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家猪基因组含有大量保守非编码区(英文)
1
作者
钟兰
李蔚
李松岗
《北京大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期792-798,共7页
用 190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组 ,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区 ,得到大量含有保守非编码区的家猪序列。 11 0 5 %的家猪读序含有“猪 人”保守的非编码区序列 ,3 13%的家猪读序含有“猪 鼠”保守的非...
用 190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组 ,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区 ,得到大量含有保守非编码区的家猪序列。 11 0 5 %的家猪读序含有“猪 人”保守的非编码区序列 ,3 13%的家猪读序含有“猪 鼠”保守的非编码区片段 ,1 86 %的家猪读序包含“猪 人 鼠”三者保守的非编码区区域。三者保守的非编码区序列跟人的相似性明显高于跟小鼠的相似性。另外 ,很多人、小鼠的非编码RNA基因跟上述含有保守非编码片段的家猪序列至少比对上一次。
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关键词
随机读序
保守的非编码
序
列
非编码RNA基因
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题名
家猪基因组含有大量保守非编码区(英文)
1
作者
钟兰
李蔚
李松岗
机构
北京大学生命科学院
中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心
中国科学院生物物理所生物信息研究室
出处
《北京大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期792-798,共7页
基金
"中国 丹麦"家猪基因组国际合作项目资助
文摘
用 190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组 ,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区 ,得到大量含有保守非编码区的家猪序列。 11 0 5 %的家猪读序含有“猪 人”保守的非编码区序列 ,3 13%的家猪读序含有“猪 鼠”保守的非编码区片段 ,1 86 %的家猪读序包含“猪 人 鼠”三者保守的非编码区区域。三者保守的非编码区序列跟人的相似性明显高于跟小鼠的相似性。另外 ,很多人、小鼠的非编码RNA基因跟上述含有保守非编码片段的家猪序列至少比对上一次。
关键词
随机读序
保守的非编码
序
列
非编码RNA基因
Keywords
random reads
conserved non-coding sequence(CNS)
non-coding RNA(ncRNA)
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家猪基因组含有大量保守非编码区(英文)
钟兰
李蔚
李松岗
《北京大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003
0
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