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长链非编码RNA(lncRNA)在甘蓝型油菜分枝角度调控中的功能分析与预测
1
作者 孙程明 周晓婴 +8 位作者 陈锋 张维 王晓东 彭琦 郭月 高建芹 胡茂龙 付三雄 张洁夫 《作物学报》 北大核心 2025年第3期559-567,I0001-I0676,共685页
分枝角度是影响油菜种植密度和机收效率的关键株型性状,适度紧凑的株型结构有利于提高油菜种植密度、降低机收损失。本研究以2个分枝角度差异大的株系为材料,对抽苔期幼嫩分枝进行链特异性RNA-seq。分析表明,6305个基因在2个株系间差异... 分枝角度是影响油菜种植密度和机收效率的关键株型性状,适度紧凑的株型结构有利于提高油菜种植密度、降低机收损失。本研究以2个分枝角度差异大的株系为材料,对抽苔期幼嫩分枝进行链特异性RNA-seq。分析表明,6305个基因在2个株系间差异表达,包括FUL、SGR5、SGR6、SGR9、AXR1、ARG1、PIN1和PIN5等分枝角度相关途径基因在油菜中的同源拷贝,GO富集通路包括色氨酸、生长素和磷脂酰肌醇等重力反应相关物质的合成、代谢通路。基于转录组数据,鉴定了4467个在分枝中活跃表达的lncRNA,包括3460个lincRNA、778个lncNAT和229个ilncRNA。50.3%的lncRNA包含转座子序列,其中Gypsy和Copia家族LTR逆转座子是2种主要插入类型。分析发现,1713个lncRNA在2个株系间差异表达,比较与50个分枝角度关联位点的位置关系,37个差异lncRNA落在26个关联位点的置信区间内。利用本研究和已公开的共计103份分枝转录组数据进行表达相关性分析,共鉴定了17,782个lncRNA-基因间靶向关系,包括1003个lncRNA和4592个基因,靶向基因包括LAZY1、SGR5、FUL1、WRKY40等分枝角度已知基因在油菜中的同源拷贝。本研究结果有助于解析lncRNA在油菜分枝角度调控中的作用,为今后分子调控机制的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 株型 分枝角度 长链非编码rna 转录组
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敲低长链非编码RNA TTTY15表达对结肠癌细胞增殖、凋亡、迁移和克隆形成能力的影响
2
作者 李颖霞 姜利彬 +2 位作者 周明霞 闻阳阳 温洪涛 《郑州大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第2期173-176,共4页
目的:探讨敲低长链非编码RNA TTTY15表达对结肠癌细胞增殖、凋亡、迁移和克隆形成能力的影响。方法:运用实时荧光定量PCR技术检测15例结肠癌组织、癌旁正常组织中TTTY15的表达。将SW620细胞分为空白对照组、阴性对照(si-NC)组及TTTY15-s... 目的:探讨敲低长链非编码RNA TTTY15表达对结肠癌细胞增殖、凋亡、迁移和克隆形成能力的影响。方法:运用实时荧光定量PCR技术检测15例结肠癌组织、癌旁正常组织中TTTY15的表达。将SW620细胞分为空白对照组、阴性对照(si-NC)组及TTTY15-siRNA组,后两组分别采用Lipofectamine 2000转染si-NC、TTTY15-siRNA。转染72 h后,采用CCK-8法、划痕实验、克隆形成实验和Annexin V-APC和7-AAD双染法检测3组细胞增殖、迁移、克隆形成能力和凋亡率;实时荧光定量PCR法检测细胞中TTTY15、miR-327-3p及TLR4 mRNA的表达,Western blot法检测细胞中TLR4、MMP-2、CDK4、CyclinD1、E-Cadherin、N-Cadherin、蛋白的表达。结果:TTTY15在结肠癌组织中的表达高于癌旁正常组织(P<0.05)。与空白对照组、si-NC组比较,TTTY15-siRNA组TTTY15、TLR4 mRNA表达下降,miR-372-3p表达升高(P<0.05);细胞增殖能力、迁移能力、克隆形成能力降低,凋亡率增加(P<0.05);细胞中TLR4、CDK4、CyclinD1、MMP-2和N-Cadherin蛋白表达水平降低,E-Cadherin蛋白表达水平增加(P<0.05)。结论:TTTY15在结肠癌组织和细胞中表达升高;敲低TTTY15表达可抑制结肠癌细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 结肠癌 长链非编码rna TTTY15 恶性生物学行为
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长链非编码RNA编码微肽的鉴定和功能研究进展
3
作者 黄桂英 王李伟 +3 位作者 刘嘉茵 王松 陈吉龙 池晓娟 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2025年第1期89-99,共11页
