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樟树长链脂肪酰基CoA合成酶基因9克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
汪信东
章挺
+2 位作者
杨海宽
郑永杰
江香梅
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1335-1345,共11页
该研究以樟树转录组数据为基础,筛选克隆了拟南芥AtLACS9同源候选基因CcLACS9,二者序列相似性为75%。相关软件预测CcLACS9享有植物LACS亚家族成员3个特征motifs,且N端含有定位质体信手肽。在Δlacs缺陷型酵母互补测试中,以油酸作为唯一...
该研究以樟树转录组数据为基础,筛选克隆了拟南芥AtLACS9同源候选基因CcLACS9,二者序列相似性为75%。相关软件预测CcLACS9享有植物LACS亚家族成员3个特征motifs,且N端含有定位质体信手肽。在Δlacs缺陷型酵母互补测试中,以油酸作为唯一外源脂肪酸、转化了CcLACS9的突变型酵母恢复正常生长,证明CcLACS9具有典型的脂肪酰基CoA合成酶的功能。为探究CcLACS9是否参与了樟树籽油生物合成,进一步研究了其组织表达模式和在种子发育过程中其表达量与籽油累积量之间的关系。实时荧光定量PCR分析显示CcLACS9基因在种仁与花中优势表达,种仁中相对表达量是根中的17.74倍。随机测定了30棵成年樟树成熟期种子千粒重、籽油含量和中链脂肪酸比例等指标。根据仁油含量将测试群体划为高、中、低三个不同品级,并在各品级中挑选3棵单株、逐月关联分析其仁油含量与CcLACS9相对表达量。结果表明:在种仁发育前期,仁油含量和CcLACS9表达量都持续上升且二者呈正相关性,8月份为CcLACS9表达量峰值期; 9月下旬后,仁油含量趋向稳定但CcLACS9表达量仍处于较高水平但呈现下降趋势,二者无明显相关性。LACS亚家族在植物进化中较为保守,同源基因在不同植物中具有相同或相似的功能。该研究结果暗示CcLACS9可能拥有AtLACS9相似的生物学功能,即在樟树种仁油酯合成和累积过程中起重要作用。
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关键词
樟树
长链脂肪酰基coa合成酶9
籽油
基因表达分析
酵母互补检测
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职称材料
油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析
被引量：
8
2
作者
江南
谭晓风
+3 位作者
张琳
李泽
蒋瑶
黄丽媛
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期139-147,共9页
长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LA...
长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LACS1基因全长c DNA序列,命名为CoLACS1(Gene Bank登录号:KJ960228),全长2114 bp,开放阅读框2088 bp,编码695个氨基酸;生物信息学分析显示CoLACS1具有3个B1ock,从分子特征可判断CoLACS1属于LACS家族;氨基酸同源比对显示与其他物种的LACS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与拟南芥LACS7相似性为78%,与麻风树、大豆、毛果杨等物种LACS6(peroxisomal)相似性可达80%以上;对CoLACS1进行原核表达分析,构建的p ET30a-CoLACS1载体成功转化至BL21(DE3)中经1 mmol/L IPTG诱导表达,菌液检测获得预测的目的蛋白(分子量约为76 k D);分析转录组数据中CoLACS1的Unigene序列RTKM值并对CoLACS1进行实时荧光定量PCR分析,结果表明CoLACS1在油茶华硕种子发育各时期平稳表达,表达丰度变化不大,荧光定量结果变化规律与转录组数据分析一致;同时分析华硕种仁不同时期含油率和脂肪酸成分变化,双变量统计分析发现CoLACS1表达模式与油茶油脂积累规律呈显著相关性。本研究为进一步研究油茶油脂积累与代谢的基因调控提供理论依据。
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关键词
油茶
长
链
脂肪
酰基
coa
合成酶
基因表达
油脂积累
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职称材料
题名
樟树长链脂肪酰基CoA合成酶基因9克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
汪信东
章挺
杨海宽
郑永杰
江香梅
机构
江西省林业科学院樟树研究所
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1335-1345,共11页
基金
江西省青年科学基金(20171BAB214005)
