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柽柳类锌指基因ThZFL的功能分析 被引量:2
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作者 曲冠证 郑唐春 +2 位作者 杜兆伟 赵思雯 夏德安 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期6-10,70,共6页
为了研究柽柳ThZFL基因的功能,将ThZFL基因过表达转入烟草后,对转基因烟草进行盐胁迫、干旱胁迫,并利用酵母双杂交及染色体步移技术,获得柽柳ThZFL基因的互作蛋白与启动子。结果表明:柽柳ThZ-FL基因能显著提高转基因烟草盐胁迫下种子的... 为了研究柽柳ThZFL基因的功能,将ThZFL基因过表达转入烟草后,对转基因烟草进行盐胁迫、干旱胁迫,并利用酵母双杂交及染色体步移技术,获得柽柳ThZFL基因的互作蛋白与启动子。结果表明:柽柳ThZ-FL基因能显著提高转基因烟草盐胁迫下种子的发芽率、离体叶片的分化和植株的生长能力;通过酵母双杂交筛选出两个与ThZFL蛋白互作的蛋白;ThZFL基因启动子驱动GUS活性显示,在幼苗的整体、叶脉和毛状体中表达显著,但在幼叶和茎尖处表达微弱。 展开更多
关键词 柽柳 锌指基因 盐胁迫 酵母双杂交 启动子
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用Bubble PCR法对一个新的锌指基因进行外显子划界
2
作者 张民 余龙 +3 位作者 胡培蓉 施少林 邢郡 赵寿元 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1997年第11期1-6,共6页
介绍了一种确定基因外显子一内含子交界点的快速、准确的方法,应用该方法对本室克隆的一个新的锌指基因ZNF191进行了外显子划界。将含有ZNF191全长CDNA的基因组DNA经限制酶酶切后与退火的Bubblelinker连接,以该连接产物为模板,用依据... 介绍了一种确定基因外显子一内含子交界点的快速、准确的方法,应用该方法对本室克隆的一个新的锌指基因ZNF191进行了外显子划界。将含有ZNF191全长CDNA的基因组DNA经限制酶酶切后与退火的Bubblelinker连接,以该连接产物为模板,用依据cDNA序列设计的引物和Bubblelinker上的特异引物进行PCR扩增,继以相同的扩增条件对扩增产物进行测序,从而确定了外显子-内含子的交界点。结果确认出ZNF191基因由4个外显子和3个内含子组成,这一结论为后来完成的ZNF191基因的全长测序结果所证实。 展开更多
关键词 BUBBLE PCR 外显子划界 锌指基因 克隆技术
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一个水稻茎叶优势表达锌指基因启动子的克隆及功能分析
3
作者 郑娅珊 袁国强 +1 位作者 刘华清 王锋 《福建农业学报》 CAS 2009年第1期1-5,共5页
通过RT-PCR分析,鉴定了一个在水稻茎、叶中特异表达的锌指基因OsZF153。利用PCR扩增了OsZF153基因上游约2 kb启动子区,构建了启动子与GUS的融合表达载体pCZF153P-GUS。pCZF153P-GUS转基因T0植株GUS活性分析显示:转基因植株的根、茎、叶... 通过RT-PCR分析,鉴定了一个在水稻茎、叶中特异表达的锌指基因OsZF153。利用PCR扩增了OsZF153基因上游约2 kb启动子区,构建了启动子与GUS的融合表达载体pCZF153P-GUS。pCZF153P-GUS转基因T0植株GUS活性分析显示:转基因植株的根、茎、叶、颖壳中检测到GUS活性,其中茎和叶GUS表达活性较强,而根和颖壳表达较弱,在雄蕊和雌蕊及种子不同发育阶段中没有检测到GUS活性,表明OsZF153启动子是一个水稻非生殖器官表达,且在茎、叶中优势表达的启动子。 展开更多
关键词 水稻 锌指基因 OsZF153 茎叶 优势表达
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促髓细胞分化的锌指基因单向PCR扩增直接测序的研究
4
作者 穆莹 惠培 《生物化学杂志》 CSCD 1994年第6期657-661,共5页
