采用限制性酶切片段长度多态性和PCR指印技术对牛结核分枝杆菌分型研究 被引量：7

1

作者 蔡宏 李淑霞 +3 位作者 呼西旦 李君莲 许苗 朱玉贤 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期175-179,共5页

5株牛结核分枝杆菌DNA经PvuⅡ消化后 ,用来自IS10 81中的 2 48bp荧光探针杂交后进行限制性酶切片段长度多态性 (RFLP)分型 ,5株牛分离株中有 4株具有相同杂交带型 ,剩余的 1株在 3.6kb处多了 1条带。将 2 48bp探针对北京牛结核分枝杆菌... 5株牛结核分枝杆菌DNA经PvuⅡ消化后 ,用来自IS10 81中的 2 48bp荧光探针杂交后进行限制性酶切片段长度多态性 (RFLP)分型 ,5株牛分离株中有 4株具有相同杂交带型 ,剩余的 1株在 3.6kb处多了 1条带。将 2 48bp探针对北京牛结核分枝杆菌分离株的RFLP分型法结果与直接反向PCR分型法对上述分离株分型结果比较发现 :5株牛结核分枝杆菌分离株中有 2株具有相同的PCR指印带型 ,剩余 3株牛结核分枝杆菌分离株则PCR指印带型各不相同 ,上述结果显示出 ,直接反向PCR分型法较标准的RFLP分型法分型能力强。直接PCR法对新疆牛结核分枝杆菌分离株的分型结果显示出 ,PCR指印带型中带数较少 ,且与北京牛结核分枝杆菌分离株的PCR指印带型截然不同。 展开更多

关键词 牛结核分枝杆菌 插入序列 限制性酶切片段长度多态性 直接反向PCR 分型

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激性腺素受体基因酶切片段长度多态性

2

作者 秦春圃 《生物技术通报》 CAS CSCD 2002年第5期52-53,共2页

关键词 猪 促性腺激素受体 促卵泡素受体 FSHR基因片断 酶切片段长度多态性

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几种杀虫药剂敏感蚊类酯酶多态性的研究

3

作者 陈丽平 乔传令 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第S1期13-19,共7页

通过蚊虫酯酶蛋白的淀粉凝胶电泳分析和基因组DNA的限制性酶切片段长度多态性(RFLPs)比较 ,对尖音库蚊Culex pipiens、三带喙库蚊 Culextritaeniorhynchus 和中华按蚊Anophelessinensis有机磷杀虫药剂敏感种群的酯酶蛋白和结构基因的多... 通过蚊虫酯酶蛋白的淀粉凝胶电泳分析和基因组DNA的限制性酶切片段长度多态性(RFLPs)比较 ,对尖音库蚊Culex pipiens、三带喙库蚊 Culextritaeniorhynchus 和中华按蚊Anophelessinensis有机磷杀虫药剂敏感种群的酯酶蛋白和结构基因的多态性进行分析。发现在蛋白质水平上 ,三带喙库蚊敏感种群 (n =5 4)在酯酶α和 β位点分别存在 2个和 3个等位基因 ,在DNA水平上有 2 9%的个体具有与酯酶 β11基因 1 3kbcDNA片段同源的 1 3kb单拷贝带存在。发现中华按蚊敏感种群 (n =5 0 )中具有低活性的非特异性酯酶存在 ,在蛋白质水平上 ,酯酶α和β位点各有一个等位基因 ;在DNA水平上 ,通过对单个蚊虫基因组DNA的研究未发现有与酯酶β11基因同源的酯酶编码基因的存在。对尖音库蚊北京敏感种群 (n =6 4)的研究发现 ,在酯酶α和 β位点都存在 5个等位基因 ,在DNA水平上 ,使用一个限制性内切酶 (EcoRI) ,15只蚊虫的样本在酯酶β位点发现了 5个等位基因 ,说明在尖音库蚊北京敏感种群的酯酶 β基因周围存在着较大的中性多态性 ,在有机磷杀虫剂的选择下 。 展开更多

