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毛白杨酵母单杂交体系的建立
被引量:
2
1
作者
刘蕾
胡旭东
+4 位作者
张强
蒋璐瑶
李丽红
要笑云
陆海
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期370-375,共6页
【目的】通过建立酵母单杂交文库筛选出与毛白杨特异性调控元件结合的候选蛋白,为研究毛白杨木材合成相关基因奠定基础。【方法】采用模板基因PCR方法,分别将ABRE-box、AC-box及-317-Box三次重复序列连接至p Ab Ai诱饵质粒上,再将诱饵...
【目的】通过建立酵母单杂交文库筛选出与毛白杨特异性调控元件结合的候选蛋白,为研究毛白杨木材合成相关基因奠定基础。【方法】采用模板基因PCR方法,分别将ABRE-box、AC-box及-317-Box三次重复序列连接至p Ab Ai诱饵质粒上,再将诱饵载体转入酵母中;使用磁珠法获得m RNA,采用SMART技术合成c DNA,以c DNA为模板进行LD-PCR并将产物纯化后与p GADT7-Rec载体共转化诱饵酵母,同时进行文库的构建与筛选。【结果】以p BI121质粒为模板扩增获得的ABRE/AC/-317-GUS片段约为650 bp。以KpnⅠ对重组质粒p Ab Ai-ABRE/AC/-317-GUS进行单酶切,获得约5000 bp的大片段与650 bp的小片段;测序结果表明,插入序列与ABRE/AC/-317序列一致且方向正确。在SD/Ura培养基中,当Ab A为100 ng/m L时,酵母菌落数为0,建库时Ab A为100 ng/m L。c DNA与p GADT7载体共转化的酵母Y1HGold(p AC-Ab Ai)细胞稀释100倍后,在SD/-Leu培养基上长出89个克隆,含AC-box的诱饵酵母所建库容量为1.3×106,且无r RNA污染。酵母转化产物在SD/-Leu/Ab A(100 ng/m L)培养基上长出18个克隆,大于250 bp的有13个克隆;测序和同源分析结果表明,成功筛选到5个候选蛋白,主要是蛋白激酶、核小体蛋白及功能未知蛋白,这些蛋白可作为与AC元件结合的候选蛋白。【结论】建立的毛白杨酵母单杂体系可用于进一步筛选与木材合成相关的基因。
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关键词
毛白杨
酵母单杂交体系
载体构建
文库构建
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职称材料
酵母单杂交体系——一种研究DNA-蛋白质相互作用的有效方法
被引量:
15
2
作者
廖名湘
方福德
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000年第4期388-391,共4页
酵母单杂交体系是借鉴酵母双杂交体系的基本原理 ,通过观察酵母细胞内报告基因的表达状况 ,研究DNA-蛋白质之间的相互作用。通过筛选 DNA文库可直接得到与靶序列相互作用的蛋白质基因序列 ,而无需分离、纯化蛋白 ,从而克服了体内研究的...
酵母单杂交体系是借鉴酵母双杂交体系的基本原理 ,通过观察酵母细胞内报告基因的表达状况 ,研究DNA-蛋白质之间的相互作用。通过筛选 DNA文库可直接得到与靶序列相互作用的蛋白质基因序列 ,而无需分离、纯化蛋白 ,从而克服了体内研究的局限性。目前酵母单杂交体系已被广泛应用于寻找与目的 DNA片段相互作用的蛋白质分子 ,该体系是一种用于研究 DNA-蛋白质之间的相互作用的有效方法。本文就酵母单杂交体系的原理、具体实现方法、在研究 DNA结合蛋白质中的应用及其优缺点等方面作一简要介绍。
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关键词
酵母单杂交体系
DNA-蛋白质
相互作用
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职称材料
应用酵母单杂交体系筛选与大鼠谷胱甘肽S-转移酶P增强子GPEⅠ相互作用的转录激活因子
被引量:
4
3
作者
廖名湘
左瑾
+1 位作者
刘东远
方福德
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000年第4期317-321,共5页
目的 探讨谷胱甘肽 S-转移酶 (GST- P)基因表达调控机制的多样性及其与化学致癌的关系 ,筛选与大鼠 GST- P增强子元件 GPE 相互作用的调控因子。方法 采用酵母单杂交体系筛选与 GPE 核心序列相互作用的转录激活因子 ,应用 DNA序列测...