锌指基因是一种造血调节基因,编码锌指结构蛋白,主要在髓细胞中表达,促进髓细胞分化,在急性早幼粒白血病维甲酸治疗中,促使病情缓解。本文报道了我们从基因分子上研究锌指基因作用中,探索并建立了单向聚合酶链反应(PCR)扩增... 锌指基因是一种造血调节基因,编码锌指结构蛋白,主要在髓细胞中表达,促进髓细胞分化,在急性早幼粒白血病维甲酸治疗中,促使病情缓解。本文报道了我们从基因分子上研究锌指基因作用中,探索并建立了单向聚合酶链反应(PCR)扩增特定单链DNA,直接测序的新方法。它能产生质和量均佳的单链DNA,无需纯化即可直接用于测序,使复杂的测序研究简便易行,可在2,3天内完成。这种单向PCR扩增特定单链DNA直接测序的方法,经对锌指基因的cDNA测序,得到验证。此法不仅适用于疾病研究中的DNA测序,还可制各单链DNA探针,更利于基因结构组成的研究。 展开更多
关键词 髓细胞 锌指基因 DNA 直接测序 聚合酶链反应
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锌指基因ZNF268两个新的差异剪接本克隆及鉴定
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作者 孙翀 赵舟宙 +3 位作者 高立 孙燕 邵焕杰 李文鑫 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期513-517,共5页
ZNF268是一个典型的KRAB类锌指基因,含有24个C2H2型锌指基序和一个KRAB功能域,它在人胚胎发育早期表达,并与胚胎肝脏的发育相关。通过免疫组化的方法,发现ZNF268在3—5周龄人胚的造血干细胞中有表达;进一步通过RT—PCR的方法检测发... ZNF268是一个典型的KRAB类锌指基因,含有24个C2H2型锌指基序和一个KRAB功能域,它在人胚胎发育早期表达,并与胚胎肝脏的发育相关。通过免疫组化的方法,发现ZNF268在3—5周龄人胚的造血干细胞中有表达;进一步通过RT—PCR的方法检测发现ZNF268在健康成人全血细胞中也有表达,并且表达有4个差异剪接本,从中克隆得到两个新的ZNF268差异剪接本ZNF268c和ZNF268d。推测ZNF268和血细胞生长发育相关。 展开更多
关键词 ZNF268 锌指基因 血细胞 差异剪接本
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冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析 被引量:2
6
作者 邢凯峰 姚杏子 +5 位作者 周军 谢昊星 陈容平 赵耀 戎俊 张剑 《经济林研究》 北大核心 2024年第1期11-19,共9页
【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测... 【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测等相关生物信息学分析,并以庐山高海拔油茶(LSG)和栽培油茶品种赣无1(GW1)为材料,对CCCH型锌指蛋白基因在冷胁迫下的表达情况进行分析。【结果】在普通油茶的冷胁迫转录组数据中共鉴定到24个CCCH型锌指蛋白基因,参考水稻分类方法,将24个CCCH型锌指蛋白聚类到2个亚家族中。保守基序分析结果表明,在24个基因中仅有3种CCCH型锌指蛋白基序类型,即C-X8-C-X5-C-X3-H、C-X7-C-X5-C-X3-H和C-X5-C-X4-C-X3-H,数目分别为92、4和4。转录组表达谱分析结果表明:在野外冷胁迫试验中CoC3H17基因在D4、D5和D6时期的表达量高于D1、D2和D3时期,在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶和赣无1的CoC3H17基因一直表现为更高的转录本丰度;CoC3H14和CoC3H24基因在野外试验的D4、D5和D6时期均表现为表达量明显上升,且在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶的这2个基因的表达量高于赣无1。【结论】CoC3H17、CoC3H14和CoC3H24基因可能是普通油茶应对冷胁迫的关键基因。 展开更多
关键词 普通油茶 CCCH型锌指蛋白基因家族 生物信息学分析 冷胁迫 转录组
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水稻种子发育期间特异锌指蛋白基因的筛选与分析 被引量:5
7
作者 周淑芬 刘华清 +2 位作者 徐桂磊 颜静宛 王锋 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1033-1039,共7页
