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应用限制性酶切位点相关DNA测序技术(RAD-seq)检测白洋淀和微山湖野生莲多样性: 1; 作者付彦荣刘凤栾 +2 位作者李硕田代科董丽《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期55-60,共6页; 采集莲(Nelumbo Adans.)样本共127份,其中:白洋淀野生莲居群样本60份、微山湖居群样本45份、对照样本共22份(黑龙江、吉林、辽宁、内蒙、湖南、四川野生莲样本6份,古代莲样本4份,莲栽培品种样本5份,泰国、印度、越南、澳大利亚的野生莲... 展开更多; 关键词莲野生莲遗传多样性限制性酶切位点相关dna测序(rad-seq) 白洋淀微山湖; 在线阅读下载PDF 职称材料

简化基因组测序技术及其在海洋生物研究中的应用被引量：11: 2; 作者边力王军《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期3-12,共10页; 传统开发遗传标记的方法通常会消耗大量的人力、物力和时间,伴随着高通量测序技术的飞速发展,一种高效的标记开发技术即简化基因组测序技术开始得到广泛应用.简化基因组测序技术可以在一次实验中获得成千上万的遗传标记,建库过程简易,... 展开更多; 关键词简化基因组测序海洋生物基因分型限制性酶切位点相关dna测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

珍稀鱼类多鳞白甲鱼的全基因组单核苷酸多态性发现及遗传多样性评价: 3; 作者苟妮娜靳铁治 +1 位作者王开锋杨斌《西北农业学报》北大核心 2025年第5期779-785,共7页; 旨在对国家二级保护野生动物多鳞白甲鱼遗传多样性进行评价。采用限制性内切位点相关DNA测序(restriction site-associated DNA sequencing,RAD-seq)技术,从秦岭南北坡两个种群中鉴定出425205个全基因组高置信度群体单核苷酸多态性(sing... 展开更多; 关键词遗传多样性多鳞白甲鱼群体遗传学限制性内切位点相关dna测序单核苷酸多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

多药耐药基因MDR1 C3435T多态性与口服环孢素A清除率的关系被引量：3: 4; 作者梁惠琪焦正 +3 位作者丁俊杰李中东施孝金钟明康《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期165-168,共4页; 的　探讨多药耐药基因 (MDR1 ) 2 6外显子C3435T多态性与环孢素A(CsA)药动学特性间的关系。方法　HPLC法测定 2 0名健康男性单次口服CsA 5 0 0mg后 2 4h中不同时间点的药物浓度。C3435T的多态性测定采用DNA限制性片段长度多态性法 ,并... 展开更多; 关键词多药耐药基因 MDR1 环孢素A 限制性片段长度多态性法清除率健康男性 26外显子 HPLC法基因多态性生物利用度药物浓度不同时间单次口服等位基因 T型 mL 药动学 24h dna 测序法志愿者 CL 基因型相关性 CsA 测定 C型; 在线阅读下载PDF 职称材料

泡桐高密度分子遗传图谱的构建被引量：6: 5; 作者李文杨王娟 +1 位作者赵振利范国强《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期80-85,共6页; 以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测... 展开更多; 关键词泡桐遗传图谱限制性酶切位点相关dna测序单核苷酸多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

