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题名牛支原体分离株全基因组序列测定及初步分析
被引量：10
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作者
王艳杰
李平安
吴太平
关平原
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机构
内蒙古农业大学兽医学院农业部动物临床诊疗技术重点实验室
内蒙古农业大学食品科学与工程学院
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出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2014年第8期44-49,共6页
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文摘
为全面了解牛支原体NM2012株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制,采用体外大量培养,酚-氯仿法提取牛支原体NM2012株基因组DNA,并送往北京华大基因公司进行全基因组测序注释。结果显示,牛支原体NM2012株基因组大小为993 483bp,GC含量为29.26%,测序组装后共产生3个scaffolds,24个contigs。基因组组分分析后发现,NM2012株的基因组含有885个基因,总长度为834 042bp,基因平均长度为942bp,占基因组全长的83.95%。串联重复序列共79个,总长为9 203bp,占基因组全长的0.926 3%。小卫星序列53个,微卫星序列5个,tRNA 34个,rRNA 4个。牛支原体NM2012株16SrRNA序列与支原体属致牛羊病主要菌株构建进化树进一步证实NM2012株为牛支原体,为后期进一步研究牛支原体提供依据。
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关键词
牛支原体
酚-氯仿提取法
全基因组测序
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Keywords
Mycoplasma bovis
phenol-chloroform extraction method
whole genome sequencing
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分类号
S852.62
[农业科学—基础兽医学]
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