随着翻译组测序、多肽组学和生物信息学分析等技术的快速发展,人们发现大量长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)含有可编码功能性微肽的短开放阅读框。这些由lncRNA编码的微肽不仅参与调控骨骼肌的生理功能、胚胎发育和神经细胞... 随着翻译组测序、多肽组学和生物信息学分析等技术的快速发展,人们发现大量长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)含有可编码功能性微肽的短开放阅读框。这些由lncRNA编码的微肽不仅参与调控骨骼肌的生理功能、胚胎发育和神经细胞发育,还对多种癌症的发生与发展、炎症反应及心血管疾病产生影响。研究这些微肽的功能对于深入理解生命活动的调控机制具有重要的科学意义,也为相关疾病的防治提供新的思路与方向。概述了鉴定lncRNA编码微肽的常用方法,以及这些微肽功能的最新研究进展,以期为后续研究提供参考。 展开更多
关键词 长链非编码rna 短开放阅读框 微肽 鉴定 功能
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长链非编码RNA通过Notch信号通路调控骨代谢
4
作者 何玉婷 翁凯鸿 +2 位作者 李发林 翁锡全 元宇 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 北大核心 2025年第3期374-383,共10页
骨代谢的平衡取决于骨吸收与骨形成之间的动态平衡,骨代谢失衡将诱发骨质疏松症等多种骨代谢疾病。Notch信号通路参与骨吸收与骨形成的调控,在维持骨代谢平衡中发挥重要作用。研究表明,长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)不仅... 骨代谢的平衡取决于骨吸收与骨形成之间的动态平衡,骨代谢失衡将诱发骨质疏松症等多种骨代谢疾病。Notch信号通路参与骨吸收与骨形成的调控,在维持骨代谢平衡中发挥重要作用。研究表明,长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)不仅通过调控骨髓间充质干细胞、成骨细胞、破骨细胞等骨组织细胞的增殖与分化广泛参与骨代谢的调节,也通过Notch信号通路调控骨代谢。但目前lncRNA通过Notch信号通路调控骨代谢的确切机制尚未阐明。本文主要概述Notch信号通路及lncRNA在骨代谢调控中的作用及探讨lncRNA通过Notch信号通路调控骨代谢的可能机制,为lncRNA调控骨代谢疾病的机制研究及骨代谢疾病的靶向治疗提供理论基础。 展开更多
关键词 长链非编码rna NOTCH 骨代谢 骨质疏松症
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口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
5
作者 刘絮影 李锦存 +3 位作者 翟堃 胡晨 董文 马坚 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge... 目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码rna 预后 LINC01980 MIR99AHG
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长链非编码RNA-微小RNA-信使RNA轴在缺血性脑卒中后程序性细胞死亡中的研究进展
6
作者 栗文静 刘安 +5 位作者 张航耀 肖雨倩 万俊 孙可心 白艳杰 王岩 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2025年第7期973-976,共4页
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)是由于大脑局部血供受阻引发局部神经细胞损伤和死亡的一种急性脑血管疾病[1]。IS发生后,神经元缺氧和缺乏营养物质后会导致细胞迅速死亡,随后引发一系列病理过程,包括血脑屏障完整性的破坏、氧化应激... 缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)是由于大脑局部血供受阻引发局部神经细胞损伤和死亡的一种急性脑血管疾病[1]。IS发生后,神经元缺氧和缺乏营养物质后会导致细胞迅速死亡,随后引发一系列病理过程,包括血脑屏障完整性的破坏、氧化应激反应、神经炎症和细胞凋亡等。程序性细胞死亡(programmed cell death,PCD)是一种由基因决定的积极而有序的细胞死亡方式,对于维持正常的细胞周期和组织稳态至关重要。 展开更多
关键词 卒中 rna 长链非编码 微rnaS rna 信使
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草鱼长链非编码RNA1153应对GCRV感染的调控功能
7
作者 刘帅 张烨煊 +1 位作者 胡旭东 曹宏 《水生生物学报》 北大核心 2025年第6期12-20,共9页
