目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB...目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株，首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207（RD207）的缺失情况，以鉴定收集的菌株是否为北京基因型；然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况，以及菌株基因组NTF（noise transfer function）区中插入序列6110（IS6110）的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中，517株（91．2％）为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中，447株（86．5％）为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株；70株（13．5％）为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析，北京基因型菌株被分为5个亚型，其中RD181（＋）的北京基因型菌株为22株（4．3％），且全部为北京基因型古代株。RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的北京基因型古代株分别为41株（7．9％）和7株（1．4％）。447株现代菌株中，RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的分别为404株（78．1％）和43株（8．3％）。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株；北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支，其中RD181（-）／RD150（＋）的北京基因型现代株为主要的流行分支。展开更多
目的对重庆地区耐多药结核患者结核分枝杆菌进行基因分型,明确该地区基因类型的特征和流行情况。方法连续收集重庆市公共卫生医疗救治中心和重庆市第十二人民医院结核内科2013年7月至2015年3月753例临床诊断为耐多药结核患者的痰液或其...目的对重庆地区耐多药结核患者结核分枝杆菌进行基因分型,明确该地区基因类型的特征和流行情况。方法连续收集重庆市公共卫生医疗救治中心和重庆市第十二人民医院结核内科2013年7月至2015年3月753例临床诊断为耐多药结核患者的痰液或其他体液,采用液体培养法分离培养分枝杆菌,采用PCR方法对分枝杆菌分离株进行菌种鉴定,并使用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number of tandem repeat analysis,MLVA)方法进行基因分型。采用Bionumerics Version 3.0和phyloviz软件进行各基因位点的多态性和成簇分析。结果共分离培养出538例耐多药分枝杆菌菌株,经PCR鉴定确认结核分枝杆菌有503例(95.8%),非结核分枝杆菌有35例(4.2%)。北京家族型470例(93.4%,470/503),非北京家族型33例(6.6%,33/503)。503例分枝杆菌菌株共分为348个基因型,其中267例患者分离株为单一基因型,其余236例菌株可归入81个簇,成簇率为30.8%。北京家族型有76个簇,成簇率为30.8%,成簇比例为35.9%,非北京家族型有5个簇,成簇率为30.3%,成簇比例为33.3%。不同特征的耐多药结核人群对结核分枝杆菌北京基因型菌株易感因素分析:感染北京基因型菌株与性别无显著性关联(χ~2=2.68,P>0.05);与年龄呈显著性关联(χ~2=784.00,P<0.05)。结论重庆地区耐多药结核分枝杆菌的基因型存在明显的多态性,北京基因型占绝对优势;不同特征耐多药结核人群感染北京基因型菌株与性别无关,与年龄相关。展开更多
文摘目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株，首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207（RD207）的缺失情况，以鉴定收集的菌株是否为北京基因型；然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况，以及菌株基因组NTF（noise transfer function）区中插入序列6110（IS6110）的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中，517株（91．2％）为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中，447株（86．5％）为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株；70株（13．5％）为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析，北京基因型菌株被分为5个亚型，其中RD181（＋）的北京基因型菌株为22株（4．3％），且全部为北京基因型古代株。RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的北京基因型古代株分别为41株（7．9％）和7株（1．4％）。447株现代菌株中，RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的分别为404株（78．1％）和43株（8．3％）。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株；北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支，其中RD181（-）／RD150（＋）的北京基因型现代株为主要的流行分支。
文摘目的对重庆地区耐多药结核患者结核分枝杆菌进行基因分型,明确该地区基因类型的特征和流行情况。方法连续收集重庆市公共卫生医疗救治中心和重庆市第十二人民医院结核内科2013年7月至2015年3月753例临床诊断为耐多药结核患者的痰液或其他体液,采用液体培养法分离培养分枝杆菌,采用PCR方法对分枝杆菌分离株进行菌种鉴定,并使用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number of tandem repeat analysis,MLVA)方法进行基因分型。采用Bionumerics Version 3.0和phyloviz软件进行各基因位点的多态性和成簇分析。结果共分离培养出538例耐多药分枝杆菌菌株,经PCR鉴定确认结核分枝杆菌有503例(95.8%),非结核分枝杆菌有35例(4.2%)。北京家族型470例(93.4%,470/503),非北京家族型33例(6.6%,33/503)。503例分枝杆菌菌株共分为348个基因型,其中267例患者分离株为单一基因型,其余236例菌株可归入81个簇,成簇率为30.8%。北京家族型有76个簇,成簇率为30.8%,成簇比例为35.9%,非北京家族型有5个簇,成簇率为30.3%,成簇比例为33.3%。不同特征的耐多药结核人群对结核分枝杆菌北京基因型菌株易感因素分析:感染北京基因型菌株与性别无显著性关联(χ~2=2.68,P>0.05);与年龄呈显著性关联(χ~2=784.00,P<0.05)。结论重庆地区耐多药结核分枝杆菌的基因型存在明显的多态性,北京基因型占绝对优势;不同特征耐多药结核人群感染北京基因型菌株与性别无关,与年龄相关。
