目的 应用随机生存森林模型探讨基因数据中结直肠癌患者预后影响因素。方法 利用TCGA数据库中结直肠癌基因表达数据,对差异表达基因进行筛选,结合临床与生存信息构建RSF模型,并与传统Lasso-Cox回归模型进行比较。结果 通过RSF模型得到包...目的 应用随机生存森林模型探讨基因数据中结直肠癌患者预后影响因素。方法 利用TCGA数据库中结直肠癌基因表达数据,对差异表达基因进行筛选,结合临床与生存信息构建RSF模型,并与传统Lasso-Cox回归模型进行比较。结果 通过RSF模型得到包括HAND1(VIMP=0.090)和PCOLCE2(VIMP=0.075)基因表达在内的13个影响结直肠癌患者预后的重要因素,并分析了病理学N分期、PCOLCE2基因及IGSF9基因变量之间的交互作用。与Lasso-Cox模型比较结果显示,尽管RSF模型预测错误率略高(1-C-index:训练集:0.296 vs. 0.213;测试集:0.369 vs. 0.332),但具有更好的模型校准度(IBS:训练集:0.205 vs. 0.214;测试集:0.210 vs. 0.221)。结论 RSF模型在处理右删失生存数据的分析时具有良好的表现,能发现重要的影响因素以及变量之间的交互作用,为结直肠癌患者预后状况的改善和生命质量的提升提供了科学依据。展开更多
目的:探讨健康社会决定因素(social determinants of health,SDOH)水平对脑卒中发病风险的影响,揭示不同SDOH水平地区人群脑卒中主要危险因素。方法:入选中国高血压调查2012~2015年采用分层多阶段随机抽样方法在全国14个省级行政区30个...目的:探讨健康社会决定因素(social determinants of health,SDOH)水平对脑卒中发病风险的影响,揭示不同SDOH水平地区人群脑卒中主要危险因素。方法:入选中国高血压调查2012~2015年采用分层多阶段随机抽样方法在全国14个省级行政区30个区县中抽取的30036名≥35岁的常驻居民,调查心血管疾病患病及相关危险因素情况,并于2018~2019年随访脑卒中事件。使用主成分分析依据社会经济和医疗资源相关9个指标构建SDOH得分,并根据其三分位数将研究对象分为三组:SDOH得分在≥-2.01~<-1.14分为低SDOH组(n=8343),≥-1.14~<0.10分为中SDOH组(n=7257),≥0.10~≤5.79分为高SDOH组(n=8457)。使用多因素Cox比例风险回归分析SDOH水平与脑卒中发病风险的关系。采用随机生存森林方法探究不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素。结果:最终纳入24057名研究对象,平均随访(4.7±0.8)年期间,669例(2.8%)发生脑卒中。低、中和高SDOH组脑卒中的发病密度分别为468.39/10万人年、628.85/10万人年和700.39/10万人年(Pdifference<0.05,Ptrend=0.01)。与低SDOH组相比,中、高SDOH组发生脑卒中的HR(95%CI)分别为1.91(1.54~2.36)和1.59(1.30~1.95);随着SDOH水平升高,脑卒中发病风险呈现上升趋势(Ptrend<0.001)。高龄是人群脑卒中首要危险因素,特别是高SDOH水平地区。在中SDOH水平地区,糖尿病是脑卒中的重要的可改变危险因素。低SDOH水平地区,高血压和饮酒是重要的可改变危险因素。结论:脑卒中发病风险与高SDOH水平相关联;不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素不同。建议通过实施有针对性的干预措施,提高不同SDOH地区人群脑卒中防治效果。展开更多
文摘目的 应用随机生存森林模型探讨基因数据中结直肠癌患者预后影响因素。方法 利用TCGA数据库中结直肠癌基因表达数据,对差异表达基因进行筛选,结合临床与生存信息构建RSF模型,并与传统Lasso-Cox回归模型进行比较。结果 通过RSF模型得到包括HAND1(VIMP=0.090)和PCOLCE2(VIMP=0.075)基因表达在内的13个影响结直肠癌患者预后的重要因素,并分析了病理学N分期、PCOLCE2基因及IGSF9基因变量之间的交互作用。与Lasso-Cox模型比较结果显示,尽管RSF模型预测错误率略高(1-C-index:训练集:0.296 vs. 0.213;测试集:0.369 vs. 0.332),但具有更好的模型校准度(IBS:训练集:0.205 vs. 0.214;测试集:0.210 vs. 0.221)。结论 RSF模型在处理右删失生存数据的分析时具有良好的表现,能发现重要的影响因素以及变量之间的交互作用,为结直肠癌患者预后状况的改善和生命质量的提升提供了科学依据。
文摘目的:探讨健康社会决定因素(social determinants of health,SDOH)水平对脑卒中发病风险的影响,揭示不同SDOH水平地区人群脑卒中主要危险因素。方法:入选中国高血压调查2012~2015年采用分层多阶段随机抽样方法在全国14个省级行政区30个区县中抽取的30036名≥35岁的常驻居民,调查心血管疾病患病及相关危险因素情况,并于2018~2019年随访脑卒中事件。使用主成分分析依据社会经济和医疗资源相关9个指标构建SDOH得分,并根据其三分位数将研究对象分为三组:SDOH得分在≥-2.01~<-1.14分为低SDOH组(n=8343),≥-1.14~<0.10分为中SDOH组(n=7257),≥0.10~≤5.79分为高SDOH组(n=8457)。使用多因素Cox比例风险回归分析SDOH水平与脑卒中发病风险的关系。采用随机生存森林方法探究不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素。结果:最终纳入24057名研究对象,平均随访(4.7±0.8)年期间,669例(2.8%)发生脑卒中。低、中和高SDOH组脑卒中的发病密度分别为468.39/10万人年、628.85/10万人年和700.39/10万人年(Pdifference<0.05,Ptrend=0.01)。与低SDOH组相比,中、高SDOH组发生脑卒中的HR(95%CI)分别为1.91(1.54~2.36)和1.59(1.30~1.95);随着SDOH水平升高,脑卒中发病风险呈现上升趋势(Ptrend<0.001)。高龄是人群脑卒中首要危险因素,特别是高SDOH水平地区。在中SDOH水平地区,糖尿病是脑卒中的重要的可改变危险因素。低SDOH水平地区,高血压和饮酒是重要的可改变危险因素。结论:脑卒中发病风险与高SDOH水平相关联;不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素不同。建议通过实施有针对性的干预措施,提高不同SDOH地区人群脑卒中防治效果。