为了解长链非编码RNA在GCRV感染草鱼过程中的分子调控机制,对GCRV攻毒的草鱼肾脏细胞(CIK)进行长链非编码RNA组学测序,在此基础上,筛选出在GCRV攻毒前后差异表达明显的lncRNA1153(PP712057)。利用qRT-PCR技术对lncRNA1153在草鱼CIK细胞... 为了解长链非编码RNA在GCRV感染草鱼过程中的分子调控机制,对GCRV攻毒的草鱼肾脏细胞(CIK)进行长链非编码RNA组学测序,在此基础上,筛选出在GCRV攻毒前后差异表达明显的lncRNA1153(PP712057)。利用qRT-PCR技术对lncRNA1153在草鱼CIK细胞中的时空表达水平进行检测,发现在GCRV感染细胞后,lncRNA1153的表达水平在稳步上升至32h达到峰值。在CIK细胞内对lncRNA进行过表达实验,发现在lncRNA1153过表达的细胞系中,在GCRV攻毒后,干扰素的mRNA表达水平上调。同时,通过在CIK细胞内进行过表达及RNA pull-down实验,将富集的蛋白质进行质谱分析,从中筛选出P62蛋白进行深入研究。qRT-PCR验证发现,在草鱼肝脏、肾脏等组织及CIK细胞中,lncRNA1153与P62的表达趋势大致相同。进一步的研究发现,GCRV感染CIK细胞后,过表达lncRNA1153与P62都对GCRV病毒蛋白的复制起到抑制作用。研究表明长链非编码RNA在草鱼拮抗GCRV感染的先天性免疫机制中发挥重要作用,为未来设计针对GCRV感染的lncRNA靶向治疗提供参考。 展开更多
关键词 长链非编码rna1153 GCRV CIK细胞 P62 草鱼
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长链非编码RNA在非酒精性脂肪性肝病中作用机制的研究进展
8
作者 孙宁 徐玉善 《生理科学进展》 北大核心 2025年第3期243-251,共9页
长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸的不具有蛋白质编码功能的RNA分子,在转录后和表观遗传水平发挥调节作用。研究表明,lncRNAs在糖脂代谢、肝脏组织纤维化、炎症反应、肿瘤的发生发展及肝细胞自噬... 长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸的不具有蛋白质编码功能的RNA分子,在转录后和表观遗传水平发挥调节作用。研究表明,lncRNAs在糖脂代谢、肝脏组织纤维化、炎症反应、肿瘤的发生发展及肝细胞自噬等细胞功能中发挥着关键作用。非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的发病机制越来越受到关注,本文详细阐述了lncRNA与NAFLD发病机制的密切关系,预测lncRNA作用的新靶点,为NAFLD的研究和防治提供研究基础和新思路。 展开更多
关键词 长链非编码rna 非酒精性脂肪性肝病 基因调控 糖脂代谢
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长链非编码RNA MALAT1对缺血性视网膜病变新生血管形成的调控作用研究进展
9
作者 李兆金(综述) 底煜(审校) 《中华实验眼科杂志》 北大核心 2025年第1期92-96,共5页
缺血性视网膜病变(IRs)伴新生血管形成常严重损伤视力甚至导致失明。研究表明,长链非编码RNA(LncRNA)MALAT1与调控视网膜细胞发育过程中的蛋白编码基因共表达。近年来的研究也证实了MALAT1在IRs中表达上调,具有诱导氧化应激和炎症反应,... 缺血性视网膜病变(IRs)伴新生血管形成常严重损伤视力甚至导致失明。研究表明,长链非编码RNA(LncRNA)MALAT1与调控视网膜细胞发育过程中的蛋白编码基因共表达。近年来的研究也证实了MALAT1在IRs中表达上调,具有诱导氧化应激和炎症反应,促进血管内皮细胞增殖、迁移及血管生成,改变表观遗传修饰等作用,在视网膜新生血管形成的发病机制和调控中起着重要作用。本文从IRs的发病机制,MALAT1在视网膜中的表达和功能及其在血管生成、氧化应激、炎症、血管内皮损伤、表观遗传调控、细胞周期等方面的作用总结MALAT1在IRs中的研究现状,探讨其在视网膜新生血管形成发生和发展中的作用,更深入地了解MALAT1在IRs新生血管形成中的作用机制将有助于开发其靶向治疗策略。 展开更多
关键词 长链非编码rna 表观遗传 氧化应激 肺腺癌转移相关转录本1 缺血性视网膜病变
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大白菜长链非编码RNA研究进展
10
作者 王瑞华 韩敏 李媛媛 《广东农业科学》 2025年第1期124-134,共11页
长链非编码RNA(lncRNAs)是一种长度至少为200个核苷酸且缺乏显著编码能力的功能性非编码RNA分子,在植物的生长发育和胁迫应对过程中发挥重要调控作用。大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)属于芸薹属蔬菜作物,是我国种植面积最大的... 长链非编码RNA(lncRNAs)是一种长度至少为200个核苷酸且缺乏显著编码能力的功能性非编码RNA分子,在植物的生长发育和胁迫应对过程中发挥重要调控作用。大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)属于芸薹属蔬菜作物,是我国种植面积最大的蔬菜作物之一。