关键词 蚊虫 酯酶 有机磷杀虫剂 限制性酶切片段长度多态性 基因扩增 迁移

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广西巴马地区长寿老人 ApoE 基因多态性与认知功能的关系 被引量：10

4

作者 胡才友 杨泽 +18 位作者 郑陈光 吕泽平 梁积英 庞国防 陈进超 韦俊兴 韦勇 王辰 屈彦纯 孙亮 杨斯雷 史晓红 唐雷 郑卫东 王沥 金锋 韩布新 吴森 梁永锡 《中国心理卫生杂志》 CSSCI CSCD 北大核心 2005年第6期383-386,共4页

目的:研究广西巴马地区长寿老人载脂蛋白E(ApoE)基因多态性的分布及其与认知功能改变的关系。方法:采用简易精神状态量表(MMSE)对112例90岁以上广西巴马地区长寿老人进行认知功能检查,并用限制性酶切片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法进... 目的:研究广西巴马地区长寿老人载脂蛋白E(ApoE)基因多态性的分布及其与认知功能改变的关系。方法:采用简易精神状态量表(MMSE)对112例90岁以上广西巴马地区长寿老人进行认知功能检查,并用限制性酶切片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法进行ApoE 基因分型。根据MMSE 得分将研究对象分为认知功能正常组和认知功能障碍组.比较两组人群的基因型、基因频率的分布特征。结果:巴马长寿老人中发生认知功能障碍者占14.29%。长寿老人中ApoEε3/3基因型分布的百分比最大,其次是ε2/3,而ε4/4最少。ApoE 各基因型和等位基因频率认知功能正常组和认知功能障碍组相比较,ε4等位基因频率认知障碍组明显高于认知正常组(P<0.01),ε4基因携带者认知功能障碍发生率明显高于其他基因携带者。结论:巴马地区长寿人群中,ApoEε3/ 3为最常见的基因型,而ε4/4最少;ApoE 基因多态性与巴马长寿老人认知功能改变有关联;ApoEε4基因仍然是长寿老人认知功能障碍发病的危险因子,较低的ApoEε4等位基因频率可能是巴马地区长寿老人认知功能保存较好的原因之一。 展开更多

关键词 APOE基因多态性 长寿老人 巴马 限制性酶切片段长度多态性分析 广西 认知功能障碍 等位基因频率 简易精神状态量表 ApoEε4基因 基因携带者 功能改变 90岁以上 基因型分布 正常组 载脂蛋白 基因分型 功能检查 研究对象

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绢丝昆虫线粒体DNA多态性研究 被引量：2

5

作者 陈元霖 桂慕燕 +1 位作者 凌建华 王斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1997年第S1期43-45,共3页

采用差速离心法和碱变性法制备家蚕、野桑蚕、蓖麻蚕、柞蚕和天蚕蛹线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ），并进行了限制性酶切片段多态性（ＲＦＬＰ）检测。结果表明，绢丝昆虫在种间ｍｔＤＮＡ酶切类型差异明显，而在种内不同品种之间则没有差... 采用差速离心法和碱变性法制备家蚕、野桑蚕、蓖麻蚕、柞蚕和天蚕蛹线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ），并进行了限制性酶切片段多态性（ＲＦＬＰ）检测。结果表明，绢丝昆虫在种间ｍｔＤＮＡ酶切类型差异明显，而在种内不同品种之间则没有差异或差异甚少。在ＨａｅⅢ酶解作用下，家蚕的１５个一化和二化性品种的酶切类型相同，５个多化性品种的酶切类型也相同，但它们彼此间则有差异，前者与野桑蚕属同一个类型。由此提示，在家蚕品种演化过程中，一化和二化品种可能与野桑蚕有更密切的亲缘关系。 展开更多

关键词 绢丝昆虫 MTDNA 酶切片段长度多态性

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CD40基因多态性与自身免疫性甲状腺病的相关性 被引量：2

6

作者 张怡 朱本章 孙燕 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期294-296,304,共4页

