目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-N1LR在脑缺血再灌注损伤后血脑屏障的作用机制。方法原代小鼠脑微血管内皮细胞常规培养,经氧糖剥夺/复糖复氧(OGD/R)处理模拟脑缺血再灌注损伤,实验分对照组、OGD组、lncRNA-N1LR过表达组(OGD处理后转染...目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-N1LR在脑缺血再灌注损伤后血脑屏障的作用机制。方法原代小鼠脑微血管内皮细胞常规培养,经氧糖剥夺/复糖复氧(OGD/R)处理模拟脑缺血再灌注损伤,实验分对照组、OGD组、lncRNA-N1LR过表达组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR过表达)、lncRNA-N1LR沉默组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR沉默)。采用逆转录聚合酶链反应检测各组中lncRNA-N1LR mRNA、紧密连接蛋白5(claudin-5)及闭合蛋白(occludin)mRNA表达水平;异硫氰酸荧光素-葡聚糖(FITC-dextran)渗透法检测血脑屏障通透性;免疫蛋白印迹法检测claudin-5、occludin蛋白表达。结果与对照组比较,OGD组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平下降(0.31±0.01 vs 1.00±0.10,0.42±0.03 vs 1.01±0.13,0.38±0.03 vs 1.00±0.15,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性明显升高(58.79±3.04 vs 8.87±0.63,P<0.01)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR过表达组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平升高(0.67±0.07 vs 0.31±0.01,0.92±0.02 vs 0.42±0.03,0.70±0.08 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性降低(41.57±2.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR沉默组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平降低(0.21±0.02 vs 0.31±0.01,0.31±0.03 vs 0.42±0.03,0.22±0.02 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性升高(72.34±1.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。结论LncRNA-N1LR上调可能通过降低血脑屏障通透性发挥神经保护作用。展开更多
目的利用与铜死亡基因有关的长链非编码RNA(cuproptosis-related long noncoding RNA,CRL)构建胰腺癌预后模型,以此预测靶向药物的敏感性,并预测可能调控铜死亡相关基因(cuproptosis-related gene,CRG)的中药。方法采用癌症基因组图谱(T...目的利用与铜死亡基因有关的长链非编码RNA(cuproptosis-related long noncoding RNA,CRL)构建胰腺癌预后模型,以此预测靶向药物的敏感性,并预测可能调控铜死亡相关基因(cuproptosis-related gene,CRG)的中药。方法采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库收集183例胰腺癌的RNA序列和临床信息,借助Cox回归、Pearson相关分析、Lasso回归等统计学方法对CRL进行筛查,建立胰腺癌预后的风险模型,通过风险评估和临床属性特征构建诺谟图(Nomogram)。模型的准确性主要采用受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)以及C-指数进行评估。利用风险评分评估免疫浸润和化疗/靶向药的相关性,利用Coremine Medical数据库来预测可能影响CRG的中药。结果基于筛选出的6个CRL(MIR1915HG、PRECSIT、AC004982.1、AC023043.4、AC010999.2、FOXCUT)构建的胰腺癌风险模型,在预测胰腺癌患者1、3、5年生存率时,ROC曲线下面积(area under curve,AUC)分别达到了0.782、0.786、0.912,其预测结果显著优于年龄、Grade分级和TNM分期等指标。风险评分与肿瘤浸润淋巴细胞、调节性T细胞等免疫细胞富集程度及14种化疗/靶向药的敏感性相关。98种中药具有潜在调节CRG的功效,主要以清热解毒、清热泻火为主,归肝、脾、肺经。其中通关藤可能存在对铜死亡机制的关键基因FDX1调控作用。结论以6个CRL构建的风险模型能够评估胰腺癌的预后和免疫情况,通关藤可能在调控铜死亡机制方面发挥重要作用。展开更多
文摘目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-N1LR在脑缺血再灌注损伤后血脑屏障的作用机制。方法原代小鼠脑微血管内皮细胞常规培养,经氧糖剥夺/复糖复氧(OGD/R)处理模拟脑缺血再灌注损伤,实验分对照组、OGD组、lncRNA-N1LR过表达组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR过表达)、lncRNA-N1LR沉默组(OGD处理后转染质粒lncRNA-N1LR沉默)。采用逆转录聚合酶链反应检测各组中lncRNA-N1LR mRNA、紧密连接蛋白5(claudin-5)及闭合蛋白(occludin)mRNA表达水平;异硫氰酸荧光素-葡聚糖(FITC-dextran)渗透法检测血脑屏障通透性;免疫蛋白印迹法检测claudin-5、occludin蛋白表达。结果与对照组比较,OGD组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平下降(0.31±0.01 vs 1.00±0.10,0.42±0.03 vs 1.01±0.13,0.38±0.03 vs 1.00±0.15,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性明显升高(58.79±3.04 vs 8.87±0.63,P<0.01)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR过表达组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平升高(0.67±0.07 vs 0.31±0.01,0.92±0.02 vs 0.42±0.03,0.70±0.08 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性降低(41.57±2.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。与OGD组比较,lncRNA-N1LR沉默组lncRNA-N1LR mRNA、occludin、claudin-5 mRNA表达水平降低(0.21±0.02 vs 0.31±0.01,0.31±0.03 vs 0.42±0.03,0.22±0.02 vs 0.38±0.03,P<0.05),血脑屏障FITC-dextran通透性升高(72.34±1.43 vs 58.79±3.04,P<0.05)。结论LncRNA-N1LR上调可能通过降低血脑屏障通透性发挥神经保护作用。
文摘目的利用与铜死亡基因有关的长链非编码RNA(cuproptosis-related long noncoding RNA,CRL)构建胰腺癌预后模型,以此预测靶向药物的敏感性,并预测可能调控铜死亡相关基因(cuproptosis-related gene,CRG)的中药。方法采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库收集183例胰腺癌的RNA序列和临床信息,借助Cox回归、Pearson相关分析、Lasso回归等统计学方法对CRL进行筛查,建立胰腺癌预后的风险模型,通过风险评估和临床属性特征构建诺谟图(Nomogram)。模型的准确性主要采用受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)以及C-指数进行评估。利用风险评分评估免疫浸润和化疗/靶向药的相关性,利用Coremine Medical数据库来预测可能影响CRG的中药。结果基于筛选出的6个CRL(MIR1915HG、PRECSIT、AC004982.1、AC023043.4、AC010999.2、FOXCUT)构建的胰腺癌风险模型,在预测胰腺癌患者1、3、5年生存率时,ROC曲线下面积(area under curve,AUC)分别达到了0.782、0.786、0.912,其预测结果显著优于年龄、Grade分级和TNM分期等指标。风险评分与肿瘤浸润淋巴细胞、调节性T细胞等免疫细胞富集程度及14种化疗/靶向药的敏感性相关。98种中药具有潜在调节CRG的功效,主要以清热解毒、清热泻火为主,归肝、脾、肺经。其中通关藤可能存在对铜死亡机制的关键基因FDX1调控作用。结论以6个CRL构建的风险模型能够评估胰腺癌的预后和免疫情况,通关藤可能在调控铜死亡机制方面发挥重要作用。