大白菜杂交种具有明显的杂种优势,杂合状态下基因表达调控网络发生改变,激发新的调控机制,使得基因表达水平发生波动,引起各种生理生化反应的变化,进而导致性状改变、形成优势表型。lncRNAs作为非编码调控RNA,可以通过顺式作用和反式作用直接调控基因表达,或作为miRNAs前体或者靶标间接调控基因表达,导致基因差异性表达。因此,lncRNAs可能在大白菜杂种优势的形成中起重要调控作用。随着高通量测序技术的不断发展和芸薹属作物相关参考基因组数据的发表,大白菜lncRNAs的种类、数量和功能被不断探索。研究发现,大白菜中存在5种类型的lncRNAs:基因间、内含子、正义、反义和双向lncRNAs,其中基因间lncRNAs的数量最多。lncRNAs可调控大白菜的春化和花粉发育过程,还可调控大白菜应对生物和非生物胁迫,如霜霉病菌、尖孢镰刀菌和高温等。该文总结了植物lncRNAs的来源、分类和调控蛋白质编码基因表达的方式,以及大白菜中鉴定到的lncRNAs种类、数量及其生物学功能,为研究lncRNAs在大白菜的生长发育和遗传调控中的生物学功能提供重要参考。 展开更多
关键词 大白菜 长链非编码rna 基因表达调控 分子机制 生物学功能 杂种优势
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长链非编码RNA调控宿主与病原体相互作用机制的研究进展
11
作者 谷九龙 尹艳玲 《中国兽医杂志》 北大核心 2025年第7期96-104,共9页
长链非编码RNA(lncRNA)是一类重要的非蛋白编码转录本,在宿主与病原体的相互作用中具有复杂的调控作用。在应对病原体入侵时,宿主表达的lncRNA可通过调节细胞信号转导和免疫反应清除感染。然而,病原体可操纵宿主lncRNA而逃避宿主的防御... 长链非编码RNA(lncRNA)是一类重要的非蛋白编码转录本,在宿主与病原体的相互作用中具有复杂的调控作用。在应对病原体入侵时,宿主表达的lncRNA可通过调节细胞信号转导和免疫反应清除感染。然而,病原体可操纵宿主lncRNA而逃避宿主的防御反应,还可通过编码lncRNA促进自身的存活和感染。阐明lncRNA在宿主与病原体相互作用中的调控机制对于理解感染性疾病的发病机理和开发新的抗感染策略具有重要意义。因此,本文总结了lncRNA的一般特征和功能,并重点综述了其在宿主与病原体相互作用中的调控机制,以期为感染性疾病的防控提供参考。 展开更多
关键词 长链非编码rna 宿主 病原体 相互作用 调控机制
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长链非编码RNA LUCAT1调控胰腺癌MIA PaCa-2细胞恶性机制研究
12
作者 叶梦洁 瞿薇薇 骆广涛 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第2期187-194,共8页
目的探究长链非编码RNA(lncRNA)LUCAT1对人胰腺癌细胞MIA PaCa-2生物学行为的影响,探讨LUCAT1在胰腺癌恶性进展中的潜在作用。方法在线数据库GEPIA分析LUCAT1在胰腺癌中的突变及表达情况;q-PCR实验检测对比人胰腺导管细胞HPNE及人胰腺... 目的探究长链非编码RNA(lncRNA)LUCAT1对人胰腺癌细胞MIA PaCa-2生物学行为的影响,探讨LUCAT1在胰腺癌恶性进展中的潜在作用。方法在线数据库GEPIA分析LUCAT1在胰腺癌中的突变及表达情况;q-PCR实验检测对比人胰腺导管细胞HPNE及人胰腺癌细胞中LUCAT1的表达水平;FISH检测人胰腺癌组织中LUCAT1表达及分布。CCK-8实验和Transwell实验检测LUCAT1对MIA PaCa-2细胞增殖、凋亡、耐药及迁移能力的影响。基因集合富集分析比对LUCAT1参与的相关信号通路,Western blot实验验证蛋白质表达水平。结果GEPIA分析结果显示,LUCAT1在人胰腺癌组织中表达水平上调;q-PCR实验结果显示,人胰腺癌细胞中LUCAT1高表达,差异有统计学意义(P<0.05)。敲低及过表达LUCAT1可影响胰腺癌细胞增殖、凋亡、吉西他滨耐药性以及迁移和侵袭能力(P<0.05)。在胰腺癌中LUCAT1影响p-Akt表达水平,并在Akt抑制剂MK-2206处理后相关功能被抑制。结论LUCAT1通过PI3K-Akt信号通路调控胰腺癌细胞MIA PaCa-2恶性进展。 展开更多
关键词 长链非编码rna LUCAT1 胰腺癌 MIA PaCa-2 肿瘤耐药 AKT
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儿童脓毒症预后相关长链非编码RNA筛选及竞争性内源RNA网络的构建
13
作者 刘田恬 赵奕琳 +2 位作者 宁菁菁 张育才 王春霞 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期282-291,共10页
