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随机扩增多态性DNA技术在中药红曲基原菌系统分类中的应用 被引量:10
1
作者 宓鹤鸣 邢旺兴 +2 位作者 程荣珍 贺祥 吴玉田 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第10期944-946,共3页
目的 :建立中药红曲基原菌的随机扩增多态性 DNA( RAPD)分析方法。 方法 :以 CTAB法提取紫色红曲霉等 7种红曲霉和 1株土曲霉的基因组 DNA;溴化乙啶荧光强度和分光光度双重测定法确定 DNA浓度 ;琼脂糖凝胶电泳法检测 PCR扩增产物 ,PHYL ... 目的 :建立中药红曲基原菌的随机扩增多态性 DNA( RAPD)分析方法。 方法 :以 CTAB法提取紫色红曲霉等 7种红曲霉和 1株土曲霉的基因组 DNA;溴化乙啶荧光强度和分光光度双重测定法确定 DNA浓度 ;琼脂糖凝胶电泳法检测 PCR扩增产物 ,PHYL IP 3.5 c进行聚类分析。 结果 :从 6 0个随机引物中筛选出 S2 82 等 10个引物的扩增产物谱带多 ,特征好 ;红曲霉属种间指纹图谱差异较大 ,呈现出明显的 DNA扩增产物多态性。 结论 :RAPD分析技术可作为真菌系统分类的客观而有效的手段之一。 展开更多
关键词 红曲 红曲霉菌 随机扩增多态性dna 分类 中药
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随机扩增多态性DNA分型法用于酵母菌基因分型 被引量:7
2
作者 项明洁 彭奕冰 +5 位作者 孙景勇 刘明 沈韻 施勇旻 戴屹东 倪语星 《上海第二医科大学学报》 CSCD 北大核心 2005年第6期572-574,共3页
目的研究酵母菌随机扩增多态性DNA分型法(RAPD)的最佳实验条件。方法在改变引物、Mg2+、模板浓度、Taq多聚酶用量等不同条件下,采用RAPD法对酵母菌进行基因分型。结果经优化后的RAPD方法能清晰地对酵母菌进行基因分型。结论RAPD是从分... 目的研究酵母菌随机扩增多态性DNA分型法(RAPD)的最佳实验条件。方法在改变引物、Mg2+、模板浓度、Taq多聚酶用量等不同条件下,采用RAPD法对酵母菌进行基因分型。结果经优化后的RAPD方法能清晰地对酵母菌进行基因分型。结论RAPD是从分子水平对酵母菌感染进行病原学、流行病学研究的一种快速、可靠的分子生物学分型方法。 展开更多
关键词 随机扩增多态性dna 基因分型 分型法 最佳实验条件 RAPD 流行病学研究 MG^2+ 酵母菌感染 分子生物学 分子水平 分型方法 多聚酶 Taq 病原学
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沙门氏菌属随机扩增多态性DNA PCR条件的优化 被引量:4
3
作者 粟婉媛 侯家奎 +4 位作者 柳婷 郭爱玲 王洪江 谢跻 马美湖 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第20期320-323,共4页
目的:以5′-CCGAAGCTGC-3′为引物,利用随机引物扩增多态性DNA技术(random amplified polymorphic DNA,RAPD)对沙门氏菌属的几种菌株进行扩增,以确定RAPD的最终优化条件。方法:首先选用25μl体系PCR和50μl体系PCR做对比,以确定进行RAP... 目的:以5′-CCGAAGCTGC-3′为引物,利用随机引物扩增多态性DNA技术(random amplified polymorphic DNA,RAPD)对沙门氏菌属的几种菌株进行扩增,以确定RAPD的最终优化条件。方法:首先选用25μl体系PCR和50μl体系PCR做对比,以确定进行RAPD实验最佳的PCR体系。其次进行PCR反应体系条件的优化,对PCR复性温度、引物浓度、Mg2+浓度进行条件优化。最后对初步确定的优化结果进行不同琼脂糖胶浓度梯度的优化以确定RAPD的最终优化条件。结果:RAPD优化条件为PCR复性32℃,25mmol/LMg2+溶液体积2.0μl,10μmol/L引物体积0.2μl,琼脂糖胶浓度1.0%。结论:在优化条件下,以引物5′-CCGAAGCTGC-3′对沙门氏菌属的3种标准菌株,9株食品分离株进行扩增,得到的电泳条带最多,且最清晰。 展开更多
关键词 沙门氏菌 地方菌株 随机扩增多态性dna 优化
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随机扩增多态性DNA在细菌鉴定分型中的影响因素 被引量:5
4
作者 赵蕊 王军 +1 位作者 李跃旗 石建时 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第8期724-725,共2页
