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小鼠BTB/锌指结构新基因Bsg6的克隆及表达谱分析
被引量：
2
1
作者
慈宏亮
李昱华
+1 位作者
陈微
李亦平
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期117-123,共7页
Bsg6(brain specific gene 6)是用消减差异筛选的方法克隆的小鼠头部特异表达新基因.Bsg6基因cDNA长3 871 bp,编码一个670个氨基酸残基的蛋白,GenBank登录号AY635051,位于小鼠第4号染色体,由2个外显子构成.Bsg6蛋白含有一个N端BTB(Broad...
Bsg6(brain specific gene 6)是用消减差异筛选的方法克隆的小鼠头部特异表达新基因.Bsg6基因cDNA长3 871 bp,编码一个670个氨基酸残基的蛋白,GenBank登录号AY635051,位于小鼠第4号染色体,由2个外显子构成.Bsg6蛋白含有一个N端BTB(Broad-complex,Tramtrack,andBric-a-brac)结构域和两个C端C2H2型锌指结构域.小鼠Bsg6蛋白与其在人类和鸡中同源蛋白的同源性分别为86.2%和79.1%.Bsg6在小鼠胚胎中的表达具有一定动态性,在E8.5的小鼠胚胎中,Bsg6主要在前脑和神经管表达.在E9.5的小鼠胚胎中,Bsg6的表达明显增强并主要集中在前脑的端脑部.Bsg6在E10.5小鼠胚胎端脑的表达出现了下降,但是在中脑和后脑的表达增加,此外,Bsg6 mRNA的表达还出现在肢芽和尾部.在HH10期的鸡胚中,Bsg6主要在头部和神经管前端表达.Northern杂交结果显示,Bsg6在很多小鼠成体组织中没有表达,但是在破骨细胞瘤中高表达.Bsg6的表达谱提示,Bsg6可能是在器官形成期对脑的发育起到重要作用的转录因子,而且其表达受到严格的调控,此外Bsg6还可能与肿瘤的发生有关.
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关键词
Bsg
6
基因
差异筛选
锌指
蛋白
BTB
结构域
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职称材料
ZBED2通过糖酵解代谢诱导肝细胞癌中PD-L1表达促进免疫逃逸的机制研究
2
作者
黄金石
丁亚亭
曹建中
《中国免疫学杂志》
北大核心
2025年第2期367-373,共7页
目的:探讨锌指BED结构域含蛋白2(ZBED2)通过糖酵解通路对肝细胞癌(HCC)免疫逃逸的影响及潜在机制。方法:生物信息学数据库分析ZBED2在HCC组织中的表达情况及二者的结合位点,分析ZBED2调控的通路,以及ZBED2与糖酵解基因的相关性。qPCR和W...
目的:探讨锌指BED结构域含蛋白2(ZBED2)通过糖酵解通路对肝细胞癌(HCC)免疫逃逸的影响及潜在机制。方法:生物信息学数据库分析ZBED2在HCC组织中的表达情况及二者的结合位点,分析ZBED2调控的通路,以及ZBED2与糖酵解基因的相关性。qPCR和Western blot检测ZBED2及程序性细胞死亡配体1(PD-L1)在HCC细胞中的表达,MTT检测细胞活力,细胞毒性实验检测CD8+T细胞毒性,ELISA检测细胞因子表达;细胞外流量分析仪检测胞外酸化率(ECAR)和耗氧率(OCR),qPCR检测糖酵解相关基因表达,试剂盒检测糖酵解指标,免疫组织化学染色检测肿瘤组织中CD8^(+)T细胞表达。结果:ZBED2在HCC中表达上调,过表达ZBED2可促进PD-L1表达,抑制CD8^(+)T细胞对HCC细胞的毒性。过表达ZBED2通过激活糖酵解通路抑制HCC中CD8^(+)T细胞活性,进一步添加糖酵解抑制剂2-脱氧-D-葡萄糖(2-DG)减弱了以上结果。体内实验发现,敲低ZBED2可抑制小鼠肿瘤生长及PD-L1表达,促进体内CD8+T细胞浸润。结论:ZBED2通过糖酵解代谢诱导HCC中PDL1表达,促进免疫逃逸。
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关键词
锌指
bed
结构域
含
蛋白
2
糖酵解
肝细胞癌
免疫逃逸
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职称材料
Zbed6基因敲除对小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制研究
被引量：
1
3
作者
刘铃
王圣楠
+3 位作者
王丹丹
马月辉
蒋琳
崔凯
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期3641-3651,共11页
【目的】研究锌指BED结构域包含蛋白6(ZBED6)基因敲除对青春期小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制。【方法】以8周龄野生型(WT)和Zbed6基因敲除(Zbed6^(-/-))C57BL/6小鼠为试验对象,采集血液,用ELISA法检测血清睾酮含量;分离骨...