目的·基于基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选儿童脓毒症预后相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),并构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探索其在儿童脓毒症预后评估中的... 目的·基于基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选儿童脓毒症预后相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),并构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探索其在儿童脓毒症预后评估中的潜在应用价值。方法·基于GEO转录组学数据集(GSE4607、GSE26440、GSE26378和GSE9692),对比儿童脓毒症休克患儿存活组与非存活组中lncRNA的表达差异,利用多元线性回归和LASSO分析筛选潜在特征lncRNA,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析其预后评估能力。预测lncRNA、微小RNA(microRNA,miRNA)和mRNA的互作,构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,进行通路富集分析。结果·筛选出55个预后相关的差异表达lncRNA。LASSO回归分析明确6个潜在lncRNA,包括miR503宿主基因(miR503 host gene,MIR503HG)、TAPT1反义RNA1(TAPT1 antisense RNA 1,TAPT1-AS1)、膀胱癌细胞凋亡相关转录物(apoptosis associated transcript in bladder cancer,AATBC)、SBF2反义RNA1(SBF2 antisense RNA 1,SBF2-AS1)、MGC16275及宿主小核仁RNA基因15(small nucleolar RNA host gene 15,SNHG15),组成6-lncRNA特征(6-lncRNA signature,lncSig6);lncSig6预测儿童脓毒症休克预后内部验证及外部验证的ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.859(95%CI 0.722~0.996)和0.854(95%CI 0.687~1.000)。进一步构建基于差异表达MIR503HG,SNHG15和SBF2-AS1的lncRNA-miRNA-mRNA网络,根据核心蛋白PPI网络和GO/KEGG信号通路分析结果提示:lncRNA经海绵化miRNA调控靶基因,涉及叉头盒蛋白O(forkhead box O,FoxO)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase-protein kinase B,PI3K-AKT)信号通路、细胞衰老信号通路、胰岛素信号通路、缺氧诱导蛋白-1(hypoxia-inducible protein-1,HIF-1)信号通路,和晚期糖化终产物(advanced glycation end products,AGEs)及其受体(receptor of AGEs,RAGE)信号通路。结论·lncSig6可以作为预测儿童脓毒症休克预后的评估方法,构建的ceRNA分子网络可为信号通路研究提供依据。 展开更多
关键词 儿童脓毒症 长链非编码rna 竞争性内源rna 预后标志物
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长链非编码RNA介导细胞凋亡干预骨质疏松症机制分析
14
作者 袁可馨 谢兴文 +3 位作者 李鼎鹏 王薛涛 黄委委 闫文 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2025年第1期142-148,共7页
骨质疏松症(osteoporosis,OP)可由过度饮酒、糖皮质激素滥用及雌激素缺乏等引起。随着全球老龄化进程的加剧,该病现已被视为主要的公共卫生问题之一。研究发现成骨细胞介导的骨生成与破骨细胞介导的骨破坏之间失衡是OP发生发展的关键机... 骨质疏松症(osteoporosis,OP)可由过度饮酒、糖皮质激素滥用及雌激素缺乏等引起。随着全球老龄化进程的加剧,该病现已被视为主要的公共卫生问题之一。研究发现成骨细胞介导的骨生成与破骨细胞介导的骨破坏之间失衡是OP发生发展的关键机制。细胞凋亡作为经典的程序性死亡方式,极大地影响着OP的进展。有关代谢性骨病的最新研究表明,成人骨量的维持不仅受成骨细胞和破骨细胞功能的控制,还受细胞凋亡的调节。近年来,长链非编码RNA(lncRNAs)在疾病中的研究逐渐深入,可通过调控细胞增殖、凋亡和迁移等多种病理生理过程中发挥关键作用。研究表明,lncRNAs可通过调节骨髓基质细胞、成骨细胞和破骨细胞的凋亡过程来参与骨重建的动态平衡,可为OP的临床治疗提供新思路。但目前尚未有该领域的系统性的研究,该文通过检索中英文相关文献,系统综述了凋亡、lncRNAs在OP中的研究概况,列举了lncRNAs通过调控细胞凋亡以恢复骨稳态而治疗OP,旨在为临床防治OP提供新靶点。 展开更多
关键词 骨质疏松症 凋亡 骨稳态 长链非编码rna 治疗进展
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长链非编码RNA在植物开花调控中的作用
