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新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌PBP1的相互作用研究
1
作者
徐铭琦
史祥睿
+6 位作者
刘威
段浩
魏静
邓炎
江悦
高英英
李海波
《陆军军医大学学报》
北大核心
2025年第9期912-921,共10页
目的 探究新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白1(penicillinbinding protein 1, PBP1)的相互作用。方法 以MRSA252基因组DNA为模板,PBP1F/R为上下游引物,以Nde I/Xho I为酶切位点构建表达质粒pET30a-pbp1-39-608。将质...
目的 探究新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白1(penicillinbinding protein 1, PBP1)的相互作用。方法 以MRSA252基因组DNA为模板,PBP1F/R为上下游引物,以Nde I/Xho I为酶切位点构建表达质粒pET30a-pbp1-39-608。将质粒转入大肠杆菌中进行表达并通过亲和层析纯化获得PBP1-39-608蛋白;利用肽聚糖侧链主干肽的硫酯类似物S2d作为底物,测定HL-J6对PBP1-39-608转肽酶活性的抑制作用;用微量热泳动技术(microscale thermophoresis,MST)检测HL-J6与PBP1-39-608的亲和力,并通过细胞热转移实验(cell thermal shift assay,CETSA)确证结合作用;分别利用AutoDock Vina和Desmond软件进行分子对接和动力学模拟,明确HL-J6与PBP1-39-608蛋白的结合模式和关键氨基酸残基。结果 成功构建pET30a-pbp1-39-608重组质粒,诱导表达后,经纯化获得相对分子质量约为65×103的PBP1-39-608蛋白;HL-J6可呈时间依赖性抑制PBP1-39-608的转肽酶活性(P<0.001);HL-J6与PBP1-39-608的结合解离常数Kd约为64.92μmol/L;分子对接结果显示HL-J6通过与ILE-348、ASN-370、THR-516、PHE-423等主要氨基酸残基相互作用结合在PBP1-39-608的活性口袋,结合评分为-8.38 kcal/mol(<-5.00 kcal/mol);动力学模拟结果显示二者结合后50 ns趋于稳定。结论 HL-J6可显著抑制金黄色葡萄球菌PBP1的转肽酶活性,并与其存在稳定的相互作用。
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关键词
金黄色葡萄球菌
青霉素结合
蛋白
HL-J6
重组
蛋白
:
相互作用
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职称材料
题名
新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌PBP1的相互作用研究
1
作者
徐铭琦
史祥睿
刘威
段浩
魏静
邓炎
江悦
高英英
李海波
机构
佳木斯大学临床医学院
陆军军医大学(第三军医大学)药学与检验医学系微生物与生化药学教研室
重庆大学药学院
陆军军医大学(第三军医大学)全军免疫学研究所
重庆医科大学附属巴南医院检验科
出处
《陆军军医大学学报》
北大核心
2025年第9期912-921,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(32270988)
重庆市自然科学基金面上项目(CSTB2024NSCQ-MSX0981)。
文摘
目的 探究新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白1(penicillinbinding protein 1, PBP1)的相互作用。方法 以MRSA252基因组DNA为模板,PBP1F/R为上下游引物,以Nde I/Xho I为酶切位点构建表达质粒pET30a-pbp1-39-608。将质粒转入大肠杆菌中进行表达并通过亲和层析纯化获得PBP1-39-608蛋白;利用肽聚糖侧链主干肽的硫酯类似物S2d作为底物,测定HL-J6对PBP1-39-608转肽酶活性的抑制作用;用微量热泳动技术(microscale thermophoresis,MST)检测HL-J6与PBP1-39-608的亲和力,并通过细胞热转移实验(cell thermal shift assay,CETSA)确证结合作用;分别利用AutoDock Vina和Desmond软件进行分子对接和动力学模拟,明确HL-J6与PBP1-39-608蛋白的结合模式和关键氨基酸残基。结果 成功构建pET30a-pbp1-39-608重组质粒,诱导表达后,经纯化获得相对分子质量约为65×103的PBP1-39-608蛋白;HL-J6可呈时间依赖性抑制PBP1-39-608的转肽酶活性(P<0.001);HL-J6与PBP1-39-608的结合解离常数Kd约为64.92μmol/L;分子对接结果显示HL-J6通过与ILE-348、ASN-370、THR-516、PHE-423等主要氨基酸残基相互作用结合在PBP1-39-608的活性口袋,结合评分为-8.38 kcal/mol(<-5.00 kcal/mol);动力学模拟结果显示二者结合后50 ns趋于稳定。结论 HL-J6可显著抑制金黄色葡萄球菌PBP1的转肽酶活性,并与其存在稳定的相互作用。
关键词
金黄色葡萄球菌
青霉素结合
蛋白
HL-J6
重组
蛋白
:
相互作用
Keywords
Staphylococcus aureus
penicillin-binding proteins
HL-J6
recombinant protein
interaction
分类号
R378.11 [医药卫生—病原生物学]
R966 [医药卫生—药理学]
R978.19 [医药卫生—药品]
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出处
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1
新型抗菌化合物HL-J6与金黄色葡萄球菌PBP1的相互作用研究
徐铭琦
史祥睿
刘威
段浩
魏静
邓炎
江悦
高英英
李海波
《陆军军医大学学报》
北大核心
2025
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