目的了解CD40基因多态性在西北地区汉族人群中的分布及其与自身免疫性甲状腺病(AITD)的相关性。方法随机选取本院内分泌科门诊的165例Graves病(GD)患者、113例桥本甲状腺炎(HT)患者为研究对象,以94例健康体查者为对照。①应用聚合酶链反... 目的了解CD40基因多态性在西北地区汉族人群中的分布及其与自身免疫性甲状腺病(AITD)的相关性。方法随机选取本院内分泌科门诊的165例Graves病(GD)患者、113例桥本甲状腺炎(HT)患者为研究对象,以94例健康体查者为对照。①应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性技术检测CD40基因5′非翻译区-1位点C/T多态性(5′UTR C(-1)T)、第三外显子58038位点-/T多态性;②应用扩增受阻突变系统-聚合酶链反应检测第九外显子64610位点C/G多态性。结果①5′UTR C(-1)T位点中CC基因型、C等位基因在GD组和对照组间有显著差异(P<0.05);②58038位点在372例样本中均为TT型;③64610位点未发现GG基因型。结论①西北地区汉族人CD40基因5′UTR C(-1)T位点上C等位基因型与GD发病有相关性,CC基因型者患GD的危险性较TT高;②58038位点-/T在西北地区汉族人中无多态性;③64610位点C/G在西北地区汉族人中未发现GG基因型。 展开更多

关键词 自身免疫性甲状腺病 CD40基因 单核苷酸多态性 聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性 扩增受阻突变系统-聚合酶链反应

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ApoE基因多态性与运动防治原发性骨质疏松效果的关系 被引量：2

7

作者 彭朋 陆一帆 +3 位作者 金泰庆 赵斐 张健 张勇 《天津体育学院学报》 CAS CSSCI 北大核心 2007年第3期235-238,共4页

目的:探讨不同ApoE基因型人群对适宜健骨运动处方防治原发性骨质疏松的敏感性,为制定基于基因多态性的个性化运动处方提供理论依据。方法:74名原发性骨质疏松患者按ApoE基因型随机分为ε2组、ε3组和ε4组,进行为期3个月的有氧及抗阻运... 目的:探讨不同ApoE基因型人群对适宜健骨运动处方防治原发性骨质疏松的敏感性,为制定基于基因多态性的个性化运动处方提供理论依据。方法:74名原发性骨质疏松患者按ApoE基因型随机分为ε2组、ε3组和ε4组,进行为期3个月的有氧及抗阻运动训练,双能X线骨密度吸收仪(DXA)测定运动前后骨矿含量、腰椎(L2～4)及髋部骨密度(BMD)的变化。结果:ε4组BMC运动前后的变化率高于ε2组(P<0.05);L2～4BMD运动前后无显著变化;ε4组髋部BMD运动前后的变化率显著高于ε2组(P<0.05)。结论:运动疗法防治原发性骨质疏松的效果受ApoE基因多态性的影响,其中ε4型人群通过运动疗法防治骨质疏松的效果较好。 展开更多

关键词 原发性骨质疏松 基因多态性 限制性酶切片段长度多态性 聚合酶链式反应 运动

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秦川牛TRAF6基因多态及其与体尺性状的关联分析 被引量：1

8

作者 张芷毓 欧德琼 +6 位作者 邬明丽 樊英智 高源 李世鹏 赖振雨 雷初朝 党瑞华 《中国牛业科学》 2018年第4期4-8,共5页

牛TRAF6基因位于15号染色体上,含有七个外显子,共编码902个氨基酸,是生长发育相关的候选基因。本研究旨在分析陕西地区秦川牛TRAF6基因多态及其与体尺性状之间的关系。本研究针对秦川牛TRAF6基因外显子及部分非编码序列设计引物,利用DN... 牛TRAF6基因位于15号染色体上,含有七个外显子,共编码902个氨基酸,是生长发育相关的候选基因。本研究旨在分析陕西地区秦川牛TRAF6基因多态及其与体尺性状之间的关系。本研究针对秦川牛TRAF6基因外显子及部分非编码序列设计引物,利用DNA池做为模板扩增测序,在第六内含子17 628bp处发现1个SNP。通过运用PCRRELP方法对该位点多态进行分析,结果发现存在2种基因型,分为TT和TC。TT的基因型频率为0.9574,TC的基因型频率0.0426;等位基因T的频率为0.9787,等位基因C的频率为0.0213,TT的基因型频率显著高于基因型TC,为优势基因型,TT基因型个体各体尺性状数据普遍高于TC基因型个体。本研究首次对陕西地区秦川牛的TRAF6基因进行了多态性分析,在第六内含子处发现了基因突变位点,且该突变位点与秦川牛体尺和体重等重要生长性状有关,可以作为分子标记辅助选择的参考。 展开更多