15
作者 郑羽琪 苏逸然 +2 位作者 彭俊睿 杜佳宏 武亮 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 北大核心 2025年第2期189-197,共9页
开花是植物从营养生长向生殖生长的关键转变,开花调控对于植物适应环境和农业生产都有重要意义。植物的开花由植物内源和外源的多重因素通过光周期途径、春化途径、自主途径等进行调控。在这些途径中,多种长链非编码RNA(long non-coding... 开花是植物从营养生长向生殖生长的关键转变,开花调控对于植物适应环境和农业生产都有重要意义。植物的开花由植物内源和外源的多重因素通过光周期途径、春化途径、自主途径等进行调控。在这些途径中,多种长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)协同有关蛋白,从转录水平、转录后水平及表观遗传水平,通过组蛋白修饰、参与可变剪接、生成或竞争性结合微RNA(microRNA, miRNA)和干扰小RNA(small interfering RNA, siRNA)等方式,调控开花途径关键因子,从而促进或抑制成花。本文综述了已发现的lncRNA参与光周期途径、春化途径、自主途径的机制和研究进展,以期揭示lncRNA在植物开花调控中的作用,为后续的研究提供参考。 展开更多
关键词 长链非编码rna 开花调控 光周期途径 春化途径 自主途径
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长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及临床意义
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作者 姚羽 林敏杰 +1 位作者 金文芳 吕艳玲 《医学研究与战创伤救治》 北大核心 2025年第6期582-586,共5页
目的探讨长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达及其临床意义,以期为肺腺癌的早期诊断提供潜在靶标。方法以生物信息学方法分析RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌患者分期、性别、年龄、吸烟状态情况之间的关系。收集40... 目的探讨长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达及其临床意义,以期为肺腺癌的早期诊断提供潜在靶标。方法以生物信息学方法分析RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌患者分期、性别、年龄、吸烟状态情况之间的关系。收集40对肺腺癌及其配对癌旁组织,根据RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达,以中位表达值为界,分为RNF157-AS1高表达组和低表达组;根据肿瘤大小,按T分期进行分组(T1,肿瘤最大径≤3 cm;T2,肿瘤最大径>3 cm,≤5 cm;T3,肿瘤最大径>5 cm);根据淋巴结转移情况,按N分期进行分组(N0,无淋巴结转移;N1,肺内淋巴结转移;N2,纵膈淋巴结转移);根据肿瘤整体情况,按TNM分期进行分组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期)。比较肺腺癌组织及癌旁组织中RNF157-AS1的表达差异;结合患者的临床信息,分析RNF157-AS1表达与临床病理特征的关系。结果GEPIA数据库中,RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达高于正常组织(P<0.01);UALCAN数据分析表明,RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.01),且在女性患者及有吸烟史的患者中表达更高(P<0.01)。在收集的40对肺腺癌及癌旁组织中,RNF157-AS1在肿瘤中的表达明显上调(P<0.01),结合患者的临床病理信息进一步分析表明,RNF157-AS1的表达与患者的年龄无明显相关性(P>0.05),而与患者的性别、吸烟史、肿瘤大小、有无淋巴结转移以及TNM分期均存在相关性(P<0.05)。结论长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中高表达并且与患者的临床病理特征相关,有望成为肺腺癌潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 肺腺癌 长链非编码rna RNF157-AS1
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长链非编码RNA GAS5通过miR-135b-5p/APC轴抑制胶质瘤进展
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作者 张吉东 王雨涛 冀建文 《陆军军医大学学报》 北大核心 2025年第3期243-254,共12页
