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干燥过程中LEA-motif蛋白特征重复片段对POPE膜结构的保护研究 被引量:1
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作者 翟振 李代禧 +4 位作者 张燕 陈正隆 刘宝林 刘立 余华星 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期161-167,共7页
通过分子动力学模拟的方法,模拟了1-棕榈酰基-2-油酰基磷脂酰乙醇胺(1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine,POPE)生物膜在添加胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryogenesis abundant proteins,LEA蛋白)特征重复片段(LEA-... 通过分子动力学模拟的方法,模拟了1-棕榈酰基-2-油酰基磷脂酰乙醇胺(1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine,POPE)生物膜在添加胚胎发育晚期丰富蛋白(Late embryogenesis abundant proteins,LEA蛋白)特征重复片段(LEA-motif)前后两种体系在低温下的干燥过程,对比分析了干燥过程中两种体系在POPE生物膜结构、扩散系数、侧链有序性及分子间氢键数目的变化,从微观角度揭示了POPE生物膜因干燥失水导致的结构变化以及添加LEA-motif之后LEA-motif与POPE生物膜的相互作用.结果表明,LEAmotif在脱水干燥过程中能够有效地稳定膜的结构,从而保护生物材料的生物活性. 展开更多
关键词 干燥 POPE生物膜 LEA蛋白特征重复片段(LEA—motif) 分子动力学模拟
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DNA片段拼接中基于定长特征子串的重复序列信息屏蔽方法 被引量:4
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作者 张博锋 王正华 《国防科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第6期67-70,共4页
包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一。在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识... 包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一。在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识大多数片段,从而减少可能的错误重叠,讨论了方法中几个参数的确定问题并用计算结果说明了方法的有效性。 展开更多
关键词 重复序列 信息屏蔽 生物信息学 片段拼接 重复片段 定长特征子串 DNA序列
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重复序列片段基因扩增用于阴沟肠杆菌的分型研究 被引量:1
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作者 李兴禄 张莉萍 +2 位作者 陈维贤 黄长武 蓝锴 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期134-135,共2页
目的 用重复序列片段基因扩增方法对阴沟肠杆菌进行分型研究。方法 选用肠杆菌科基因间的重复序列 (ERIC)进行扩增 ,对阴沟肠杆菌进行分型研究 ,并与其抗生素耐药特征进行比较。结果 阴沟肠杆菌分成 6种不同基因型 ,不同基因型有不... 目的 用重复序列片段基因扩增方法对阴沟肠杆菌进行分型研究。方法 选用肠杆菌科基因间的重复序列 (ERIC)进行扩增 ,对阴沟肠杆菌进行分型研究 ,并与其抗生素耐药特征进行比较。结果 阴沟肠杆菌分成 6种不同基因型 ,不同基因型有不同的耐药特征。结论 本法简便易行 ,重复性好 。 展开更多
关键词 重复序列片段 基因扩增 阴沟肠杆菌 分型研究 抗生素 耐药特征 分子流行病学
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人类X染色体短串联重复序列基因座在群体遗传学中应用的研究进展
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作者 伦军 覃耀春 +2 位作者 周丽宁 邓琼英 龚继春 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期111-113,共3页
人类X-染色体短串联重复序列(short tandem repeat,STR)是指存在于X-染色体上特异碱基短串联重复片段,其重复单位为2~6个核苷酸,又称微卫星DNA(microsatellite DNA)。
关键词 短串联重复序列 群体遗传学 X染色体 人类 基因座 短串联重复片段 X-染色体 应用
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基于生物信息学特征的DNA序列数据压缩算法 被引量:8
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作者 纪震 周家锐 +1 位作者 朱泽轩 Q H Wu 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第5期991-995,共5页
本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序列集合... 本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序列集合以及剩余序列的集合.根据各集合中序列的具体生物学特征分别使用针对性的压缩策略进行预处理,并通过LZMA算法进行压缩编码.实验结果表明,BioLZMA算法在基准测试序列上的压缩性能优于原有的DNA序列压缩方法.特别是对于生物信息学特征清晰的长序列,算法能够在较短的时间内获得较高的压缩率. 展开更多
关键词 DNA数据压缩 生物信息学 序列重组 近似重复片段 LZMA
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DNA序列中基于后继数组索引的SATR查找算法 被引量:2
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作者 王镝 赵毅 +1 位作者 陈白尘 王国仁 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期184-188,共5页
研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similari... 研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similarity based approximate tandem repeats).在进行SATR的查找时,采用了一个轻量级的索引后继数组,并设计出在后继数组上进行SATR查找的算法.实验评估和性能分析表明,基于后继数组的SATR查找算法在查找结果和查找时间上都要优于其他同类方法. 展开更多
关键词 DNA序列 相似性重复片段 片段相似度 SATR 后继数组
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脑部疾病
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《国外科技资料目录(医药卫生)》 2000年第6期168-170,共3页
0022786 杭庭顿病病人在接受认识刺激过程中脑血流速度减慢/Deckel A W//Neurology.-1998,51(6).-1576~1583湘医图0022787 一个少年型杭庭顿病病人的一个非常大的三核苷酸重复片段的分析/Nance M A//Neurology.-1999,52(2).-392~394 ... 0022786 杭庭顿病病人在接受认识刺激过程中脑血流速度减慢/Deckel A W//Neurology.-1998,51(6).-1576~1583湘医图0022787 一个少年型杭庭顿病病人的一个非常大的三核苷酸重复片段的分析/Nance M A//Neurology.-1999,52(2).-392~394 湘医图0022788 脑积水自然发生大鼠模型的克隆分离和形态学探索[日]/太田善夫//日病理会志.-1999,88(1). 展开更多
关键词 脑血流速度 早发性帕金森病 重复片段 帕金森氏病 大鼠模型 急性脑积水 形态学 注意缺陷多动障碍 病人 脑部疾病
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脊髓疾病
8
《国外科技资料目录(医药卫生)》 2000年第6期171-173,共3页
0022862 在361个共济失调家庭中显性脊髓小脑型和弗雷德里克型三联密码子重复片段的发病率/Moseley M L//Neurology.-1998,51(6).-1666~1671 湘医图0022863
关键词 多发性硬化症 脊髓小脑型共济失调 中枢神经系统 重复片段 多发性硬化病 脊髓后角 脊髓疾病 发病率 脑脊液 脱髓鞘
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