为探讨各种试剂的浓度及不同DNA扩增仪对随机扩增多态性DNA(randomlyamplifiedpolymorphicDNA ;RAPD)的影响因素。用不同浓度引物、4×dNTP等试剂及 3种不同型号DNA扩增仪对 11株致病弧菌进行RAPD扩增。结果 11株致病弧菌分成 4型 ... 为探讨各种试剂的浓度及不同DNA扩增仪对随机扩增多态性DNA(randomlyamplifiedpolymorphicDNA ;RAPD)的影响因素。用不同浓度引物、4×dNTP等试剂及 3种不同型号DNA扩增仪对 11株致病弧菌进行RAPD扩增。结果 11株致病弧菌分成 4型 ,重复性好。不同引物、4×dNTP对RAPD构成一定影响 ,3种DNA扩增仪产生的DNA指纹图谱基本一致。提示用于RAPD的试剂可以标准化 。 展开更多
关键词 影响因素 随机扩增多态性dna技术 细菌分技术 质量控制
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丁[鱼岁]遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析 被引量:5
5
作者 杨太有 陈宏喜 +1 位作者 关建义 刘向奇 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期111-113,共3页
利用RAPD分子标记技术对15个丁[鱼岁]养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200-3 0... 利用RAPD分子标记技术对15个丁[鱼岁]养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200-3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0-0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁[鱼岁]养殖群体的遗传多样性水平较低. 展开更多
关键词 丁[鱼岁] 遗传多样 随机扩增多态性dna
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甜叶菊随机扩增多态性DNA技术优化及亲缘关系研究 被引量:3
6
作者 胡能兵 何克勤 +3 位作者 张子学 林平 隋益虎 崔广荣 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期159-162,166,共5页
以甜叶菊为试材,对影响其随机扩增多态性DNA标记反应体系的7个因子进行优化,同时对来自国内外的12个品种进行亲缘关系分析。结果表明,20μL的优化体系包括:双蒸水13.6μL,10×Buffer(含15mmol/LMgCl2)溶液3μL,2.5mmol/L的dNTPS1.2... 以甜叶菊为试材,对影响其随机扩增多态性DNA标记反应体系的7个因子进行优化,同时对来自国内外的12个品种进行亲缘关系分析。结果表明,20μL的优化体系包括:双蒸水13.6μL,10×Buffer(含15mmol/LMgCl2)溶液3μL,2.5mmol/L的dNTPS1.2μL,10μmol/L的引物1μL,20ng的模板DNA1μL,1UTaq聚合酶;热循环程序为:94℃预变性4min,94℃变性30s,35℃退火30s,72℃延伸1min,40个循环,最后72℃延伸7min。聚类图结果表明,品种间的遗传距离变异范围为0.12~0.88,在遗传距离为0.37时,8个引物可将12个品种分为四大类,来自日本的2个品种与国内品种关系较远。 展开更多
关键词 甜叶菊 随机扩增多态性dna 优化 亲缘关系
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随机扩增多态性DNA(RAPD)技术用于青海田鼠鼠疫菌株亲缘性的研究 被引量:6
7
作者 崔百忠 金丽霞 +7 位作者 李敏 戴瑞霞 赵海红 祁芝珍 马英 席亚芳 冯建萍 金星 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2003年第1期58-59,共2页
目的 对青海省称多县境内和四川省石渠县境内青海田鼠体内分离的 32株鼠疫耶尔森氏菌的基因进行分析 ,明确两地鼠疫耶尔森氏菌间的亲缘关系。方法 用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术。结果 扩增产物在凝胶电泳上显示的条带 ,除 7株菌略... 目的 对青海省称多县境内和四川省石渠县境内青海田鼠体内分离的 32株鼠疫耶尔森氏菌的基因进行分析 ,明确两地鼠疫耶尔森氏菌间的亲缘关系。方法 用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术。结果 扩增产物在凝胶电泳上显示的条带 ,除 7株菌略有不同外 ,其余 2 5株均相同。TreeView[Win32 ]统计软件分析的结果也显示两地鼠疫耶尔森氏菌之间具有很近的亲缘关系。结论 青海省称多县和四川省石渠县青海田鼠体内分离到的鼠疫耶尔森氏菌在遗传学上属同一来源。 展开更多