目的探讨长链非编码RNA生长停滞特异性5(growth arrest-specific 5,GAS5)与miR-135b-5p和腺瘤性结肠息肉病基因(adenomatous polyposis coli,APC)轴之间的相互作用,以阐明其在胶质瘤增殖、转移、侵袭中的生物学功能。方法通过CGGA数据... 目的探讨长链非编码RNA生长停滞特异性5(growth arrest-specific 5,GAS5)与miR-135b-5p和腺瘤性结肠息肉病基因(adenomatous polyposis coli,APC)轴之间的相互作用,以阐明其在胶质瘤增殖、转移、侵袭中的生物学功能。方法通过CGGA数据库分析GAS5表达水平与胶质瘤患者的生存率的关系;通过qRT-PCR检测GAS5在胶质瘤组织和细胞系中的表达水平;人类神经胶质瘤T98和A172细胞系分别用于过表达和敲低实验。通过转染来过表达或者沉默GAS5、miR-135b-5p和APC;通过Western blot与qRT‑PCR技术检测GAS5、miR-135b-5p、APC的表达水平;利用CCK-8实验检测胶质瘤细胞活力,通过Transwell和划痕实验分析肿瘤细胞运动活性;通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-135b-5p与GAS5或APC的靶向关系。结果CGGA数据库分析显示GAS5低表达的胶质瘤患者的生存率显著降低(P<0.001)。Western blot与qRT‑PCR检测结果显示,分别与癌旁组织和正常人星形胶质瘤细胞系比较,GAS5在胶质瘤组织和胶质瘤细胞系中的表达下调(P<0.01);CCK-8、Transwell和划痕实验分析表明,与vector组比较,GAS5过表达抑制了胶质瘤细胞活力、侵袭和迁移(P<0.01);双荧光素酶报告基因实验证明,GAS5和miR-135b-5p之间存在结合位点,且二者mRNA表达水平呈负相关(P=0.019)。CCK-8、Transwell和划痕实验显示,GAS5对胶质瘤细胞生物学功能的影响是通过靶向miR-135b-5p完成的,APC过表达逆转了miR-135b-5p对胶质瘤细胞的促进作用(P<0.01);Western blot结果显示,与mimic_NC比较,miR-135b-5p升高能够抑制APC的表达(P<0.001),GAS5通过靶向miR-135b-5p上调APC的表达(P<0.01)。结论GAS5通过miR-135b-5p/APC轴共同抑制肿瘤发展,揭示了GAS5/miR-135b-5p/APC在胶质瘤发展中的分子调控机制。 展开更多
关键词 长链非编码rna生长停滞特异性5 神经胶质瘤 miR-135b-5p 腺瘤性结肠息肉病基因
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调控PRRSV复制的功能性长链非编码RNA的筛选与鉴定
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作者 刘宇明 许大伟 +1 位作者 马鸣潇 李明 《现代畜牧兽医》 2025年第6期28-33,共6页
为了筛选可以调控猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)复制的宿主长链非编码RNA(lncRNA),研究通过PRRSV感染Marc145细胞后24、48 h收集样品,利用华大基因第二代测序平台进行全转录组测序分析,筛选出病毒感染后显著变化的lncRNA候选分子。经... 为了筛选可以调控猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)复制的宿主长链非编码RNA(lncRNA),研究通过PRRSV感染Marc145细胞后24、48 h收集样品,利用华大基因第二代测序平台进行全转录组测序分析,筛选出病毒感染后显著变化的lncRNA候选分子。经初步验证后选择LTCONS_00092659(命名为NRPL),采用敲低和过表达NRPL的方法观察其对PRRSV复制的影响。结果显示,敲低NRPL可明显抑制PRRSV复制,而过表达NRPL则明显促进病毒复制。研究表明,lncRNA-NRPL在PRRSV感染过程中发挥重要的促进作用,提示NRPL可能成为开发抗PRRSV感染疗法的新宿主靶标,为猪繁殖与呼吸综合征的防治提供了潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 长链非编码rna 转录组学 Ⅰ型干扰素
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长非编码RNA在相分离调控中的作用
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作者 杨新玲 张栋栋 常晓彤 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期384-392,共9页