锌指蛋白基因是植物基因组中最大最复杂的基因家族之一.大部分的锌指模体存在于转录因子中,它们在转录水平上参与植物生长发育及植物对生物和非生物胁迫的反应.为了解锌指蛋白基因在水稻种子发育中的作用,本研究通过多种数据库搜索获得... 锌指蛋白基因是植物基因组中最大最复杂的基因家族之一.大部分的锌指模体存在于转录因子中,它们在转录水平上参与植物生长发育及植物对生物和非生物胁迫的反应.为了解锌指蛋白基因在水稻种子发育中的作用,本研究通过多种数据库搜索获得了878个水稻锌指蛋白基因.从中选取311个利用RT-PCR技术分析它们在水稻成熟期根、茎、叶、花及不同发育阶段种子中的表达特征.结果发现,共有196个基因能在至少1个水稻器官中表达,其中10个为种子特异性表达基因.进一步分析发现,10个特异表达基因在水稻种子不同发育阶段中的表达具有种子阶段表达特异性.同时分析它们的基因及蛋白结构特点,结果显示它们的结构较简单,其中3个蛋白含有线粒体靶肽,5个蛋白含有CCCH锌指结构域.另外,分析种子特异性表达基因上游调控区的顺式作用元件,结果表明它们都含有TATA-box、CAAT-box和种子特异调控元件,除此之外还发现了光、激素和胁迫反应相关调控元件.这些结果为进一步研究它们在种子发育过程中的生物学功能提供了有用的线索. 展开更多
关键词 水稻 锌指蛋白基因 种子特异表达 RT-PCR
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欧美杨锌指蛋白转录因子基因(ZxZF)的遗传转化及抗旱性初步分析 被引量:4
8
作者 张伟溪 刘浡洋 +4 位作者 丁昌俊 张冰玉 黄秦军 褚延广 苏晓华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第3期31-37,共7页
C2H2型锌指蛋白转录因子在激活胁迫相关基因、增强植物抗逆性方面具有重要的作用。以来自极端抗逆木本植物霸王C2H2型锌指蛋白转录因子基因(ZxZF)为外源基因,利用农杆菌介导法对欧美杨‘渤丰1号’进行遗传转化。经卡那霉素筛选获得80株... C2H2型锌指蛋白转录因子在激活胁迫相关基因、增强植物抗逆性方面具有重要的作用。以来自极端抗逆木本植物霸王C2H2型锌指蛋白转录因子基因(ZxZF)为外源基因,利用农杆菌介导法对欧美杨‘渤丰1号’进行遗传转化。经卡那霉素筛选获得80株抗性植株,通过PCR检测获得17株呈阳性植株,Southern印记杂交检测证实外源基因以单拷贝方式整合到5个转基因株系体内,RT-PCR及qRT-PCR分子检测表明,外源基因在4个转基因株系中成功表达。PEG模拟干旱胁迫试验结果初步表明,转基因株系叶片相对含水量和脯氨酸含量均显著高于非转基因植株10%以上,转基因株系抗旱性得到一定程度提高。研究表明ZxZF转录因子基因对提高转基因杨树抗旱能力具有重要作用,在培育抗旱林木优良品种中具有重要育种价值。 展开更多
关键词 欧美杨 锌指蛋白基因 遗传转化 抗旱性
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用RACE结合cDNA文库筛选的方法获取新的锌指蛋白基因 被引量:8
9
作者 杜占文 刘立仁 张俊武 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期329-331,共3页
大多数有重要功能的蛋白质都含相应的由保守氨基酸顺序组成的功能结构域。本文首先根据蛋白质功能结构域保守氨基酸序列设计简并引物 ,用PCR方法扩增出基因EST序列 ,再利用改进的快速扩增cDNA末端(RACE)方法从cDNA文库中扩增出基因非同... 大多数有重要功能的蛋白质都含相应的由保守氨基酸顺序组成的功能结构域。本文首先根据蛋白质功能结构域保守氨基酸序列设计简并引物 ,用PCR方法扩增出基因EST序列 ,再利用改进的快速扩增cDNA末端(RACE)方法从cDNA文库中扩增出基因非同源部位 ,然后以非同源序列为探针 ,筛选cDNA文库。利用此方法成功地从人骨髓cDNA文库中克隆到几个编码锌指蛋白并代表原有EST的新的全长cDNA。这一策略也应适用于筛选编码具有其他序列保守性功能结构域蛋白的基因。 展开更多
关键词 RACE CDNA文库 筛选 锌指蛋白基因 非同源DNA序列 基因
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小脑锌指结构1基因在人子宫内膜癌中的表达及其预后预测价值 被引量:7
10
作者 顾星 曹方 +3 位作者 胡永伟 丁厚中 浦少锋 刘琴 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期875-879,共5页
