检索结果-维普期刊中文期刊服务平台

功能作图的混合效应模型开发: 1; 作者王子健叶梅霞 +1 位作者张涵邬荣领《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期163-172,共10页; 【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的... 展开更多; 关键词功能作图关联分析混合效应限制性最大似然估计数量性状位点; 在线阅读下载PDF 职称材料

3周龄蛋鸡体质量性连锁遗传效应分析被引量：2: 2; 作者郭军曲亮 +3 位作者窦套存沈曼曼胡玉萍王克华《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期645-649,共5页; 以白莱航鸡、绿壳蛋鸡为亲本,构建F2资源群体,进行蛋鸡早期体质量遗传评估。结果表明:Z染色体基因对蛋鸡早期体质量加性遗传方差有贡献;遗传模型固定效应包括品种、世代及近交系数;蛋鸡F2分离群体3周龄体质量遗传力为0.52±0.03,其... 展开更多; 关键词鸡遗传力性连锁效应混合模型方程组限制最大似然法; 在线阅读下载PDF 职称材料

变系数混合模型的光滑样条推断(英文) 被引量：1: 3; 作者卢一强许王莉《应用概率统计》 CSCD 北大核心 2009年第5期531-543,共13页; 为了拟合纵向数据和其他相关数据, 本文提出了变系数混合效应模型(VCMM). 该模型运用变系数线性部分来表示协变量对响应变量的影响, 而用随机效应来描述纵向数据组内的相关性, 因此, 该模型允许协变量和响应变量之间存在十分灵活的泛函... 展开更多; 关键词变系数混合效应模型光滑样条估计限制最大似然线性混合效应模型; 在线阅读下载PDF 职称材料

蛋鸡5周龄体质量遗传参数及估计方法比较: 4; 作者郭军曲亮 +3 位作者窦套存沈曼曼胡玉萍王克华《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期746-750,共5页; 为调查蛋鸡资源群体早期体质量选育潜力,比较了限制最大似然法、马尔科夫链蒙特卡洛方法和积分嵌套拉普拉斯逼近方法的效率和结果准确性,应用动物模型估计遗传参数。试验鸡来自东乡绿壳蛋鸡与白来航鸡F2资源群体,包括3个世代总计5405只... 展开更多; 关键词贝叶斯法动物模型蛋鸡限制最大似然法遗传力; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用ML和REML法监测基于Wood模型奶牛泌乳曲线形状的研究被引量：1: 5; 作者王瑞军王雅春 +5 位作者吴红军崔久辉王东升赵建虎张文广李金泉《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第9期130-134,共5页; 利用最大似然法(ML)估计了内蒙古三河牛泌乳曲线基于不完全伽马函数(Wood)的不同统计模型,对各模型的差异用似然比(LR)进行检验。结果表明,模型Ⅲ显著优于模型Ⅱ和模型Ⅰ(P<0.01)。采用限制性最大似然法(REML)对模型Ⅲ估计得出,泌乳... 展开更多; 关键词内蒙古三河牛泌乳曲线 WOOD模型最大似然法(ML) 限制性最大似然法(REML); 在线阅读下载PDF 职称材料