相分离是细胞内生物分子由单一均相混合物形成2种不相溶的液滴凝聚体过程,是细胞内分子凝聚体和无膜细胞器形成的主要驱动力。相分离不仅在多种生理活动中发挥重要的动态调控作用,而且调控神经退行性疾病和癌症等多种疾病的发生发展。... 相分离是细胞内生物分子由单一均相混合物形成2种不相溶的液滴凝聚体过程,是细胞内分子凝聚体和无膜细胞器形成的主要驱动力。相分离不仅在多种生理活动中发挥重要的动态调控作用,而且调控神经退行性疾病和癌症等多种疾病的发生发展。已有研究发现,长非编码RNA(lncRNA)与相分离密切相关,这为理解lncRNA的作用机制打开了新的视角,成为近年来非编码RNA领域的研究热点。本文重点介绍了LncRNA SLERT作为分子伴侣与DDX21蛋白相互作用,影响核仁纤维中心区/高密度纤维区(FC/DFCs)的相分离;LINC00657(NORAD)与PUM蛋白形成NP小体,驱动PUM蛋白的相分离而抑制其活性,促进基因组的稳定性;dilncRNA调控DNA损伤应答小RNAs(DDRNA)、p53结合蛋白1(53BP1)的相分离,lncRNA LINP1相分离液滴与Ku蛋白结合促进DNA损伤修复;LncRNA SNHG9、MELTF-AS1、MALR分别驱动LATS1、YBX1、ILF3蛋白质的相分离发挥促癌lncRNAs作用,GIRGL、LncFASA分别调控CAPRIN1、PRDX1的相分离在癌症发展中发挥抑癌基因作用;lncRNA XIST通过相分离驱动X染色体失活的研究。总之,本文综述了lncRNAs通过调节相分离在细胞核无膜细胞器的形成、基因组稳定性与DNA损伤修复、肿瘤发生发展和X染色体失活等病理生理过程中的最新研究进展。本文表明长非编码RNA可通过调节相分离,参与多种病理生理过程,有望为相分离介导的疾病的治疗提供新的方向。 展开更多
关键词 相分离 长非编码rna 无膜细胞器 DNA损伤修复 癌症 X染色体失活
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长链非编码RNA(lncRNA)-MSTRG.22610.1对BHV-1体外复制影响的研究
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作者 姜坤生 王禹淳 +2 位作者 马金柱 于立权 宋佰芬 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期278-284,299,共8页
本研究室前期将牛疱疹病毒Ⅰ型(BHV-1)感染牛肾细胞(MDBK),通过转录组测序筛选到了转录显著差异的长链非编码RNA-MSTRG.22610.1(lncRNA-MSTRG.22610.1),为了探究其在MDBK中对BHV-1复制的影响,本研究采用CCK-8法筛选对细胞无毒性的聚凝... 本研究室前期将牛疱疹病毒Ⅰ型(BHV-1)感染牛肾细胞(MDBK),通过转录组测序筛选到了转录显著差异的长链非编码RNA-MSTRG.22610.1(lncRNA-MSTRG.22610.1),为了探究其在MDBK中对BHV-1复制的影响,本研究采用CCK-8法筛选对细胞无毒性的聚凝胺、嘌呤霉素的最佳浓度;将重组慢病毒r ZHLV-U6-Zs Green1-puro-MSTRG.22610.1和r ZHLV-U6-Zs Green1-puro(对照慢病毒)按照不同的MOI分别感染MDBK细胞,48 h后观察荧光,采用Image J软件检测并计算各慢病毒感染细胞后出现绿色荧光细胞的比率,出现绿色荧光细胞的比率达80%的细胞对应的MOI即为最佳MOI。筛选结果显示聚凝胺与嘌呤霉素的最佳工作浓度分别为5μg/mL及3μg/m L,慢病毒感染的最适MOI为80。将r ZHLV-U6-Zs Green1-puro-MSTRG.22610.1和对照慢病毒分别以最佳条件感染MDBK细胞并培养及传代,传至8~10代,每代均观察细胞形态及细胞中的绿色荧光,并通过RT-q PCR检测第6、8、10代细胞中lncRNA-MSTRG.22610.1的转录水平,以构建并鉴定稳定表达lncRNA-MSTRG.22610.1的MDBK细胞系1T及对照细胞系1NC。结果显示,每代1T细胞、1NC细胞的状态均良好并均与阴性对照MDBK细胞的形态无差别,且每代1T及1NC细胞均出现绿色荧光。RT-q PCR结果显示,与1NC及阴性对照细胞相比,1T细胞系中lncRNA-MSTRG.22610.1的转录水平极显著升高(P<0.0001)。表明获得了高水平表达lncRNA-MSTRG.22610.1却不影响细胞增殖的细胞系,且该细胞系的遗传稳定性较强。将BHV-110倍倍比稀释后分别感染传至10代的1T与1NC细胞,24 h后采用Reed-Muench法计算各组细胞中的病毒滴度。结果显示,1T、1NC及MB细胞(感染BHV-1的MDBK细胞)的病毒滴度分别为105.15 TCID50/0.1 m L、104.41TCID50/0.1 m L及104.58 TCID50/0.1 m L。与MB和1NC细胞相比,1T细胞中的病毒滴度显著升高(P<0.05),表明lnc RNA-MSTRG.22610.1表达后促进BHV-1在MDBK细胞中的复制。本研究为进一步探究lncRNA-MSTRG.22610.1促进病毒复制的分子机制及深入了解BHV-1感染的分子机制提供参考依据。 展开更多
关键词 长链非编码rna 牛肾细胞 牛疱疹病毒I型 慢病毒过表达 病毒增殖
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