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利用随机多肽文库研究ZO-1中PDZ3结构域的配体结合特点 被引量:3
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作者 郭佳岩 宋婀莉 +2 位作者 黄海明 马素参 高友鹤 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期341-346,共6页
建立一种研究PDZ结构域配体结合特点的简单方法 .利用酵母双杂交技术从随机多肽文库中寻找所有可能与ZO 1中PDZ3结构域结合的C末端序列 ,从现有蛋白质数据库中检索所有具有该C末端蛋白 .利用液体培养物 β 半乳糖苷酶检测实验 ,比较文... 建立一种研究PDZ结构域配体结合特点的简单方法 .利用酵母双杂交技术从随机多肽文库中寻找所有可能与ZO 1中PDZ3结构域结合的C末端序列 ,从现有蛋白质数据库中检索所有具有该C末端蛋白 .利用液体培养物 β 半乳糖苷酶检测实验 ,比较文库中筛选的C末端序列和已知的PDZ3结构域结合配体———JAM的C末端 (SFLV)与PDZ3结构域结合的强弱 .共筛选到 3个阳性克隆 ,其C末端序列分别为 LGWV、 LVWV和 DEWV .前 2者属于第二类PDZ结构域 ,后者属于第三类 .蛋白质数据库检索结果表明 ,有多个蛋白质具有 LGWV、 LVWV末端 ,没有检索到任何具有 DEWV末端的蛋白质 .结合强度实验结果表明 ,它们与PDZ3结构域结合强度依次为 DEWV > LGWV > LVWV > SFLV ,说明筛选的 3个C末端除了反映ZO 1中PDZ3结构域可能的潜在结合配体外 ,也有可能成为JAM蛋白阻断性试剂甚至药物的重要组成部分之一 .利用随机多肽文库 ,可以尽可能寻找所有可能与PDZ结构域结合的C末端序列 。 展开更多
关键词 ZO-1 PDZ3结构域 蛋白质相互作用 随机多肽文库 酵母双杂交
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一种用于穿透多肽筛选的随机文库的构建及筛选 被引量:2
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作者 刘瑜 刘亚伟 +3 位作者 李海玉 刘靖华 邓鹏 姜勇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期491-497,共7页
以增强型绿色荧光蛋白(enhancedgreenfluorescenceprotein,EGFP)为示踪物,在pET-14b载体上构建编码12个氨基酸的随机多肽表达文库.建立一种简便、经济、有效的文库筛选方法,从所构建的文库中筛选出细胞穿透多肽(cell-penetratingpeptide... 以增强型绿色荧光蛋白(enhancedgreenfluorescenceprotein,EGFP)为示踪物,在pET-14b载体上构建编码12个氨基酸的随机多肽表达文库.建立一种简便、经济、有效的文库筛选方法,从所构建的文库中筛选出细胞穿透多肽(cell-penetratingpeptide,CPP).采用点突变技术,首先在pET-14b载体多克隆位点NdeⅠ和XhoⅠ之间加入4个限制性内切酶位点,随后在BamHⅠ位点后加入三联终止密码子,接着再利用亚克隆的方法在KpnⅠ和XhoⅠ之间插入EGFP,形成一个新的用于原核表达示踪蛋白的载体pET-14bMCStop/EGFP.最后再利用点突变技术在上述构建的示踪载体的多克隆位点XhoⅠ和BamHⅠ之间插入36个随机碱基序列.以His-Tat-EGFP作为工具建立有效的筛选方法,利用这种方法对文库进行筛选.酶切和测序表明,示踪载体的构建是正确的,且在大肠杆菌中可有效地表达出His标记的EGFP.在示踪载体的基础上构建的随机多肽文库至少包含了105个独立克隆,其中90%以上的克隆插入的随机片段都是36个碱基.建立的筛选方法是可行的,并用此方法进行了初步的筛选. 展开更多
关键词 细胞穿透多肽 随机多肽文库 跨膜转运 内化
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日本血吸虫病患者血清对噬菌体随机7肽库的免疫筛选 被引量:17
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作者 舒新华 易新元 曾宪芳 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 2000年第2期109-112,共4页
目的从噬菌体随机多肽文库中 ,筛选出能与慢性血吸虫病患者血清特异性结合的短肽分子。方法采用慢性血吸虫病患者血清免疫球蛋白(Ig)作为配基 ,免疫筛选以融合蛋白形式在丝状噬菌体M13外壳蛋白III表达的随机7肽文库。按吸附 -洗脱 -扩... 目的从噬菌体随机多肽文库中 ,筛选出能与慢性血吸虫病患者血清特异性结合的短肽分子。方法采用慢性血吸虫病患者血清免疫球蛋白(Ig)作为配基 ,免疫筛选以融合蛋白形式在丝状噬菌体M13外壳蛋白III表达的随机7肽文库。按吸附 -洗脱 -扩增的淘筛过程 ,经3轮免疫淘筛后 ,随机挑取噬菌体克隆用ELISA检测其特异性 ,并用斑点ELISA分析其诊断血吸虫病的价值。结果经3轮免疫淘筛后 ,特异性结合的噬菌体富集增加近100倍。用ELISA检测第3轮筛选后随机挑取的30个噬菌体克隆 ,有26个克隆能与慢性血吸虫病患者的血清Ig产生特异性反应 ,其中A值最高的2个克隆具有诊断血吸虫病的潜在价值。结论噬菌体随机肽库技术 ,可应用于分析、鉴定血吸虫抗原表位 ,继而为获得亚单位表位水平的诊断试剂和抗血吸虫病的短肽疫苗提供依据。 展开更多
关键词 日本血吸虫病 免疫筛选 噬菌体 随机多肽文库
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利用噬菌体肽库筛选抗黏附的活性多肽 被引量:2
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作者 郭玉 廖端芳 +1 位作者 朱炳阳 唐圣松 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期34-37,共4页
目的 :筛选抗内皮细胞与单核细胞黏附的活性多肽。方法 :①以氧化型低密度脂蛋白 (ox LDL ,10 0mg/L)损伤的内皮细胞作为筛选的“靶”细胞 ,从XCX15肽文库 (X代表随机氨基酸 ,C为半胱氨酸 ,X15代表编码随机 15肽 )中 ,筛选能与受损内皮... 目的 :筛选抗内皮细胞与单核细胞黏附的活性多肽。方法 :①以氧化型低密度脂蛋白 (ox LDL ,10 0mg/L)损伤的内皮细胞作为筛选的“靶”细胞 ,从XCX15肽文库 (X代表随机氨基酸 ,C为半胱氨酸 ,X15代表编码随机 15肽 )中 ,筛选能与受损内皮细胞特异性结合的多肽。②用ELISA法鉴定部分阳性克隆 ,经DNA序列测定确定其插入的氨基酸序列。③以计数法检测特异性噬菌体多肽对内皮细胞与单核细胞黏附率的影响。结果 :①从挑选鉴定的 14个克隆中 ,得到 6个阳性克隆 ,测序结果有两个克隆的外源多肽序列相同 ,4个克隆的外源多肽中含有亮氨酸 亮氨酸重复序列。②两个序列相同的克隆的噬菌体多肽 ,能明显降低内皮细胞与单核细胞的黏附率(分别降低 17.0 %和 17.6 % ,P <0 .0 1,n =4 )。结论 :从XCX15肽文库中 ,初步鉴定出 展开更多
关键词 噬菌体随机多肽文库 受损的内皮细胞 细胞黏附
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