关键词 秦川牛 TRAF6基因 SNP 限制性酶切片段长度多态性 体尺性状

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氨胁迫对猪粪厌氧消化性能的影响 被引量：13

9

作者 高文萱 张克强 +3 位作者 梁军锋 宋香育 韩冰雅 杜连柱 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1997-2003,共7页

以猪粪为原料,采用批式试验方法,研究不同氨氮添加量(0、400、800、1600、2400、3200、4000 mg·L-1)对厌氧消化产气效果的影响。结果表明:随着氨氮添加量的增加,总产气量和CH4产率均呈现先升高后降低的变化趋势,氨氮添加量≥2400 m... 以猪粪为原料,采用批式试验方法,研究不同氨氮添加量(0、400、800、1600、2400、3200、4000 mg·L-1)对厌氧消化产气效果的影响。结果表明:随着氨氮添加量的增加,总产气量和CH4产率均呈现先升高后降低的变化趋势,氨氮添加量≥2400 mg·L-1时,厌氧消化过程受到显著抑制;不同处理中猪粪挥发性固体(VS)的CH4产率分别为328.5、338.1、323.2、304.9、276.2、124.9、56.1 m L·g-1。氨氮添加量为0~800 mg·L-1时,最大VS产CH4速率分别为18.3、18.4、17.1 m L·g-1·d-1;氨氮添加量为2400 mg·L-1时,产气高峰推迟,产CH4速率明显降低;氨氮添加量≥400 mg·L-1时,厌氧消化30 d底物的生物转化产CH4效率随氨氮添加量的增加逐渐降低,分别为56.7%、54.5%、52.4%、30.6%、1.6%和1.3%;氨氮添加量为400~2400 mg·L-1时,乙酸利用型产甲烷菌Methanosaeta的相对丰度总体随氨氮质量浓度的增加而降低,而氢利用型产甲烷菌Methanosarcina和Methanococcus具有相反的变化规律。 展开更多

关键词 厌氧消化 氨氮 猪粪 末端限制性酶切片段长度多态性 产甲烷菌

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弓形虫基因型鉴定方法的研究进展 被引量：2

10

作者 钱伟锋 闫文朝 +1 位作者 韩利方 王天奇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期409-412,共4页

弓形虫是一种重要的人兽共患原虫。已知弓形虫仅有一个种,但存在众多的基因型。研究表明,弓形虫基因型分布具有明显的地域性。对分离的弓形虫虫株进行基因型鉴定,对其分子流行病学、感染的溯源以及弓形虫病的预防和控制具有重要意义。... 弓形虫是一种重要的人兽共患原虫。已知弓形虫仅有一个种,但存在众多的基因型。研究表明,弓形虫基因型分布具有明显的地域性。对分离的弓形虫虫株进行基因型鉴定,对其分子流行病学、感染的溯源以及弓形虫病的预防和控制具有重要意义。本文对弓形虫基因型的鉴定方法进行了总结,为更好地选择合适的分型方法等提供参考。 展开更多

关键词 弓形虫 基因型 分型 限制性酶切片段长度多态性 内含子

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PCR-RFLP法检测生殖道沙眼衣原体感染 被引量：4

11

作者 丁庆 黄锡全 +6 位作者 邵启祥 王文红 李良菊 傅翠梅 孙惠华 王丽莉 孙宏彬 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第4期89-90,共2页