目的 探讨谷胱甘肽 S-转移酶 (GST- P)基因表达调控机制的多样性及其与化学致癌的关系 ,筛选与大鼠 GST- P增强子元件 GPE 相互作用的调控因子。方法 采用酵母单杂交体系筛选与 GPE 核心序列相互作用的转录激活因子 ,应用 DNA序列测定及计算机分析等手段对所测的 DNA序列进行分析。结果 共获得两个阳性克隆 p YGPE1和 p YGPE2。 DNA测序分析表明 :p YGPE1的插入片段与大鼠原癌基因 c- jun c DNA具有 99%的同源性 ,其编码的氨基酸序列与大鼠 c- Jun蛋白具有 10 0 %的同源性。 p YGPE2的插入片段与大鼠线粒体腺苷酸转位酶 c DNA具有 99%的同源性 ,其编码的氨基酸序列与大鼠腺苷酸转位酶具有 10 0 %的同源性。结论 大鼠 c- Jun蛋白和线粒体腺苷酸转位酶在酵母细胞内与大鼠 GST- P增强子 GPE 核心序列结合 ,可能是作用于 GPE 的反式作用因子。
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关键词
酵母单杂交体系
谷胱甘肽S-转移酶
增强子GPE
Ⅰ
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职称材料
人Jurkat细胞GAGA样元件结合蛋白cDNA的克隆
被引量:
3
4
作者
莫志成
陆瑜
+2 位作者
高超
吴宁华
沈珝琲
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期269-271,共3页
目的探讨人Jurkat细胞中是否存在与GAGA样元件相互作用的结合蛋白。方法采用酵母单杂交体系,在HTLV-1转化的Jurkat细胞cDNA文库中筛选与GAGA样元件相互作用的蛋白;提取人Jurkat细胞总RNA,应用反转录反应标记cDNA探针,与候选的阳性克隆...
目的探讨人Jurkat细胞中是否存在与GAGA样元件相互作用的结合蛋白。方法采用酵母单杂交体系,在HTLV-1转化的Jurkat细胞cDNA文库中筛选与GAGA样元件相互作用的蛋白;提取人Jurkat细胞总RNA,应用反转录反应标记cDNA探针,与候选的阳性克隆杂交。结果共获得9个阳性克隆,其中6个阳性克隆的插入片段可以与cDNA探针杂交。结论在人Jurkat细胞中有与GAGA样元件相关的结合蛋白。
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关键词
JURKAT细胞
酵母单杂交体系
GAGA元件
基因调控
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职称材料
题名
毛白杨酵母单杂交体系的建立
被引量:
2
1
作者
刘蕾
胡旭东
张强
蒋璐瑶
李丽红
要笑云
陆海
机构
北京林业大学生物科学与技术学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期370-375,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31170574)
文摘
【目的】通过建立酵母单杂交文库筛选出与毛白杨特异性调控元件结合的候选蛋白,为研究毛白杨木材合成相关基因奠定基础。【方法】采用模板基因PCR方法,分别将ABRE-box、AC-box及-317-Box三次重复序列连接至p Ab Ai诱饵质粒上,再将诱饵载体转入酵母中;使用磁珠法获得m RNA,采用SMART技术合成c DNA,以c DNA为模板进行LD-PCR并将产物纯化后与p GADT7-Rec载体共转化诱饵酵母,同时进行文库的构建与筛选。【结果】以p BI121质粒为模板扩增获得的ABRE/AC/-317-GUS片段约为650 bp。以KpnⅠ对重组质粒p Ab Ai-ABRE/AC/-317-GUS进行单酶切,获得约5000 bp的大片段与650 bp的小片段;测序结果表明,插入序列与ABRE/AC/-317序列一致且方向正确。在SD/Ura培养基中,当Ab A为100 ng/m L时,酵母菌落数为0,建库时Ab A为100 ng/m L。c DNA与p GADT7载体共转化的酵母Y1HGold(p AC-Ab Ai)细胞稀释100倍后,在SD/-Leu培养基上长出89个克隆,含AC-box的诱饵酵母所建库容量为1.3×106,且无r RNA污染。酵母转化产物在SD/-Leu/Ab A(100 ng/m L)培养基上长出18个克隆,大于250 bp的有13个克隆;测序和同源分析结果表明,成功筛选到5个候选蛋白,主要是蛋白激酶、核小体蛋白及功能未知蛋白,这些蛋白可作为与AC元件结合的候选蛋白。【结论】建立的毛白杨酵母单杂体系可用于进一步筛选与木材合成相关的基因。
关键词
毛白杨
酵母单杂交体系
载体构建
文库构建
Keywords
Populus tomentosa Carr.