关键词 随机扩增多态性dna 青海田鼠 鼠疫耶尔森氏菌
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中国太湖和荷兰的中华绒螯蟹随机扩增多态性DNA分析 被引量:5
8
作者 马春艳 陈亚瞿 张凤英 《海洋渔业》 CSCD 2005年第4期276-280,共5页
用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对中华绒螯蟹两个群体(荷兰盐城湖和中国太湖)进行了检测,从40个随机引物中筛选出14个对两群体进行扩增分析.结果为:14个引物共检测到100条清晰且重复性好的条带,分子量在200~2000bp之间,太湖和盐城湖两群... 用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对中华绒螯蟹两个群体(荷兰盐城湖和中国太湖)进行了检测,从40个随机引物中筛选出14个对两群体进行扩增分析.结果为:14个引物共检测到100条清晰且重复性好的条带,分子量在200~2000bp之间,太湖和盐城湖两群体的多态位点比例、Shannon多样性指数、Nei基因多样性指数分别为:46%和44%、0.2195和0.1976、0.1446和0.1270,两群体的遗传距离为0.013.据此结果推断,中华绒螯蟹群体遗传多样性不高,种内群体间的遗传变异较低,其遗传资源亟待保护,同时验证了荷兰的中华绒螯蟹是从中国引进繁衍的推论. 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 随机扩增多态性dna 遗传多样 分子标记
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ICU铜绿假单胞菌感染暴发的随机扩增多态性DNA分子分型 被引量:2
9
作者 庞杏林 李孝权 +5 位作者 张欣强 胡玉山 刘俊华 邓志爱 陈守义 莫自耀 《中国感染控制杂志》 CAS 2009年第5期315-317,345,共4页
目的对铜绿假单胞菌(PA)进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分子分型,探讨重症监护室(ICU)中PA医院感染的流行规律。方法采用RAPD技术对13株分离自某院ICU临床诊断为医院感染肺炎患者下呼吸道标本的PA进行分型,并与抗菌药物耐药谱分型比较。结... 目的对铜绿假单胞菌(PA)进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分子分型,探讨重症监护室(ICU)中PA医院感染的流行规律。方法采用RAPD技术对13株分离自某院ICU临床诊断为医院感染肺炎患者下呼吸道标本的PA进行分型,并与抗菌药物耐药谱分型比较。结果 13株PA产生A型(12株,92.31%)和B型(1株,7.69%)2种耐药表型,优势耐药表型为A型;RAPD分型可分2型,分别为Ⅰ型(6株,46.15%)和Ⅱ型(7株,53.85%)。7株分子Ⅱ型和5株分子Ⅰ型的耐药A型PA是优势菌株,可判断为引起ICU中PA医院感染暴发的病原菌。结论 ICU存在PA暴发流行,流行株为耐药A型/分子Ⅱ型、耐药A型/分子Ⅰ型。PA产生多重耐药性,RAPD分型是目前比较理想的分子流行病学溯源手段。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 重症监护室 医院感染 暴发流行 流行病学 随机扩增多态性dna 抗药 微生物
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口腔白色假丝酵母菌毒力因子与随机扩增多态性DNA条带的多元回归分析 被引量:1
10
作者 刘奇 武有聪 +2 位作者 袁有华 白丽 牛坤 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期643-645,共3页