【目的】研究锌指BED结构域包含蛋白6(ZBED6)基因敲除对青春期小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制。【方法】以8周龄野生型(WT)和Zbed6基因敲除(Zbed6^(-/-))C57BL/6小鼠为试验对象,采集血液,用ELISA法检测血清睾酮含量;分离骨骼肌组织并记录肌肉重、肌肉率。通过骨骼肌组织切片和免疫组化分析检测骨骼肌肌纤维面积及IGF2蛋白表达水平。通过Illumina NovaseqTM6000高通量测序对WT和Zbed6^(-/-)雌、雄小鼠进行转录组测序分析,联合小鼠ZBED6靶基因数据,筛选在Zbed6基因敲除小鼠肌肉组织中发挥作用的下游靶基因,并通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果中差异表达基因的可靠性。【结果】与WT小鼠相比,Zbed6^(-/-)雌、雄小鼠肌肉重、肌肉率均极显著增加(P<0.01)。Zbed6基因敲除后,雌、雄小鼠骨骼肌Zbed6基因mRNA表达量显著降低(P<0.05),IGF2的mRNA及蛋白表达量均显著或极显著增加(P<0.05;P<0.01),血清睾酮含量极显著升高(P<0.01)。转录组测序结果显示,Zbed6^(-/-)组雄鼠骨骼肌中共筛选到38个差异表达基因,其中22个上调,16个基因下调;雌鼠骨骼肌中筛选到49个差异表达基因,其中19个基因上调,30个基因下调。共有10个差异表达基因在雌、雄小鼠中共同表达,其中Dock3、Lhx2、Brsk2、Caskin1、Gbe1为ZBED6靶基因。实时荧光定量PCR检测发现,4个差异表达基因的表达情况与转录组测序分析结果一致,证实测序结果准确可信。【结论】Zbed6^(-/-)促进青春期小鼠骨骼肌生长发育,增加血清睾酮含量,筛选出Dock3、Lhx2、Brsk2、Caskin1、Gbe1 5个ZBED6靶基因。研究结果为深入探究ZBED6功能提供了新的基因靶点和研究方向,有助于完善ZBED6功能图谱,为大动物品种改良和畜禽瘦肉性状遗传育种研究提供了重要的理论依据。
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关键词
锌指bed结构域包含蛋白6
骨骼肌
生长发育
转录组测序
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职称材料
题名
小鼠BTB/锌指结构新基因Bsg6的克隆及表达谱分析
被引量：
2
1
作者
慈宏亮
李昱华
陈微
李亦平
机构
北京师范大学生命科学学院生物医学研究所
美国哈佛大学牙医学院Forsyth研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期117-123,共7页
基金
浙江赛尔生物医学研究院资助项目~~
文摘
Bsg6(brain specific gene 6)是用消减差异筛选的方法克隆的小鼠头部特异表达新基因.Bsg6基因cDNA长3 871 bp,编码一个670个氨基酸残基的蛋白,GenBank登录号AY635051,位于小鼠第4号染色体,由2个外显子构成.Bsg6蛋白含有一个N端BTB(Broad-complex,Tramtrack,andBric-a-brac)结构域和两个C端C2H2型锌指结构域.小鼠Bsg6蛋白与其在人类和鸡中同源蛋白的同源性分别为86.2%和79.1%.Bsg6在小鼠胚胎中的表达具有一定动态性,在E8.5的小鼠胚胎中,Bsg6主要在前脑和神经管表达.在E9.5的小鼠胚胎中,Bsg6的表达明显增强并主要集中在前脑的端脑部.Bsg6在E10.5小鼠胚胎端脑的表达出现了下降,但是在中脑和后脑的表达增加,此外,Bsg6 mRNA的表达还出现在肢芽和尾部.在HH10期的鸡胚中,Bsg6主要在头部和神经管前端表达.Northern杂交结果显示,Bsg6在很多小鼠成体组织中没有表达,但是在破骨细胞瘤中高表达.Bsg6的表达谱提示,Bsg6可能是在器官形成期对脑的发育起到重要作用的转录因子,而且其表达受到严格的调控,此外Bsg6还可能与肿瘤的发生有关.
