并表达其编码蛋白;探讨NS1对细胞增殖的影响。方法 :从江苏省甲型H3N2流感病毒毒株提取病毒RNA,采用RT-PCR技术扩增NS1全长基因,将其克隆至pMD18-T Simple Vecto... 目的:构建甲型H3N2流感病毒非结构蛋白-1(nonstructal-1,NS1)真核表达载体并表达其编码蛋白;探讨NS1对细胞增殖的影响。方法 :从江苏省甲型H3N2流感病毒毒株提取病毒RNA,采用RT-PCR技术扩增NS1全长基因,将其克隆至pMD18-T Simple Vector中构建pMD18-T/NS1质粒,双酶切pMD18-T/NS1与pXJ40-HA后,构建真核表达载体pXJ40-HA-NS1,经酶切及测序鉴定后将质粒转染到293T细胞中,通过免疫印迹法鉴定NS1蛋白的表达。3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐[3-(4,5)-dimethylthiahiazo(-z-y1)-3,5-di-phenytetrazoliumromide,MTT]法检测NS1转染细胞后对细胞增殖的影响。结果:经双酶切、测序鉴定证实NS1基因的真核表达载体构建成功;免疫印迹法证实NS1蛋白的表达。MTT法证实转染NS1质粒后对细胞增殖有抑制作用。结论:成功克隆了NS1全长基因,构建了其真核表达载体,并初步验证了NS1蛋白过表达后能抑制细胞的增殖,该表达载体的构建为后期建立稳定表达NS1的细胞模型和NS1蛋白对细胞增殖和凋亡作用机制的进一步研究提供了基础。 展开更多
关键词 H3N2流感病毒 结构蛋白-1基因 克隆 真核表达 细胞增殖
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丙型肝炎病毒NS3区7个抗原表位融合基因载体的构建及在真核细胞的表达 被引量:1
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作者 杨素霞 李煜 +2 位作者 杨梅英 高江平 洪宝发 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期567-569,共3页
目的建立丙型肝炎病毒非结构蛋白3(NS3)区7个辅助T细胞抗原表位融合基因的真核表达载体,并在真核细胞中表达产物,为进一步研究应用HCVNS3序列进行预防HCV感染的DNA免疫的研究创造条件。方法合成3对相互重叠的寡核苷酸引物,涵盖NS3区7个... 目的建立丙型肝炎病毒非结构蛋白3(NS3)区7个辅助T细胞抗原表位融合基因的真核表达载体,并在真核细胞中表达产物,为进一步研究应用HCVNS3序列进行预防HCV感染的DNA免疫的研究创造条件。方法合成3对相互重叠的寡核苷酸引物,涵盖NS3区7个辅助T细胞抗原表位,细胞通过重叠延伸PCR方法,将它们拼接在一起构建了一个多肽融合基因,经克隆测序后,插入真核表达载体pEGFPN3和pBuDCE中,用构建的pEGFPDR4质粒分别转染293T和B淋巴细胞系046W,用pBuDCEDR4质粒转染293T细胞,用Western印迹和流式细胞仪检测其表达。结果经测序证实成功的将丙型肝炎病毒NS3区7个辅助T细胞抗原表位基因序列拼接成融合基因,构建的pEGFPDR4质粒在293T和B淋巴细胞系046W中均表达了预期的融合蛋白36kD。构建的pBuDCEDR4质粒在293T细胞中可观察到预期的13kD的多肽融合蛋白。结论本研究建立了能够在真核细胞表达HCVNS3区7个辅助T细胞抗原表位融合基因的细胞系。 展开更多
关键词 肝炎病毒 丙型 结构蛋白3-DNA免疫 真核细胞基因表达
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1983~1989年美国活禽市场和养禽场分离到的禽流感H_5N_2 毒株的序列分析
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作者 刘峰松 《动物医学进展》 CSCD 2002年第1期88-89,共2页
美国最近爆发的高致病力的禽流感是由H_5N_2 高株引 起的,该毒株曾引起1983~1984年美国宾西法尼亚州和新泽西州禽流感的爆发。在1986~1 989年间,从美国的养禽场和活禽市场分离到了多株H_5N_2毒株。通过... 美国最近爆发的高致病力的禽流感是由H_5N_2 高株引 起的,该毒株曾引起1983~1984年美国宾西法尼亚州和新泽西州禽流感的爆发。在1986~1 989年间,从美国的养禽场和活禽市场分离到了多株H_5N_2毒株。通过对11个病毒株的血凝 素的非 结构基因完整的代码序列和血凝素亚单位蛋白1的序列检测,并将其和以前分离到的毒株序 列进行比较。结果表明1986~1989年分离到的H_5N_2毒株和1983~1984年引发宾西法尼 亚州禽流感 的毒株具有高度同源性。研究进一步证实了禽流感长期存在和进化于美国的活禽市场,为活 禽场与1983年宾西尼亚州禽流感爆发的相关性提供了更多的依据。 展开更多
关键词 禽流感 血凝素 非结构基因 序列分析 H5N2毒株
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7株鹅细小病毒的克隆序列分析与分子特性 被引量:4
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作者 刘中勇 李福伟 +3 位作者 曹宗喜 李惠敏 吴玄光 张桂红 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第7期11-13,共3页
参照GenBank中收录的鹅细小病毒(GPV)B株基因序列设计并合成了扩增GPV分离株的3对引物,利用PCR技术扩增7株小鹅瘟病毒的非结构蛋白基因和结构蛋白基因。然后将其克隆到pMD18-T载体上,筛选重组质粒并进行了序列测定及分析,测序结果表明,... 参照GenBank中收录的鹅细小病毒(GPV)B株基因序列设计并合成了扩增GPV分离株的3对引物,利用PCR技术扩增7株小鹅瘟病毒的非结构蛋白基因和结构蛋白基因。然后将其克隆到pMD18-T载体上,筛选重组质粒并进行了序列测定及分析,测序结果表明,GPV分离株非结构蛋白基因由1884个核苷酸组成,编码627个氨基酸;结构蛋白由2199个核苷酸组成,编码732个氨基酸。拼接非结构蛋白和结构蛋白的全序列,不同毒株的同源性分别为94.3%~99.2%和92.6%~98.5%。表明目前国内的鹅细小病毒的同源性比较高,但是强弱毒株也存在一定的差别。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 结构蛋白基因 结构蛋白基因
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