江西省林业科学院青年人才培养项目(2014521102)~~
文摘
该研究以樟树转录组数据为基础,筛选克隆了拟南芥AtLACS9同源候选基因CcLACS9,二者序列相似性为75%。相关软件预测CcLACS9享有植物LACS亚家族成员3个特征motifs,且N端含有定位质体信手肽。在Δlacs缺陷型酵母互补测试中,以油酸作为唯一外源脂肪酸、转化了CcLACS9的突变型酵母恢复正常生长,证明CcLACS9具有典型的脂肪酰基CoA合成酶的功能。为探究CcLACS9是否参与了樟树籽油生物合成,进一步研究了其组织表达模式和在种子发育过程中其表达量与籽油累积量之间的关系。实时荧光定量PCR分析显示CcLACS9基因在种仁与花中优势表达,种仁中相对表达量是根中的17.74倍。随机测定了30棵成年樟树成熟期种子千粒重、籽油含量和中链脂肪酸比例等指标。根据仁油含量将测试群体划为高、中、低三个不同品级,并在各品级中挑选3棵单株、逐月关联分析其仁油含量与CcLACS9相对表达量。结果表明:在种仁发育前期,仁油含量和CcLACS9表达量都持续上升且二者呈正相关性,8月份为CcLACS9表达量峰值期; 9月下旬后,仁油含量趋向稳定但CcLACS9表达量仍处于较高水平但呈现下降趋势,二者无明显相关性。LACS亚家族在植物进化中较为保守,同源基因在不同植物中具有相同或相似的功能。该研究结果暗示CcLACS9可能拥有AtLACS9相似的生物学功能,即在樟树种仁油酯合成和累积过程中起重要作用。
关键词
樟树
长链脂肪酰基coa合成酶9
籽油
基因表达分析
酵母互补检测
Keywords
Cinnamomum camphora
long chain fatty aycl-
coa
synthetase
9
seed oil
gene expression analysis
yeast complementation
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析
被引量：
8
2
作者
江南
谭晓风
张琳
李泽
蒋瑶
黄丽媛
机构
中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
湖南工业大学包装与材料工程学院
中南林业科技大学/湖南工业大学经济林培育与利用湖南省
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期139-147,共9页
基金
国家林业公益性行业科研专项重大项目(201404702)
湖南省自然科学基金项目(2016JJ5031)
国家自然科学基金项目(31470684)
文摘
长链脂肪酰基Co A合成酶(LACS)在脂肪酸的合成与分解代谢中起着重要作用。本研究以油茶(Camellia oleifera Abel)国家审定品种华硕(Camellia oleifera Huashuo)种仁转录组数据为基础,根据LACS基因Unigene序列设计引物,分离克隆了油茶LACS1基因全长c DNA序列,命名为CoLACS1(Gene Bank登录号:KJ960228),全长2114 bp,开放阅读框2088 bp,编码695个氨基酸;生物信息学分析显示CoLACS1具有3个B1ock,从分子特征可判断CoLACS1属于LACS家族;氨基酸同源比对显示与其他物种的LACS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与拟南芥LACS7相似性为78%,与麻风树、大豆、毛果杨等物种LACS6(peroxisomal)相似性可达80%以上;对CoLACS1进行原核表达分析,构建的p ET30a-CoLACS1载体成功转化至BL21(DE3)中经1 mmol/L IPTG诱导表达,菌液检测获得预测的目的蛋白(分子量约为76 k D);分析转录组数据中CoLACS1的Unigene序列RTKM值并对CoLACS1进行实时荧光定量PCR分析,结果表明CoLACS1在油茶华硕种子发育各时期平稳表达,表达丰度变化不大,荧光定量结果变化规律与转录组数据分析一致;同时分析华硕种仁不同时期含油率和脂肪酸成分变化,双变量统计分析发现CoLACS1表达模式与油茶油脂积累规律呈显著相关性。本研究为进一步研究油茶油脂积累与代谢的基因调控提供理论依据。
关键词
油茶
长
链
脂肪
酰基
coa
合成酶
基因表达
油脂积累
Keywords
Camellia oleifera C. Abel
long chain fatty acid acyl-
coa
synthetase
gene expression
lipid accumulation
分类号
S794.4 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
樟树长链脂肪酰基CoA合成酶基因9克隆与表达分析
汪信东
章挺
杨海宽
郑永杰
江香梅
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
油茶长链脂肪酰基CoA合成酶基因1(CoLACS1)分子特征与表达分析
江南
谭晓风
张琳
李泽
蒋瑶
黄丽媛
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
8
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