目的　建立检测沙眼衣原体的聚合酶链反应 -限制性内切酶切片段长度多态性分析 (PCR -RFLP)方法。方法　在利用PCR扩增沙眼衣原体的基础上 ,引入RFLP方法 ,并与美国ABI公司的金标免疫层析法试剂盒和镜检包涵体法比较。结果　共检测 40... 目的　建立检测沙眼衣原体的聚合酶链反应 -限制性内切酶切片段长度多态性分析 (PCR -RFLP)方法。方法　在利用PCR扩增沙眼衣原体的基础上 ,引入RFLP方法 ,并与美国ABI公司的金标免疫层析法试剂盒和镜检包涵体法比较。结果　共检测 40例临床确诊病人 ,镜检包涵体法有 15例 (37.5 % )阳性 ,金标免疫层析法有 2 3例 (5 7.5 % )阳性 ,而PCR-RFLP法有 2 9例 (70 .3 % )阳性 ,各组间有显著性差异 (P <0 .0 5 )。结论　我们认为PCR -RFLP法优于镜检包涵体法。 展开更多

关键词 沙眼衣原体 聚合酶链反应 限制性内切酶切片段长度多态性分析法

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河南IBV肾变型地方分离株的分型研究 被引量：1

12

作者 王泽霖 王宪文 +2 位作者 席瑞珍 李建丽 李华民 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期32-35,共4页

在气管环上进行交叉中和试验,结果显示河南分离的肾变型宜毒株与除T株以外的其余标准血清型毒株(M41、Holte、Arka、Conn、Gray)均有不同程度的交叉,但与Ark株相关性最大,为25%。将除Holte株以外的5株标准株和宜株的0.6kb扩增产物,用三... 在气管环上进行交叉中和试验,结果显示河南分离的肾变型宜毒株与除T株以外的其余标准血清型毒株(M41、Holte、Arka、Conn、Gray)均有不同程度的交叉,但与Ark株相关性最大,为25%。将除Holte株以外的5株标准株和宜株的0.6kb扩增产物,用三种限制性内切酶AluⅠ、TaqⅠ和AfaⅠ进行酶切,RFLP分析可分为三种模式,宜株与Ark株、Gray株、CoNn株属同一模式,AluⅠ和AfaⅠ酶切阳性而TaqⅠ酶切阴性。另AluⅠ、TaqⅠ、AfaⅠ酶切均阳性的M41模式和TaqⅠ、AfaⅠ酶切阳性而AluⅠ酶切阴性的T株模式。将地方株宜株的0.6kb扩增片段进行测序并与标准株Ark株、Gray株、Conn株、Holte株和M41株的相应序列进行分析比较,核苷酸、氨基酸同源性的分析显示,宜毒株与同一酶切类型的Ark＿1529＿29株同源性最高,核苷酸同源性为93%,氨基酸同源性为91.6%。推测宜株可能是Ark血清型毒株的变异株。宜株与Ark株在血清学分型与基因分型上的一致性,表明这两种分型方法之间有一定的内在联系。 展开更多

关键词 交叉中和试验 传染性支气管炎病毒 反转录聚合酶链式反应 限制性酶切片段长度多态性分析 同源性分析 河南 IBV 菌株分型

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肺癌分子预后分析 被引量：2

13

作者 崔永 王天佑 《中国肺癌杂志》 CAS 2005年第6期570-573,共4页

关键词 肺癌分期 预后分析 分子分期 限制性酶切片段长度多态性分析 逆转录聚合酶链反应 免疫组化染色技术 酶联免疫吸附实验 等位基因特异性 蛋白质水平 基因扩增

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长臀AFLP分析体系的建立 被引量：1

14

作者 程飞 叶卫 +1 位作者 叶富良 刘波 《南方水产》 CAS 2007年第4期46-51,共6页

以珠江长臀(Cranoglanis bouderius)为试验材料,建立了长臀扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分析体系,对其分析过程中的DNA提取、双酶切、单酶切、连接、预扩增、选择性扩增、银染等步骤进行了检测,并对反应条件进行了优化。用PstI/Taq... 以珠江长臀(Cranoglanis bouderius)为试验材料,建立了长臀扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分析体系,对其分析过程中的DNA提取、双酶切、单酶切、连接、预扩增、选择性扩增、银染等步骤进行了检测,并对反应条件进行了优化。用PstI/TaqI、EcoRI/MseI等2组双酶切组合构建长臀的AFLP指纹图谱,条带清晰可辨,扩增信号强,得到清晰的长臀AFLP指纹图谱。 展开更多