目的探讨白色假丝酵母菌毒力因子与随机扩增多态性DNA(RAPD)电泳条带之间的关系,构建多元回归模型。方法采用体外法对92株白色假丝酵母菌的细胞外磷脂酶活性、分泌性蛋白酶活性、芽管生成率、对口腔黏膜细胞的黏附力进行检测;并通过RAP... 目的探讨白色假丝酵母菌毒力因子与随机扩增多态性DNA(RAPD)电泳条带之间的关系,构建多元回归模型。方法采用体外法对92株白色假丝酵母菌的细胞外磷脂酶活性、分泌性蛋白酶活性、芽管生成率、对口腔黏膜细胞的黏附力进行检测;并通过RAPD方法进行扩增,电泳后分析扩增条带。对上述毒力因子和电泳条带进行多元回归分析。结果白色假丝酵母菌的细胞外磷脂酶活性与RAPD扩增后350、450、650和1300 bp 4个条带明显相关(P<0.05);分泌性蛋白酶活性与350、1 200 bp 2个条带明显相关(P<0.05);芽管生成率与400、550 bp 2个条带明显相关(P<0.05)。结论白色假丝酵母菌RAPD部分电泳条带与部分毒力因子的强弱有关,其所含基因信息可能参与该菌毒力因子的调节。 展开更多
关键词 白色假丝酵母菌 毒力 随机扩增多态性dna 多元回归
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木豆随机扩增多态性DNA的反应体系研究 被引量:4
11
作者 蒋慧萍 李杨瑞 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第20期8489-8491,共3页
[目的]分析影响木豆RAPD-PCR反应中的主要因素,优化反应条件。[方法]以木豆品种ICPL87091为试材,以木豆基因组DNA为模板,通过对PCR反应体系中各种参数的优化设置,分析比较各种因素对RAPD扩增结果的影响,建立适宜的反应体系。[结果]试验... [目的]分析影响木豆RAPD-PCR反应中的主要因素,优化反应条件。[方法]以木豆品种ICPL87091为试材,以木豆基因组DNA为模板,通过对PCR反应体系中各种参数的优化设置,分析比较各种因素对RAPD扩增结果的影响,建立适宜的反应体系。[结果]试验得到了较为理想的适宜木豆的反应体系。优化的木豆RAPD反应条件为:模板DNA浓度30 ng,随机引物1.6μmol/L,dNTPs(dATP,dCTP,dGTP,dTTP)各0.2 mmol/L,Mg2+浓度2.0 mmol/L,Taq酶1.0 U,反应体积为25μl。循环体系为:先94℃1 min,35℃2 min,72℃2 min,5个循环;然后94℃30 s,37℃1 min,72℃1 min,35个循环;最后72℃延伸10 min。[结论]利用这一反应体系可有效地进行木豆随机扩增多态性DNA分析,极大地提高了实验结果的可重复性。 展开更多
关键词 木豆 随机扩增多态性dna 分子标记 反应体系
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5种帘蛤科贝类随机扩增多态性DNA比较分析 被引量:2
12
作者 金彬明 李佩珍 应俊 《水利渔业》 北大核心 2006年第3期14-15,23,共3页
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对浙江南部海区硬壳蛤、等边浅蛤、青蛤、菲律宾蛤仔和文蛤的遗传多样性进行了分析和比较。5个种群的群间遗传距离明显大于群内遗传距离;群内相似性系数由高到低依次为等边浅蛤(0.681),青蛤(0.656),文... 利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对浙江南部海区硬壳蛤、等边浅蛤、青蛤、菲律宾蛤仔和文蛤的遗传多样性进行了分析和比较。5个种群的群间遗传距离明显大于群内遗传距离;群内相似性系数由高到低依次为等边浅蛤(0.681),青蛤(0.656),文蛤(0.606),菲律宾蛤仔(0.537),硬壳蛤(0.526);UPG-MA分析显示等边浅蛤、菲律宾蛤仔聚为一组,青蛤、文蛤、硬壳蛤聚为一组,然后进行总的聚类。硬壳蛤作为浙江南部新引进的海水养殖外来物种,遗传多样性优势明显;平阳县南麂列岛的等边浅蛤则迫切需要进行资源保护并开展品种选育工作。 展开更多
关键词 随机扩增多态性dna 硬壳蛤 等边浅蛤 青蛤 文蛤 菲律宾蛤仔
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三种笛鲷属鱼类的随机扩增多态性DNA初步研究 被引量:2
13
作者 易乐飞 刘楚吾 《湛江海洋大学学报》 CAS 2001年第1期70-72,共3页
关键词 红鳍笛鲷 紫红笛鲷 勒氏笛鲷 随机扩增多态性dna(RAPD)
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文蛤、青蛤和四角蛤蜊的随机扩增多态性DNA(RAPD)的比较分析 被引量:1
14
作者 陈大鹏 沈怀舜 +2 位作者 丁亚平 杨家新 许璞 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期84-87,共4页
