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古茶树林菌株D2的鉴定、酶学特性及基因组学分析
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作者 叶柳健 蒙健宗 +5 位作者 覃福方 何双 朱绮霞 王小虎 韦圣博 周礼芹 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期267-279,共13页
【目的】鉴定1株百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2,分析菌株D2的酶学特性及基因组,为进一步应用菌株D2开发农业用途的功能性肥料提供依据。【方法】基于16S rRNA扩增技术和菌落形态鉴定菌株D2,福林法测定蛋白酶的酶活力,二代测序... 【目的】鉴定1株百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2,分析菌株D2的酶学特性及基因组,为进一步应用菌株D2开发农业用途的功能性肥料提供依据。【方法】基于16S rRNA扩增技术和菌落形态鉴定菌株D2,福林法测定蛋白酶的酶活力,二代测序技术对菌株D2的基因组测序并进行生物信息学分析。【结果】鉴定百色野生古茶树林根际高产蛋白酶菌株D2为Stenotrophomonas属的一个新种,与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的亲缘关系最近。菌株D2发酵24 h产生255.73 U/mL的中性蛋白酶以及282.12 U/mL的碱性蛋白酶,总蛋白酶酶活力为544.60 U/mL。菌株D2蛋白酶催化反应的最适温度为50℃、最适pH为8,高温对酶活力的影响较大,pH和有机溶剂的影响相对较小,二甲基亚砜处理会提高酶活力。菌株D2基因组的全长为4599465 bp,GC含量为66.77%,包含4176个CDS,71个tRNA,5个rRNA基因,1个ncRNA。菌株D2基因组还存在丰富的碳水化合物活性酶基因和重金属抗性基因,具有11个Saccharide合成基因簇(占总基因簇的57.89%),作用于38种植物病原菌。【结论】古茶树林菌株D2鉴定为Stenotrophomonas属的一个新种,其产蛋白酶的活力高且酶学性质较好。菌株D2基因组具有丰富的碳水化合物活性酶、重金属抗性、次级代谢产物合成基因簇以及植物病原菌抗病等基因资源。 展开更多
关键词 嗜麦芽寡养单胞菌 野生古茶树林 根际微生物 中性蛋白酶 碱性蛋白酶 酶学特性 基因组学
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