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题名芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析
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作者
李云宾
黎玉萍
成钦
林春
毛自朝
刘正杰
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机构
云南农业大学农学与生物技术学院
云南省作物生产与智慧农业重点实验室
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出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第1期198-209,共12页
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基金
国家自然科学基金项目(32360089)
云南省基础研究计划面上项目(202201AT070254)。
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文摘
【目的】对芦笋全基因组DUF247家族进行鉴定与分析,为该基因家族特别是AoSOFF的性别决定的分子功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对芦笋中的DUF247基因家族成员进行鉴定,开展其各成员编码蛋白理化性质、聚类、蛋白保守结构域、启动子中顺式作用元件及表达模式分析;利用实时定量PCR(RT-qPCR)和组织原位杂交技术验证芦笋性别决定基因AoSOFF的表达模式。【结果】芦笋中鉴定出24个DUF247基因家族成员,它们不均匀地分布在7条染色体上,且在不同器官中呈现差异表达。该家族成员编码蛋白的理化性质如氨基酸组成、分子量、理论等电点、不稳定系数和脂肪族系数等都存在差异。RT-qPCR和组织原位杂交结果表明,DUF247基因家族成员之一AoSOFF在芦笋雄花无性别分化早期的雌蕊、雄蕊以及花冠中均有较高表达,但在性别分化早期开始降低表达;在两性花中的表达量较低;而在雌性芦笋各组织中表达极低或检测不到,说明AoSOFF在雄性芦笋中特异性表达,与芦笋性别决定中的雌性抑制功能密切相关。【结论】芦笋DUF247家族成员具有明显的保守性,在芦笋不同性别的不同组织中的表达模式存在显著差异,特别是AoSOFF是一个雄性专一性基因,其同源基因参与植物的自交亲和调控,预示其以自交不亲和类似的反应导致雌性发育的抑制。
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关键词
芦笋
DUF247
AoSOFF
性别分化
雄性专一性
雌性抑制
原位杂交
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Keywords
Asparagus officinalis
DUF247
AoSOFF
sex differentiation
male specificity
female inhibition
in situ hybridization
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分类号
S644.6
[农业科学—蔬菜学]
Q943.2
[生物学—植物学]
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