关键词 长臀鮠 扩增酶切片段长度多态性(AFLP) 条件优化 DNA指纹

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猪繁殖与呼吸综合征病毒RFLP 1-4-4 L1C株的分离鉴定及其遗传演化分析 被引量：4

15

作者 田笑笑 黄昕怡 +4 位作者 夏大松 王海伟 田志军 蔡雪辉 安同庆 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期583-590,597,共9页

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)RFLP 1-4-4 lineage1C(L1C)变异株自2020年在美国出现以来,给养猪业造成了严重的经济损失。我国目前尚无RFLP 1-4-4 L1C变异株的报道。为了解我国PRRSV RFLP 1-4-4株的流行情况,本研究对我国15个省219份疑... 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)RFLP 1-4-4 lineage1C(L1C)变异株自2020年在美国出现以来,给养猪业造成了严重的经济损失。我国目前尚无RFLP 1-4-4 L1C变异株的报道。为了解我国PRRSV RFLP 1-4-4株的流行情况,本研究对我国15个省219份疑似PRRSV感染的临床样品进行了PRRSV ORF5基因的RT-PCR检测与测序。结果显示,41份(18.72%)为PRRSV阳性样品,其中有1份来自黑龙江省样品中的PRRSV ORF5基因为1-4-4模式。将该样品经PAM分离病毒并经PCR和间接免疫荧光试验鉴定,结果显示分离到一株RFLP模式为1-4-4的PRRSV,命名为HLJ-80。采用PCR对分离病毒的全基因组分段扩增并测序拼接后显示其基因组全长15013 nt,利用MegAlign软件分析分离病毒与PRRSV 6株代表株的全基因组序列、ORF基因序列的同源性及其NSP2的氨基酸序列;利用MEGA6.0软件分析分离株ORF5基因序列并绘制其系统发生树(ML法);采用RDP4分析分离株全基因组序列的重组事件。全基因组序列的同源性分析结果显示,HLJ-80株与NADC30株的同源性最高,为93.3%,与其他代表株的同源性均低于90%。除ORF2基因外,其余基因序列均与NADC30株同源性最高(90.6%~99.3%)。ORF5基因的遗传进化树显示,HLJ-80株属于RFLP 1-4-4 L1C株。NSP2氨基酸序列分析结果显示,与VR-2332株相比,HLJ-80株NSP2存在131个氨基酸(111+1+19)的不连续缺失,缺失位置与NADC30株一致。上述结果表明,HLJ-80株与NADC30株的亲缘关系较近。重组分析结果显示,HLJ-80株有可能与PRRSV 2014-81株、SD53-1603株高度同源的病毒株重组而来。将本研究中的41株分离株ORF5基因序列,及GenBank中1996年~2021年我国3125条共计3166条北美洲型PRRSV ORF5基因序列,按照PRRSV RFLP 1-4-4模式和L1C分支谱系分类,并分析我国RFLP 1-4-4 L1C株在时间和地理上的分布;将2016年~2021年GenBank中7个国家全部北美洲型PRRSV ORF5基因序列(共计1918条),按照PRRSV RFLP分类,分析2016年以来我国与不同国家之间PRRSV RFLP的模式特点。结果显示,我国PRRSV RFLP 1-4-4自2003年首次出现,至今已累计达260株(8.2%),其中217株属于L1C分支(83.46%),其余为L8和L1A分支。PRRSV的RFLP分类结果显示,1918条PRRSV ORF5基因共有36种RFLP模式。其中RFLP 1-7-4模式的数量最多占25.96%,RFLP 1-4-4分布最广泛,除越南和印度外,该模式在其余5个国家均有分布,其在我国的数量最多。本研究为了解我国PRRSV RFLP 1-4-4株的流行情况提供了重要参考数据。 展开更多

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 限制性酶切片段长度多态性 分支谱系 RFLP 1-4-4 L1C

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