目的:探讨小脑锌指结构1(zinc finger protein of the cerebellum 1,ZIC1)基因在人子宫内膜癌组织中的表达情况及其与临床参数之间的关系和预后预测价值。方法:收集江苏大学附属昆山医院及上海市第六人民医院自2008年1月至2011年12月收... 目的:探讨小脑锌指结构1(zinc finger protein of the cerebellum 1,ZIC1)基因在人子宫内膜癌组织中的表达情况及其与临床参数之间的关系和预后预测价值。方法:收集江苏大学附属昆山医院及上海市第六人民医院自2008年1月至2011年12月收治的子宫内膜癌患者43例,取肿瘤组织及相应的距原发灶边缘2 cm以上的癌旁黏膜组织标本。应用免疫组织化学法、Western blotting及RT-PCR法检测43例子宫内膜癌原发灶组织及癌旁黏膜组织中ZIC1的表达,分析其与临床病理参数之间的关系,并通过5年生存情况分析评价其预后价值。结果:子宫内膜癌组织中ZIC1的m RNA水平和蛋白水平均明显高于癌旁组织。ZIC1蛋白在子宫内膜癌组织中呈现高表达,其阳性表达率为72.1%(31/43),在癌旁组织中阳性表达率为39.5%(17/43)。ZIC1 m RNA的表达与淋巴结转移及FIGO分期有关(P<0.01或P<0.05)。ZIC1低表达患者的5年生存率明显高于高表达患者(66.7%vs 38.7%,P<0.05)。单因素分析发现ZIC1(高表达vs低表达)风险比(HR)为2.66,95%CI:1.07-5.89,P=0.047;经多因素分析调整后,HR=2.25,95%CI:1.36-3.71,P=0.002,说明高水平的ZIC1与子宫内膜癌术后预后不良密切相关。结论:ZIC1表达水平的升高在子宫内膜癌的发生发展中起着重要作用,可能成为子宫内膜癌治疗和预后测评的一个新的指标。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 小脑锌指结构1基因 预后
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火龙果类锌指蛋白基因片段的克隆及表达分析 被引量:3
11
作者 颜凤霞 文晓鹏 +1 位作者 乔光 刘涛 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期37-41,共5页
锌指蛋白在原核生物与真核生物基因转录的调控中发挥着重要作用.根据火龙果抗逆cDNA芯片中的一个EST设计一对引物,采用RT-PCR克隆火龙果类锌指蛋白基因片段,生物信息学分析表明,该片段长334bp,编码1中含有109个氨基酸残基的肽链,命名为H... 锌指蛋白在原核生物与真核生物基因转录的调控中发挥着重要作用.根据火龙果抗逆cDNA芯片中的一个EST设计一对引物,采用RT-PCR克隆火龙果类锌指蛋白基因片段,生物信息学分析表明,该片段长334bp,编码1中含有109个氨基酸残基的肽链,命名为HuZF.该基因序列与其它植物锌指蛋白基因核苷酸序列的同源性均在70%以上,推测的氨基酸序列与其它植物锌指蛋白的氨基酸序列的同源性达60%以上.RT-PCR分析表明,高盐和干旱胁迫下,火龙果茎中HuZF的表达增强,低温胁迫时,HuZF的表达先减弱后增强,初步推测该基因的表达与火龙果低温、高盐、干旱等逆境胁迫响应相关. 展开更多
关键词 火龙果 锌指蛋白基因 克隆 表达分析
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金黄壳囊孢菌侵染过程中银中杨锌指蛋白基因的表达 被引量:1
12
作者 杨明秀 宋瑞清 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期510-515,共6页
研究了银中杨接种金黄壳囊孢菌后锌指蛋白基因的表达,为林木抗病遗传育种工作奠定基础。从杨树上分离得到了一株杨树烂皮病菌(CHH001),测定其对银中杨的致病力,并采用形态学和ITS-PCR鉴定方法鉴定该菌株为金黄壳囊孢菌。采用实时定量荧... 研究了银中杨接种金黄壳囊孢菌后锌指蛋白基因的表达,为林木抗病遗传育种工作奠定基础。从杨树上分离得到了一株杨树烂皮病菌(CHH001),测定其对银中杨的致病力,并采用形态学和ITS-PCR鉴定方法鉴定该菌株为金黄壳囊孢菌。采用实时定量荧光PCR技术对银中杨接种金黄壳囊孢菌后锌指蛋白基因的表达进行了研究。实验结果显示,ZFP1和69-Ⅳ-2-4在接种后表达水平持续上升,ZFP1在48 h的基因表达量分别为烫伤对照和空白对照的4.21倍和3.11倍;69-Ⅳ-2-4在48 h为烫伤对照和空白对照的9.56和7.06倍。ZFP1和69-Ⅳ-2-4在接种前期高表达,表明可能参与了植物与病原物的识别过程和防御反应。 展开更多
关键词 银中杨 金黄壳囊孢菌 锌指蛋白基因 实时定量RT—PCR