利用随机扩增多态性 DNA (RAPD) 技术,对吕四海区的三种重要的水产贝类:文蛤、青蛤和四角蛤蜊的遗传多样性进行了分析和比较。用 60 个随机引物对三种贝类共 24 个样品进行随机扩增,从中选取了 45 个扩增效果比较稳定的引物用于群体分析... 利用随机扩增多态性 DNA (RAPD) 技术,对吕四海区的三种重要的水产贝类:文蛤、青蛤和四角蛤蜊的遗传多样性进行了分析和比较。用 60 个随机引物对三种贝类共 24 个样品进行随机扩增,从中选取了 45 个扩增效果比较稳定的引物用于群体分析,共得到了 250 个位点。根据 Nei 氏公式计算出 3 种贝类种间和种内的遗传相似性指数和相对遗传距离,并进行聚类分析。通过比较分析,3 种贝类之间的遗传距离差异不大;相对与青蛤和四角蛤蜊,文蛤种内的遗传距离要小。 展开更多
关键词 随机扩增多态性dna 基因组dna 四角蛤蜊 青蛤 文蛤
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随机扩增多态性DNA技术检测不同地区田鼠型鼠疫耶尔森氏菌基因结构 被引量:5
15
作者 崔百忠 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第4期344-345,共2页
目的 了解不同地区田鼠型鼠疫耶尔森氏菌 (以下简称鼠疫菌 )之间的亲缘关系和基因类型。方法 随机扩增多态性DNA(RAPD)技术。结果 扩增的 13株田鼠型鼠疫耶尔森氏菌在凝胶电泳所显示的条带 ,除 3株菌缺少部分条带外 ,其余菌株基本相... 目的 了解不同地区田鼠型鼠疫耶尔森氏菌 (以下简称鼠疫菌 )之间的亲缘关系和基因类型。方法 随机扩增多态性DNA(RAPD)技术。结果 扩增的 13株田鼠型鼠疫耶尔森氏菌在凝胶电泳所显示的条带 ,除 3株菌缺少部分条带外 ,其余菌株基本相同。结论 青海田鼠型鼠疫耶尔森氏菌和布氏田鼠型鼠疫耶尔森氏菌具有相似性 ,在遗传学上属于同源。 展开更多
关键词 检测 田鼠型鼠疫耶尔森氏菌 随机扩增多态性dna技术 基因型
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以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术筛选意大利蜜蜂重要农艺性状遗传标记 被引量:6
16
作者 孙亮先 吉挺 +3 位作者 周斌 陈国宏 袁建军 黄周英 《中国养蜂》 2003年第6期6-8,共3页
为了获得意大利蜜蜂重要农艺性状的分子遗传标记 ,本研究以 30种RAPD随机引物对平湖浆蜂、美意、澳意、苏意等 4个在产浆、采蜜和抗病性上存在较大差异的意蜂品系的基因组DNA进行RAPD_PCR扩增筛选。试验结果显示 ,随机引物W 1 8(5′_CGG... 为了获得意大利蜜蜂重要农艺性状的分子遗传标记 ,本研究以 30种RAPD随机引物对平湖浆蜂、美意、澳意、苏意等 4个在产浆、采蜜和抗病性上存在较大差异的意蜂品系的基因组DNA进行RAPD_PCR扩增筛选。试验结果显示 ,随机引物W 1 8(5′_CGGACGGCGG_3′)和W2 3(5′_GTACCGCCCG_3′)的扩增图谱呈多态性。其中 ,在引物W 1 8所扩增出的 9条片断中 ,2 35 2bp和 36 4bp条带为美意所特有 ,表明可将之用于鉴别美意 ;2 0 92bp条带仅出现于蜂蜜高产的美意和澳意中 ,意味着该条带为一个蜂蜜高产性状的遗传标记 ;而 6 32bp条带在王浆高产品系平湖浆蜂中出现的频率 (0 91 )显著高于 (P <0 0 1 )美意(0 0 4 )、澳意 (0 0 2 )和苏意 (0 0 0 ) ,说明 6 32bp条带可能为王浆高产性状的一个遗传标记。在W2 3引物扩增条带中 ,6 5 1bp条带为澳意所特有 。 展开更多
关键词 RAPD 意大利蜜蜂 农艺 遗传标记 随机扩增多态性dna
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三叶青种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析 被引量:3
17
作者 尹明华 占学林 +3 位作者 徐文慧 谢妮妮 蔡红 陈荣华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第11期1839-1848,共10页
