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东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析
被引量：
5
1
作者
崔玲玲
李磊
+7 位作者
韩小霞
邢俊杰
李玲龙
阳志刚
罗秀娟
李丁
谢灵灵
曹孟良
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期111-115,共5页
利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已...
利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
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关键词
东乡野生稻
液体质粒文库
长片段高保真pcr
生物信息学
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职称材料
题名
东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析
被引量：
5
1
作者
崔玲玲
李磊
韩小霞
邢俊杰
李玲龙
阳志刚
罗秀娟
李丁
谢灵灵
曹孟良
机构
中南大学研究生院隆平分院
湖南西城杂交水稻基因科技有限公司
国家杂交水稻工程技术研究中心
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期111-115,共5页
基金
国家“973”项目(2007CB109007)
国家“863”重点项目(2006AA100101)
国家科技支撑计划项目(2007BAD77B00)
文摘
利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
关键词
东乡野生稻
液体质粒文库
长片段高保真pcr
生物信息学
Keywords
Dongxiang wild rice
the liquid plasmid library
LA-
pcr
bioinforrnatics
分类号
S511.903.4 [农业科学—作物学]
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出处
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被引量
操作
1
东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析
崔玲玲
李磊
韩小霞
邢俊杰
李玲龙
阳志刚
罗秀娟
李丁
谢灵灵
曹孟良
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
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