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小菊‘类锌指蛋白’基因植物表达载体构建及对烟草的转化
13
作者 赵飞 佟友丽 +1 位作者 赵楠 李玉花 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期13-15,共3页
为了建立耐盐碱小菊(Chrysanthemum morifolium)中克隆到的'类锌指蛋白基因'CmSTZF(DQ864730)的烟草遗传转化体系,并研究其抗逆特性。本研究借助Gateway技术构建了小菊'类锌指蛋白'基因CmSTZF的过量表达载体pH7WG2D-CmS... 为了建立耐盐碱小菊(Chrysanthemum morifolium)中克隆到的'类锌指蛋白基因'CmSTZF(DQ864730)的烟草遗传转化体系,并研究其抗逆特性。本研究借助Gateway技术构建了小菊'类锌指蛋白'基因CmSTZF的过量表达载体pH7WG2D-CmSTZF,并以烟草NC89(N.plumbaginifolia'NC89')的叶片为试材,通过农杆菌介导的转化,成功地建立了烟草遗传转化体系,经PCR-Southern鉴定获得CmSTZF的转基因烟草株系。 展开更多
关键词 锌指蛋白基因 表达载体构建 基因
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小白菜RING锌指蛋白基因的克隆及其表达分析
14
作者 赵瑞丽 钟凤林 +4 位作者 林俊芳 高世超 胡海非 杨碧云 林义章 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期90-97,共8页
锌指蛋白在调控植物防御和抗性方面具有重要作用。根据从小白菜中获得的与铜胁迫相关的RING锌指蛋白基因TDF片段设计引物,应用RACE技术克隆出具有完整阅读框的小白菜RING锌指蛋白基因,该基因全长855 bp,开放阅读框606 bp,编码202个氨基... 锌指蛋白在调控植物防御和抗性方面具有重要作用。根据从小白菜中获得的与铜胁迫相关的RING锌指蛋白基因TDF片段设计引物,应用RACE技术克隆出具有完整阅读框的小白菜RING锌指蛋白基因,该基因全长855 bp,开放阅读框606 bp,编码202个氨基酸,分子量为21.32 ku,理论等电点为6.87,属于中性蛋白。结构分析结果表明,该蛋白C-端含有1个保守的C3HC4型RING锌指结构域。进化树分析结果显示,小白菜RING锌指蛋白与芜菁RING锌指蛋白的相似度高达98%,属于C3HC4型RING锌指亚家族。RT-PCR分析结果表明,在铜胁迫下该基因下调表达,推测其可能参与对铜胁迫的应答反应。此结果为进一步研究该基因在小白菜逆境应答中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 小白菜 RING锌指蛋白基因 RACE RT—PCR
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一个新的家蚕锌指蛋白基因的克隆及基因组结构分析
15
作者 徐豫松 汪旭升 +1 位作者 王华兵 楼程富 《蚕业科学》 CAS CSCD 2004年第4期343-347,共5页
锌指蛋白是一类能与细胞内核酸特异结合 ,调控基因表达活性 ,对细胞分裂、分化、胚胎发育及个体生长有重要作用的转录因子。从家蚕 5龄丝腺组织cDNA文库中克隆了一个具有锌指结构的新基因 ,命名为BmZFP基因 (GenBank登录号 :AY75 36 5 9... 锌指蛋白是一类能与细胞内核酸特异结合 ,调控基因表达活性 ,对细胞分裂、分化、胚胎发育及个体生长有重要作用的转录因子。从家蚕 5龄丝腺组织cDNA文库中克隆了一个具有锌指结构的新基因 ,命名为BmZFP基因 (GenBank登录号 :AY75 36 5 9) ,其cDNA全长为 180 9bp ,编码 14 3个氨基酸 ,3′端非翻译区 (3′ untranslatedregion ;3′ UTR)达 1332bp碱基序列。BmZFP氨基酸序列推测有 6个功能结构域 ,是一种CCHC型锌指蛋白。虽然BmZFP氨基酸序列与人、大鼠和小鼠的相关锌指蛋白的氨基酸序列同源性只有 33%左右 ,但 6个功能域中的Cys(C)和His(H)却完全匹配 ,推测其功能与人、大鼠和小鼠的相关锌指蛋白有相似性。BmZFP基因序列的结构分析表明 :该基因由 2个外显子和 1个 14 86bp碱基序列的内含子组成 ,在 5′端上游 - 182~ - 2 2 2区域存在一个启动子元件 ,但不是典型的TATA盒启动子。 展开更多
关键词 家蚕锌指蛋白基因 BmZFP 基因克隆 基因结构 启动子