日本鳗鲡离散SNP标记筛选及群体遗传多样性分析被引量：5: 6; 作者于磊刘炳舰刘进贤《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期37-47,共11页; 日本鳗鲡(Anguilla japonica)野生资源数量锐减,亟需对其开展群体遗传学和保护遗传学研究。单核苷酸多态性标记(SNP)是重要的遗传标记,然而在日本鳗鲡中还尚未有报道。本研究采用酶切位点相关DNA测序技术开发了日本鳗鲡的离散SNP标记,利... 展开更多; 关键词酶切位点相关dna测序技术日本鳗鲡离散SNP标记保护遗传学遗传多样性; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用限制性酶切位点相关DNA测序技术(RAD-seq)检测白洋淀和微山湖野生莲多样性: 1; 作者付彦荣刘凤栾李硕田代科董丽; 机构北京林业大学上海辰山植物园; 出处《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期55-60,共6页; 基金上海市绿化和市容管理局课题(G182412、G162402)。; 文摘采集莲(Nelumbo Adans.)样本共127份,其中:白洋淀野生莲居群样本60份、微山湖居群样本45份、对照样本共22份(黑龙江、吉林、辽宁、内蒙、湖南、四川野生莲样本6份,古代莲样本4份,莲栽培品种样本5份,泰国、印度、越南、澳大利亚的野生莲样本5份,美洲莲、亚美杂交莲样本各1份)。采用限制性酶切位点相关DNA测序技术(RAD-seq)对莲样本单核苷酸多态性(SNP)检测、遗传多样性和遗传结构分析。结果表明:对116份莲样本简化测序,共得到高质量序列数919915896条、高质量碱基数据128055038010 bp。经单核苷酸多态性检测,共得到535269个单核苷酸多态性标记,构建了邻接法(NJ)系统发育树和群体遗传结构图;系统发育树表明,所有莲样本可分为10个分支,其中48份白洋淀野生莲样本、36份微山湖野生莲样本、6份中国其他地区野生莲样本、4份古代莲样本,泰国、印度等外国野生莲样本共同组成1个伞状分支。遗传结构分析表明,白洋淀和微山湖野生莲居群主体属于同一遗传背景,与系统发育树反映的结果高度一致。说明在大地理范围的外国野生莲作为对照的背景下,白洋淀野生莲居群和微山湖野生莲居群之间未呈现显著遗传分化。; 关键词莲野生莲遗传多样性限制性酶切位点相关dna测序(rad-seq) 白洋淀微山湖; Keywords Nelumbo nucifera Wild lotus Genetic diversity rad-seq Baiyangdian Lake Weishan Lake; 分类号 S682.32 [农业科学—观赏园艺]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名简化基因组测序技术及其在海洋生物研究中的应用被引量：11: 2; 作者边力王军; 机构厦门大学海洋与地球学院; 出处《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期3-12,共10页; 基金国家自然科学基金(31372504 41476118); 文摘传统开发遗传标记的方法通常会消耗大量的人力、物力和时间,伴随着高通量测序技术的飞速发展,一种高效的标记开发技术即简化基因组测序技术开始得到广泛应用.简化基因组测序技术可以在一次实验中获得成千上万的遗传标记,建库过程简易,成本较低.其通过实验手段降低基因组的复杂度,仅对部分基因组进行测序,随后在该部分获得的基因组开发分子标记.基于酶切的简化基因组测序技术可分为三大类:简化代表库测序、限制性酶切位点相关DNA测序和低覆盖度的分型测序.在海洋生物研究中,简化基因组测序技术已被广泛应用于群体遗传学、系统进化学、适应性进化、遗传图谱构建及数量性状位点定位等研究领域.; 关键词简化基因组测序海洋生物基因分型限制性酶切位点相关dna测序; Keywords reduced-representation sequencing marine organism genotyping restriction site-associated dna sequencing （rad-seq）; 分类号 Q341 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名珍稀鱼类多鳞白甲鱼的全基因组单核苷酸多态性发现及遗传多样性评价: 3; 作者苟妮娜靳铁治王开锋杨斌; 机构陕西省秦岭生态安全重点实验室; 出处《西北农业学报》北大核心 2025年第5期779-785,共7页; 基金陕西省重点研发计划(2022NY-105)。; 文摘旨在对国家二级保护野生动物多鳞白甲鱼遗传多样性进行评价。采用限制性内切位点相关DNA测序(restriction site-associated DNA sequencing,RAD-seq)技术,从秦岭南北坡两个种群中鉴定出425205个全基因组高置信度群体单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)。秦岭北坡多鳞白甲鱼的期望杂合数、核苷酸多样性和多态性信息含量分别为0.177、0.200和0.145,而秦岭南坡多鳞白甲鱼的期望杂合数、核苷酸多样性和多态性信息含量分别为0.261、0.291和0.212。种群结构分析结果表明,秦岭南北坡两个多鳞白甲鱼地理种群的遗传多样性存在明显差异。; 关键词遗传多样性多鳞白甲鱼群体遗传学限制性内切位点相关dna测序单核苷酸多态性; Keywords Genetic diversity Onychostoma macrolepis Population genetics rad-seq SNP; 分类号 S917.4 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名多药耐药基因MDR1 C3435T多态性与口服环孢素A清除率的关系被引量：3: 4; 作者梁惠琪焦正丁俊杰李中东施孝金钟明康; 机构复旦大学附属华山医院临床药学研究室; 出处《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期165-168,共4页; 基金上海市卫生局百人计划项目资助课题 (项目编号 98BR0 0 9); 文摘的　探讨多药耐药基因 (MDR1 ) 2 6外显子C3435T多态性与环孢素A(CsA)药动学特性间的关系。方法　HPLC法测定 2 0名健康男性单次口服CsA 5 0 0mg后 2 4h中不同时间点的药物浓度。C3435T的多态性测定采用DNA限制性片段长度多态性法 ,并用基因测序法验证。结果　 2 0名健康男性志愿者中 ,5例为CC型 ,1 1例为CT型 ,4例为TT型。CC型、CT型和TT型的cmax分别为 (2 1 2 4 .4± 1 79.4 )ng/mL、(1 934.3±372 .8)ng/mL和 (1 76 5 .3± 4 1 6 .0 )ng/mL ;AUC0 inf分别为 (1 392 2 .2± 2 881 .9)ng·h/mL、(1 1 5 1 1 .8± 2 1 92 .1 )ng·h/mL和 (85 1 5 .3± 1 0 6 2 .3)ng·h/mL ;CL/F分别为 (37.0± 6 .5 )L/h、(45 .0± 9.0 )L/h和 (5 9.5± 8.1 )L/h ;至少含有一个C等位基因的基因型 (CC和CT型 )与TT型相比 ,cmax和AUC0 inf分别高了 1 5 %和 4 9%,CL/F低了 31 %。