题名功能作图的混合效应模型开发: 1; 作者王子健叶梅霞张涵邬荣领; 机构北京林业大学生物科学与技术学院; 出处《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期163-172,共10页; 基金国家自然科学基金项目(32071796)。; 文摘【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的生长数据作为实际案例,将亚群和SNP基因型作为固定效应的来源,将固定效应因素融入定位模型,提出了Q矩阵模型的扩展;在保留使用方差–协方差模型对随机残差建模的前提下,使用Legendre模型对随机效应建模,开展了固定效应加一般性的随机效应的混合效应模型分析(模型1);利用限制性似然估计的方法推导其方差–协方差参数、随机效应和固定效应,开展了固定效应和亲缘关系造成随机效应的混合模型(模型2)分析;利用Zwald检验法推导各标记位点p值的计算方法。【结果】(1)2种模型中,95%的标记呈现出p值与期望值相吻合的特点,p值分布在QQ图中的上翘结果满意。(2)模型2相比模型1检测到了更多的SNP位点,表明模型2对亲缘关系造成的随机效应解释性更强。(3)计算机模拟结果显示:样本量较小、遗传力较低时,模型假阳性率为4.77%;当样本量为800,遗传力为1%时,模型对QTL的发现率可超过70%;或当样本量为400,遗传力超过1.5%时,QTL发现率也可超过70%。【结论】本研究提出的在功能作图模型中引入固定效应和亲缘关系造成的随机效应的混合模型的方法较好地完善了功能定位理论,对固定效应中的协变量因素具有较好的校正功能,可有效剖分随机效应与剩余残差;为后续完善功能定位,开发固定效应加亲缘关系(Q+K)模型的软件包奠定了良好基础。; 关键词功能作图关联分析混合效应限制性最大似然估计数量性状位点; Keywords functional mapping association analysis mixed effect restricted maximum likelihood estimation quantitative trait loci(QTL); 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名3周龄蛋鸡体质量性连锁遗传效应分析被引量：2: 2; 作者郭军曲亮窦套存沈曼曼胡玉萍王克华; 机构江苏省家禽科学研究所; 出处《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期645-649,共5页; 基金现代农业产业技术体系建设专项(CARS–40–K01) 江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(16)1008); 文摘以白莱航鸡、绿壳蛋鸡为亲本,构建F2资源群体,进行蛋鸡早期体质量遗传评估。结果表明:Z染色体基因对蛋鸡早期体质量加性遗传方差有贡献;遗传模型固定效应包括品种、世代及近交系数;蛋鸡F2分离群体3周龄体质量遗传力为0.52±0.03,其中Z染色体遗传力为0.07±0.02。蛋鸡早期体质量遗传评估时应考虑性染色体连锁遗传效应的影响;3周龄蛋鸡体质量属于中等偏高遗传力性状,可通过个体选育获取遗传进展。; 关键词鸡遗传力性连锁效应混合模型方程组限制最大似然法; Keywords chicken heritability sex linkage effect mixed model equations REML; 分类号 S831.2 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名变系数混合模型的光滑样条推断(英文) 被引量：1: 3; 作者卢一强许王莉; 机构解放军信息工程大学电子技术学院中国人民大学统计系; 出处《应用概率统计》 CSCD 北大核心 2009年第5期531-543,共13页; 基金 supported by the National Natural Science Foundation of China (10501053) supported by the National Natural Science Foundation of China (10701079); 文摘为了拟合纵向数据和其他相关数据, 本文提出了变系数混合效应模型(VCMM). 该模型运用变系数线性部分来表示协变量对响应变量的影响, 而用随机效应来描述纵向数据组内的相关性, 因此, 该模型允许协变量和响应变量之间存在十分灵活的泛函关系. 文中运用光滑样条来估计均值部分的系数函数, 而用限制最大似然的方法同时估计出光滑参数和方差成分, 我们还得到了所提估计的计算方法. 大量的模拟研究表明对于具有各种协方差结构的变系数混合效应模型, 运用本文所提出的方法都能够十分有效地估计出模型中的系数函数和方差成分.; 关键词变系数混合效应模型光滑样条估计限制最大似然线性混合效应模型; Keywords Varying-coefficients mixed model, smoothing spline estimation, restricted maximum likelihood, linear mixed effect model.; 分类号 O212.7 [理学—概率论与数理统计]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋鸡5周龄体质量遗传参数及估计方法比较: 4; 作者郭军曲亮窦套存沈曼曼胡玉萍王克华; 机构江苏省家禽科学研究所江苏省家禽遗传育种重点实验室; 出处《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期746-750,共5页; 基金国家现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-40-K01）国家重点研发计划（2018YFD0501302） +1 种基金江苏省农业重大新品种创制项目（PZCZ201729）; 文摘为调查蛋鸡资源群体早期体质量选育潜力,比较了限制最大似然法、马尔科夫链蒙特卡洛方法和积分嵌套拉普拉斯逼近方法的效率和结果准确性,应用动物模型估计遗传参数。试验鸡来自东乡绿壳蛋鸡与白来航鸡F2资源群体,包括3个世代总计5405只鸡,采用限制最大似然法和贝叶斯法剖分5周龄蛋鸡体质量表型方差。结果表明:蛋鸡F2资源群体5周龄体质量遗传力为0.49~0.59,具体因算法而定;马尔科夫链蒙特卡洛方法计算用时较长、准确性稍差;积分嵌套拉普拉斯逼近方法能够准确给出方差组分的标准误,而不是近似的或依据正态分布推测的;限制最大似然法计算用时短,结果准确,目前为最佳选择。由于蛋鸡资源群体5周龄蛋鸡体质量选育潜力大,将来可以通过个体选育获取遗传进展。; 关键词贝叶斯法动物模型蛋鸡限制最大似然法遗传力; Keywords Bayesian approach animal model layer restricted maximum likelihood method heritability; 分类号 S831 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用ML和REML法监测基于Wood模型奶牛泌乳曲线形状的研究被引量：1: 5; 作者王瑞军王雅春吴红军崔久辉王东升赵建虎张文广李金泉; 机构内蒙古农业大学中国农业大学内蒙古自治区海拉尔农牧业管理局内蒙古农业大学动物遗传育种与繁殖重点实验室; 出处《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第9期130-134,共5页; 基金 "十一五"国家科技支撑计划(2006BAD04A01 2006BAD04A01-51); 文摘利用最大似然法(ML)估计了内蒙古三河牛泌乳曲线基于不完全伽马函数(Wood)的不同统计模型,对各模型的差异用似然比(LR)进行检验。结果表明,模型Ⅲ显著优于模型Ⅱ和模型Ⅰ(P<0.01)。采用限制性最大似然法(REML)对模型Ⅲ估计得出,泌乳初期奶量在不同胎次(pari)、产犊年度(year)、产犊季节(seas)、场(herd)下具有显著差异(P<0.05);测定日产奶量的变化率随测定日(t)、测定日自然对数(t′)的推移,以及胎次与测定日(t)及其自然对数(t′)交互作用的不同差异极显著(P<0.01),泌乳初期奶量与t′和t的斜率系数之间存在显著的正或负相关(P<0.01)。; 关键词内蒙古三河牛泌乳曲线 WOOD模型最大似然法(ML) 限制性最大似然法(REML); Keywords Inner Mongolia Sanhe cattle lactation curve Wood model ML REML; 分类号 S823.81 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	功能作图的混合效应模型开发	王子健叶梅霞张涵邬荣领	《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	3周龄蛋鸡体质量性连锁遗传效应分析	郭军曲亮窦套存沈曼曼胡玉萍王克华	《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	变系数混合模型的光滑样条推断(英文)	卢一强许王莉	《应用概率统计》 CSCD 北大核心	2009	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	蛋鸡5周龄体质量遗传参数及估计方法比较	郭军曲亮窦套存沈曼曼胡玉萍王克华	《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2019	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	应用ML和REML法监测基于Wood模型奶牛泌乳曲线形状的研究	王瑞军王雅春吴红军崔久辉王东升赵建虎张文广李金泉	《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心	2011	1	在线阅读下载PDF 职称材料