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题名野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性研究
被引量：5
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作者
兰阿峰
杨曼
郭素芬
邓百万
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机构
陕西理工学院生物科学与工程学院
陕西省食药用菌工程技术研究中心
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2018年第8期88-91,共4页
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基金
陕西理工学院人才引进启动项目(SLGQD-8)
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文摘
[目的]了解野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌的组成及其多样性。[方法]提取野生秦岭羚牛瘤胃内容物总DNA,选用产甲烷菌特异性引物Met86F和Met1340R,对总DNA进行16S rRNA特异性扩增,构建秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌16S rRNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的105个阳性克隆归为14个不同的可操作分类单元(OTUs)。系统发育分析表明,这些克隆序列均位于广域古菌门(Euryarchaeota),隶属甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae,65.71%)、Methanomassiliicoccus(29.52%)和Methanosarcinaceae(4.76%)3个科。其中有57个序列与可培养菌相似度在97%以上,分属于Methanobrevibacter millerae、Methanobrevibacter olleyae和Methanobrevibacter thaueri。其余48个序列与未培养菌相似度较高,占11个OTUs。[结论]野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性比较丰富,且可能存在新的分类单元。
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关键词
野生秦岭羚牛
瘤胃
产甲烷古菌
分子多样性
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Keywords
Wild Budorcas taxicolor bedfordi
Rumen
Methanogenic archaea
Molecular diversity
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分类号
S852.6
[农业科学—基础兽医学]
Q939
[生物学—微生物学]
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