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水稻C2C2锌指蛋白基因OsLSD2对日本晴品种生长及氮素利用的影响 被引量:2
16
作者 童君 陈景光 +2 位作者 朱静雯 范晓荣 徐国华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期435-441,共7页
LSD1基因家族是一类特殊的C2C2型锌指蛋白基因。OsLSD2是LSD1型基因家族的一员。已知LSD1基因参与了植物抗病信号途径。为了培育环境友好型水稻,我们研究了OsLSD2在日本晴中的过量表达。T3代转基因水稻表型表现为株高降低,分蘖数平均减... LSD1基因家族是一类特殊的C2C2型锌指蛋白基因。OsLSD2是LSD1型基因家族的一员。已知LSD1基因参与了植物抗病信号途径。为了培育环境友好型水稻,我们研究了OsLSD2在日本晴中的过量表达。T3代转基因水稻表型表现为株高降低,分蘖数平均减少2个,结实率只有64%~72%,单株产量下降33%~42%,生育期提前15d,对氮素的吸收利用率降低等,说明该基因过量表达显著抑制水稻的生长和氮素转运。 展开更多
关键词 水稻 LSD1型锌指蛋白基因 过量表达 氮素转运
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普通烟草CCCH类锌指蛋白家族的全基因组鉴定和表达分析 被引量:6
17
作者 唐春闺 邓兆龙 +5 位作者 刘琼 金维环 向世鹏 谢鹏飞 郭红祥 刘卫群 《河南农业科学》 北大核心 2022年第4期48-58,共11页
为了解烟草CCCH类锌指蛋白家族特性,利用拟南芥CCCH类锌指蛋白结构域比对烟草基因组数据库,共鉴定到86个CCCH类锌指蛋白基因家族成员,并对其进行蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布、基序、启动子顺式作用元件、基因表达模式分析以... 为了解烟草CCCH类锌指蛋白家族特性,利用拟南芥CCCH类锌指蛋白结构域比对烟草基因组数据库,共鉴定到86个CCCH类锌指蛋白基因家族成员,并对其进行蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布、基序、启动子顺式作用元件、基因表达模式分析以及对激素的响应分析。结果显示,烟草CCCH类锌指蛋白家族86个基因中37个成员分布在17条不同的染色体上;基序分析显示,该家族所有成员均含有C-X_(7/8)-C-X_(5)-C_(3)-H基序,除此之外,在烟草中也发现了一些新的CCCH基序,如C-X_(6)-C-X_(4)-C-X_(3)-H等;系统进化树显示,86个CCCH类锌指蛋白中的51个成员分为9个亚家族;启动子分析表明,NtC3H-39基因含有多个应激响应元件和激素响应元件。基因表达模式和激素响应分析表明,NtC3H-39具有明显的组织表达特异性,并对激素和干旱胁迫具有明显响应。 展开更多
关键词 烟草 CCCH类锌指蛋白基因家族 NtC3H-39 胁迫应答 生物信息学
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甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因鉴别和表达模式 被引量:1
18
作者 柳琼 黄毅 +4 位作者 陶章生 黄顺谋 王新发 黄邦全 刘贵华 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期562-571,共10页
植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、... 植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式.结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0% ~99.2%,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用元件;RNA-seq分析表明,部分基因在甘蓝型油菜品种中双11号的根、初花期雌蕊和角果中特异表达. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 TFⅢA型锌指蛋白基因 基因结构 保守基序 表达模式
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端粒相关锌指蛋白基因TASL30在人早期胚胎与组织中的mRNA表达及染色体定位 被引量:1
