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题名黄瓜FtsZs基因家族鉴定及分析
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作者
陈琳杰
常婧姝
张宇
颜爽
任仲海
王丽娜
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机构
山东农业大学园艺科学与工程学院
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出处
《山东农业大学学报（自然科学版）》
北大核心
2024年第5期774-781,共8页
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基金
国家自然科学基金(31972419,31672170)
山东“双一流”专项建设基金(SYL2017YSTD06)
+1 种基金
山东省泰山学者建设工程(ts20130932)
山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(2022LZGCQY001)。
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文摘
FtsZ蛋白作为微管蛋白同源物,常通过自我组装成一个收缩的细胞骨架元素“Z”环,影响质体分裂。但是,黄瓜FtsZ蛋白的研究尚未见报道,其功能尚不明确。本文利用生物信息学方法在黄瓜中鉴定到了3个FtsZ蛋白,并将它们分为2组。序列分析发现它们的长度在4493~6264bp之间,含有6~7个外显子,氨基酸长度为421~488AA,分布在3号或6号染色体上;亚细胞定位预测结果显示,黄瓜FtsZ定位于叶绿体或细胞质;RNA-seq分析发现黄瓜FtsZs在茎、叶、雌花和子房表达较高,荧光定量PCR结果显示黄瓜CsFtsZ2-1基因在雄花中的表达量也较高,表明黄瓜FtsZs基因在叶、花和子房生长发育中发挥功能;此外,在胁迫响应过程中,CsFtsZ2-1基因可响应盐胁迫,CsFtsZ1、CsFtsZ2-1和CsFtsZ2-2可响应冷胁迫,CsFtsZ1和CsFtsZ2-1可响应白粉病病原菌侵染。本文章结果为进一步研究FtsZs基因在黄瓜中的作用和机制提供了参考和依据。
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关键词
黄瓜
FtsZs基因
生物信息学分析
非生物胁迫反应
生物胁迫反应
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Keywords
Cucumber
FtsZ gene
bioinformatics analysis
abiotic stress response
biotic stress response
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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