关键词
Bsg
6
基因
差异筛选
锌指
蛋白
BTB
结构域
Keywords
Bsg
6
gene
differential screening
zinc finger protein
BTB motif
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
ZBED2通过糖酵解代谢诱导肝细胞癌中PD-L1表达促进免疫逃逸的机制研究
2
作者
黄金石
丁亚亭
曹建中
机构
南通大学附属医院药学部
出处
《中国免疫学杂志》
北大核心
2025年第2期367-373,共7页
文摘
目的:探讨锌指BED结构域含蛋白2(ZBED2)通过糖酵解通路对肝细胞癌(HCC)免疫逃逸的影响及潜在机制。方法:生物信息学数据库分析ZBED2在HCC组织中的表达情况及二者的结合位点,分析ZBED2调控的通路,以及ZBED2与糖酵解基因的相关性。qPCR和Western blot检测ZBED2及程序性细胞死亡配体1(PD-L1)在HCC细胞中的表达,MTT检测细胞活力,细胞毒性实验检测CD8+T细胞毒性,ELISA检测细胞因子表达;细胞外流量分析仪检测胞外酸化率(ECAR)和耗氧率(OCR),qPCR检测糖酵解相关基因表达,试剂盒检测糖酵解指标,免疫组织化学染色检测肿瘤组织中CD8^(+)T细胞表达。结果:ZBED2在HCC中表达上调,过表达ZBED2可促进PD-L1表达,抑制CD8^(+)T细胞对HCC细胞的毒性。过表达ZBED2通过激活糖酵解通路抑制HCC中CD8^(+)T细胞活性,进一步添加糖酵解抑制剂2-脱氧-D-葡萄糖(2-DG)减弱了以上结果。体内实验发现,敲低ZBED2可抑制小鼠肿瘤生长及PD-L1表达,促进体内CD8+T细胞浸润。结论:ZBED2通过糖酵解代谢诱导HCC中PDL1表达,促进免疫逃逸。
关键词
锌指
bed
结构域
含
蛋白
2
糖酵解
肝细胞癌
免疫逃逸
Keywords
Z
bed
2
Glycolysis
Hepatocellular carcinoma
Immune escape
分类号
R392.12 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
Zbed6基因敲除对小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制研究
被引量：
1
3
作者
刘铃
王圣楠
王丹丹
马月辉
蒋琳
崔凯
机构
青岛农业大学动物科技学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期3641-3651,共11页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(32202621)
国家自然科学基金优秀青年科学基金项目(32222079)。
文摘
【目的】研究锌指BED结构域包含蛋白6(ZBED6)基因敲除对青春期小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制。【方法】以8周龄野生型(WT)和Zbed6基因敲除(Zbed6^(-/-))C57BL/6小鼠为试验对象,采集血液,用ELISA法检测血清睾酮含量;分离骨骼肌组织并记录肌肉重、肌肉率。通过骨骼肌组织切片和免疫组化分析检测骨骼肌肌纤维面积及IGF2蛋白表达水平。通过Illumina NovaseqTM6000高通量测序对WT和Zbed6^(-/-)雌、雄小鼠进行转录组测序分析,联合小鼠ZBED6靶基因数据,筛选在Zbed6基因敲除小鼠肌肉组织中发挥作用的下游靶基因,并通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果中差异表达基因的可靠性。【结果】与WT小鼠相比,Zbed6^(-/-)雌、雄小鼠肌肉重、肌肉率均极显著增加(P<0.01)。Zbed6基因敲除后,雌、雄小鼠骨骼肌Zbed6基因mRNA表达量显著降低(P<0.05),IGF2的mRNA及蛋白表达量均显著或极显著增加(P<0.05;P<0.01),血清睾酮含量极显著升高(P<0.01)。转录组测序结果显示,Zbed6^(-/-)组雄鼠骨骼肌中共筛选到38个差异表达基因,其中22个上调,16个基因下调;雌鼠骨骼肌中筛选到49个差异表达基因,其中19个基因上调,30个基因下调。共有10个差异表达基因在雌、雄小鼠中共同表达,其中Dock3、Lhx2、Brsk2、Caskin1、Gbe1为ZBED6靶基因。实时荧光定量PCR检测发现,4个差异表达基因的表达情况与转录组测序分析结果一致,证实测序结果准确可信。【结论】Zbed6^(-/-)促进青春期小鼠骨骼肌生长发育,增加血清睾酮含量,筛选出Dock3、Lhx2、Brsk2、Caskin1、Gbe1 5个ZBED6靶基因。研究结果为深入探究ZBED6功能提供了新的基因靶点和研究方向,有助于完善ZBED6功能图谱,为大动物品种改良和畜禽瘦肉性状遗传育种研究提供了重要的理论依据。
关键词
锌指bed结构域包含蛋白6
骨骼肌
生长发育
转录组测序
Keywords
zinc finger
bed
domain containing protein
6
skeletal muscle
growth and development
transcriptome sequencing
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小鼠BTB/锌指结构新基因Bsg6的克隆及表达谱分析
慈宏亮
李昱华
陈微
李亦平
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
2
在线阅读
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职称材料
2
ZBED2通过糖酵解代谢诱导肝细胞癌中PD-L1表达促进免疫逃逸的机制研究
黄金石
丁亚亭
曹建中
《中国免疫学杂志》
北大核心
2025
0
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职称材料
3
Zbed6基因敲除对小鼠骨骼肌生长发育的影响及其分子作用机制研究
刘铃
王圣楠
王丹丹
马月辉
蒋琳
崔凯
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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