C3435T的基因多态性与cmax无相关性 (P >0 .0 5 ) ,而与CL/F和AUC0 inf有关 (P =0 .0 1 3)。结论　MDR1C3435T的多态性是口服CsA生物利用度变异大的影响因素。; 关键词多药耐药基因 MDR1 环孢素A 限制性片段长度多态性法清除率健康男性 26外显子 HPLC法基因多态性生物利用度药物浓度不同时间单次口服等位基因 T型 mL 药动学 24h dna 测序法志愿者 CL 基因型相关性 CsA 测定 C型; Keywords cyclosporine A p-glycoprotein multidrug resistant gene genetic polymorphisms; 分类号 R730.53 [医药卫生—肿瘤] R734.2 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名泡桐高密度分子遗传图谱的构建被引量：6: 5; 作者李文杨王娟赵振利范国强; 机构信阳农林学院林学院河南农业大学泡桐研究所; 出处《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期80-85,共6页; 基金 2012年度河南省中原学者专项(122101110700) 河南省自然科学基金项目(162300410158); 文摘以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测序建库,以白花泡桐基因组为参考,采用SOAP2软件进行序列比对,利用筛选到的单核苷酸多态性SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点对该群体进行基因型分析,使用Joinmap version 4.0软件构建泡桐连锁遗传图谱。结果表明:利用RAD测序技术共获得551894个SNP标记,构建了含20个连锁群的泡桐遗传连锁图谱,该图谱的总图距为2050.77cM,标记间平均图距为0.58cM,图谱预期长度为2064.29cM,图谱基因覆盖度为99.35%。本研究构建的泡桐连锁遗传图谱具有高精度和覆盖泡桐基因组完整(构建连锁群数目等于泡桐单倍体基因组染色体的数目)的优点,为泡桐分子育种学研究奠定了基础。; 关键词泡桐遗传图谱限制性酶切位点相关dna测序单核苷酸多态性; Keywords Paulownia fortunei genetic map restriction-site associated dna sequencing single nucleotide polymorphism; 分类号 S763.11 [农业科学—森林保护学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名日本鳗鲡离散SNP标记筛选及群体遗传多样性分析被引量：5: 6; 作者于磊刘炳舰刘进贤; 机构中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室中国科学院大学青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室; 出处《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期37-47,共11页; 基金国家自然科学基金项目(41676137) 青岛海洋科学与技术国家实验室鳌山人才项目(2015ASTP-ES05) +1 种基金中国科学院百人计划项目资助~~; 文摘日本鳗鲡(Anguilla japonica)野生资源数量锐减,亟需对其开展群体遗传学和保护遗传学研究。单核苷酸多态性标记(SNP)是重要的遗传标记,然而在日本鳗鲡中还尚未有报道。本研究采用酶切位点相关DNA测序技术开发了日本鳗鲡的离散SNP标记,利用KASPar技术对辽宁丹东和福建三沙两个群体共61尾玻璃鳗样品进行SNP分型,验证所开发SNP标记的多态性。研究共得到38个多态性较高的离散SNP标记。在丹东群体中,这38个位点的观测杂合度(Ho)为0.000~0.407,期望杂合度(He)为0.033~0.484;在三沙群体中,这38个位点的观测杂合度(Ho)为0.032~0.500,期望杂合度(He)为0.032~0.494。这表明已处于濒危状态的日本鳗鲡依然具有较高的遗传多样性水平。丹东群体中的AJ_SNP_03位点和三沙群体中的AJ_SNP_25和AJ_SNP_35位点偏离哈温平衡,所有位点间均不存在连锁不平衡现象。丹东群体和三沙群体间的遗传距离FST值为-0.005(P=0.898),表明这两个群体间无显著的遗传分化,符合日本鳗鲡随机交配的属性。研究结果表明,本研究开发的SNP标记可以用于解析日本鳗鲡的群体遗传结构及探究其本地适应性,为其资源的保护提供基础资料。; 关键词酶切位点相关dna测序技术日本鳗鲡离散SNP标记保护遗传学遗传多样性; Keywords restriction site-associated dna sequencing Japanese eel outlier SNP marker conservation genetics genetic diversity; 分类号 S931.3 [农业科学—渔业资源] Q346 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	应用限制性酶切位点相关DNA测序技术(RAD-seq)检测白洋淀和微山湖野生莲多样性	付彦荣刘凤栾李硕田代科董丽	《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	简化基因组测序技术及其在海洋生物研究中的应用	边力王军	《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2017	11	在线阅读下载PDF 职称材料
3	珍稀鱼类多鳞白甲鱼的全基因组单核苷酸多态性发现及遗传多样性评价	苟妮娜靳铁治王开锋杨斌	《西北农业学报》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	多药耐药基因MDR1 C3435T多态性与口服环孢素A清除率的关系	梁惠琪焦正丁俊杰李中东施孝金钟明康	《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2005	3	在线阅读下载PDF 职称材料
5	泡桐高密度分子遗传图谱的构建	李文杨王娟赵振利范国强	《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	6	在线阅读下载PDF 职称材料
6	日本鳗鲡离散SNP标记筛选及群体遗传多样性分析	于磊刘炳舰刘进贤	《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2018	5	在线阅读下载PDF 职称材料