利用RAPD技术对64个三叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个三叶青样本的观测等位基因数(Na)为1. 666 7~2. 000 0,有效等位基因数(Ne)为1. 247 9~1. 701 3,Nei’s基因多样... 利用RAPD技术对64个三叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个三叶青样本的观测等位基因数(Na)为1. 666 7~2. 000 0,有效等位基因数(Ne)为1. 247 9~1. 701 3,Nei’s基因多样性指数为0. 167 0~0. 398 4,Shannon多样性指数(I)为0. 262 8~0. 583 0,平均多态位点为7. 5,平均多态百分数为93. 145%;在遗传相似系数0. 720 56处,可以将64个三叶青样本分成11大类;在遗传相似系数0. 697 04处,则可将64个三叶青样本分成4大类;聚类分析的结果与种源的地理距离存在不一致性,这可能与种质资源库的地形、气候等自然因素有关。表明所测三叶青种质资源遗传多样性丰富,具有一定的开发利用价值,可为合理保护三叶青的基因资源及其遗传改良提供科学依据。 展开更多
关键词 三叶青 种质资源 遗传多样 随机扩增多态性dna
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蝴蝶兰随机扩增多态性DNA分子标记体系优化
18
作者 崔广荣 胡能兵 +1 位作者 张子学 何克勤 《种子》 CSCD 北大核心 2012年第10期29-34,共6页
采用改良的SDS法提取蝴蝶兰叶片基因组DNA,并以其为模板对影响随机扩增多态性DNA(RAPD)扩增反应的主要因子采用递进分析方法进行优化,建立了蝴蝶兰RAPD反应体系。结果表明,所提DNA达到10 ng/μL,优化后的20μL反应体系为:10 mmol/L的dNT... 采用改良的SDS法提取蝴蝶兰叶片基因组DNA,并以其为模板对影响随机扩增多态性DNA(RAPD)扩增反应的主要因子采用递进分析方法进行优化,建立了蝴蝶兰RAPD反应体系。结果表明,所提DNA达到10 ng/μL,优化后的20μL反应体系为:10 mmol/L的dNTPs 0.5μL,10 ng/μL的模板DNA 0.5μL,25 mmol/L的MgCl22.4μL,2 U Taq聚合酶,10μmol/L的引物0.5μL,10×Buffer溶液2μL,双蒸水15.7μL。优化后的扩增程序为:94℃预变性5 min,94℃变性1 min,36℃退火1 min,72℃延伸1.5 min,42次循环,最后72℃延伸10 min。 展开更多
关键词 蝴蝶兰 随机扩增多态性dna 优化
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随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析
19
作者 王羽 董文龙 +2 位作者 张喜庆 马红霞 高云航 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第12期19-23,共5页
随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRN... 随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S^23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S^23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S^23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。 展开更多
关键词 绿色气球菌 16S^23S RRNA 随机扩增多态性dna技术
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金樱子随机扩增多态性DNA分析
20
作者 王晓丽 王晓玲 常楚瑞 《安徽农业科学》 CAS 2015年第7期23-24,60,共3页
[目的]揭示不同产地金樱子30个居群间的遗传多样性和亲缘关系。[方法]采用RAPD分子标记技术,从35条RAPD随机引物中,筛选出8条有效引物进行扩增,用NTSYSpc,ver.2.02软件进行UPGMA聚类分析。[结果]共扩增出86条带,其中多态性条带84条,多... [目的]揭示不同产地金樱子30个居群间的遗传多样性和亲缘关系。[方法]采用RAPD分子标记技术,从35条RAPD随机引物中,筛选出8条有效引物进行扩增,用NTSYSpc,ver.2.02软件进行UPGMA聚类分析。[结果]共扩增出86条带,其中多态性条带84条,多态性百分率(PPB)97.67%。30个居群的相似性系数在0.11-0.58,聚成A、B、C三大类群。[结论]金樱子具有丰富的遗传多态性,产自贵州地区的金樱子有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 金樱子 随机扩增多态性dna 亲缘关系
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