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作者 冯耀东 高立 +3 位作者 苟德明 蒋达和 毛歆 李文鑫 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期361-364,共4页
采用原位杂交和RNA点杂交方法 ,观察了一种新的端粒相关锌指基因TASL30在早期人胚与50种器官组织中的mRNA表达。结果表明 ,TASL30基因在早期人胚神经管中有明显表达 ,其中在神经管的头端表达最强 ,而在人的50种器官组织中均未检测到该... 采用原位杂交和RNA点杂交方法 ,观察了一种新的端粒相关锌指基因TASL30在早期人胚与50种器官组织中的mRNA表达。结果表明 ,TASL30基因在早期人胚神经管中有明显表达 ,其中在神经管的头端表达最强 ,而在人的50种器官组织中均未检测到该基因的明显表达。另外通过G -显带和染色体原位杂交 ,将TASL30基因定位于人染色体12q24~qter。 展开更多
关键词 基因定位 染色体 端粒 锌指蛋白基因 早期胚胎
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毛竹4个B-box锌指蛋白序列和基因表达特征及PeBZF4的功能 被引量:3
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作者 娄永峰 杨丽 +2 位作者 彭镇华 赵韩生 高志民 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期34-40,共7页
【目的】B-box锌指蛋白(BZF)在植物生长发育和应对逆境过程中发挥着重要的调控作用。强光胁迫对竹子的生长发育有着重要的影响,通过分析毛竹BZF基因编码蛋白的分子特征及组织表达模式,研究过量表达Pe BZF4转基因植株的荧光动力学参数变... 【目的】B-box锌指蛋白(BZF)在植物生长发育和应对逆境过程中发挥着重要的调控作用。强光胁迫对竹子的生长发育有着重要的影响,通过分析毛竹BZF基因编码蛋白的分子特征及组织表达模式,研究过量表达Pe BZF4转基因植株的荧光动力学参数变化,以期为揭示竹子BZF基因对强光的应答与调节机制提供参考。【方法】采用同源基因比对的方法直接从Bamboo GDB中获得毛竹BZF基因同源序列,利用专用软件和在线公共平台分析基因及其编码蛋白序列,查找各种作用元件,预测蛋白功能结构域,分析蛋白的亲水性/疏水性。采用实时定量PCR技术分析基因在不同组织中的表达情况以及强光(1 200μmol·m-2s-1)和黑暗处理后基因在叶片中的表达变化。构建Pe BZF4基因的过量表达载体,利用农杆菌介导法转化拟南芥,直接观察转基因植株表型,利用IMAGING-PAM荧光仪测定其叶绿素荧光参数。【结果】从毛竹数据库获得4条不同的BZF基因同源序列,编码4个不同的锌指蛋白,分别命名为Pe BZF1,Pe BZF2,Pe BZF3和Pe BZF4。4个基因中均具有光应答顺式作用调控元件ACE和G-box,但它们所含光应答元件却有所差异,Pe BZF1中有MNF1和Sp1,Pe BZF2中有I-box,Sp1和boxⅡ,Pe BZF3和Pe BZF4中有GT1-motif,MNF1和Sp1。4个基因所编码的蛋白都具有2个B-box结构域和CHC3H2锌指结合域,属于B-box型锌指蛋白。在根、茎、叶片和叶鞘中的表达4个基因存在着明显差异,其中Pe BZF1和Pe BZF3在叶片中的表达丰度最高,Pe BZF2和Pe BZF4在叶鞘中的表达丰度最高。强光处理后4个基因的表达均受到抑制,且随着光照时间的延长Pe BZF2和Pe BZF3的表达呈逐渐下降趋势,而Pe BZF1和Pe BZF4的表达却在光照1 h时比0.5 h时略微上调,随后迅速下降;黑暗对Pe BZF1,Pe BZF2和Pe BZF3的表达有明显抑制作用,而Pe BZF4的表达却显著上调,约是对照的3.2倍。过量表达Pe BZF4的转基因植株光系统Ⅱ的实际光合效率Y(Ⅱ)和非光化学猝灭(NPQ)值都比野生型有不同程度的提高。【结论】毛竹中有4个不同B-box型锌指蛋白基因,其表达为组成型,强光和黑暗处理4个基因的表达变化表明它们参与了光胁迫的应答调节。过量表达Pe BZF4基因能够提高转基因植株的Y(Ⅱ)和NPQ值,证明Pe BZF4能够增强其热耗散能力,提高强光下的光合效率。因此,BZF可能与竹子抵抗强光胁迫有关。 展开更多
关键词 毛竹 锌指蛋白基因 光胁迫 基因表达
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