yeast one-hybrid system
vector construction
construction of c DNA library
分类号
S792.117 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
酵母单杂交体系——一种研究DNA-蛋白质相互作用的有效方法
被引量:
15
2
作者
廖名湘
方福德
机构
中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000年第4期388-391,共4页
文摘
酵母单杂交体系是借鉴酵母双杂交体系的基本原理 ,通过观察酵母细胞内报告基因的表达状况 ,研究DNA-蛋白质之间的相互作用。通过筛选 DNA文库可直接得到与靶序列相互作用的蛋白质基因序列 ,而无需分离、纯化蛋白 ,从而克服了体内研究的局限性。目前酵母单杂交体系已被广泛应用于寻找与目的 DNA片段相互作用的蛋白质分子 ,该体系是一种用于研究 DNA-蛋白质之间的相互作用的有效方法。本文就酵母单杂交体系的原理、具体实现方法、在研究 DNA结合蛋白质中的应用及其优缺点等方面作一简要介绍。
关键词
酵母单杂交体系
DNA-蛋白质
相互作用
Keywords
yeast one hybrid system
DNA protein interaction
分类号
Q813 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
应用酵母单杂交体系筛选与大鼠谷胱甘肽S-转移酶P增强子GPEⅠ相互作用的转录激活因子
被引量:
4
3
作者
廖名湘
左瑾
刘东远
方福德
机构
中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000年第4期317-321,共5页
基金
国家自然科学基金!( 3 9670 173 )资助&&
文摘
目的 探讨谷胱甘肽 S-转移酶 (GST- P)基因表达调控机制的多样性及其与化学致癌的关系 ,筛选与大鼠 GST- P增强子元件 GPE 相互作用的调控因子。方法 采用酵母单杂交体系筛选与 GPE 核心序列相互作用的转录激活因子 ,应用 DNA序列测定及计算机分析等手段对所测的 DNA序列进行分析。结果 共获得两个阳性克隆 p YGPE1和 p YGPE2。 DNA测序分析表明 :p YGPE1的插入片段与大鼠原癌基因 c- jun c DNA具有 99%的同源性 ,其编码的氨基酸序列与大鼠 c- Jun蛋白具有 10 0 %的同源性。 p YGPE2的插入片段与大鼠线粒体腺苷酸转位酶 c DNA具有 99%的同源性 ,其编码的氨基酸序列与大鼠腺苷酸转位酶具有 10 0 %的同源性。结论 大鼠 c- Jun蛋白和线粒体腺苷酸转位酶在酵母细胞内与大鼠 GST- P增强子 GPE 核心序列结合 ,可能是作用于 GPE 的反式作用因子。
关键词
酵母单杂交体系
谷胱甘肽S-转移酶
增强子GPE
Ⅰ
Keywords
yeast one hybrid system
glutathione S transferase P
glutathione S transferase P enhancer Ⅰ
trans action factors
分类号
Q753 [生物学—分子生物学]
Q813 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
人Jurkat细胞GAGA样元件结合蛋白cDNA的克隆
被引量:
3
4
作者
莫志成
陆瑜
高超
吴宁华
沈珝琲
机构
中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期269-271,共3页
基金
国家自然科学基金(39930050)资助
文摘
目的探讨人Jurkat细胞中是否存在与GAGA样元件相互作用的结合蛋白。方法采用酵母单杂交体系,在HTLV-1转化的Jurkat细胞cDNA文库中筛选与GAGA样元件相互作用的蛋白;提取人Jurkat细胞总RNA,应用反转录反应标记cDNA探针,与候选的阳性克隆杂交。结果共获得9个阳性克隆,其中6个阳性克隆的插入片段可以与cDNA探针杂交。结论在人Jurkat细胞中有与GAGA样元件相关的结合蛋白。
关键词
JURKAT细胞
酵母单杂交体系
GAGA元件
基因调控
Keywords
yeast one-hybrid system
GAGA element
gene expression
分类号
Q343.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
毛白杨酵母单杂交体系的建立
刘蕾
胡旭东
张强
蒋璐瑶
李丽红
要笑云
陆海
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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职称材料
2
酵母单杂交体系——一种研究DNA-蛋白质相互作用的有效方法
廖名湘
方福德
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000
15
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
应用酵母单杂交体系筛选与大鼠谷胱甘肽S-转移酶P增强子GPEⅠ相互作用的转录激活因子
廖名湘
左瑾
刘东远
方福德
《中国医学科学院学报》
CSCD
北大核心
2000
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
人Jurkat细胞GAGA样元件结合蛋白cDNA的克隆
莫志成
陆瑜
高超
吴宁华
沈珝琲
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002
3
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职称材料
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